Bombus affinis (rusty patched bumble bee): 126924664
Help
Entry
126924664 CDS
T09368
Name
(RefSeq) putative elongator complex protein 1
KO
K11373
elongator complex protein 1
Organism
baff
Bombus affinis (rusty patched bumble bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baff00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
baff03016
]
126924664
Transfer RNA biogenesis [BR:
baff03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Elongator complex
126924664
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_ELP1_1st
A-sol_ELP1
HB_ELP1
Beta-prop_ELP1_2nd
TPR_ELP1
TPR_GEMI5
TPR_12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126924664
NCBI-ProteinID:
XP_050595331
LinkDB
All DBs
Position
15:complement(8218430..8223230)
Genome browser
AA seq
1314 aa
AA seq
DB search
MKNLVVKQHTSRLLNILENQMLNVKDLKILYTVDSTNDDFYMLLKNKLYKIPSNNVEDIS
FFEIDENLEFIGLGYCSVTQEIYGVCKSGNIIRINLEPEFRYELITDLNTDLQCMKLSPD
HEIIILVTISGIVITMVSTFEIISEVNLHAQYFGQKQFVTVGWGKKETQFHGSEGKKAAI
SKPTEICENNLDDGLYKITWRDDGLLFAVGLLHPENKVRQFKVFNREGILQYTSEIANGL
EGSLSWKPSGSLIASTQISQNKHLVVFFEKNGLKHREFSLPFKPKEIRVKDLFWSSDSEI
LTIWCQIQADSSSVLQLWTENNYHWYLKQTIKFPTDNSLICATWSTTSCFKKLIVLTYKE
LITFDYNWSVDHSRGITVHDKSVIGIIDGNKSLMTGLRVGIVPPPMAHKTLEISESINAI
VFAPDIKDKATWIDSNAFFCVSASKKLIFYKYLVDSFLLDYEHVGTYDIKWDILLEHKNF
FYNMHHFLWLNENNVLCSLSINDQSFLCVLMLSAIEDQTQGQVILRRIHIMDGLIQHIVR
SPDSDEAYIIVDNSIIKYTKETELIPVDTQLQGYTYKVEVVKIGTKHMVLSLYHRNCFAI
NGKQIANNITSFFIHSEFLLLTTAQNTLICVNLNENDFEELIKQDLTVKPWENRLNDKSF
SDINIRRVERGSLLIAAIPKDSKVILQMPRGNLECIQPRALSLYIIGFYLDNCNYLSAFD
LMRRQRINLNLIYDYNPKKFIENANKFVEQVSKASWLSLFLSELADEDVTTTIYANYYRR
HQSESRNLEINKIELICSLLRNIMEEKNNSDHLIQPILISLVKDKKKQGIEAALAKIKEI
QKLEEKRTGYEEHIMSVEALKYLLYIMDVNVLFDIALGMYDFDLTMFIASKSQKDPKEYI
PFLNGLKKLDENYMKYSIDLHLKRYESALEHIAKESNRFNECINLIRNYNLYTKALKLFE
KKSKMYKEVARSYGEYLLNKRHYHEAGIMFHRSGDIKEALNAYKLASCWQDVIILSTQME
LSETEKHVIYQDLVERLKTDKKYEEAAHILMNYFRDMKEAIISLCNGKRWKDAVRIAHDT
KNLDLIECHIKPSVYEYADHTLSQIKKNRQDFERYKLRLATVRHNISQRNIKSDNEILCD
NESICNKGISDILSDTSSVVSSTLSQRSRLSTMSGKSYRSSKNRRKQERKFLSLKEGSVF
EDLALIQTLYQIISNMYKERDDLHILIQMLLYFDDDEYAEKIQNSMEELLLIIEKDKSEI
WDKSAASSLAEMENTELTTMKDSQGFSTCYKLVESYITHPPVANSSPWKLNIFY
NT seq
3945 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaatttggtagtaaaacaacacactagtcgtcttttaaatatcctagaaaatcaa
atgctaaatgtaaaagatttaaaaatattgtatactgttgactcaactaatgatgatttt
tatatgcttttaaaaaataagttatataaaattccatcgaataatgtggaagatataagt
ttcttcgaaatcgatgaaaatttagaattcatcggtttgggatattgtagtgtaacacaa
gaaatatatggtgtctgtaaatctggcaatattataagaataaatttagaacctgaattt
agatacgaattgataactgatttaaacacagatttacaatgcatgaaattaagcccagat
catgaaataatcatattagttacaattagtggtattgtgattacaatggtatctactttt
gaaataatctcagaggtaaatctgcatgcacaatatttcggtcaaaagcaatttgtgact
gttggttggggtaagaaggaaactcagtttcatggttcagaaggaaaaaaagcagcaata
tctaaaccaacagaaatatgtgaaaacaatctagatgatggattatataaaataacttgg
cgtgatgatggtttgttatttgctgttggtttgttacatcccgaaaataaagttagacag
tttaaggtattcaatagagaaggtattttacaatacaccagtgagatcgctaatggtttg
gaaggatcattgtcatggaaaccatctggtagtttaattgcatcaacacagatttcacaa
aacaagcaccttgttgtattctttgagaaaaatggtttaaaacacagagaattttcactt
ccttttaaaccaaaagaaattagggtgaaagatttattttggtcatcagattcagaaatt
ttaactatttggtgtcaaattcaggcagattcttcttcagttctacaactatggacagaa
aataattatcattggtatttgaaacaaactattaaatttcccacagataactcattgata
tgtgccacatggagtacaacatcctgtttcaaaaagttgattgttttaacatacaaagaa
cttatcacgtttgattataattggtctgttgatcatagtagaggcataactgtacatgat
aaatctgttattggcatcattgatggaaataagtcattaatgactggtcttagagtagga
attgtaccaccaccaatggcacataaaactttagaaatttctgaatccataaatgctatt
gtttttgcacctgatataaaagacaaagctacctggatagacagcaatgcattcttctgt
gtttctgccagcaaaaaattaatattttacaagtatttagtggattcattcctcttagac
tatgaacatgttggaacatatgatattaaatgggatattctactagaacataaaaatttc
ttttacaatatgcatcattttttatggcttaatgaaaacaacgttttatgttcattgtca
ataaatgatcagagtttcctttgtgttttgatgttaagtgcaatagaagatcaaacacag
ggacaagttatattgaggcgaatacacattatggatggtttaattcaacacatagttcgt
tccccagattcagatgaagcatacataattgtagacaattccattataaaatatacaaaa
gaaacagaactaatcccagttgatacacaattgcaaggatatacctataaagtagaagtt
gtgaaaattggtacaaagcacatggtactatcattatatcataggaactgttttgcaatt
aatggaaagcaaattgctaacaatatcacaagttttttcattcactcggaatttttactt
cttacaactgcacaaaatactttaatatgcgttaacttgaacgagaatgactttgaagaa
ttaataaagcaagatttgacagtaaagccatgggaaaatcgactcaatgataagtcattt
tcagatataaatattagaagagtggaaaggggatctctattgattgcagctattcctaaa
gattccaaagttattttgcaaatgcctcgtggaaatctagaatgcattcaaccaagggca
ttgtctttatatattatcggattttacttagacaattgcaattatttatctgccttcgat
ttaatgcggagacaacgaataaacttgaacttgatctatgactataatccaaaaaaattt
atcgagaatgcaaataaatttgtggaacaagtttccaaagcgagttggttaagtttattc
ttgtctgagttagcagatgaagacgttaccacgacaatatatgcaaattactatcgaaga
catcagtcagaatcaagaaaccttgaaataaataaaattgaattaatttgtagtttattg
cgaaacattatggaagaaaagaacaactctgatcatttaattcaaccaatattaatcagt
ttggtaaaagataagaaaaaacaaggaatagaagctgcgctagcgaaaataaaggagatt
cagaagttagaggaaaaacgtacgggatatgaggaacacataatgtctgttgaagcacta
aaatatctgttatacataatggatgtgaatgtactatttgatatagctctaggaatgtac
gattttgatttgactatgttcattgcttctaagtcacaaaaagatcccaaagaatatatt
ccatttcttaatggcttgaaaaagcttgacgagaattatatgaaatattctattgattta
catttgaaacgctatgagtctgctcttgaacatattgcgaaagaatcaaacagatttaac
gaatgtataaatttgatacgcaattataatctgtatacaaaagctttaaaattatttgag
aagaaaagcaaaatgtataaggaggtagccagaagttatggtgaatatttattgaataaa
cgacactatcatgaagctggaattatgtttcatagatctggtgatatcaaagaagcttta
aatgcttataaattagctagttgttggcaagatgttattatactatctactcaaatggaa
ctaagcgaaacagaaaaacacgtgatttaccaggatcttgtagaacgtctaaaaactgat
aaaaagtatgaggaagctgcacatattttaatgaattatttcagagatatgaaggaagct
ataatctctttatgtaatggtaaacgatggaaagatgctgtaagaattgcacatgatact
aaaaatctagatttgattgaatgtcatataaaacctagtgtatacgaatatgcggatcac
actctatcacaaataaaaaaaaataggcaagattttgaacgatataaattgcgtcttgca
acagtcaggcacaatatttctcagagaaacataaaatcggacaatgaaatactttgtgac
aatgagtcgatatgtaacaaaggcatttcagatattcttagcgatacaagtagcgttgtt
agttcaactttgagtcaaagatcgagattgtccactatgtctggaaaaagttatagatcc
agcaaaaatcgaagaaagcaggaaaggaaatttttaagtttaaaagaaggcagtgtcttc
gaggatttggcattaatacaaactttgtatcaaattatcagcaatatgtacaaagaacga
gatgatttgcacatattgatacaaatgcttttatatttcgatgacgatgaatatgcggaa
aaaatacaaaattccatggaagaattacttttaataatagaaaaagataaatctgaaatc
tgggataaatctgcagcttcaagcttagcagaaatggaaaatacagaactcacgacgatg
aaagattcacaaggattctctacctgttacaaattagttgaatcttatattacacatcca
ccggtagctaattcttcaccttggaaattgaacatattttactaa
DBGET
integrated database retrieval system