KEGG   Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera): 126897495
Entry
126897495         CDS       T09738                                 
Name
(RefSeq) CCR4-NOT transcription complex subunit 1-like isoform X1
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
dvt  Daktulosphaira vitifoliae (grape phylloxera)
Pathway
dvt03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:dvt00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    126897495
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:dvt03019]
    126897495
Messenger RNA biogenesis [BR:dvt03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     126897495
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     126897495
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind CNOT1_TTP_bind NOT1_connector ARM_Cnot1 DUF3819 CNOT1_HEAT CNOT1_1st
Other DBs
NCBI-GeneID: 126897495
NCBI-ProteinID: XP_050527107
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 2454 aa
MNLDSLSYTLSQISYLVANLSKKNYKSSVQEITDAIQLQGFEADRHLLRCLFSLVDLKDI
EGPRNTSHKDYYQVQLLVHQCKTLLNKPSLISILCFALDNPLTIAKPLKPSIQLFLQLSR
ILHLSPVQEVVFGLVCLESTNYSTYALEFVKLKLPELIKSYTNSDFNTDQVTEGGLHDSS
PEVLHLILSQVFTVNKIDFGISKESKEVLLQNLQRDFPLEVAPVLLAPLIYPDKLDCPMD
KINLDTSSISNTMLDSSLADLIMEMGYSVCVSIEECRRNLISVSNGSNKSIIFGAPSIAK
VLSMMICTHSILDRHINLPYWPGDNLNNDLEKNGNIELNTWNVEVFVQTINDLNPSLSWL
DVIKELDHAEFIVKDRKGLAILFSALRLGLNRQGYQIENFPIEMIYRNWSCSEAQMSLVQ
HILQNSDIFCFADYPYRSISIDLLKVIPETDNKDINNWYSIELVDLMIFLAEQGLCYQVQ
ECLKFPAQKCPDLLALALIQSNRPLSMVRHEMISGLIPVFLGNHSNSAVILHYAWNHQNV
GLRHTLVQAMSEWYVRSDQDHVKLSRILDIAQDLKALSLLLSIQQFSFVIDLACLASRRE
YLKLDKWLSDKIREHGESFMTSCLKFLQKRCPQLIGSTIQDDNLSKYTPISSETVITMLN
CLRNVNTGTISQELSETLMLMVTNCTNIYISKVASSRVNPSASLPSILCTSQQQRPIEGS
SPQVLVDQLTGLATSLANLGLNPSAQSASTFTLPGSLVQTSSSPSRNIISSSGHSGFSLK
TSSSINTSVPTLSSQLSGSSNLLGRLPSHQVTPSVIGKMNHTIDNSLFLDSNMPLSVPKD
IEDEANSYFQRIYNLAPHHSLSIDEVLEMLKRFQESHIKREREVFCCMLRNLFEEYRFFP
AYPEKELITTAHLFGGIIEHGLVLNYKALGLALRFILDALKKSPNSKMYNFGITALDRFR
NRLKDYHQYCSHISSIPHFQQFPQHLIEYVEYGKNSQEPPSSRVLDIVGTTSTLPQVPFM
PNTLGIFKAQSITATTTTTTVSTASSKLITTNAILSSRPSIANTTNIDTLLVATEQNAKL
IVPPENVLDKIAFIFNNLSQINLQTKCDEIKEIITDDYLPWLSQYLVMKRVSIELNFHTL
YSNFLDCLGNEELNTLIISETFRNIRVLLRSDKGMSNFSDRSLLKNLGHWLGMITLAKNK
PLLLDDIDLKMLLVEAYNKGHQELLFTVPFIAKVLESCAKSKVFKPRNPWTMSVVNCLAE
LHQEPDLKLTLKFEVEVLCKALNIDLKDLNPGFVLKDPEIAKKLEPQLSNGDYSKVQVTS
VLDTAEQPKVSVSITLQNNNTPIIQTTVSFLAQPTTNPLISQSMTSNTRFNDELVGHVVA
AGGVTAMTSTGSVGISGTPIMSPPLPSTEPKFNYVTFNTANSSQLLSMIVINSHIPLFIN
QPSLKTYIRVAIEKSIQEWINPVVERSVKIAVITTEHIVKKDFGMDSDETHLRKAAHCMV
RNLTSGLAMITCREQITQALTTNLKQHFLSILISPTQAQKEMIDQACTICVNDNLELACA
FVQKTATEKAVVEIDKYLKNEYERRNLSRIEGRRYCDQTVVSGQAEFLPDTLRNKLGLPP
SQMIGIYEEFARNIPGFQQLDREAVSLFMPKAGLNLPPDEISLVYEKLINEIEDLLQLYM
SNQRILSNTTQAANLHGILEVLITLRRCRDVITAANVINKVVESYLDGLSSPSNQDLDLA
MKYRDLHLSIFRAFQDPRAYNLQWTNKTLTKAIVESRDELRFNLDAIDVLIRAGMVNISM
YDMHLALSMDNGTNYVSMAYVKQFLQYYLIDNRSNSPITEIHLQATIDALNTIILSGRPV
PDGLAAIIEVLRSSLTENTTVDRTSNTDSNSNSSTHIQHGILQERDFDDPPGLLEKTEYL
LKEWLTIYSASPNRDPGKTFSVYIHQMNVQGILKSDDIITRFFRLSTQMMVELCYRQIPN
QTQSPSTIRAKLFHTIDAYVKLIVLLVKHSGDANAITTKINLLNKVLGIIVGVLLQDHDV
QATDFHQLPYHRILVTLFLDLNTPDPVLESINYPILAAFCHTFHLLRPKKVPGFAYAWLE
LISHRIFIGRLLGLTPQQKRQRSYDQAPVTDVQGWNFYAQLLIDLFKYLAPFLRNAELAK
PVHLLYKGTLRILLILLHDFPEFLCEFHYGFCDVIPPNCIQMRNLILSAFPRNMRLPDPF
TPNLKVDILQEISLSPKISPDFQCYIQPTNFKKDLDLYLKTRAPVTFLSEIRSTMQQSCC
EPGMRYNLSLLNAIVLYVGTQAIQHIRSKGLVPNTSTIAHSAHMDIFQNLSVDLDTEGRY
LFLNAIANQLRFPNSHTHYFSCTLLYLFAEANSEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLI
TFIELIKNPAYKFWQHEFVHCAPEIEKLFESVARSCMVHKQSSNTKNGIDLPII
NT seq 7365 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaacctggattcattgtcatatacgttgtcgcaaatcagctatctcgttgctaatttg
tcgaaaaaaaattataagtctagtgttcaagaaataactgacgctatacaacttcaagga
tttgaagctgaccgtcatttattgcgttgtttattttccttagtagatcttaaagatatt
gaaggacctagaaatacatcacataaagattattaccaagttcaactattagtgcatcag
tgcaaaactcttttgaataagccctcgcttatttcaattttgtgttttgcactagataat
ccacttactattgccaaaccattgaagccatcaatacagctatttttacagctaagcaga
atattacatcttagtcctgttcaagaagttgtttttggacttgtgtgcttggaatctact
aattattcaacttatgctttagaatttgtcaaattgaaattaccagaattgattaaatct
tatacaaattcagatttcaatactgatcaagtcacagaaggtggattacacgattcaagt
cctgaagttcttcatttgattttaagtcaagtattcactgttaataaaatagattttggt
ataagtaaagaaagtaaagaagtattattacaaaatttacaacgtgactttcctcttgaa
gttgcacccgttttattggctccattgatatatcccgataaactagactgtcctatggat
aaaataaatctagatacatcatcaatttccaatactatgctggactcatctttagctgat
ttaataatggaaatgggttattcagtttgtgtttcaattgaggaatgtcgaagaaattta
atttcagtgtcaaatggtagtaataaatcaattatttttggagcaccgtcaattgccaaa
gtattgtcaatgatgatatgtactcactctatattagatcgtcatataaatttaccatac
tggcctggtgataatcttaataatgatttagaaaaaaatggaaacattgaattaaatact
tggaatgtggaagtttttgtccaaactatcaatgatttgaatccatctctttcttggttg
gatgttattaaagaattggatcatgctgagtttattgttaaagatagaaaaggtttggct
atccttttttctgcacttcgtcttggtttaaacagacaaggatatcaaatagaaaatttc
cctattgaaatgatttatagaaattggtcatgttctgaagcacaaatgtctttagtacaa
catatacttcaaaattctgatatattttgttttgctgattatccttaccgatcaatatca
attgatttattaaaagttataccagaaactgataataaagatataaacaattggtattca
attgaattggtggatttaatgatatttttggctgaacaaggcctatgctatcaagtacaa
gagtgcttgaagtttccagctcaaaaatgccctgatcttttagctcttgcgcttatacaa
tcaaataggcctcttagtatggtgagacatgaaatgataagtggtctaataccagttttt
ttaggaaatcatagcaactctgcagtaattttacattatgcttggaaccatcagaatgtg
ggactcagacatactttggttcaagcaatgagtgaatggtatgtacgtagcgatcaagat
catgtaaaactttcccgtattttagatattgctcaagatttgaaggctttgtcattgttg
ttgagcattcaacagttttcttttgtcatagatcttgcttgcttagcttcaaggcgagaa
tatttaaaactagacaagtggctttcagacaaaattcgtgagcatggtgaaagttttatg
acttcttgtctcaaatttttacagaaacgatgtcctcaattaattgggtcaacaattcaa
gatgataatttatcaaagtacacgccaatatcatccgaaactgtgataactatgttaaat
tgtctcagaaatgttaacactggaactatttctcaagaactttctgaaactctaatgtta
atggtaaccaactgtacaaatatttatatttcaaaagtcgcatcttctcgtgtgaatcca
tccgcttcattaccttctattttatgtacatctcaacagcaacggccaatagaaggttca
tcaccacaagttttagttgatcaattaacaggtcttgcaactagtttggctaatttagga
ctcaacccatcagctcaatctgcctctacatttacattacctggttcattagttcaaact
tctagttcaccatctagaaatattattagtagttctggacatagtggtttttctttgaag
acatcttcatctataaatacttctgttccaactttatctagtcaattatctggatcatct
aatttactgggccgtttaccatctcatcaagttactccttcagttattggaaagatgaat
catactattgacaatagtttatttttggatagtaatatgccattatcagttcctaaagat
atagaagatgaagctaatagttattttcaacgtatttataatttggctcctcatcattca
ctatcaatagatgaagttcttgaaatgttgaaaagatttcaagaatcacatattaaacgt
gaaagggaagtattttgctgtatgctaagaaatttatttgaagaatatagatttttcccg
gcttatcctgaaaaagaactaataacaacagctcacttatttggtggaataattgaacac
ggacttgttttaaattataaagctttaggattagcactacgttttattttggatgcacta
aaaaaaagtccaaattcaaaaatgtataattttggtataactgctttggatcgatttaga
aatcgtttaaaagattaccatcaatactgctctcatatatcttctattcctcactttcag
cagtttccacagcatttaattgaatatgttgaatatggtaaaaattcacaagaacctcca
tcatcacgagttttagatatagtaggaacaacctctactttaccacaggtaccttttatg
ccaaatacacttggtattttcaaagctcaaagtattacagctactactacaactactact
gtatcaactgcatcttctaaacttataacaacaaatgctattttatcatctaggccttca
attgccaatactacaaatattgatacactactggttgctactgaacaaaatgctaaattg
attgttcctcctgaaaacgttttagataaaattgcatttatatttaataacttaagtcaa
ataaatttacaaacaaagtgtgatgaaattaaagaaattattactgatgattatctgcct
tggctatcacaatatttagttatgaaacgagttagtattgaattaaacttccatacattg
tactcaaatttcttggactgtttgggtaatgaagagctaaatactttgattatatcagaa
acttttagaaatataagggttttattgagaagtgacaaagggatgtctaatttctcagac
agatctttgttgaagaatttaggtcattggttgggaatgattactctggccaaaaataaa
ccattactgttagatgacattgaccttaaaatgttattggttgaagcctataataaaggg
catcaagaattgctctttacagtgccttttatagcaaaagtacttgaatcatgtgcaaag
agtaaagtattcaaaccaagaaatccttggactatgtctgttgtaaactgtttagctgaa
cttcatcaagaacctgatttgaaattaactttaaaatttgaagttgaagtgctttgtaaa
gcattaaacattgatttgaaagacttaaatcctggttttgtattaaaagatcctgaaata
gccaaaaaattggaacctcaattgtctaatggtgattattcaaaagttcaagtcacttct
gtactagatacagctgagcaacctaaagtttctgtttctataactcttcaaaataataat
actcctattattcaaacaactgtatcttttctagctcaaccgacaactaatcctttaatt
agtcaatctatgacttccaatactaggtttaatgatgagttagttggtcatgttgttgct
gctggaggagtcacagcaatgacatcaactggaagtgtaggtattagtggtactccaata
atgtcacctcctttaccttcaactgaaccaaaatttaactacgtaacattcaatactgcc
aattcatcacaattattatcaatgattgttattaactcccatattccattatttattaat
caaccatcccttaagacttatattcgtgttgctattgaaaaatctatacaagaatggatt
aatccagttgttgaaagatctgttaagattgctgttataaccactgaacatattgttaaa
aaagactttggtatggattcagatgaaacacatttacgaaaagctgctcattgtatggta
agaaatttgacttctggtttagctatgattacatgtcgtgaacaaattactcaagcttta
actacaaatttaaagcagcattttttaagcattttaatatcacccactcaagctcaaaaa
gaaatgatagatcaagcatgtactatttgtgtaaatgataatttggaacttgcttgtgct
tttgttcaaaaaactgcaactgaaaaagcagtagttgaaattgataaatatctcaaaaat
gaatatgaaaggcgtaatttatccaggatagaaggtcgtcgttactgtgatcaaactgta
gttagtggtcaagctgagttcttaccagatacacttcgtaataaactaggtttaccacca
tctcaaatgataggaatttatgaagaatttgctagaaatattcctggattccaacaatta
gacagagaggcagtttcattatttatgcccaaagctgggttaaatttacctcctgatgaa
atatcacttgtttatgagaaacttatcaatgaaattgaagaccttttacaattatatatg
tctaatcaaagaattctatctaatacaacccaggcagcaaatttacatggtattttagaa
gtattaatcactcttagaaggtgccgtgatgttattactgcagctaatgttattaataag
gttgttgaaagttatttggatgggttgagttctccttcaaatcaagatttagatctggct
atgaaatatcgtgacttgcatcttagtatatttagagcatttcaagatccccgtgcctat
aatttacaatggacaaataaaacattgacaaaagctatcgtggagtcaagagatgaacta
agatttaatttagatgcaattgatgtgctaattagggcgggtatggtcaatattagtatg
tatgatatgcatttggctttgtcaatggataatggtactaactatgtttctatggcttat
gttaaacaatttttacaatattatttaattgataatcgatccaattccccaataactgaa
attcatttacaagcaactattgatgcattaaatacaatcatacttagtggtcgtcctgta
cctgatggtttggcagcaattatagaagtattgagatcatcgttaacagagaatacaact
gttgatagaacgagtaatactgacagtaatagtaattcttcaactcatattcagcatgga
attttacaagaaagagattttgatgatcctccaggtttactggaaaaaactgaatatctt
ttaaaagagtggcttactatttatagtgcttcgccaaatagagatcctggaaaaactttt
agtgtttatattcatcaaatgaatgtccaaggaattttgaagtctgatgatattataact
cgtttctttagacttagtacacagatgatggtagaactatgttaccgtcaaataccaaat
caaacacaatcaccatcaacaatacgagcaaaactttttcacacaattgatgcttatgtc
aaacttattgtgttattagttaaacattcgggtgatgccaatgctattactactaaaatt
aatttattgaataaagtattaggaattattgttggtgtgttacttcaagatcatgatgta
caagctactgattttcaccagttaccctatcatagaatattagtgacactatttttagat
ttaaatacaccagatcctgtattagaatcaataaattacccaatactagcagctttttgc
cacacatttcatttacttagaccaaaaaaagttcctggttttgcatatgcctggttggaa
ttaatatctcatcgcatatttattggcagactattaggattaacaccacaacaaaaaaga
caacgttcttatgatcaagctccagtaactgatgtccaaggttggaatttctatgctcaa
ttattaattgatttatttaaatatttggcaccatttctaagaaatgctgagcttgcaaaa
cctgttcacttgttatataaagggacattacgtatacttctcatattgctacatgacttt
ccagagtttttatgtgaatttcattatgggttttgtgatgttatacctcctaattgtatt
caaatgagaaatttaatattatctgcattcccacgtaatatgcgtttaccagatccattt
acacccaacttgaaggtagacattcttcaagaaatttcattgtctccgaaaataagtcct
gattttcagtgttatatccagccaacaaattttaaaaaagatctcgatttataccttaaa
actcgtgctccagtcacatttttatcagaaattcgttctacaatgcagcagagctgttgt
gaaccaggaatgcgttataatttatcattattaaatgctattgttttgtatgttggcact
caagccattcaacatataagaagcaaaggtctagtgcctaacacttctacaattgctcat
tcagcacatatggacatatttcaaaatttgtcagtggaccttgacactgaaggtcgttat
ttgtttttaaatgcgattgctaaccaactacgttttcctaatagtcatactcattatttt
agctgcacactattatatttatttgctgaagccaatagtgaagctatacaagaacaaata
acaagggttctcttagagaggcttattgttaatagacctcatccttggggtctgttgatt
acttttattgaactaattaagaatccagcatataagttttggcaacatgaatttgttcat
tgtgcacctgaaatagaaaaactatttgaatcagttgctcgatcttgtatggttcataaa
caatcaagtaatacaaaaaatggaattgatttaccaattatttaa

DBGET integrated database retrieval system