Flavobacterium columnare: FCOL_02845
Help
Entry
FCOL_02845 CDS
T01653
Name
(GenBank) ABC-type iron(III) dicitrate-transport system component, TonB-dependent outer membrane receptor FecA
KO
K16091
Fe(3+) dicitrate transport protein
Organism
fco
Flavobacterium columnare
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fco00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fco02000
]
FCOL_02845
Transporters [BR:
fco02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FCOL_02845
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
DUF2490
Porin_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEW85414
UniProt:
G8X4I9
LinkDB
All DBs
Position
complement(651881..654304)
Genome browser
AA seq
807 aa
AA seq
DB search
MKLKDFKCMLLLLVVTKMFSQNTIIGKVVSNGIGVSQVEILDKNLNLNYFTDSNGNFTLK
KGSPTNLVFYKEGYEIIEKKIIPSAQLQIIEIEQLKKLSEVKIVSQRQKISAIRTLKDVE
ETAIYAGKKTEVIVVNNLTANKAINNARQIFSQVVGITMNESIDGGLQLSIGGRGLDPNR
TANFNTRQNDYDISADVLGYPESYYATPTEAIEEIQVIRGAASLQYGTQFGGMINFKIKK
PSTKPLEAVSRFTAGSFNTFANFTSLSGTKDKWSYYTFYNYKKGDGFRPNSNFESKNYFG
NLNYKLSDKTSLHLDYTHFNYLAKQPGGLTNGMFVNDPFQSNRSRNWFSVNWNLFALRLK
HKFNNDADFSLQLFGLDAYRKALGYRSNRVSNPDTPNTERDLIIGEFINWGAEARYLYKY
NLWNKRNAFLIGAKYYQSKNSGIQGPGSSTLDADFTIADKEFSYYQNQSSYSYPNLNISL
FGENIFKITDHFSITPGFRYEYIKTQAVGFFRVINRDLAGNINIDKTEFEDRIFERKFAL
LGLGFSYKPKYGLELYANLTQNYRSVTFNDIRTASPSIVVADDITDEKGYGSDIGLRGKI
GNIISFDINGFGLLYDNKIGEYSARDPKGLKPDVRLRDNIGTGITYGVESLVTINFLKMI
VPDNLNFKFDGFSNISITKSKYIKSDIPNIKDNHVEFVPLHNLKTGLSLGYKNLLVSTQY
TYVSSQFTDASNRISDQNDLSGIFGGIPSYNVLDVSASYKFNRFKLEASINNLTNNKYFT
KRATGYPGPGIIPSEPRVYYVTLEIKL
NT seq
2424 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaaaggattttaaatgtatgctactgctattagtagttacaaaaatgttttcg
caaaataccataattggtaaagttgtttctaatggaataggagtttcacaagttgaaata
ttagataaaaatttaaatctaaattactttactgattcaaatggaaatttcacactaaaa
aagggaagtccaacaaacttagttttttataaagaaggttacgaaattatagagaaaaaa
attattccatcagctcaattacaaattatagaaatagagcagttgaaaaagttatcagaa
gtgaaaatagtcagtcaacgccaaaaaataagtgctattagaactttaaaggacgttgaa
gaaacggctatatatgctggaaaaaaaacagaagtaatagtagtaaataatttaacagct
aataaagccataaataatgcgcgtcaaattttttcgcaagttgtaggtattacaatgaat
gaaagtattgatggaggattacaattatcaataggggggcgtggtttagatcctaataga
acagctaattttaatacacgacagaatgactatgatattagtgcagatgtgctagggtat
cccgaaagttattatgctactccaacagaagctatagaagaaattcaggtaatcagagga
gctgcgtctcttcagtatgggacgcaatttggaggaatgattaactttaaaataaaaaag
ccaagtactaaacctttagaagccgtttctcgttttacagcaggttcatttaatacattc
gctaactttacaagcttgagcggtacaaaagataaatggagttattataccttttacaat
tataagaaaggagacggattcaggcctaattcaaattttgaatcaaagaattactttggg
aatttaaattataaattatccgataaaacttcacttcatcttgattatacacattttaat
tatttagccaaacaacctggaggtttgaccaatggcatgtttgtaaatgatccttttcaa
agcaaccgatcacgtaattggttttctgtaaattggaatttatttgctttacgcttaaaa
cacaagtttaataatgatgcggatttctcattacaattattcggattagatgcttataga
aaagcgttaggatatcgttcgaatagagtttctaacccagatactcctaatacagaaaga
gatttaattataggtgaatttataaattggggagcagaagcacgatatctctataaatac
aatttatggaacaaacggaatgcttttttaataggtgccaaatattatcaatctaaaaat
tcagggatacaaggtccaggaagttctactttagatgctgattttacaattgcagataaa
gaattttcatattatcaaaatcagtcgtcctatagttatccaaaccttaatatatcatta
tttggtgaaaacatatttaaaataaccgatcatttttcaattacacctgggtttagatat
gaatatattaaaacacaagccgttggtttctttagagtaattaatagagatctagcagga
aatataaatatagataaaacagagtttgaagatagaatttttgaaagaaaatttgcatta
cttggacttggttttagttataaacctaaatatggtttagaattatacgctaatctaaca
caaaactatcgctcagtaacttttaatgatataagaaccgctagtcctagtattgttgta
gcagatgatataactgatgaaaaaggatacggttcagacattggcctccgaggaaaaata
ggaaacataataagttttgatattaacggatttggcttattatatgataataaaattggc
gaatatagcgcccgtgatcccaaaggattaaaaccggatgtacgcttaagagataatatt
ggaacaggtattacttatggagttgaatcattagttactatcaattttttaaaaatgata
gtacccgataatttaaactttaaatttgatggattttcaaatatatccataacaaagtct
aaatatataaaatcagatattcctaatataaaagacaaccatgttgagtttgtacctctt
cataatctaaaaacaggattaagtttgggatacaaaaatctattagttagtacacaatat
acttacgtatcatcacaatttacagatgcttctaatagaatttctgaccaaaatgactta
tcaggtatatttggtggaattccttcgtataatgtgttggacgtatctgcttcttataaa
tttaatcgttttaaattagaagctagtattaataatttgactaataacaaatactttacc
aaaagagcaacaggatatccaggcccaggtatcatcccttcagaacctagagtttattat
gtaacgctagaaattaaattgtaa
DBGET
integrated database retrieval system