Caloranaerobacter azorensis: G3A45_03945
Help
Entry
G3A45_03945 CDS
T06467
Symbol
recJ
Name
(GenBank) single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ
KO
K07462
single-stranded-DNA-specific exonuclease [EC:3.1.-.-]
Organism
cazo
Caloranaerobacter azorensis
Pathway
cazo03410
Base excision repair
cazo03430
Mismatch repair
cazo03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cazo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03410 Base excision repair
G3A45_03945 (recJ)
03430 Mismatch repair
G3A45_03945 (recJ)
03440 Homologous recombination
G3A45_03945 (recJ)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cazo03400
]
G3A45_03945 (recJ)
DNA repair and recombination proteins [BR:
cazo03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
RecJ
G3A45_03945 (recJ)
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecFOR pathway proteins
G3A45_03945 (recJ)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
RecET pathway
G3A45_03945 (recJ)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RecJ_OB
DHH
DHHA1
tRNA_anti-codon
tRNA_anti_2
HTH_28
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIB26534
UniProt:
A0A6P1YBR1
LinkDB
All DBs
Position
complement(720340..722880)
Genome browser
AA seq
846 aa
AA seq
DB search
MIRYDKFIKLYNEDYSNVNEISSAFGISSITAKVLINRGIKTVEECKNFINVSLENLYNP
FLLKDMDVAVERIINAIQKNEQIWIYGDYDVDGITSTTILKLYLQKIGCNVNYYIPDRMT
EGYGVNKDAIDYIVDKGGQLIITVDCGITAIDEVKYCNEKGIEIIITDHHLCKEEIPNAL
AVINPNRKDSDYPFKKLAGVGVAFKLIQAISNKLNIEIPIREILPIVAIGTVADVVSLTG
ENRILVKEGLALINQTENIGVKALLEVTGLKDKDITVGHVGFVIGPRINAAGRLGSAKTG
VELLTCKSKEKALSLAVELDRINRERQEIEMQILKEAEEIIKNDSRYEKEKVLVIAKENW
HHGVIGIVASRICEKYFKPCILIAIEGNQGRGSARSIPTFDIYEGLSRVSEFFNKFGGHK
QAAGLSINTEKIEDFRKGINEIAEELLMEEDMIDEIKVDDVLKIKDIDYKIIDELKLLKP
YGIGNPSPLFISKDVKLINIKAVGSEGKHLKFSIEDEENVVDCIGFNLGYKMQYIKEGDR
VDIVFLPDVNIYMNETKIQLNIKDIFIRNKISNDIEEKYYLDFIYNLKEKRNNTISNPDN
KIIIKKVDDRIRYLIGFLHNNDNTLVIINNLLNAKRVINELYFQGREFNKRISINIGDEF
KIRTNTLLISPLYRGYDLSVFDKIIFFDICFDEIDFFDIIKKLIYKEVYLLFDEEDFKMN
QVLLNDFIPKLIELRIIYKTFLLNKKNVFKIDIESYFNYLNKNFKIKINRSKFIFILEVL
KDSNLIEYKIVQNDYYIKLKQKPKDNIEILEIPVYKSANFLLDNQKRMKNTFLNLFELKK
EEMLWI
NT seq
2541 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataagatatgacaagtttataaaattatacaatgaagattacagtaatgtaaatgaa
attagcagtgcttttggcatatctagtataactgcgaaagttctcataaatagagggatt
aaaactgtagaagaatgtaaaaattttattaatgtaagtttagaaaatctatacaatcct
tttttgcttaaagatatggatgtagctgttgaaagaataattaatgcgattcaaaaaaat
gagcagatatggatttatggagattatgatgtggatggaattaccagcacaacgatttta
aagttgtatttacaaaagataggctgcaatgttaactattatatacctgataggatgaca
gagggatacggtgttaataaggatgctatcgattatatagtagataaaggtggacaactt
attattactgtcgattgcggtattacagctattgatgaagtcaaatattgtaatgaaaaa
ggtattgagattataattacagatcatcacttgtgcaaagaagaaatacctaatgctctg
gcagtgataaatcctaatagaaaagatagcgattacccttttaaaaaattagctggagta
ggggttgcatttaaattgattcaagccatatctaacaaattaaatattgaaatccctata
agagaaatattacctattgttgcgatagggacagtagcagatgttgtttcgctaacaggc
gaaaataggattttagtaaaagaaggtttagcattaattaatcaaactgaaaatatagga
gttaaggctttattagaagtaactggattaaaagataaagatataacggttggacatgta
ggatttgtaataggcccaagaattaatgcagctggaagattaggttctgctaaaactggt
gttgagcttttaacgtgcaaatcaaaagaaaaggctttatcactagctgtagaattagat
agaataaatagagaacgtcaggaaatcgagatgcaaatattaaaagaagcagaagaaatt
attaaaaatgatagcagatatgaaaaagaaaaagtgcttgtaattgcaaaagaaaattgg
catcatggtgtaattgggattgtagcatcacgaatatgcgaaaaatactttaaaccatgt
attttaatagcgattgaaggtaatcaaggtagagggtcagctaggagtataccgactttt
gatatatatgagggattaagtagagtaagtgagttttttaataaatttggcggacataaa
caggctgcagggttgtcaattaatacagaaaaaattgaagactttaggaaaggaataaat
gagattgccgaagaattacttatggaagaagatatgattgatgagataaaagttgatgat
gtactaaagattaaagatatagattataaaattatagatgaattaaaattattaaaacca
tatggtattggtaatccttctccgttatttattagtaaagatgtgaaacttatcaatatt
aaagcggttggttctgaaggaaaacacttaaagtttagtattgaagatgaagaaaatgtt
gtggattgtataggttttaatttgggttataagatgcaatatattaaagaaggcgataga
gtagatattgtatttttacctgatgtaaacatatatatgaatgaaacaaagattcaatta
aatataaaggatatatttattaggaataagattagcaatgatattgaggaaaaatattat
ttagactttatttataacttaaaagaaaaaaggaataatactatttctaatccagataat
aaaataatcattaaaaaagttgatgataggataagatatttaattggatttctgcataat
aatgataatactttggtcataataaataatttattaaatgcaaagagagtaattaatgag
ttatattttcaagggagagagtttaataaaagaatatctattaatattggggatgaattt
aaaattaggacaaatacgttactaataagtccgctatatagaggatatgacttaagtgta
tttgataaaataattttttttgatatttgttttgatgaaatcgatttttttgatataata
aaaaagctaatatataaagaagtatatcttttattcgatgaagaagattttaaaatgaac
caagttcttttaaatgactttattcctaaattaatagaattgagaattatttacaaaaca
tttcttttaaataaaaagaatgtatttaaaattgatattgaaagttattttaattattta
aataaaaattttaaaattaaaattaatagaagtaaatttatttttatacttgaagtatta
aaagatagtaatttgattgaatataaaattgttcaaaatgattattatataaaattaaaa
cagaaaccgaaagataacatcgaaatattagaaatacctgtatataagagtgcaaatttt
ctattagataatcaaaaaagaatgaagaatacatttctaaatttatttgaattaaagaag
gaggaaatgctatggatttaa
DBGET
integrated database retrieval system