KEGG   Candida tropicalis: CTRG_02169
Entry
CTRG_02169        CDS       T01115                                 
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
  KO
K15075  DNA repair/transcription protein MET18/MMS19
Organism
ctp  Candida tropicalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ctp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:ctp03036]
    CTRG_02169
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ctp03400]
    CTRG_02169
Chromosome and associated proteins [BR:ctp03036]
 Eukaryotic type
  Centrosome formation proteins
   Spindle formation proteins
    CTRG_02169
DNA repair and recombination proteins [BR:ctp03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    Other NER factors
     CTRG_02169
SSDB
Motif
Pfam: MMS19_N MMS19_C SCD Ipi1_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 8296303
NCBI-ProteinID: XP_002547872
UniProt: C5M9K7
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1061 aa
MVESEHNIPVLINQFIATVGTDEQASNTYTDELSSLITTNQLSLLQFIQFLGPTLTSETD
LIRSKSVQCLSFTIKKLDLEKLSKHDVNVLIDFYIYKIKDDQLSLQFKLIGISYLVECKG
FLTSYIEKVLTVLEKEYQPKKLLAKVRHEGFVILQRILLKFHEYLATKIELSDLYVKTFI
NIASGEKDPRNLLISFELNMKINEWFKFDKSNELHKQFVVDLFDVCFCYFPISFKPPPND
PYKITSEELKIKLRTAIASQSQYANDSFPSLIEKLTSTNPVIRNDTLKTIDLCVENYDAL
TVEEYWITLWNALKFEVLHNDIDSVFKPVNDTIIPENYHDIDDNDEFKPLVLTLVILNHI
ISKIPQPEMMLQTVVEELKPYLMVIKDKSKKASLILSSLGSTSIENLNYTVDYVFQYDIW
GKFLNIEKKEDVETKQVDDVQEVEINEDAALNIAKQRDLIDSIGFVLTSYQVLQPQVETS
LQEYKDYILIFLGQLLTVTSDMEKTLKIKTIQQLIKLVKLPNFLTTTELDLILGNYFKSF
ILKTNQKDVILQEIINGLVGCMQDNPNVTSSTIELVINPLLNTLEDGNVEQYEFILSLVG
DLCVNYQVLEVISIRLLNKLSAVNSSANKFQLYKIIIQLFIKLINQIERIQQFLTNSWYK
NFIPTFLHNVLTIVPVGENEEEQFEILDLTGDLLGLIVKFIDVSKHQSIFDEMFTAFFTN
ETTHGSFAYPSNLLETPSFYVNVFCKILSSTDKSCVFANYKPIITSCLQVVSDLKDTRSL
RIQYLLAISLMFNKIATDEQFIEEHLILPQQLTSDTLSDEFLIQFEQSIWILKGLIVKLD
NAGMKALDNLLHIFDSTDNLALMNAISKSLHILFIDLKIFTNSTPDIKQNKIISKVKNLN
IKLLYKQQIFVKVLPYLINSETNFNIKFYALSLVIENLSTNILINNLQEVLPIVLKSFQN
SELNKKSSLLILSIILKENESILSPDDILRLVPVLVELSNTSKLEAIRVSSLGNLLLIVE
KFPQLIKKQELLRQTMTVLDDKKRTVRKLVIDLRQNLYEMK
NT seq 3186 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggttgagtcagaacataatattccggttttaataaaccagtttatagctactgttggt
acggatgaacaagcatctaatacctatactgacgaattatcttcattaataactacaaat
caattatcattattgcaattcattcaatttttgggacctaccttgacatcagaaacagat
ttgattagaagtaaaagtgttcaatgtttgagttttaccattaagaaattggatttagag
aaattgagtaaacatgatgttaatgtattgattgatttttatatttataagattaaagat
gatcaattaagcttacaatttaaattaattggtattagttatttagtcgaatgtaaagga
tttttaacatcttatattgaaaaagtcttgactgttttagagaaagaataccaaccaaag
aaacttttggctaaagttcgtcatgaaggatttgttattttacaaagaatattacttaaa
tttcatgaatatttagctacaaagatagaattatccgatttatatgtgaaaacatttatc
aatattgcatccggtgaaaaagatccaagaaatttattaatttcatttgaattgaacatg
aaaatcaatgaatggtttaaatttgacaagtcaaatgaattacataaacaatttgtggtt
gatttatttgatgtttgtttctgttatttcccaatttcatttaaaccaccgccaaatgat
ccatacaagataacatccgaagaattgaaaattaagttgcgtactgcaattgcttcacaa
tcacaatatgccaacgattccttcccaagtttgattgaaaagttaacttcaacaaatcct
gtcatcagaaatgatactttaaaaacaatagatttatgtgttgaaaattatgatgcactt
acagttgaggaatattggataactttatggaatgcattgaaatttgaagtattacataat
gacattgattctgtgtttaaacctgttaatgatacaataataccggaaaactatcacgat
atagatgataatgatgagttcaaaccattagttttaacattggttattctcaatcacatt
attctgaaaattcctcagccagaaatgatgttgcaaaccgtggttgaagaattgaaacct
tatctcatggtgatcaaagacaagtccaagaaagctagtttgatattaagttcattgggt
tcaacttcgattgaaaatttgaattacacagtggattatgtattccagtacgatatttgg
ggtaaattcttaaacattgaaaagaaagaagacgtagagactaaacaagttgatgacgtt
caagaggttgaaattaatgaagatgctgcattaaatattgccaaacagagagatttgata
gatagtattggattcgtcttgacttcatatcaagttttgcaaccacaagtcgagacatca
ttgcaggaatataaagattacatattgatcttcttgggtcaattattgactgttacatca
gacatggagaaaacattaaagattaaaactattcaacagttgataaaattagtgaaattg
ccaaattttttaaccaccacggaattggatcttattttaggaaattatttcaagagcttt
attttgaaaaccaaccagaaagatgttattttgcaagagataatcaatgggttagttggc
tgtatgcaagataatcctaatgttacttcatctaccattgagttagttataaacccgttg
ttgaatacattagaagatggtaatgttgaacaatatgaatttatcttgtcattagttggt
gatttatgtgttaattatcaagttttggaagttatttcaatcagattacttaacaaatta
tccgcggtcaattcttctgctaacaaattccaattatacaaaataatcatacaattgttt
attaaattaattaatcaaattgaaagaattcaacaatttttaacgaattcatggtataag
aattttataccaacattcttgcacaatgtattaactattgtacctgttggtgaaaacgag
gaagaacaatttgagattctcgatttaactggggatttactaggattgatagttaaattt
atcgatgttagtaaacatcaaagtattttcgatgaaatgtttactgctttttttacaaat
gaaacaacccatggatcatttgcatatccactgaatttgttagaaacaccatccttctat
gttaatgtattttgcaagatcttgagttctaccgacaaatcatgtgtttttgccaactat
aaacccattataacactgtgcttacaagttgtgtctgatttgaaggacaccagatcgcta
agaatacaatatttgttggctatatcattaatgtttaataaaattgccaccgatgaacaa
tttattgaagaacatttgatcttacctcaacaattaacaagtgacacattgtctgacgag
ttcttgattcaatttgaacagtccatctggatccttaagggattaattgttaaacttgac
aatgctggtatgaaagcattggacaatcttttacatatatttgactccacagataatctt
gccttgatgaatgccatttctaaatcattgcatattttgtttattgatttgaaaatattc
accaattctaccccagatatcaaacaaaataagattatttccaaggtcaaaaatttgaat
attaagttgttgtacaaacaacaaatttttgtcaaggtgttgccatatttgataaattct
gaaactaacttcaatattaaattctatgccttatcacttgttatcgaaaacttgtctaca
aacatcttgattaataatctacaagaagtgttaccaattgtattgaaatcattccagaat
tccgaattgaataagaaatcgtcattattgatcttgagtataattcttaaagagaatgaa
tcgattttatcaccagatgatatattacgacttgttccagttttggttgaattatccaat
acaagcaaattagaagctataagagtatcaagtttaggtaatttattattaattgtggag
aaattcccacaactaattaagaaacaagaattattaagacaaaccatgactgttttagat
gataagaagagaactgtacgtaaattagtcattgatttacgtcaaaacttatacgaaatg
aaataa

DBGET integrated database retrieval system