Flavobacterium channae: LOS89_12230
Help
Entry
LOS89_12230 CDS
T08502
Name
(GenBank) choice-of-anchor I family protein
Organism
fcb
Flavobacterium channae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
choice_anch_I
Big_5
Por_Secre_tail
Calx-beta
GlyL_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UGS23510
LinkDB
All DBs
Position
complement(2630971..2634021)
Genome browser
AA seq
1016 aa
AA seq
DB search
MNKNYTVKRKSYILFLLLGLFVSTTYGQTLVHYWNFNNSTSISAITAPTQTIGGATLNAI
PVGISVIDFANGTGQNFNLLNLNARNGDASGTHLRFNDPIGGALEFALPTTGYENCVVNF
ATRRSGSGAGTQIWSYSTDGSNYVFFANVIPNNGDPAFATLDFSSIAASDNNPNFKLKVE
FEQGSGGTVGNNRFDNFTLEGTVFSGPDVIAPVATLSPLNNAINVATNVVPTISFNEAIR
LIDNSAIDNNNVDAVVELRLNNASGAIVPFDATISGNVISITPLSSLAVNQTYYVALMEN
AIEDLNDNAITTVQSGVFTTANPSISFASNFITVNENQGTLSLVLNIINPASSLVDLVVK
SAPFSTADNSDFTLTSQTIFISETSSTTQTITIPIIDDSLEEQHSEYFVLSLENASGISI
TGTPTATIYIVDNDSQAPVPSNQIELNYIGSFDPSGVSASTCEIVVHDPASQRLFTTSAV
AGYLDIIDFSDPTSLSVINSININPYGGVTSVAVKNGVVAVASPNADETLNGSVLFFDTN
GVFLNQVTVGALPDMITFSPDGTKVMTANEGQPNTDYSIDPEGSVSIIDISGGIPSLSQS
NVTTLLFTDYNAQEAALIASGVRKIKATSTLSQDIEPEYITISSDSQKAWVSLQENNAIA
EINLANNTISDVWAMGTKDISLPGNGFDVSDNNGQVLIANWPIQAYFIPDGIASYTVGGT
TYLVTANEGDEKEYGAFTERVAVSAGAYGLDAANFPNASVLKQNYNLGRFRATNVNGNID
ADAQFETIHCVGTRSFSIFNTTTKQIVFDSGDDFERYTAANLPALFNADHEDNTPKGRSR
AKGPEPEGVTIAQIATETFAFVSLERVGGVMVYNITDPNNPVFVDYKNSRSSSAYSGDHG
PEGITYVTPANSTTGKGYVLVANEISGTITIYEVDENTLSSSDFSVDPKTFVIFPNPASN
SELVYFNRKADIELFDLTGKLILSEKDALTINISKLQTGVYIVKTSEGITKRLVVK
NT seq
3051 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaattacacagtaaaaaggaaaagctacattttgtttcttcttttgggattg
tttgtttctactacttacggacaaacattagtacattattggaactttaacaacagtaca
tcaatttctgcgataacagctcctacacaaactattggaggagcaactttaaatgcaatt
cctgtaggaataagtgttattgattttgctaatggaacaggtcaaaattttaatttactt
aatttaaatgcaagaaatggtgatgcttctggaacacatttacgtttcaacgatcctatt
ggtggagcattagaatttgcattaccaactacaggttacgaaaactgtgtcgtaaacttt
gcaactcgtcgttcaggttcgggtgctggaacacaaatttggtcttattctacagatggt
tccaattatgttttttttgccaatgtaattccaaataatggtgatccagcatttgcaact
ttagatttttcatcaattgctgcttcagataataaccctaattttaaattaaaagttgaa
tttgaacaaggaagtggtggtacagtaggaaataatcgttttgataactttactttagaa
ggaacagtttttagtggtcctgatgttatagctccagtagctactttatctcctttaaat
aacgcgattaatgttgcaactaatgttgtgccaacaatttcttttaatgaagcaatacgt
ttaattgataatagtgcaattgataacaacaatgtagatgctgttgtagaattgcgatta
aataacgcatctggtgctattgtcccttttgatgctacaatttctggaaatgtaatttcg
attacgcctctttcaagtttagcagttaatcaaacctattatgttgcattgatggaaaac
gcaattgaagatttaaacgataatgctattacaacggttcaatctggagtttttacaacg
gcaaaccctagtatttcttttgcttctaattttattactgtaaatgaaaatcaaggtaca
ttatcattggttttaaatattataaatccagcttctagtttagtagatttagttgtaaag
tcagcaccatttagtacggctgataattctgattttacattgacttcacaaacaattttt
atttcagaaacgtcatcaactactcagactattacgattccaattatagatgatagttta
gaagaacaacattcagaatattttgttttgagtttagaaaatgcttctggaatttcaata
acaggaacacctactgctactatttatattgttgataatgatagtcaggcaccagttccg
agtaatcaaattgaattaaattatattggaagttttgatccttctggtgtaagcgctagt
acttgcgaaattgtagttcatgatcctgcttctcaacgtttgtttacaacaagtgcggtt
gctggatatttagatattatcgatttttcagatccaacaagtctttctgtgattaattcg
ataaatattaatccttatggaggtgtaacaagtgttgcagttaaaaatggagtagttgca
gttgcatcgcctaatgcagatgaaactttaaacggttctgttttattttttgatacaaac
ggagtgtttttaaatcaagtaactgttggagcgcttccagatatgataacattttcacca
gatggaactaaagtgatgactgcaaatgaaggtcagccaaatacagattattctattgat
ccagaaggttcagtaagtattattgatatttcaggcggaatcccttcgttatcacaatca
aatgtaacaacattattattcacagattacaatgctcaagaagctgctttaattgcttca
ggagtaagaaaaataaaggctacaagtacattgtctcaagatatagaaccagaatacatt
acaataagttcagattctcaaaaagcatgggtttctttacaagaaaataatgcaattgca
gaaatcaatcttgcaaataatacgatttctgatgtttgggcaatgggaacaaaagatatt
agcttgcctggaaatggatttgatgtttctgataacaatggtcaagttttgattgctaac
tggccaattcaagcttattttattccagatggaattgcaagttacactgttggaggaaca
acgtatttggtaactgcaaacgaaggagacgaaaaagaatatggtgcttttactgaaaga
gttgctgtaagtgcaggagcttatggtttagatgctgcaaatttcccaaatgcttcagtt
ttaaaacaaaattacaatttaggaagatttagagcaacaaacgtaaacggaaatatcgat
gctgatgctcaatttgaaacaattcattgtgtgggaactcgttcgttttcaatttttaat
acaaccacaaaacaaatagtttttgatagtggagatgattttgagcgttatacagcggca
aatttaccagcactttttaatgcagatcacgaagataatacgccaaaaggtagaagccgt
gcaaaaggtccagaaccagaaggagtaactattgctcaaattgcaactgaaacttttgct
tttgtttctttagaaagagttggtggagttatggtttacaatattacagatcctaataat
cctgtttttgtagattataaaaattcaagaagttcttcagcttattcgggagaccacgga
ccagaaggaattacttatgttactccggctaacagcacaactggaaaaggttatgtttta
gttgctaacgaaattagtggaacaatcacaatttatgaagtggatgaaaatacattgtca
tcgtcagattttagcgttgatccaaaaacttttgtgatttttcctaatccagcatcaaac
tctgagttggtttattttaatagaaaagcagatattgaattatttgatttaacaggaaaa
cttattttatcagaaaaagatgcgttgacaataaatatatcaaaattacaaacgggagtt
tacatcgtaaaaacttctgaaggtattacaaaaaggttggttgttaagtag
DBGET
integrated database retrieval system