Flavobacterium ammonificans: SHINM13_10260
Help
Entry
SHINM13_10260 CDS
T08737
Symbol
secY
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecY
KO
K03076
preprotein translocase subunit SecY
Organism
fao
Flavobacterium ammonificans
Pathway
fao02024
Quorum sensing
fao03060
Protein export
fao03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fao00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SHINM13_10260 (secY)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SHINM13_10260 (secY)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SHINM13_10260 (secY)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
fao02044
]
SHINM13_10260 (secY)
Secretion system [BR:
fao02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SHINM13_10260 (secY)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecY
PalH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDB56730
LinkDB
All DBs
Position
1226182..1227528
Genome browser
AA seq
448 aa
AA seq
DB search
MKKFIESISNVWKIEELKNRILMTLGLLLIYRFGAQVTLPGIDATQLANLAGQTKDGIGS
ILDMFTGGAFSQASVFALGIMPYISASIVVQLMGMAIPYLQKLQSDGESGRKKINQITRW
LTIGITLLQGPTYIYNLYRTLPGNAFLLGFNSFEFLFSSVVILTTGTIFAMWLGEKITDK
GIGNGISLLIMVGILARLPQAFIQEFTTRVTNNNGGPMLLVIEIIVWLLVIISCVLLVMA
VRKIPVQYARRTSTGDYEQDVMGGNRQWIPLKLNAAGVMPIIFAQAIMFIPAAVAGLSKS
DASQSIVGAFSNMFGLWYNIVFATLIVVFTFFYTAITVPTNKMSDDLKRSGGFIPGVKPG
VETSDFLDKVMSLITFPGSLFLALIAVFPAIVVSVMDVQQSWAMFFGGTSLIIMVGVAID
TMQQINSYLLNQHYDGLMKTGKNRKAVA
NT seq
1347 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaatttattgaatcaataagtaatgtttggaaaatcgaagagttaaagaatcgt
attcttatgactcttggtttgctattaatctatcgatttggagctcaagttacgcttcca
gggattgatgctacacaattggctaatttagctggtcaaacaaaagacggaataggttct
attttggatatgtttacaggtggagctttttctcaagcgtctgtttttgctttaggtatt
atgccttacatttctgcatctattgtagtacaattgatgggtatggctattccttacttg
cagaagctacaaagcgatggtgaaagtggtagaaagaagatcaatcaaattactcgttgg
ttaacaattggaattactttacttcaggggcctacttacatttacaatttatacagaacc
ttacctggtaatgcttttttattaggttttaattcttttgaattcttattttcttcagtg
gttattttaactacaggaaccatatttgctatgtggttaggagaaaaaattactgataaa
ggaattggtaatggtatttctttgttaattatggtaggtattttagctcgtttaccacaa
gcttttattcaagaatttacaactagagtaactaacaataatggtggaccaatgttattg
gtaattgaaattattgtttggttgttggtaattatttcttgtgtattacttgttatggcg
gttagaaagatacctgttcaatatgctcgtcgtacatcaactggtgactatgaacaagac
gttatgggtggtaatagacaatggattcctttgaagcttaatgctgctggggttatgcca
attatctttgctcaggcgattatgtttattccggctgctgtcgcaggtctgtctaaatca
gatgcatctcaatctattgttggtgcttttagtaatatgttcggattgtggtataatatt
gtttttgcaacattaattgttgtgtttacattcttttacactgcaattacagttcctact
aacaaaatgtctgatgatttgaaaagaagtggtggatttattccaggtgttaaaccagga
gttgaaacttcagattttcttgataaagtgatgtctttaattactttcccaggatctcta
ttcctagctttgattgctgtgttcccagctattgtagttagtgtgatggatgttcaacag
tcttgggctatgttttttggaggtacctctttaattattatggttggtgttgctattgat
acgatgcaacaaattaattcttacctattgaaccaacattatgatggtttaatgaaaacg
ggtaaaaatagaaaagcagtagcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
