Theileria equi: BEWA_022600 Help Entry BEWA_022600       CDS       T02820                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K12604   CCR4-NOT transcription complex subunit 1 Organism beq  Theileria equi Pathway beq03018   RNA degradation Brite KEGG Orthology (KO) [BR:beq00001]  09120 Genetic Information Processing   09123 Folding, sorting and degradation    03018 RNA degradation     BEWA_022600  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:beq03019]     BEWA_022600 Messenger RNA biogenesis [BR:beq03019]  Eukaryotic type   mRNA surveillance and transport factors    mRNA cycle factors     P-body specific factors      BEWA_022600   mRNA degradation factors    3'-5' decay     Ccr4-NOT complex      BEWA_022600 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Not1 CNOT1_CAF1_bind DUF3819 CNOT1_TTP_bind Motif Other DBs NCBI-GeneID:  15806734 NCBI-ProteinID:  XP_004829078 UniProt:  L0AUZ2 LinkDB All DBs Position 1:complement(995180..1001767) Genome browser AA seq 2195 aa AA seqDB search MNSKQELGHTQGEGLAPANCTMESVIGDYTTVRDRLKSILSPKNIEEFHEILVGIKCNEG IDREVILKIDTLYEEIASGKCIVGDTPLTLMDIAECYIATLISYLHDILAIELILNILLY SNNTHLSNYSEQRLHELIFDFKLVIPLDKLKCKTALLPVLLKSTSLLKKKRISDCESRIN TGYELCKEILSSEEFLESIKEEKADLYNYMISLKFDNRSMKELTNKDNWLKTCLQLQHYV GSYSKGMPKFVDNLAKACKWIETKTDFGEEASFFKLITGKFFNPVFQIELLLTYVEEYAG EFYTEPKSSTDIDGFLKLVSNEDIKSVAWIIDTDVLPALLSLVYTKSNIERFKAWIDKVV KSGGKGTLLCKAMIYKLSLIWMNDQRVLTTKYNPIQLKLATMNPIYWHIYESCIQEFVTR NKLMAEIKNLSGESLKDKDCEVLYDFIFSIAINMPCECFFLILLEIMRLVDYDYDVINFT LQMYQSTVFEIFKSNSVRFSRGILEIVCYCRQTFDWGFMNLLIKSIDNLIETESDAFAKQ TLATGFIDYLEWKLTQIKSQSSLTNVKLYIPTCNIIAEIFYILHHVIGTDDVLVDIFFLY NEQYKSLNHYNILLLPLFKALEAKFEPLESFSVGDEETPADEAVRSVGAGDVLDLSDKVE LSIGLNRDVYGYLLLNDDAEVTTTHIIHLIFAGKMHTSILNAIKLLNNELESLRSQYILD LLLRKFVNRFHGILSLTMPSTFCFHFLQASPGTVTDDSSSTTNEKIADILKSLAIFSGSM VSLHLSGPHIDSIYLILRIILEALKRDDIFIVEFALQAILSIKNLHCYPAFVKELATNKR VEKICPGLYSVMSSTKGAVSGSVSEIETLEDSLIATDVISNIEKAVETVACVKDKLDKGD LKDRSTGLKILKPSIPSPPTDVHIDPIQGTPKSASVFFSIINLASNIRFKQFKVDVPWNQ EQLGMSNINATLDDFLNLLRADLNVPPADVESLNIINASFGTKQFIAHVERLVSSGYTDW LLFAIHRYAILHDESVFRDCIVFVSTLGGNRMMDALVRFSAYSINTFLKYLKSCRALLIY RKLLKISGSWLGALTVGRNKPLLTKHLDLKHLIIHAYENGMLTIIIPCVCRLLENITNSK NFKLPNPWTNSILGLLAEICTIKGLKSLLNNEVAALFTNLDFNPATSTCNILRHKVIADA DQSPKFGSAIWSYSGSCVSDSKIKIPPIHEEIRLLLKRKIALNPKVSNLSSHVPWHDLIL SAVETCYKESVTVIEKTVMTCMITCIEIIKLDFTQETPVDIVKRCISSMSSGLASSLVFV NSRDVLSSILSSQIYEKLAAIISGNSMDPKFHLSSGLEKIPNIPPQNLVEINNVGVEQIS RILAKDNIGLVCALVEQLTIELMTRCLEDIVNSWRGSKSIERKLPESLQIHSLDISSRLN LYKKFVYLVPSALTRMQGDAGKADKRHMGLRLPDYFIIPPIDNLPTSLILCKFDEFENRL KEAMKYLLMYPPIVPLATSKFYYTADTPSLLLLSCLPKDHQIFSLLWNMHYLFLRAGDVM ECFEVLINKVVKSITDAYKGVCVTTLVYEVELCLLEMLCMDSPNLLNVSSSMLPNLTFGK LILFLRFKLIKMSVLDCYLSNSGDVEFVAKIIYRLIVECSYVTVNDLPLSIQYLNQFDKG TIIHSVGAPIELKKLYERLINYKSEPSDKLRSLRYYMTEPGCSRNGSDVQIAELVNPRYI KMFADYVKGSDADRDRFFLNFTEQPIDGYIASTLLCALQMSYEPVGTEIKFDKVPQITHD APILDYCNIWSQMVIGFIQNDIFTLQKILHLILTIMNHKICFPLIAKIIENIIANLEGNN AHVSMAHFLISCSPSEMVEFGQYWLPIATSKAFLQHLIASPADWPLCSQILQQAILSPHS NATSITYLIVLLIQSAPEFICGYYLGLCDVLSPRNIKLRNLLTCPAPRNVKLPNPVNFED TIDVPPMVFTNHIQTILQRTTLKGLTDVFITKPTDKCFFGILRELKLQENLDLMLINHYT LYIGYTLPTLFHKLSNASANSHAITIVNCYKLLERLIHQCKGHIKHILLGSVMLHIRYPN STTFKFITFIKGLFEKGENSIQEHIILVILERLLTPKPHPWGIVNLLFQLVRDAKYKFWS HIQNNPQVEQHLKKIIQSYLVTNKPNDQAQQMGDH NT seq 6588 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaacagcaaacaggaactcggccatactcaaggcgaaggccttgcacctgcaaattgt actatggaatccgtaattggcgattacacaactgtaagagatcgcctcaagagtatactg tctccaaagaacattgaggagtttcacgaaatactcgtaggaataaagtgcaacgaagga atagatcgtgaagttattttaaaaattgatacgctttacgaagaaatcgcaagcggtaaa tgtattgtaggggataccccgctcactttgatggacattgcagagtgctacatagcaaca ttgatctcatacttgcatgatattttggctattgaactaattttaaacatcttattatat tcaaacaacacacatttgtcaaactatagtgaacaacgcttacacgaattgatttttgat tttaaacttgtcataccattggataaattaaaatgcaaaacagcgctattaccagtactg ctaaagagtacaagcttgcttaagaagaaaagaatatctgactgtgaatcaaggattaac accggctatgaactttgcaaagaaattctatccagtgaagaattccttgaaagtatcaag gaagaaaaggctgacttgtataactacatgattagcctcaagtttgataacagatccatg aaggaactgacaaacaaggataattggctcaaaacatgtttgcagttgcagcattatgtt ggatcatactcaaagggtatgccaaagtttgtggataatctagcaaaagcctgcaaatgg attgagacaaaaacagattttggggaagaagcttcttttttcaagctaataactggtaaa ttttttaatcctgtgtttcaaatagagttgctcctgacatatgtggaagaatatgctggt gaattttacactgagccaaaatctagtactgatatagacggattcttaaagttggtgtct aacgaagatataaagagtgtggcatggatcatcgacaccgatgtgttgccagccttgcta tcactggtatacaccaaatcaaatattgaacggttcaaggcatggatagataaagttgta aagtccggtggaaaaggcacgcttttatgtaaagctatgatttacaaactctctctaatt tggatgaatgatcaaagggtacttacaacaaagtataatccaattcagctcaagttggca acaatgaatcccatttactggcatatctatgagtcatgtatccaggaatttgtgaccaga aacaagctcatggcagaaattaagaacttgagtggcgaatccctaaaggataaagattgc gaagtgctctatgactttattttcagcatagcaataaatatgccatgtgagtgctttttt ctgatactcctggaaatcatgcgcctagtggattatgactatgatgtaatcaattttacc cttcaaatgtatcaatctactgtttttgagatttttaaatcaaatagtgttagatttagc cgtggtattttggaaattgtctgttactgccgccaaacatttgattgggggtttatgaac cttttgataaaatccattgacaacctcatagagacagagtctgacgcatttgcaaagcaa actttggctaccggatttattgattatctcgaatggaagttgacacaaataaaatcgcaa tcaagcttgacaaatgttaagctttatatacccacatgtaacataatcgccgaaattttt tacattttgcatcacgtcattgggactgatgacgttctggttgacattttctttttatac aatgagcaatataagagtcttaatcactacaacatactcttgctaccactattcaaagcg ttggaagctaaatttgagccactagagtcattttctgtgggagatgaagaaactcctgcc gatgaagcggtacgtagtgtaggagctggtgatgtgttagatctaagtgataaagtggaa ctttccatagggttaaatagggatgtatatggatacttactcctcaatgatgatgctgaa gttaccactacacatataatccacctcatttttgccggtaaaatgcatactagcatatta aacgctattaagttgttgaataatgaattggaaagtttgaggtcacagtacattttggat ttgctcctgcggaagtttgtaaataggtttcatggcatcttgtctttaacgatgcctagc actttctgctttcattttctgcaggcatcaccagggaccgttacagatgactcatcttca acgacaaatgagaaaatagctgatattctaaagtcattggccatcttttctgggtcaatg gtaagtcttcacttatccggaccacacattgactctatatatttgatattgagaataata ctggaggcattaaagcgtgatgatatctttatagttgaatttgcactgcaagcgatttta tccataaagaatttgcactgttacccagcctttgtaaaggagctcgccaccaacaagaga gttgaaaaaatttgcccgggtttgtattctgtcatgtctagtacaaagggggctgtctca gggtctgtttcagagattgaaactctggaagactctctaatagcgacagatgtaatttcc aatattgaaaaggccgttgaaactgtagcttgtgtaaaggataaattagacaagggtgac ctcaaggacagaagtactggcttaaagatattaaagccatccataccatcaccgcctaca gatgtacacatcgatcccattcaaggtacacctaaatctgctagtgtatttttctcaata ataaatttggcgtcgaacattaggtttaaacaatttaaagttgatgtaccttggaatcag gaacaattaggtatgagcaatattaacgctactcttgatgatttcctgaatttattgaga gctgatttgaatgttcctccggctgacgtggaaagtttgaacattataaatgcgtcattt ggtacaaagcagtttatagctcacgttgagaggttggtaagttctggatatactgattgg ttactttttgcaattcatcgttatgcaatacttcacgatgaatcggtatttcgcgactgc atagtatttgtctctactttgggaggaaaccgtatgatggacgctttggttagattctct gcatattcaataaacacatttttaaaatatttaaagtcatgtagggctcttttaatatat cgcaaacttttgaaaatatcgggatcatggcttggtgccttgactgttggtagaaataaa ccacttctaacaaagcacctggatttaaaacacctgattatacacgcatatgagaatgga atgctcacaatcattattccatgtgtttgtaggcttttggagaacattacaaattctaaa aattttaaattgccaaatccatggacaaactctattttgggtctcttagctgaaatatgc actataaaaggacttaaatcactgcttaataatgaggttgcagcacttttcaccaatctg gatttcaatcctgcgacttctacttgtaatatattaagacacaaagtaattgcagatgcc gatcaaagtccaaagtttggatctgcgatttggagttactctggatcgtgtgtttctgac tccaaaattaagattccaccaatacatgaggagattaggctgctactaaagagaaagatt gccttaaatccaaaagtatcaaacttgagttctcatgttccttggcatgatcttattttg tcagctgtagaaacgtgttacaaagaatctgttactgtgattgaaaagactgttatgaca tgtatgatcacttgcattgaaattataaagttggactttacacaggaaacaccagtggat attgttaagagatgtatatcttcaatgtcatctggacttgctagtagtttggtatttgta aattctcgtgatgtgttgtcttcaattctatcatcacaaatttatgaaaagttggcagct ataatttctggcaattctatggatccaaagttccatctttcgtctggtttggaaaagata ccaaacatacctcctcaaaatttggtggagataaacaatgttggagttgagcagatttct agaatacttgcaaaggataacattggactagtttgtgctctggttgaacagttaacgatt gagctaatgacaaggtgtcttgaggatattgtgaattcatggcgtggtagcaaaagtatt gaaaggaaactcccagaatccctgcaaatacattccctggatatatcttctcgtttgaat ctatacaagaagtttgtatacttggtaccgtctgcattaacaaggatgcaaggggatgct ggaaaggctgataaacgccatatgggtctccgtctcccagattactttataatcccacct attgacaacctcccaacatctctaatcctctgcaagtttgacgaatttgaaaatagactg aaggaagctatgaaataccttttgatgtatccacctattgtaccccttgcgactagcaag ttttattacactgcagatactccatctctactccttctgtcatgcctgccaaaggatcat caaatattctcgttgctatggaatatgcattatctgttcttgagggcaggtgatgttatg gaatgctttgaggttttaataaacaaggttgtaaagtccatcacagatgcatacaagggc gtttgtgtcacaacccttgtgtacgaggtggaactttgtctcttggaaatgctttgtatg gattccccaaatctgctcaacgtttcttcgagtatgcttccaaatttgacttttggtaaa ctcattctctttttgcgcttcaaactcatcaagatgagcgtgttggactgctatctttcc aacagtggagatgtggaattcgtcgcaaagattatttacaggctcattgtagagtgcagt tatgtgacggttaacgatttaccactctctattcagtatcttaatcagtttgataaggga accataatacactctgttggagcgccaattgagttgaaaaaactttatgaacggttgata aattacaagagtgaaccaagtgataagctgcgtagcttgcgctactatatgacagagcca ggatgctcgagaaatggaagtgatgtgcagattgcagaacttgttaatccaaggtacatt aaaatgtttgcggactatgtcaagggaagtgatgcagatcgtgatcggttctttttaaat tttactgagcaaccgattgatggatatattgcttctacgctattgtgtgcactccaaatg tcatatgagcctgtaggaacagaaattaaatttgataaagttccgcagattactcatgac gcaccaatccttgattattgtaatatatggtcacaaatggtgattggttttattcaaaat gacatttttacattacaaaaaattctacacttgatacttacaataatgaatcacaagatt tgcttcccccttatcgcaaaaataattgaaaacattatcgctaatttggaaggaaacaac gctcatgtatcaatggctcactttttgataagctgttcaccctcggaaatggtggagttt ggtcagtattggctgccaattgctactagcaaggcttttctgcaacatcttattgcatca cccgctgattggccactatgtagtcaaattctacagcaagccatactatctccgcattcg aatgctacatccataacgtaccttattgtcctcttaatacagagtgcacccgaatttatt tgtggatactatcttggtttgtgtgacgttttatctccaaggaacataaagcttcgtaat ttgctgacctgtccagcgcccaggaatgtaaagctcccaaacccagtaaactttgaggat acaattgatgtgcctccaatggtctttacaaatcacatacaaactatactccaaaggact acattaaagggtcttacggatgtctttatcacaaaaccaacggacaagtgcttttttggt attctaagggagcttaaacttcaggaaaatttggatctaatgcttatcaatcactatacg ctatacattggatacaccctccctaccctctttcacaaactctcaaatgctagtgcaaat tcacatgccattacaattgtgaactgctacaagctcctagagaggttgatccaccagtgc aagggacatataaaacacattctacttggaagtgttatgctccacattagatatccaaac agcacaacctttaagtttataacgtttataaagggcctatttgaaaagggtgaaaacagc attcaggaacacattatacttgtaatcttggaacgtttgctcacaccaaaaccacatcca tggggaattgtaaacctcttgtttcaactcgtaagggacgccaagtacaagttttggagt cacattcaaaacaatccgcaagtggaacagcatctcaagaagatcattcagtcatatctt gtcaccaataagcctaatgaccaggcacaacaaatgggcgatcattga

DBGET integrated database retrieval system