Chiloscyllium plagiosum (whitespotted bambooshark): 122555635
Help
Entry
122555635 CDS
T08871
Name
(RefSeq) deleted in malignant brain tumors 1 protein-like
KO
K13912
deleted in malignant brain tumors 1 protein
Organism
cpla
Chiloscyllium plagiosum (whitespotted bambooshark)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SRCR
SRCR_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122555635
NCBI-ProteinID:
XP_043557568
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(60051035..60173570)
Genome browser
AA seq
1465 aa
AA seq
DB search
MSLVYSCREMQHLGIFVLILHVSLSSTIRSTVQPSNQNATVDAQNEKDFRDLRLVGQLAP
CIGKLEIYYRGQWNSVCSGVLDSAAGKVICKQILCSSFHTLTTSPNPQETGPILLDRIQC
NGTESSLWDCSFTTSSQQTCETGTSAVIFCKVQQSAILQGGGSPCAGTVQARSFGVWNII
CGRMWDLNDAHVLCKYLGCGDALSASGNSQFAVGNWPVLNFEIGCKGSEEDPWKCELKQL
AHNNCSREVEAAGVVCSGHKQPRLVGGVDECSGRLEIQKGMTWGTVCYSHWDSLDARVVC
TSLKCGEVISVLSGAQFGEGSGPIWQDVYECQGNETVIWDCPITSSNQRNCTHSHDVSII
CSGQKGPRLVGGDNTCSGRVEILMGDTWGTVCDTYWDLQNANVVCNQLGCGTAISTPGGA
LFGEGDGLIWMHIIECNGNEMRLTDCPFVSWGQHRCTHRNDAGVICSGEDWQLRLANGES
ICEGLVEVYYDGVWGRVIDTQWNFNEAEVVCRQLKCGSAISIYNQLKFGKGTGPTWISNV
RCNGSEPFLWNCTFTKTEQSSIGDDVGVVCSDHIQIRLVDGGNRCAGRVELYSNGTWGTV
CDDSWDLTDAQVVCNQLKCGQALNATISGWFGPGLGPIWLDNVNCSMNESVLWECLAGPW
SESDCNHKEDAGVICLELSPRKIHNQRDSKKSEIRPVPEHLELRLTAGFDNCSGRVEIFF
SGTWGTVCDDSWDKQDAAVVCQQLNCGGPIWTVGGMIFDQGNGTIWMDEVKCKGTELFLW
DCQLSAMGDHDCDHKEDVNVICSGQQKLIAPFNQESPPTFIIPSILVILLIAVSLALAAE
LQRSFQKANKNRNFDPVYEEIKAQDIGAGPDLFPPSDAELEREYDEIQITRTSLIRFSFI
SLEHCRREMHRLGVFVLIVHVSMELRNPTLLGPHAPCGGILKVYDRGQWKSVCSNSWDSA
AGEVVCKQIGCEFYLSGQVHPIPHGPAFLDKIQCKGTESSLSECALSPSGQQKCDTEMSV
IVICNGAVQQNLILGDGGSPCAGRLQVYLLFAWHHICGQTWDMNDARVLCKYLRCGEAVS
ASASQFGDRNLPILNLEIGCKGSENNPWDCEITPVFNRRCSREVEPAGVICSGHKQPRLI
GGAGRCAGRLEIQKGMTWGTVCDSHWDTLDANVVCTSLECGEVVTVRRGAQFGEGSGPIW
QDVYECQGTETILWSCPTTQINQKNCTHRHDVSIICSGKRRPRLIGGNDTCSGRVEIMFD
DTWNTVCDTYWDLQDAAVVCNQLGCGAAISTPGGAYFGEGNGPVWNYIHVCTGNEIRLTD
CPIASRGHRECTHRNDASVICSGEDWQLRLANGEGICEGRVEVYYDGVWGRVTDTQWNFN
EAEVVCRQLKCGSAISIYNQLKFGKGTGPTLISNVRCNGSEPFLWNCTFTKSEQSSIGDD
VGVVCSGMTSFISSDLTIVLLLAIG
NT seq
4398 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctctggtgtactcttgccgtgaaatgcagcacctggggatattcgtgctgattcta
cacgtttctttgtcctcgacaattcgatccacggtacaaccttccaatcaaaatgctaca
gttgatgcacagaatgaaaaagatttcagagatctgaggttggtggggcagcttgcacca
tgcatcggaaaattggaaatttattaccgaggtcagtggaactctgtttgtagtggtgtg
ttggattcagctgctgggaaagtcatctgcaaacagattttgtgcagttcatttcataca
ttaacaactagcccaaacccgcaagaaacaggtcctattttactggatagaattcagtgc
aatggaacagaatcttcattgtgggattgttcattcacaacgtccagccagcagacctgc
gaaactgggacaagtgcagtcatcttctgtaaagtgcagcaaagtgcaattctccagggt
ggaggtagcccatgtgctgggacagttcaagcccgtagcttcggtgtttggaacattatc
tgcggtcgcatgtgggatttgaatgatgctcatgttttatgtaaatacctgggatgtggt
gatgctctatctgcatcagggaattctcagtttgcggttggcaattggcctgtgctgaac
tttgaaattggctgcaaaggcagcgaggaagatccctggaagtgtgaattgaagcagctg
gctcacaataactgttccagagaagtggaagcagctggtgtggtatgttcaggtcacaag
cagccaagattggttggtggagtggatgaatgttctggaaggttggagatacagaaagga
atgacatgggggactgtgtgctactcacattgggattcactggatgcccgtgtggtttgc
acatcattgaaatgtggggaagtgatatcagtactcagcggggctcaatttggagaaggc
agtggtcctatatggcaggatgtctatgaatgtcagggtaatgagacagttatctgggac
tgccccattacatcaagtaatcaaaggaactgcacacacagccatgatgtcagtataatt
tgttctggtcaaaagggaccacggttagttggtggtgataatacctgttcaggaagagtg
gaaatactgatgggtgatacttggggcacagtttgcgacacctactgggatttacagaac
gcaaacgttgtctgcaatcagcttggctgtgggactgcgatatcaactcctggtggtgca
ttgtttggagagggagatggtttgatatggatgcatatcattgaatgtaatggcaatgaa
atgcgtttgacagattgcccctttgtatcctgggggcaacatcggtgcacacacagaaat
gatgctggtgtcatctgctcaggtgaagattggcagttacgattggcgaacggagagagt
atttgcgaaggccttgtggaggtttattatgacggtgtttgggggagagtgattgacact
cagtggaatttcaatgaagcagaagtggtgtgcagacagctgaaatgtggctctgcaata
agcatttacaaccaattgaagtttgggaaaggcaccggaccgacctggatcagtaatgtc
aggtgcaacggaagtgaacccttcctttggaattgcacttttacaaaaacggagcagtca
tcaattggagatgacgtgggagtggtgtgctctgatcatattcagataagattggtggat
ggtggaaatcgctgtgctggaagggtggagctttattccaatggaacttggggaacagtg
tgtgatgactcctgggatttaacagatgcccaagttgtctgtaaccagctgaagtgcgga
caggctttaaatgcaacaatttccggttggtttggtccaggcttggggcctatttggtta
gataatgtgaactgcagcatgaatgagtctgttttatgggaatgtctggctgggccatgg
agtgagagcgactgcaatcataaagaagatgctggagttatctgcttggaactaagtcca
aggaaaatacacaatcagagggattcaaagaaaagtgaaatccgacctgttccagaacat
ttagagttacggctaactgcaggatttgataattgttccggaagagttgaaatattcttc
agcggtacatggggaacagtttgtgatgattcctgggataaacaggatgctgctgttgtc
tgtcagcaattaaattgtggtggcccaatttggactgtgggaggaatgatattcgaccaa
ggtaatggcacaatttggatggatgaggttaaatgcaaaggaactgaattattcctgtgg
gactgccaattgtcagctatgggcgatcacgactgtgatcataaagaggatgtcaatgtg
atatgttctggccagcagaaactcatagcacctttcaaccaggaaagcccccctactttc
atcatcccttccattcttgttattcttttgattgctgtctcacttgctttggctgcagaa
ttacagagaagcttccagaaagccaacaaaaacagaaattttgacccagtttatgaagag
attaaagctcaggacattggtgcagggccagatttgtttcctccatctgatgctgaactt
gaaagggaatatgatgaaattcaaatcactcgtacatccttgatcaggttttccttcata
tcacttgaacactgtcgccgtgaaatgcatcgcttgggggtttttgttctgattgtgcac
gtttcaatggagctcagaaaccccacattgttggggccacacgcgccatgtggtgggata
ttgaaggtttatgaccgaggtcaatggaagtccgtttgtagtaattcgtgggattcagct
gctggagaggttgtctgcaagcaaattggctgtgagttttatctctcaggacaggtacat
cccatcccacatggacctgccttcctggataagattcagtgcaaaggaacagaatcttca
ttgtcggagtgtgcgctcagtccttccggccagcagaagtgcgatactgagatgagtgtc
atcgtcatctgcaacggggcagtgcagcaaaacctgattcttggagatggagggagcccg
tgtgctgggagacttcaagtttacctcctttttgcatggcatcatatctgtggtcaaaca
tgggacatgaatgacgctcgtgttttgtgtaaatacctcagatgtggcgaagctgtatca
gcatcagcatctcagtttggagatcgcaatttgcccatactaaaccttgaaattggctgc
aagggcagtgagaataatccttgggattgtgaaattactcctgtatttaacagaaggtgt
tcgagagaagtggaaccagctggtgtcatatgttcaggtcacaagcagccaaggcttatt
ggtggagcaggtagatgcgctggaagattggagatccagaaaggaatgacctgggggact
gtgtgtgattcacactgggatacactggatgccaatgttgtgtgcacatcactcgaatgt
ggagaagttgtaacagtacggagaggagctcagtttggagagggcagtggtcccatatgg
caagatgtctatgaatgccagggaactgagaccattctctggtcttgccctacgacacaa
atcaatcaaaagaattgcacgcacagacatgatgtcagtattatttgttctggaaaaagg
agaccacggttaattggtggcaatgatacctgctcaggaagagtggagataatgtttgat
gatacctggaacacagtatgtgatacctattgggatttacaagatgcagctgtggtctgc
aatcaacttggttgtggggctgcgatttcaactccaggaggtgcatactttggagaggga
aatgggccagtatggaattatatccacgtttgcactggcaatgaaatccgtttgactgac
tgcccaattgcatccaggggccaccgtgagtgcacacacagaaatgatgctagtgtcatc
tgttcaggtgaagattggcagttacgattggcgaacggagagggcatttgtgaaggccgt
gtagaggtttattatgacggtgtctgggggagagtgactgacactcagtggaatttcaat
gaagcagaagtggtgtgcagacagctgaaatgtggctctgcaataagcatttacaaccaa
ttgaaatttgggaaaggcaccggaccgaccttaatcagtaatgtcaggtgcaatggaagt
gaacccttcctttggaattgcacttttacaaaatcggagcagtcatcaattggagatgac
gtgggagtggtgtgctctggtatgacctcttttatttcctcagatctaaccattgtcctc
ctgctagcaattggataa
DBGET
integrated database retrieval system