KEGG   Bombus affinis (rusty patched bumble bee): 126924664
Entry
126924664         CDS       T09368                                 
Name
(RefSeq) putative elongator complex protein 1
  KO
K11373  elongator complex protein 1
Organism
baff  Bombus affinis (rusty patched bumble bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:baff00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:baff03016]
    126924664
Transfer RNA biogenesis [BR:baff03016]
 Eukaryotic type
  tRNA modification factors
   Elongator complex
    126924664
SSDB
Motif
Pfam: Beta-prop_ELP1_1st A-sol_ELP1 HB_ELP1 Beta-prop_ELP1_2nd TPR_ELP1 TPR_GEMI5 TPR_12
Other DBs
NCBI-GeneID: 126924664
NCBI-ProteinID: XP_050595331
LinkDB
Position
15:complement(8218430..8223230)
AA seq 1314 aa
MKNLVVKQHTSRLLNILENQMLNVKDLKILYTVDSTNDDFYMLLKNKLYKIPSNNVEDIS
FFEIDENLEFIGLGYCSVTQEIYGVCKSGNIIRINLEPEFRYELITDLNTDLQCMKLSPD
HEIIILVTISGIVITMVSTFEIISEVNLHAQYFGQKQFVTVGWGKKETQFHGSEGKKAAI
SKPTEICENNLDDGLYKITWRDDGLLFAVGLLHPENKVRQFKVFNREGILQYTSEIANGL
EGSLSWKPSGSLIASTQISQNKHLVVFFEKNGLKHREFSLPFKPKEIRVKDLFWSSDSEI
LTIWCQIQADSSSVLQLWTENNYHWYLKQTIKFPTDNSLICATWSTTSCFKKLIVLTYKE
LITFDYNWSVDHSRGITVHDKSVIGIIDGNKSLMTGLRVGIVPPPMAHKTLEISESINAI
VFAPDIKDKATWIDSNAFFCVSASKKLIFYKYLVDSFLLDYEHVGTYDIKWDILLEHKNF
FYNMHHFLWLNENNVLCSLSINDQSFLCVLMLSAIEDQTQGQVILRRIHIMDGLIQHIVR
SPDSDEAYIIVDNSIIKYTKETELIPVDTQLQGYTYKVEVVKIGTKHMVLSLYHRNCFAI
NGKQIANNITSFFIHSEFLLLTTAQNTLICVNLNENDFEELIKQDLTVKPWENRLNDKSF
SDINIRRVERGSLLIAAIPKDSKVILQMPRGNLECIQPRALSLYIIGFYLDNCNYLSAFD
LMRRQRINLNLIYDYNPKKFIENANKFVEQVSKASWLSLFLSELADEDVTTTIYANYYRR
HQSESRNLEINKIELICSLLRNIMEEKNNSDHLIQPILISLVKDKKKQGIEAALAKIKEI
QKLEEKRTGYEEHIMSVEALKYLLYIMDVNVLFDIALGMYDFDLTMFIASKSQKDPKEYI
PFLNGLKKLDENYMKYSIDLHLKRYESALEHIAKESNRFNECINLIRNYNLYTKALKLFE
KKSKMYKEVARSYGEYLLNKRHYHEAGIMFHRSGDIKEALNAYKLASCWQDVIILSTQME
LSETEKHVIYQDLVERLKTDKKYEEAAHILMNYFRDMKEAIISLCNGKRWKDAVRIAHDT
KNLDLIECHIKPSVYEYADHTLSQIKKNRQDFERYKLRLATVRHNISQRNIKSDNEILCD
NESICNKGISDILSDTSSVVSSTLSQRSRLSTMSGKSYRSSKNRRKQERKFLSLKEGSVF
EDLALIQTLYQIISNMYKERDDLHILIQMLLYFDDDEYAEKIQNSMEELLLIIEKDKSEI
WDKSAASSLAEMENTELTTMKDSQGFSTCYKLVESYITHPPVANSSPWKLNIFY
NT seq 3945 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaagaatttggtagtaaaacaacacactagtcgtcttttaaatatcctagaaaatcaa
atgctaaatgtaaaagatttaaaaatattgtatactgttgactcaactaatgatgatttt
tatatgcttttaaaaaataagttatataaaattccatcgaataatgtggaagatataagt
ttcttcgaaatcgatgaaaatttagaattcatcggtttgggatattgtagtgtaacacaa
gaaatatatggtgtctgtaaatctggcaatattataagaataaatttagaacctgaattt
agatacgaattgataactgatttaaacacagatttacaatgcatgaaattaagcccagat
catgaaataatcatattagttacaattagtggtattgtgattacaatggtatctactttt
gaaataatctcagaggtaaatctgcatgcacaatatttcggtcaaaagcaatttgtgact
gttggttggggtaagaaggaaactcagtttcatggttcagaaggaaaaaaagcagcaata
tctaaaccaacagaaatatgtgaaaacaatctagatgatggattatataaaataacttgg
cgtgatgatggtttgttatttgctgttggtttgttacatcccgaaaataaagttagacag
tttaaggtattcaatagagaaggtattttacaatacaccagtgagatcgctaatggtttg
gaaggatcattgtcatggaaaccatctggtagtttaattgcatcaacacagatttcacaa
aacaagcaccttgttgtattctttgagaaaaatggtttaaaacacagagaattttcactt
ccttttaaaccaaaagaaattagggtgaaagatttattttggtcatcagattcagaaatt
ttaactatttggtgtcaaattcaggcagattcttcttcagttctacaactatggacagaa
aataattatcattggtatttgaaacaaactattaaatttcccacagataactcattgata
tgtgccacatggagtacaacatcctgtttcaaaaagttgattgttttaacatacaaagaa
cttatcacgtttgattataattggtctgttgatcatagtagaggcataactgtacatgat
aaatctgttattggcatcattgatggaaataagtcattaatgactggtcttagagtagga
attgtaccaccaccaatggcacataaaactttagaaatttctgaatccataaatgctatt
gtttttgcacctgatataaaagacaaagctacctggatagacagcaatgcattcttctgt
gtttctgccagcaaaaaattaatattttacaagtatttagtggattcattcctcttagac
tatgaacatgttggaacatatgatattaaatgggatattctactagaacataaaaatttc
ttttacaatatgcatcattttttatggcttaatgaaaacaacgttttatgttcattgtca
ataaatgatcagagtttcctttgtgttttgatgttaagtgcaatagaagatcaaacacag
ggacaagttatattgaggcgaatacacattatggatggtttaattcaacacatagttcgt
tccccagattcagatgaagcatacataattgtagacaattccattataaaatatacaaaa
gaaacagaactaatcccagttgatacacaattgcaaggatatacctataaagtagaagtt
gtgaaaattggtacaaagcacatggtactatcattatatcataggaactgttttgcaatt
aatggaaagcaaattgctaacaatatcacaagttttttcattcactcggaatttttactt
cttacaactgcacaaaatactttaatatgcgttaacttgaacgagaatgactttgaagaa
ttaataaagcaagatttgacagtaaagccatgggaaaatcgactcaatgataagtcattt
tcagatataaatattagaagagtggaaaggggatctctattgattgcagctattcctaaa
gattccaaagttattttgcaaatgcctcgtggaaatctagaatgcattcaaccaagggca
ttgtctttatatattatcggattttacttagacaattgcaattatttatctgccttcgat
ttaatgcggagacaacgaataaacttgaacttgatctatgactataatccaaaaaaattt
atcgagaatgcaaataaatttgtggaacaagtttccaaagcgagttggttaagtttattc
ttgtctgagttagcagatgaagacgttaccacgacaatatatgcaaattactatcgaaga
catcagtcagaatcaagaaaccttgaaataaataaaattgaattaatttgtagtttattg
cgaaacattatggaagaaaagaacaactctgatcatttaattcaaccaatattaatcagt
ttggtaaaagataagaaaaaacaaggaatagaagctgcgctagcgaaaataaaggagatt
cagaagttagaggaaaaacgtacgggatatgaggaacacataatgtctgttgaagcacta
aaatatctgttatacataatggatgtgaatgtactatttgatatagctctaggaatgtac
gattttgatttgactatgttcattgcttctaagtcacaaaaagatcccaaagaatatatt
ccatttcttaatggcttgaaaaagcttgacgagaattatatgaaatattctattgattta
catttgaaacgctatgagtctgctcttgaacatattgcgaaagaatcaaacagatttaac
gaatgtataaatttgatacgcaattataatctgtatacaaaagctttaaaattatttgag
aagaaaagcaaaatgtataaggaggtagccagaagttatggtgaatatttattgaataaa
cgacactatcatgaagctggaattatgtttcatagatctggtgatatcaaagaagcttta
aatgcttataaattagctagttgttggcaagatgttattatactatctactcaaatggaa
ctaagcgaaacagaaaaacacgtgatttaccaggatcttgtagaacgtctaaaaactgat
aaaaagtatgaggaagctgcacatattttaatgaattatttcagagatatgaaggaagct
ataatctctttatgtaatggtaaacgatggaaagatgctgtaagaattgcacatgatact
aaaaatctagatttgattgaatgtcatataaaacctagtgtatacgaatatgcggatcac
actctatcacaaataaaaaaaaataggcaagattttgaacgatataaattgcgtcttgca
acagtcaggcacaatatttctcagagaaacataaaatcggacaatgaaatactttgtgac
aatgagtcgatatgtaacaaaggcatttcagatattcttagcgatacaagtagcgttgtt
agttcaactttgagtcaaagatcgagattgtccactatgtctggaaaaagttatagatcc
agcaaaaatcgaagaaagcaggaaaggaaatttttaagtttaaaagaaggcagtgtcttc
gaggatttggcattaatacaaactttgtatcaaattatcagcaatatgtacaaagaacga
gatgatttgcacatattgatacaaatgcttttatatttcgatgacgatgaatatgcggaa
aaaatacaaaattccatggaagaattacttttaataatagaaaaagataaatctgaaatc
tgggataaatctgcagcttcaagcttagcagaaatggaaaatacagaactcacgacgatg
aaagattcacaaggattctctacctgttacaaattagttgaatcttatattacacatcca
ccggtagctaattcttcaccttggaaattgaacatattttactaa

DBGET integrated database retrieval system