Fusobacterium canifelinum: I6I83_08155
Help
Entry
I6I83_08155 CDS
T07213
Name
(GenBank) autotransporter-associated N-terminal domain-containing protein
Organism
fci
Fusobacterium canifelinum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQS87018
UniProt:
A0ABX7CBW3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1657901..1664659)
Genome browser
AA seq
2252 aa
AA seq
DB search
MSNNLLKMERNLKSIVKRYKTVKYSLGLAILFLMMGTNAFTEEVITKQTIQNSVENLQTK
INTLRSENEKQLKGLRLELIQLMEQGNQVVKSPWSSWQFGMGYTYSKWGGKYKGKGDKEK
ETLNIFKGESVLSKYVKSDLSSTVYGTTELDLESTYEPNAEITVSAAVKIKNVAKRTPDI
RLQTVNTPSSPQLNISLPSPEGITQPNINSPAINRKVIKPNLDFFHDFLHSYYNSPNWGK
VYKEKDGKKYFIVQTYTDIEGIFWSGVDGGSVLPDKDKVVKTISGAKDVKIEGIAQADFS
DNVRRSNIIGIRNPTHSDSVNPTRKIEGKRIILYIAGGEPLYGAYDIYTPGHLPRRGGAG
IYIEGDAKFSDMTFNLYGEAAGINILGIGGPRVEVNNSTINLYKDYNTVFNLTGADMDLE
SKNFYGRRFAGISSYIKGNVNISLKTKKNLVYGLANYMSTYKFMNSGKIKIDGASNTTFF
IGSYSPNPTKYLTDNASYGDTNKIPIKHAKETDLNAFIPLIQTNNHIEQYGDENVAVIFN
KSRIGEGDLVKRHAPIGIYQGEIDIKAKIGEYLSSDTNATEQIEDGNLTSNGYSNKFVEG
NVGIYADSGQRKGLKPHEHLGANTYHNKDAIHNLEIGKFDIKFGKYSKQGFMFLTKLGTV
IDVGKSTTTVHIGNTSTDFTDGLTGADTDDRKSGLESVIAYSEGVFANNAFKLGITTGLE
GKSSEINVHIPLTMTSREGIAYFGDNKGKVTVNANTEATGRKSIIALANKGGEVNITGTV
NAKDRGVSAIDAKVEKYKNIGAYAKAENGENSLITINGNIDINGIGALADGQGSKISLKG
NTNKIYTGTDGGLVAKSGGEIEFHGGTIVNKNNSVDRGLTDNDHKNTTPFYATDKNGIIP
QGKISFKTNDTNIEIYDGILVFGKASDYASASSPNPLAKYQGMEKVKVKLMGDGVNLGVF
DGLNNVVWAGNSSLTTYTNGLLTIPKFGALDPNGKAFKSTLTGGTLTINSDVNLTDSSDK
FNGISMEKELVTINSGKTITGNGKGLSMGSNNSATSNLISGYINKGNVNITGGTLTSGVA
GINVSYGYISNLEDVKVDNGAGLYGTNGSKLENKGNILISGSGQGIAGISKKASVTYGTD
AVEIINDGKITIIGNNSTGIYAENNTNTVHNNINIKNNNKIDVGDNGVGIALKSTNGSTI
GGLISVNGTGNSDIVVGKNGIGIYAENSKITLNSDYGIETKDNGVGIYTIGNSTVGNNKT
LKYTYSGSSNGNGIATLYLGTNSENKLHINLNNATNSTGGLVGVFAKGGGNFVNSGNIAG
TSRAAEFGIVTENASVNNTGNISLGDADNLMKGNVGIFVKNSLSAITNTGSITAGKNSIG
LYGYAINHTIGNIKVGDNGIAVYSQGGNVSLTSGSIEVGKNEAVGVFTTGIGQNITSSNT
MLIDKSSYGFVMKGEGYNLLAQNPDTILKGDSVFAYSDIAGKIENQTKLSSNGSGNYGLY
SAGIIENKADINFGTGTGNVGIYSISYTDSTGKEVAGKAVNGVAGLPLTAQPKITVGETN
TTAKLYGIGMAAGYADEDTGIVKRIGQIENLGTIDVFNENSIGMYAVGSGSKAINRGIIN
LSGKKTVGMYLDQNAIGENYGTIRTVPNPTNDGIIGVVALNGAILKNYGQIIIDSSNGIG
FYSAGGGKYEEYTGGSITANGTDSRAKEIAARNNTGKEVKGIKIIALPGSTNATIIRDGQ
IVSTMPIDTNIASANATQVQVGSTILDLSSIKIPSVNLGQASSIGMYIDTSGINYTNPIQ
GLENITGLKKVNLMVGTEASLYTNAKDIEIGQNILKPYNDTITQVSSSGSGNVKWIVNSA
GLTWIATVTQNPDFTISKMYLSKIPYTSFAKDKDTHSFMEGLEEHYNKASGKDKEIFNKI
NALGKQEGQIFAQAVDEMKGKQYANIQQRINTTGNILDKEFKNLRADRNMSKDSNKIKTF
GAKGEYKTDTAGISDYKYNAYGVAYVHESEDVKLGKDIGWYTGIVQNKFKFKDIGNSKEE
QLQTKLGLFKSRPYDDNNSLNWTTSGEIFIGYNRMDRKFLVVDEIYQAKSKYYTYGIGVR
NEISKEFRLSEDFRLKSYAALKLEYGRVSKIKEKNGEIKLEIKSNDYVSIKPEIGTELSY
RHYFGAKTLNTSIGMSYENELGKVANGKNKAKVADTNGDWFNIRGEKEDRKGNVKFDLNL
GFDNQRYGIIGNIGYDTKGSNIRGGLGIKVIF
NT seq
6759 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaataatttattaaaaatggaaagaaatttaaaatcaatagtaaaaaggtacaaa
acagtaaaatattcattaggactggcaatattatttttaatgatgggaacaaatgcattc
acagaagaagtaataaccaaacaaacaatacaaaattcagtagaaaacttacaaacaaaa
ataaatacattaagaagtgaaaatgaaaaacaattaaaaggtttaagattagaattaata
caattaatggaacaaggaaatcaggttgtaaaatctccatggtcctcatggcaatttgga
atgggatatacatatagtaaatggggtggaaaatataaagggaaaggtgataaagaaaaa
gaaactctaaatatatttaaaggagaaagtgtattatcaaaatatgtaaaaagtgattta
agtagcacagtatatggaacaacagaactagatttagagagtacctatgaaccaaatgca
gaaataacagtaagtgcagctgtgaagataaagaatgttgcaaagaggacaccagatata
cgcctacaaacagtaaatactccaagttctccacaattaaatattagtttaccttcacca
gagggaattactcagccaaatataaactctccagctattaatagaaaagttataaaacct
aatttagatttctttcatgactttttacatagctattacaattcacccaattggggtaaa
gtatataaagaaaaagatggaaaaaaatattttatagtgcaaacttatacagatatagaa
ggaattttttggtcaggtgttgatggaggtagtgttcttccagataaagataaggtagta
aaaaccatttctggagctaaggatgtaaaaatagaaggaattgcacaagctgatttttca
gataatgtcagaagatctaatataattggtattagaaatccaacgcattctgattctgtt
aatcctactagaaaaatagaagggaagaggataatactttatatcgctggaggagaacct
ctatatggagcttacgatatatatactcctgggcatttaccaagaagaggtggagcagga
atttatatagaaggagatgctaaatttagtgatatgacctttaatctctatggagaggca
gcggggataaatatacttggtataggaggtcctagagtagaggttaataactctacaata
aatttatataaggattataacacagtctttaatttaacaggtgctgatatggatttagaa
tcaaaaaatttctatggtaggcgttttgcgggaatatcttcatatataaaaggaaatgtt
aatataagtttaaaaactaaaaaaaatttagtatatggtttggcaaattatatgtccacc
tataaatttatgaatagtgggaaaataaaaattgatggagcctctaatacaacttttttt
attggttcatattcacctaaccctacaaagtatttaactgataatgcttcatatggtgat
acaaataaaattcctataaagcatgcaaaagaaactgatttaaatgcttttattcctttg
atacaaacaaataatcatatagaacaatatggtgatgaaaatgtagcagtaatttttaat
aaatcaagaattggagaaggagatttggtaaaaagacatgcaccaattggtatctatcaa
ggtgaaatagatattaaagcaaaaataggagaatatctttcatctgatacaaatgctaca
gaacaaatagaagatggaaatttgacttcaaatggatatagtaataaatttgtggaagga
aatgttggtatttatgctgattctggtcaaagaaaaggtttgaaaccacacgaacattta
ggagcaaatacttatcataataaagatgcaattcataatttagagatagggaaatttgat
ataaaatttggtaagtattcaaaacaaggttttatgtttttaacaaaattaggtactgta
atagatgtcggaaaatccacaactactgttcatatagggaatactagtacagattttaca
gatggtctaacaggtgcagatactgatgacagaaagtcaggattagagagtgttatagct
tattcagagggagtatttgcaaataatgcttttaaattaggcataactactggtttagaa
ggaaaatcttctgaaattaatgtacatattcctttaacaatgacatcaagagaaggaatt
gcttattttggtgataacaaaggaaaagtaactgtaaatgcaaatacagaagccacaggt
cgtaaatcaattattgctctcgcaaataagggaggagaagttaatataacaggaactgta
aatgccaaagatagaggtgtatcagctattgatgcaaaagttgaaaaatataaaaatatc
ggagcttatgctaaggctgaaaatggtgagaatagtttaattaccattaatggaaatatt
gatataaatggtataggagcattagcagatggacaaggctcaaaaatatctttaaaagga
aatacaaataaaatatatacaggtactgatggaggcttagttgcaaaaagtggtggagaa
attgaattccatggaggaactattgttaataaaaataatagtgttgatagaggtttaact
gataatgatcataaaaatacaactcctttctatgcaactgataaaaatggaattatacct
caaggtaaaatttcttttaaaacaaatgacacaaatattgaaatttatgatggaatttta
gtttttggaaaagcaagtgattatgcaagtgcaagttctccaaatccattagctaaatat
caaggtatggaaaaagttaaagttaaattaatgggagatggagttaatcttggagttttt
gatggattaaataatgttgtttgggcaggtaatagcagtttaacaacatatacaaatgga
cttttaacaattccaaaatttggtgctttggatccaaatggaaaagcttttaaaagtact
ttgacaggaggaactttaactattaacagtgatgtaaatttaacagatagttctgataaa
tttaatggtatttctatggaaaaagaacttgttactataaattctggaaagacaattaca
ggaaatggtaaaggtttatcaatgggttctaacaatagtgcaacatcaaatttaatttct
ggatatattaataaaggaaatgtaaatattactggtggtacgttaacttccggtgtagca
ggaataaatgtcagctatggatatatttcaaatttagaagatgttaaagtagataatgga
gcaggactttatggaactaatggaagtaaattagaaaataaaggaaatattttgattagt
ggctcaggacaaggaatagcaggaataagtaaaaaagcaagtgtaacttatggaacagat
gccgtagaaataataaatgatggaaaaataacaataattggaaataattctactggtata
tatgctgaaaataatactaacacagttcataataatattaatataaaaaacaataataaa
atagatgttggagataatggagttggaattgcattaaaatctacaaatggaagcacaata
ggagggcttatttctgtcaacggaacaggaaattctgatatagtagtgggtaaaaatgga
ataggaatatatgcagaaaacagtaaaattacattgaattctgattatggtattgaaaca
aaagataatggagttggaatatatacaataggaaattctactgttggaaataataaaact
ctaaaatatacctattcaggaagttccaatggaaatggtatagctactttgtatcttgga
acaaattcagaaaataaacttcatataaatttgaataatgctactaattctactggtgga
cttgttggagtatttgcaaaaggaggaggtaattttgtaaattctggaaatattgcagga
acttcaagggcagcagaatttgggatagtaacagaaaatgcaagtgtaaataatacagga
aatattagtttaggtgatgctgataatttaatgaaaggaaatgttggaatttttgtaaaa
aattctttaagtgctattactaatacaggaagcataacagcaggtaaaaatagtatagga
ctttatggatatgcaataaatcacacaattggtaatataaaagtaggagataatggtata
gctgtttattcacaaggtggaaatgtttcattgacaagtggaagtattgaagttggtaaa
aatgaagcagttggagtctttacaacaggaattgggcaaaatataacaagtagcaataca
atgctaatagataaatcttcttatggttttgttatgaaaggtgaaggctataatctatta
gcacaaaatcctgatactattttaaaaggggattcagtatttgcttattctgatattgca
ggaaaaatagaaaatcaaacaaaattaagttcaaatggaagtggaaactatggactttat
tctgctggaataattgaaaataaagctgatataaattttggaacaggaacaggaaatgtt
ggaatttatagtataagttacactgattcaacaggtaaagaagtggctggaaaagcagtt
aatggagttgctgggcttcctttaacagctcaacctaaaattacagtaggagaaactaat
acaacagctaaactatatggaataggaatggcagcaggttatgcagatgaagatactgga
attgtaaaaagaataggacaaatagaaaaccttggaacaatagatgtattcaatgagaat
tcaataggaatgtatgcagtaggaagtggctctaaagcaataaatcgtggtattatcaat
ttaagcggcaagaaaactgtaggaatgtacttagatcaaaatgcaataggtgaaaattat
gggacaataagaacagtacctaatccaacaaacgatggaataataggagtggttgcatta
aatggtgcaatcttaaaaaactatggtcaaatcattattgattcttcaaatggaataggt
ttttactctgctggtggaggaaaatatgaagagtatacaggtggaagtataacagctaat
ggaactgattcaagagctaaagaaatcgctgcacggaataatacgggaaaagaagtaaaa
ggaattaaaattatagccctacctggttctactaatgcaaccataataagagatggtcaa
attgtttcaactatgcctatagatacaaatattgcttcagcaaatgctacacaagtacaa
gtaggaagtactattttagatttaagcagtataaaaatcccatctgtgaatttaggtcaa
gcctcgtcaataggaatgtatattgatacttctggaatcaattatacaaatccaattcaa
ggtttagaaaatataacaggactaaaaaaagtcaatctaatggtaggaacagaagcttct
ttatatactaatgcaaaagatatagaaattggtcaaaatattttaaagccatataatgat
actattactcaggtaagtagtagcggttctggaaatgtaaagtggatagtaaattctgct
ggactgacttggatagcaacagtaactcaaaatcctgatttcactatttcaaaaatgtat
ctatctaaaataccttatacttcatttgcaaaagataaagatacacatagctttatggaa
ggattggaagaacattataataaagcttcaggaaaagataaagagatattcaataaaata
aatgccttaggaaagcaagaaggacaaatatttgcacaagcagtagatgaaatgaaaggg
aaacaatatgcaaatattcaacaaagaataaatacaacaggaaatattttggataaagaa
tttaaaaatttaagagcagatagaaatatgtcaaaagattctaataaaataaagacattt
ggggcaaaaggagaatataagacagatactgctggtatatcagattataaatacaatgct
tatggagtagcttatgttcatgaaagtgaagatgtcaaactaggaaaagatataggatgg
tacacaggaatagttcaaaataaatttaagtttaaagatattggaaactcaaaagaagaa
caattacaaactaaattaggactattcaaatcaagaccttatgatgataacaatagttta
aattggacaacatcaggagaaatatttataggttataacagaatggatagaaaattctta
gttgttgatgaaatatatcaagcaaaatctaaatattatacttatggaataggagtaaga
aatgaaataagtaaagaatttagactaagtgaagatttcagattgaaatcttatgcagca
ttgaaattagaatatggcagggtatctaagataaaagaaaagaatggagaaatcaaatta
gaaataaaatcaaatgactatgtttcaataaaaccagaaataggaacagaattatcatat
aggcattactttggagctaagacattaaatacatcaataggaatgtcttatgaaaatgag
ctaggcaaagtagcaaatggaaagaataaggctaaggtagcagatacaaatggagattgg
tttaatataagaggagaaaaagaagatagaaaaggaaatgtaaaatttgatttgaattta
ggatttgataatcaaagatatggaataataggaaatataggatatgacacaaaaggaagt
aatataagaggaggacttggaataaaagttatattttag
DBGET
integrated database retrieval system