Candida dubliniensis: CD36_64860
Help
Entry
CD36_64860 CDS
T01140
Name
(RefSeq) subunit of the CCR4-NOT transcriptional complex, putative
KO
K12604
CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
CD36_64860
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cdu03019
]
CD36_64860
Messenger RNA biogenesis [BR:
cdu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
mRNA cycle factors
P-body specific factors
CD36_64860
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ccr4-NOT complex
CD36_64860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Not1
CNOT1_CAF1_bind
CNOT1_HEAT_N
CNOT1_TTP_bind
DUF3819
ARM_Cnot1
CNOT1_HEAT
NOT1_connector
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8048635
NCBI-ProteinID:
XP_002421182
UniProt:
B9WJC0
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(958274..964210)
Genome browser
AA seq
1978 aa
AA seq
DB search
MSFKELLIEIGPENLLPEKLLPSLLQIKPNEIDQGIALILAEILIPGSQGLSQGLTFASS
LPGSNAKGAQLQACFKSIESSGKFNVNWYEVFNHVHQYLFDSSQRDIQPSVGSITQFLSS
LDFKQEPIDIFLNYEWWFNKTLLYILHSSDASQGGYDISLSPNLAYCFEEDKNTPQTRRN
ILKFINVGKLEIQVITKIQQQQQQQHQLSEQDKKLNTFLNQLFEHDYRVFPEYILAAALT
VVEKSQFINDLIDTLFYLLVDSASPSLPKVVRLLKESGLAAVKLADYYKSRKTIAAADKV
LTLASSFELTQEILDIFWAFDSKIAIKLLVESSLFGYDYKSVIESKLKDPQAKTSIYQAL
CEALDERAQKDYERGQQVQQAQQLQQQQALPPHQVLKIPTVYYLLEKIKSSNGVIDAKTL
RNLQLLLLTTYPRLINFGNGHDEAILANEEKSPFFPPTVEMEMKAYYSKMYNKELEIKEI
VDMLTQMKASDDLHSQDVFACMIHSLLDEYKFFSEYPLSALASTSLLFGALLEKDLIQGT
TLTVALNFIWESCNQPQDSHLFKFAVQSLYNFKSRLHEYPIYCKHLLECRSLSAHAKMYQ
IVKDAANGIPCATGAAPTQTNTPEVGPKYQSINYVDRTIGYATQEGPPESIRDKLLFSVN
NMTGENLRLSEIQEVLTESYFAWFSDYLVSDRAKAEPNNHELYSTLVKSLGNPIFFEYIL
NVSLKEVDHIIRNFKDSRSERNQLKNLGAWLGRITLANDKPLRRDYIALKFLLVEAYDFN
SLPLILPFVCKILDQAQYSKVFKPPNPWVVGVMKVLSELYECADLKLQLKFEIEVLLNSF
NMKIKDIEQSTIIRNHNPEPAALARMFGISSQSVNLANEMTKLSLEGSQLANNMQAPFPQ
QIIESKQFPGISQPQMQNVLQQQQNLPPQQQLQGQLPPQQQAEPALDTSFSTLIGNSIFT
QHANLRRAFQASLSRAVRECTPHICNKVVETVVTTTKALITKDFATERDVEKLRNSYHKL
ALSLSHAMVSCNGRKALVETIEATMLQLLGNNPNEVPLAELNNAIQANVGLCVDIVDVLV
GESILDLIEARMQTEVFLREHHNATVPNEPFIEEGASEYSLRLPNPLGLAPTGLSTQQLK
IYEHFGETRVDQIVPPPGSAAITQQQPQSLAPLQQQSQAPAGVGVGAVAPPPQQQKERVV
AQAQGVPDDIVSFEQLFAAITANCDKAVQLVSEVTETKLADLPPNHSIMAALTQALVIAQ
SNAIKYPELLLKAAQYAVNCLFTQAHENPMSNEIYVVILDKLCEYSPSTAKDVIWWLVHS
SDQRKFNMPVMLSLLKVQLIQPIKLDLSIGKLIKETNNPVVVKFAASLLTNIFTSEDMRP
IALRSEFANTLDALSKYQGNDQSDEHRQAKEATSTLFKLLNEAAPASNQLFAQLGYIFAE
WVRLLTHGDEATHELQIEFVKGLIQAGILNNPEYVKTFFKAAIEISITSFATEHELRSRT
QHETYLAVDTLAMLIVRIVLLIEDSKQAIDYLKKVLGIIILNLINDHETSKANWNERAYF
RFFSSLLSTWCDASVLDEEATVNLDVEFYNYLGELFNALQPIVIPGFTFAWISLISHRMY
LPKLLELPERKGYSTLVKLLSSALKFQQVYGNKQSSRQHEHEHEQEQEHEQKDEKEKQEN
SQQGPDVINVTYKAINRIFIGILHDFPEFLVECHYQLVTNIPRGYIQLRNIVLSATPKDI
HVPDPFTQGLKVERLPEINESPVVFYKPIEDLSKVGLKKPVENFLRIPAPGLMRTIYNGL
KLNQPKEVNDLGYEETIHFNIKLINALVLHVGISSVADRLPNNRGFNTKSSQVALLVDLM
NYGNTEFKYHLINAIANQLRYPNSHTHWFIGIILHFFSNNNIWNSNSNKLVVQEIITRVL
LERRISNKPHPWGLTILFTELVKNGDYGFFELPFVKDSVEEVKNIFNVLSVNVKGSTP
NT seq
5937 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcattcaaggaattattaatcgaaattggtccagaaaatttattaccagaaaaattg
ttaccaagcttattgcagattaaaccaaacgaaattgatcaaggcatagcattaatatta
gctgaaatattaatacctgggtctcaagggttatcccaaggattgacttttgccagtagc
ttaccaggttcaaacgccaaaggtgctcaattacaagcatgtttcaaatctatcgagagt
tccggaaaattcaatgtcaactggtacgaagtgtttaatcacgtgcatcaatatttattt
gactcgtcacaaagagatatccaaccatcagttggcagcattacccaattcttatcgtca
ttagatttcaagcaagaaccaatagatatatttttgaattacgaatggtggttcaataaa
acattgttgtatatcttgcactcactggatgcatcgcagggtggttatgatatatcgttg
ctgcctaatttagcttactgttttgaggaagacaaaaacaccccccaaactagaaggaac
attttgaagtttatcaatgtcggtaaactagaaattcaagtaataaccaaaatacaacag
caacagcaacagcaacaccaattgagtgaacaggataaaaaactaaacacttttttaaac
caattattcgagcatgattatcgtgtgttccccgagtatattttggctgcagcattaact
gtcgttgagaaatcccaatttataaatgacttgattgataccttgttttatttgttggta
gatagcgcaagtccttcgttgcccaaagtagtacgtttgcttaaggaatcagggcttgca
gccgttaaattagctgactactacaagagcagaaaaaccattgctgcagctgataaagtg
ttgaccttagcatccagttttgagttaacccaagaaatattggatatattttgggcgttt
gacctgaaaattgctatcaagcttttggtagaatcaagtcttttcggatacgactacaaa
tctgttattgaatccaagctcaaggatccacaagccaaaacatccatttatcaagcattg
tgcgaagcattggacgagcgtgctcaaaaagattatgaaaggggccagcaggttcagcaa
gcacaacaacttcaacaacaacaagcgctcccacctcatcaagttttaaaaatccccact
gtttattatttgctcgaaaaaataaaatcaagcaatggggttattgatgctaagacattg
agaaaccttcaattgttgttgttgacaacttatccaagattaattaattttggaaatggt
catgatgaagccattttagccaacgaggagaaatctccttttttcccacctaccgttgag
atggaaatgaaagcttactactctaaaatgtataacaaagagcttgagatcaaagagatt
gttgatatgttgactcaaatgaaggcaagtgacgatctccacagtcaagatgtctttgca
tgcatgatacactcgttactagacgagtataaatttttctccgaatatccgttgtcagcg
ttggcttcgacatctttgttgtttggggcgcttttagaaaaagatttgattcaaggtaca
accttgactgttgcattaaatttcatttgggaatcctgtaatcaaccacaagattcacat
ttgttcaaatttgccgtgcaatcattgtacaacttcaaatcaaggttgcatgaatatcca
atttattgcaaacatttgttggaatgtcgttcattatctgcccacgctaagatgtaccag
atagtaaaggatgcagctaatggtataccatgcgccactggtgcagctcctacccaaact
aatacaccagaggttggtccaaaatatcagtccattaattatgttgacagaactattggt
tatgcaacccaagagggaccgccagagtccatcagagataagttgttattcagtgttaac
aatatgacaggtgaaaatcttagattatccgaaatccaagaggtattgactgagagctat
tttgcgtggttttcagactacttggtgtcggacagagccaaggcagagccaaacaaccat
gaattatattccacgttggtcaagtcgttgggcaacccaatattttttgagtatattttg
aatgtttctttgaaagaggttgatcatatcattcgtaattttaaagattcaagaagtgaa
agaaaccaattgaagaatttaggtgcttggttaggaagaatcacattagccaacgacaaa
ccattgaggagagattatattgcattaaagttcttgttagtggaggcatatgatttcaac
tcattgccattgattcttccctttgtgtgtaaaatcttggatcaggctcaatattcaaaa
gtgttcaaaccaccaaacccttgggttgttggggttatgaaggttttatctgagttgtat
gaatgtgcagacttgaaattacaattaaaatttgaaattgaagtgttgttgaattcattc
aacatgaagataaaagatattgaacaaagtactattattagaaaccacaaccctgaacca
gctgcattggcgagaatgtttggtatcagttcacaatcagtgaatttggctaatgaaatg
acaaaattgtctttagaaggttcgcaattggctaacaacatgcaagcaccattcccacaa
caaataattgaatctaaacagttcccgggaatttcccaaccgcagatgcaaaatgtttta
cagcaacaacaaaatttaccaccacagcaacagcttcaaggacagttaccaccacagcaa
caagcagaacctgcgttggataccagcttcagcactttaattgggaattccattttcacc
cagcatgcaaatttgcgaagagcattccaagcatctttatctcgtgctgttagggaatgt
actccacacatttgtaacaaagttgtggaaactgttgttactactaccaaagctttaata
actaaggattttgccacagaacgtgatgttgagaaattgcgtaacagttatcacaaattg
gcattgctgttatctcatgcaatggtgtcatgcaatggaagaaaagcattggtagaaacc
attgaggctactatgttgcagttgttgggaaacaatccaaatgaagttcctctagctgaa
ttgaataatgccattcaagctaatgttggcttatgtgttgatattgttgatgtgttggtc
ggggaaagtattcttgatttgatagaggcaagaatgcagacagaggtatttttgcgtgaa
catcataatgccacagttccaaatgaaccgtttattgaagaaggggctagtgagtactcg
ttgagattaccaaatccattagggttagcgcctactggattgagtacacaacaattgaag
atttatgaacatttcggagaaacaagagtggatcaaattgtaccccctccaggaagtgca
gctataacacaacagcaaccacaatcattggcaccattacaacaacaatcacaagcgcca
gctggtgtaggggtaggagcagtagcaccaccaccacaacaacagaaagaacgtgttgtt
gcgcaagcacaaggtgttcctgatgatattgtttcctttgaacaattgtttgctgctatt
actgccaattgtgacaaagcagttcaacttgtttctgaagtcacagaaaccaaattagca
gatttgccaccaaaccattccattatggcagcattgactcaagctttagttattgcacaa
agcaatgccataaaatatcctgagttgttattaaaggctgcacaatatgcagttaactgt
ttgtttacccaggcgcatgaaaacccaatgagtaatgagatttatgttgttattttggat
aaattgtgtgaatattcgccttctacagccaaggatgttatctggtggcttgtacactca
tctgatcaacgtaagtttaacatgccagttatgctttcattattaaaggttcaattgatc
caaccaattaaattagatttatccattgggaagttgattaaagagacaaacaatccggtt
gtggtaaagtttgcagctagtttgttgaccaatattttcacatcagaggatatgcgtcct
attgcgttacgatcagagtttgctaatacattagatgccttatctaaataccaaggaaat
gatcaaagcgatgaacatagacaagcaaaggaagcaactagtacattgttcaaactcttg
aatgaggcagcaccagcgtcaaaccaattatttgcccaattgggttatatatttgctgaa
tgggtaagattgttgactcatggagacgaggcaacacatgaattgcagattgagtttgtc
aagggattgattcaagcaggtatactcaataatcctgaatatgtaaagacttttttcaag
gcagctattgagatttccatcacttcgtttgccactgaacatgagttacgttcaagaact
caacatgaaacgtaccttgctgttgatactttggctatgttgattgttcgaattgtttta
ttgattgaagattctaagcaggccattgactatttgaagaaagtgttgggaataatcatt
ttgaatttaattaatgaccatgagacttcaaaggctaattggaatgaacgtgcgtatttc
agatttttctcatctttgttatcgacatggtgtgatgcttcagttttggatgaagaagct
actgttaatttagatgttgaattttataattatcttggtgaattattcaatgccttgcaa
ccaattgttatacctggatttacctttgcttggatttcattgatttcgcatcgtatgtat
ttgcccaagctattggaattaccagagagaaaaggatattcaacattggtcaagttgttg
agttcggctttgaaattccaacaagtttatggtaacaagcaatcatcgagacaacacgaa
catgagcatgaacaagaacaagagcatgaacagaaagatgagaaagagaaacaagaaaac
tcacaacaaggacctgatgtgatcaatgtaacctacaaggctattaacagaattttcatt
ggtattttacatgatttccctgaatttttagtagaatgccattatcaattagtgactaat
attccgaggggatacattcaattaagaaatattgttttatcggctactcccaaagatatc
catgtaccagatcctttcactcaagggttaaaagttgaaagattacctgagatcaatgaa
tcaccagtagtattttataaaccaattgaagatttgagtaaagttggattgaagaaaccg
gttgagaactttttgagaattcctgcgccaggattgatgagaaccatttataatggatta
aaattgaatcaacctaaagaggttaatgatttgggatatgaagaaacaattcatttcaat
ataaagttgatcaatgcgttagtgttgcatgttggaatatccagtgttgctgatagatta
ccgaacaaccgaggatttaacaccaaatcatcacaagtggcactattagttgatttaatg
aattatggaaacactgaattcaagtatcatttgatcaatgctattgctaatcaattgaga
tatccaaatagccatacccattggttcattggtattatcttacatttcttcagtaataac
aatatttggaacagtaatagcaataagttggttgtacaagagattatcaccagagtttta
ttggaaagaagaattagcaataaaccacatccttggggattaactattttatttaccgaa
ttggttaaaaatggggattacggattttttgaattaccatttgtcaaagattcagttgaa
gaggtgaagaatattttcaatgttttaagtgtcaatgttaaagggtcaactccttag
DBGET
integrated database retrieval system