KEGG   Cryptosporidium hominis: Chro.60241
Entry
Chro.60241        CDS       T00210                                 
Name
(RefSeq) transcription regulatory protein
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
cho  Cryptosporidium hominis
Pathway
cho03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cho00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    Chro.60241
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:cho03019]
    Chro.60241
Messenger RNA biogenesis [BR:cho03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     Chro.60241
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     Chro.60241
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind DUF3819 CNOT1_TTP_bind ARM_Cnot1
Other DBs
NCBI-GeneID: 3415310
NCBI-ProteinID: XP_667454
LinkDB
Position
6
AA seq 2661 aa
MVEKNLPCGEDIPKRQLFEIIKEIGPSSTSNQENFDEILLGWINDSSNFKREIATSFIYM
LNDTSKYNKDPKYKEKGSDDFSEVLRARWNELSNNKNDQNLLIQSSREDIRLGWNSSVFV
EGVNKIMKIQESKNKQFNTNWNDIIDEIIDKSDLLDLTDNDGSFELFCSLLGESYRRDEN
KVYKPKYNELYYKLDPFLKEWKNPDIQALFLLKICKTSYEINNRSYNLHQKDYSSDILED
TLIENAVNFDSVYTNMSNYSIILDASLRIHNSIVSMFESDESILELIKDGLLGTPCDDIF
KSKLPKIGIFHTKGSCGLLICHDLLRAIINIYNRINNQRLLELLQHLIFYEIPRYSPIGL
LSSLGAIYDDLPQTVSVSSDLANKISESFDILVPNNKVTKVSLIKMAIYSAQEFIIFPIS
KIVATSHEKEYDIGPRFGVIMQIIFASSEKHRNGNSQSQFMRDFISQIAFCYRISSVFLI
SKLNSLSRSYLWKFLDSEWKTLPQFYKMNVSDCLSQILSRDKLDLLKDSEYSHESIDYYH
WWFLCIDIVFSGISISQNSELGLSSSICDEISSHAVNVLFTLFKEELEGKNIETPLFIIA
IMDYIRARLVYMTYASAELQTILVNRRTSLPFFSVDKAASFKVFAARVVRRNLSLGSSQL
YQPKECWISSLETPSFKFSCWRISSSSILAIQEAILKFGVSTKGYESTPISELHDALLEF
EKIKDKNNSQDKNNSLGSINKDVSSEIMLNSSVNEKDEKTLNNISQTLFTNNDSEHKNST
KINSKSELIEAENEGNGFEINQVNDFLTKCYLGEVNTSELTVELKKMHSLSNHPGKNVKI
FNTFLQTLFDECRSYPKYPNPELKITAEILGILVKEDLLISFGNALVFVLRCIIEALRKG
HWTKMFCFGVFAMEMFIDRFISFPQFLSAIINMSQHLKHAIEPYVTYCESCIAILPENLK
NKLYIERSVMESLNLDIPPKPESLISKVHPEMINFEFRQKETSESPCKPNMSIDKLGSFI
TLNLSERKVLPTGITIDQLQGFGLGSLEKLMNDPEILNALVTPSENVIEHIFTICNTLAS
TNIETKAIEMADILNKNPEYCHWFAFYLVKNRASKEKNNHSTYINFLIKLDKLMPKNSDL
LLEEKTESDIPLTHKGNEESKINIIEITTLASYDCIKALLRYASILNDVSSFLNVLRHLG
YWLGQITIGINRPIIHKYLNPRQLLIDSYSRGCIASVLPFICKILENIKGSYYYPPNPWT
NNILYALAEIHSLANNSNSHMFEVELLFKQLELNLDDYVGKSNYLGLSSHTDYIEHKALG
EKQRGHNIYPKTQTEHNSHITLGSSFERPNTINVINSSLNQSASLYQLSANIGDAQLAST
FMPPNHSSQMMHQQTPQQIPSSDIQFWANKVLISPSIVLFQIQPSLRPLVPLALDRSIRE
ILQVVIPRSVRIAAITTKEIIGKEFAFEADENIYKRAAHLMVAALSGSMAIAACREPLRV
AFTAQLRQVLHPTPSRDGEDHVLIEQVVQVICSDNIDLGCQIIEQAVVEKAIEELDEVIS
PGIIARRKSRETGHQFVDTDFYGGPNTQNSATFWSSLPENLKYRHNSMRHLQLYKDFLQF
TLMRNLERRDSVTQYELQNSLQSNQITPLYQHGSNDQFNSQTQQWNNSNAIQFSHQAESI
QNFNTVRSDNTSSQMPSSNHSQMNTSSSTIVQPPEPVRVPLVFELAYLPLMMRVDECLGQ
IKDVIREIALYPPIFSKQLIPPVSNNLSEGMSVNQNVYSKPLGSNILTYTPKSTAHPVLS
VLSSLQSDHILFYLCRVLYSIGKSASQREDVLIGISQKLFKTLFDAGAAFQQSTTGILPS
SRCIASSLGFDAALLHIEVFLALCNQISYYSSKFWLKLRKEAIGWFIYTIEDPKYSVDIV
IGALRYDLISSDELDVSLSNILETAISTLNDSNPAIGGNSRCLRIVEFIYKLFFRSIEDW
HYPITKKLPSTTKNLNRLSNNSVAFQNSNFSAIPIVLPGLYYKPYSYTTNLGELKNKVES
ILLELESNKSITFHEMWIGDQCPEILNFYSVIQCNLDTILNPRYIALPTPIKPPPDISKG
INTIFDEWILLLRITIFNGVGGSERNNPYRNLFLQRLSRQGLLRMDDTTEKLFTVCIERA
IYLSLNHDSDSDALNNSISENAYDSRNMDPFPIDSLVRLITTMARYVDPQQMAAVVITHK
FLSILTRVIHKDAESHGFNQRPYYRIFYSLLQEYESIGFNTEMIHFTCILSVVHHLQYLN
PNRVPGFAYSWIQIISSNRFFPYLLRHVKGWQPYQALLLQIFIFISPFLRSVQLSSNIKT
IYGALLRILLVLLHDFPEFLCDYSCSFCDVLPVNCIQIRNLILSAFPRNMKLPDPFLPTL
KIENLPEMKLIPRMIANYGAYILYKDLKVNIDKFWITRDASILPLITETIKMPRDEALKC
GTKYSFPIITGLLLYIGIYLPNGNESNSSIDGSHNGIFNVFNSDPSTNSIESASKLDQTP
NLKSDQLETFEDPSLSIILFLCKDLDMEGRFVLISAITNFLGYPNSYTYYFSSLILWLFS
KSNDSIVQEQITRILLERLIVHRPHPWGLLITFIELIKNPKYAFWSCSFVHLAPEVEKLF
QSVAQTCLGQAPNKTNLVNHT
NT seq 7986 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtagaaaagaatctcccttgtggagaagatattcccaagcggcaactttttgaaata
ataaaggaaattggcccaagcagcacgtcaaatcaagaaaactttgatgagattcttcta
ggatggattaacgactcaagcaactttaaacgcgagattgccacttcattcatttatatg
ctcaatgatacatcaaaatacaataaggatccaaaatataaagaaaaaggcagcgatgat
ttctctgaagttctaagagctagatggaacgagctgagtaataacaaaaatgaccaaaat
ttattgattcaaagctctagagaagatattaggctggggtggaactcttccgtttttgtg
gaaggagtgaacaagataatgaaaattcaagagtccaagaataagcaatttaatactaat
tggaatgacattattgacgaaatcattgataaaagcgacttactagatctaactgataat
gatggaagcttcgaattattttgttcacttttaggtgaatcatatcgaagggatgaaaat
aaagtttataaaccaaaatataacgaactgtattataaattagacccttttttaaaagaa
tggaagaatcccgatattcaagctctttttcttttgaaaatctgtaaaacaagctatgaa
ataaataacaggagttataacttacatcaaaaggactattcaagtgatatattagaggat
acattaatagaaaatgcagtaaattttgattcagtctacactaatatgagtaattactca
attatattagatgctagcttaaggattcataattcgattgtttcaatgttcgaatcagat
gaatccattttggaactcattaaagatggtttactcggaaccccttgtgacgatatattt
aaatctaaattaccaaagattggaatctttcacactaaaggttcatgtggattattaatt
tgtcatgatttgctaagggccatcattaatatatataatcgaattaataatcagagatta
ttagagctccttcaacatcttattttttatgagattccaagatattctcctattggccta
ctctcatctcttggagcaatttatgatgaccttccacaaaccgtttctgtatctagtgac
ctagctaacaagataagtgagtcgttcgatatattagtgccaaataataaggtcacaaag
gtttcgttgattaaaatggcaatttacagtgctcaagagtttattatatttcctatttct
aaaatagttgcaacttctcatgaaaaagaatatgatattggtcctcgttttggagtgatt
atgcaaatcattttcgcctcttcagagaaacacaggaatggtaatagccaatcccagttt
atgagagattttatcagccaaattgcattctgttacagaatttcatctgtttttctaatt
tcaaagttgaactccctctcgaggagctacctttggaagttcttggactctgaatggaag
accttacctcaattttataaaatgaatgtttctgattgtttgtctcaaattttgtctaga
gataagcttgatttattgaaagattcagaatattctcatgaatcgatcgactattatcat
tggtggtttctttgtatcgatattgttttttctggaattagtatatctcaaaattccgaa
ttggggttatcttctagtatatgtgacgaaattagctctcacgctgttaatgtccttttt
actctatttaaagaagaactagagggtaaaaatattgaaactccactatttattattgct
attatggactatatccgggccaggcttgtatacatgacttacgcttcagctgaacttcaa
actattctagtaaatagaagaacatcattacctttcttttcggttgataaagctgcaagt
tttaaagtttttgctgcaagagttgttcgtaggaatttatctttaggttcatctcagcta
tatcagcctaaagaatgctggatttcttcgcttgaaactccctcattcaagttttcctgt
tggcgtattagctcatcttctatcctcgcgattcaagaagcaattttgaagtttggagta
agcactaaaggatatgaaagcacccctatctctgagcttcatgatgctttacttgaattt
gagaagattaaagataaaaataattcgcaagataaaaataactccttgggctctattaat
aaagatgttagctccgaaattatgttgaattcttccgtaaatgaaaaagatgaaaaaacc
cttaataatatttcacaaactttattcaccaataacgattcagaacacaaaaactccaca
aaaattaatagtaaatctgaactgatagaggctgaaaatgaaggaaatggatttgaaatc
aatcaagtcaacgattttctaacaaaatgttatttaggtgaagttaatacatctgaatta
acagttgagttgaaaaaaatgcactctctttcaaaccacccaggtaaaaatgttaaaatc
ttcaatactttccttcaaacgttatttgatgaatgtagatcctatcctaaatatcctaat
ccagagcttaaaattactgcagaaattcttgggattttagttaaggaggatctacttatt
tcatttggaaatgcactagtgtttgtattgcgatgcattattgaagcacttagaaaaggg
cattggaccaaaatgttttgttttggagtatttgctatggaaatgtttatagacagattt
atttctttcccccaatttctctctgcaataattaatatgtctcaacatttaaaacatgca
atagaaccgtatgttacttattgcgagtcttgtattgccatccttccagaaaatctaaag
aataagttatacattgaaaggagtgtaatggagtctcttaacttagatatcccaccaaaa
ccagaaagtcttatttcaaaggtgcacccagagatgatcaactttgaattcagacaaaag
gagactagcgaaagtccttgtaaaccaaatatgtcgattgacaagcttggaagttttatc
accttaaatctttcagaaaggaaggtgcttccaactggaattacaattgatcaacttcaa
ggctttggtttgggtagtttagaaaaattaatgaatgatcctgaaatattaaacgcgcta
gtaactccctccgaaaatgtaattgaacacattttcacgatatgtaatactcttgcgagc
acgaacatcgaaactaaagctatcgaaatggctgatattctaaataaaaacccggaatat
tgtcattggtttgcgttttatctcgtgaagaatagggcatctaaggaaaagaataaccat
tctacatatatcaacttcttaattaaattggataaactgatgccaaaaaattcagattta
ttgctcgaggaaaaaactgaatcggatattccactaactcataaaggaaatgaagaaagt
aaaataaacataattgaaattactactcttgccagttatgactgtattaaggctttgctg
cgatatgcaagtatattgaatgatgtctcctcattcttaaatgtactacgtcatttaggc
tactggctagggcaaattacaataggaattaaccgtccgattatccacaaatacctaaac
cccagacaattgcttatagatagctattctagaggttgcatagcctctgtcctacctttt
atttgtaaaatattggagaatattaaaggaagctactattatccgccaaacccttggaca
aacaatattttatatgcactagccgaaattcattcgcttgcgaataattcaaactctcat
atgttcgaggtagaacttttatttaagcaactggagcttaatctagatgattatgttggt
aagtcaaactacctaggtttgagcagccatacagactatattgagcataaggctctggga
gaaaaacaaagaggtcataatatttatccaaagacccagacagagcataattctcacata
actttaggaagctcatttgagcgtccaaatactattaatgtaattaacagctctttaaac
caatctgctagcttatatcaactaagtgccaatattggagatgcacaacttgcctcgacc
ttcatgccgcctaatcattcatcccaaatgatgcatcaacaaactccacagcagatacca
tcatccgacatacaattttgggccaacaaagtactaatttctccctctattgtattattt
cagatacaaccatcgctcaggcctttggtaccactagctttagacagatcaataagagaa
atactacaggttgtgattccaaggtcagttagaattgctgcaattactactaaagaaatt
atcggcaaagaatttgcttttgaggctgatgaaaacatctataaaagagcagcacatctg
atggtcgccgctttatctggctctatggctattgcagcatgtcgtgaaccccttagagtt
gcatttactgctcaactaagacaagtattacacccaacaccatcaagagatggtgaggac
catgtattaattgaacaagttgtccaagtcatttgcagtgataatattgatttaggttgc
cagatcatcgaacaggccgtggttgaaaaagctattgaagaactagacgaagttatctct
ccaggaattattgcaaggaggaaatccagagaaaccgggcatcaattcgttgatacagac
ttttacggaggaccgaacactcagaattccgctactttttggtcatcactacctgaaaat
ttaaaatacagacataattctatgagacatttgcagctttataaagatttcttacaattc
accttaatgagaaatttggaaaggagggattctgttacccaatatgagctacagaacagt
ttacaatcaaatcaaataacacctctatatcagcatggaagtaatgaccaattcaatagc
caaacccaacaatggaataattctaacgcaattcaattctcacaccaagctgaaagtatc
caaaatttcaatacggttaggagtgacaatacaagctcccaaatgccttcttctaatcat
tcccaaatgaatacctcgtcttcaactattgtacaacctccagaacctgtaagggtacct
cttgtttttgaattggcatatctgcctctaatgatgcgtgttgacgaatgtttgggtcaa
ataaaggatgtaatacgcgagattgccctatatcctccgattttctccaaacagctgatt
cctccagtaagcaataatttaagcgaaggaatgtctgttaaccagaatgtatactcaaaa
cctctcgggtctaatattcttacatatactccaaaatcaaccgcacatccagttctttct
gtgttatcttctctccaatctgaccacattttattttatttatgcagggtattatattcg
attggaaaatctgcgtcacaaagagaagatgttttgattggaatctctcaaaaattgttt
aaaacactttttgatgcaggcgccgcctttcagcagagtacaacaggtatacttccctcg
agtagatgtattgcctcttcgcttggtttcgatgcagctttgttacatatcgaggtattt
ctggcgctatgtaatcaaatttcgtattatagctcaaaattttggctgaagcttaggaaa
gaggcaataggatggtttatttacactatagaggatccaaaatattccgttgatattgta
attggtgcattgagatatgatcttatctcctcagatgaacttgatgtttctctatcaaac
attttagaaactgcaatttctacgcttaatgactctaatccagcaatcggtggaaatagt
agatgtttgagaattgtcgagtttatttacaaactgtttttcagaagtattgaagattgg
cactacccaattactaagaagttaccaagcactactaaaaacttgaatcgattatcaaat
aacagtgtagccttccaaaacagtaatttttctgcaataccaatagtgctaccagggctt
tattataagccatactcttatacaactaatctgggagaacttaagaataaagtagaaagt
attctattggaattggaatccaacaagtcaattacgtttcatgaaatgtggataggtgac
caatgtccagagattttgaacttttactcagtaattcagtgtaatttggatacaatattg
aacccgagatatattgcgttacctacccctattaaaccacctcctgatatttcgaaagga
atcaacacgattttcgatgagtggatattgctattgagaataacaatttttaatggagtt
ggaggttccgagcgtaataatccatacagaaatctatttcttcaaaggctttctaggcaa
ggtctactaagaatggatgacactacagaaaaattgtttactgtttgtattgagagagca
atttatttaagcttaaatcatgatagtgactcagacgccttgaataactctatttcggaa
aatgcatatgactcacgtaatatggatccgttcccaatagattcattggttagattgatt
acaactatggcaaggtatgtagatccacagcaaatggctgcagtagtaataacacacaaa
tttctttcaatacttactagagttattcataaggatgcagagtcacatggctttaatcaa
agaccatattataggattttttactctttgttacaagaatatgaaagtataggattcaat
actgaaatgatacactttacctgcattctaagtgtagttcatcaccttcaatatttaaat
cctaacagggtccccggatttgcatattcttggatccagattatctcaagtaaccgattt
ttcccgtacctactacgccatgtaaaaggttggcaaccttatcaagctctattattgcaa
atcttcatttttatttcgccattcttgagaagtgtacagctatcaagtaacattaaaaca
atttatggtgcgctactccgtatcctactggtattactacacgactttcctgagtttctt
tgtgactacagttgcagtttctgcgatgtcttgcctgttaactgcatacaaattagaaac
ctaatcttatccgcattcccaagaaacatgaaactgcctgatccatttttacctaccttg
aaaattgaaaatcttcccgagatgaagctaatccccagaatgattgcaaattatggtgct
tatattttgtacaaggatctaaaggtaaacatagataaattctggattaccagagatgca
tcaattcttcccctcatcacagaaactattaaaatgccaagggatgaagcacttaaatgt
ggtactaaatactctttcccgataataacaggtttattgctttatattgggatatatctc
ccaaatggaaatgaatctaattcaagcattgacggttctcataatgggatatttaatgtc
tttaattccgatccatcaactaactcgattgaatctgcatcgaaactggaccaaacacca
aacctaaaaagtgatcaattagaaacttttgaagatccgtccctttcaataattctattt
ctttgtaaggacctggatatggaagggcgttttgtcctcatatctgcaatcacaaatttt
cttggatatcctaattcttacacatactactttagctcacttattttatggttgttttct
aaaagcaatgactctattgtacaagaacaaatcacaaggatacttctagaaaggcttatt
gtgcacaggccacatccatggggtcttttaataacatttattgagttgattaagaatcca
aaatacgcattttggagctgttcatttgtgcatctggctccggaagttgagaagctcttt
cagtctgttgctcaaacctgtttaggtcaagcccctaataagacgaatttggtgaaccat
acataa

DBGET integrated database retrieval system