Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly): 135964093
Help
Entry
135964093 CDS
T10781
Symbol
Ser
Name
(RefSeq) protein serrate
KO
K06052
jagged-1
Organism
cvj Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly)
Pathway
cvj04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cvj00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
135964093 (Ser)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04090 CD molecules [BR:
cvj04090
]
135964093 (Ser)
CD molecules [BR:
cvj04090
]
Proteins
135964093 (Ser)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
EGF_TEN
hEGF
MNNL
DSL
JAG1
EGF_DL_JAG
EGF_2
EGF_CA
EGF_Teneurin
JAG1-like_EGF2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
135964093
NCBI-ProteinID:
XP_065372234
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(151185545..151325072)
Genome browser
AA seq
1440 aa
AA seq
DB search
MYLSSSFTTKSSSSPATHKMFTKHFRRKSSEIYGKSSINSLNRSSCWSRITAINNTITMP
CILIFVILSLLVNKISAAGNFELEILEISNTNSHLLSGYCCGVPLEIRSTKTTGCPPCST
AFRLCLKEYSAIEQGTPSITTGCSFGNTTTTILGGSSFVLSDPVRGAMVLPFTFRWTKSF
TLILQALDMYNISYPDSERLIEETSFSSVILPSPEWKTLDHIGRNARITYRVRVQCAATY
YNTTCTTFCRPRNDQFGHYNCGPQGEKICLNGWMGDNCEKAICKPGCDPIHGKCDKPGEC
DCRPGWQGPLCNECVVYPGCKHGSCYGEAWKCKCDTNWGGILCDQDLNYCGTHEPCKHGG
TCENTAPDKFRCTCAEGLSGERCEIIEHPCATQPCKNGGSCTVKESKIPNITALPMYRKM
RGMSSSMGKPVSRHNLPLLELGLGSSSSSSSSILAALTSSLNNSNNTASGRSTGSSSIIS
NTNYNHQQIPPVSEFTCACVPGWTGPTCEINIDECAGGPCEHGGTCIDLIGGFRCECPPE
WTGDVCQIDVNECEITYPVSATSSTTHHHLHTSTLRTSTAAVAAAAVAGSSTSSSALIAA
LNAASSSLAAAAAANGSSGMFGPCVNARQCINMPGSFSCVCLEGWGGPTCAKDFDDCVGQ
CKNGATCMDLVNDYHCACATGFTGRDCETDIDECANSPCRNGGECVDMIGKFNCICPLGY
SGTLCEEANDHCTPSPCLEGRCLNTPGSYYCHCPPGRAGKHCEQVRPMCNQPHCNDGCFA
NSTINSSKNLPCSGHGTCEMGDVGTFCKCHTGYTGTFCEHNLNECSPNPCRNGGICLDGD
GDFTCECPSGWTGKRCSERATACYNGQCQNGGTCVVGSPDKGLQSQCRCAPGWDGTFCTE
RIDQCRGQPCHNGGTCESGSGWFRCVCAQGFSGPDCRINVNECSPQPCQGGATCIDGIGG
YTCICPPGRHGLRCEILLSDPKSACLNLTNSNSPYSPLNKTQDVLAQLLTGQTNEYCNAC
NCENGTSRCTNLWCGLPNCFKTDASSKSSNFSGVCKQHEVCVPTLSENCLNGPCSLRGDC
RSLEPSHRVAPPRLPAKADCWPNQANLNDNCARLTILLDRQRVGTGSSVEGLCSVLRFLL
ASRLIKLPKGDNEGMLIVICDLKTGTNDTIEVTVSSTQQNDSQLPTAIALLGELLSSRQL
NSLQQKNDMKSTKLAALVSILEVKVETASIAEGNSNSLLIGILCGIFIVLIGLAIFLSLF
WRQRIVMTSTSGINLAPSMDALRHDEEKSNNLQNEENLRRYTNPLKGSSSSLGRVNGMEL
SLNPAPELATVSTLANASASSSGVHRSQPLYPESNFDCDLETTTKNKEFHTKRSSQILLH
KTQNSDMKKNTVGSIDSPRKDFGKRSINCKSMPPPPSSSSSTVTTAVTECNDSEILTVLV
NT seq
4323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatttatcatcatcgtttaccacaaaatcttcatcatcacctgctacacataaaatg
tttaccaaacattttcgcagaaaatcttccgaaatttatgggaaatccagcataaattct
ttaaaccgttccagttgttggagtagaattaccgccatcaacaacaccatcacaatgcct
tgtattttaatatttgttatattaagtttattagttaataagatatctgccgctggtaat
tttgaattagaaatattagaaatttcaaatacaaatagtcacttattaagtggttactgt
tgtggtgttcctttagagataagaagtacaaaaacaacgggctgtccgccttgttctaca
gcatttcgactgtgccttaaagaatactccgccattgagcagggtacacccagtataacg
acaggttgttcgtttggtaacaccacaacaacaatactgggtggttccagttttgtattg
agtgatcccgttagaggggccatggtactgccatttacattcagatggacgaaatcattt
acattaatactacaggcgttggatatgtacaacatatcgtatccagactctgaaaggtta
attgaagaaacatcattttcaagcgtgattctaccatcacccgaatggaaaacattggat
catattggtcgcaatgctcgcattacatatcgtgtcagagttcaatgtgcagctacttat
tataatacaacatgtactacgttttgtcgtccccgcaacgatcaatttggtcattacaac
tgtgggccacagggtgaaaagatctgtctaaatggctggatgggtgataattgtgaaaag
gccatttgtaagcccggctgtgatcccatacatggcaaatgtgataaacccggtgaatgc
gactgtcgtcctggctggcagggacccctatgcaatgaatgtgtggtttatcctggctgc
aaacatggctcctgctacggtgaagcctggaagtgtaaatgtgataccaattggggtggc
atattatgtgatcaagatttaaattactgtggcactcatgaaccctgcaaacatggcggt
acttgtgagaataccgcacctgataaatttcgctgcacttgcgctgagggcttatctggt
gagcgctgtgaaatcatagaacatccatgtgctacacaaccatgtaaaaatggtggctca
tgcacggttaaggaatcaaaaataccaaatataactgccttgccaatgtatcgtaaaatg
cgtggcatgagttcgtcgatggggaaaccagttagtagacataatttaccgctgctagaa
ttgggtttaggatcatcatcgtcatcatcatcttccatcttagctgctttaacgtcatca
ttaaacaacagtaataatacagcaagtggacgcagcaccggcagcagcagcattattagt
aatacaaactataaccaccaacaaattccaccagtctcggaattcacttgtgcctgtgta
cccggttggacaggtccaacatgtgaaataaatatcgatgagtgtgccggtggcccttgc
gaacatggtggcacttgtattgatctaatcggcggtttccgttgtgaatgtccacccgaa
tggacaggcgatgtgtgtcaaattgatgtaaacgaatgtgaaatcacttatcccgtctca
gccacatcatccaccactcaccaccacctgcacacatccacattgcgtacctcaacggcg
gctgtagctgcggctgccgtagcaggctctagcacttcatcatcagctttaattgccgcc
ttaaatgccgcttcatcttctttggcagcagcggcggcagcaaatggctcttcaggcatg
tttggtccctgtgttaatgctcgccagtgcataaatatgccggggtcgttttcgtgcgtc
tgcctggagggttggggtggtcccacatgtgctaaagatttcgatgattgcgtgggccaa
tgcaagaatggtgccacttgtatggatttggttaacgattatcattgcgcctgtgcaact
ggatttacaggtcgagattgtgaaactgatattgatgaatgtgctaattcaccgtgtcgt
aatggtggcgaatgtgtggacatgattggtaaatttaattgcatttgtccactggggtat
tccggtacattatgtgaggaagccaatgatcattgtacaccctcgccctgtctagaaggt
cgttgtttgaatacgcccggcagctattactgtcactgtccacctggacgagctggcaag
cattgtgaacaagtgcgtcctatgtgcaatcagccccactgtaatgatggttgttttgcc
aattccaccattaattcttcgaaaaatttaccctgttctggccatggcacttgtgaaatg
ggtgatgtgggtacattttgtaaatgccatactggttataccggcacattttgtgaacac
aatcttaatgaatgttcacccaatccttgccgcaatggtggtatatgtttagatggtgat
ggcgattttacatgtgaatgcccttctggctggactggcaaacgctgctctgaacgtgcc
accgcctgctacaatggtcagtgtcaaaatggcggtacttgtgtggttggttcacccgac
aaaggtttgcagtcacaatgtcgttgtgctcccggttgggatggcactttctgcaccgaa
cgcattgatcagtgtcgtggacaaccttgccacaatggtggtacttgtgaatcgggtagt
ggctggtttcgttgtgtatgtgctcaaggtttttccggtcccgattgtcgtataaatgtc
aacgaatgctcacctcaaccttgtcagggtggtgccacctgtattgatggcattggtggt
tatacctgtatctgtcctcccggcagacacggcttgagatgtgaaatattactctccgat
cccaaatctgcttgccttaatcttaccaactcaaattctccctattcacctttgaacaaa
acccaagatgttttggctcaattgttgacgggtcaaacgaatgagtattgcaatgcttgt
aattgtgaaaatggtacttcacgctgcaccaatttatggtgtggtctaccaaattgcttt
aaaacggacgcctcttcaaaatcatcgaatttttcaggggtttgcaaacaacatgaagtt
tgtgtgcctactttaagtgagaattgtttaaatggaccttgttcgttaagaggtgattgc
cgttctctggaaccttctcatcgggtggcacctccgcgccttcccgctaaagctgattgc
tggcccaatcaggccaatttaaatgataattgtgccaggcttaccatactattggatcgt
caaagagtgggcaccggttcctcggtggagggcttatgttcggtgttaagatttttgctg
gcctcaagattgattaaattgcccaagggagataatgagggcatgttaatagtaatctgt
gatttgaaaactggcaccaatgataccatagaagtgacagtgtcttccacccaacaaaat
gactctcaactacccactgccatagcattgctgggcgaacttttgtcttctcgccaattg
aactccttgcagcagaaaaacgatatgaaatcaaccaaattggctgctttagtttccata
ctggaagtgaaagtggaaacggcttcaattgcggagggcaatagcaatagccttttgata
ggcattttgtgtggcatatttattgtactcattggtctggctatattcctgagcctcttc
tggcgtcaacgtattgttatgacttccacatccggcattaatttggcaccctccatggat
gccttaaggcacgatgaagaaaaatccaataatttacaaaacgaagaaaacttacgacgc
tatacgaatcccttaaagggtagttcttcctcgttgggacgtgttaatggcatggaattg
agtttaaatcctgcccctgaattggctaccgttagcactctagctaatgcttctgcctcc
agttccggcgtacatcgttcacaacccttgtatcctgaatcgaatttcgattgtgattta
gaaacgaccacaaaaaacaaagaatttcatacaaaacgtagttcacaaatattattgcat
aaaacacaaaattccgatatgaaaaagaatacggttggctctatagatagtcctcgaaaa
gattttggcaaaagatcaatcaattgtaaatcaatgccaccaccaccctcatcctcatcg
tctacggtgacgacggcggtaacggaatgtaatgactcggaaatattaacagttttagtg
tag
DBGET
integrated database retrieval system