Formosa sediminum: FNB79_13345
Help
Entry
FNB79_13345 CDS
T06103
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
fop
Formosa sediminum
Pathway
fop01501
beta-Lactam resistance
fop01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fop00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
FNB79_13345
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
FNB79_13345
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fop02000
]
FNB79_13345
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
fop01504
]
FNB79_13345
Transporters [BR:
fop02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
FNB79_13345
Antimicrobial resistance genes [BR:
fop01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
FNB79_13345
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Patched
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDO94910
UniProt:
A0A516GU65
LinkDB
All DBs
Position
complement(3040367..3043531)
Genome browser
AA seq
1054 aa
AA seq
DB search
MFNKFIKRPVLSAVISIIVLILGLIGITTLPISQYPDIAPPTVQVSASYDGANAEAVLNS
VIVPLEEAINGVEGMTYMTSTATSGSASISVYFELGTDPDIAAVNVQNSVSTATNLLPSE
VTQAGVTTEKQQSSNVFIFGLYSENDIYDEEFIQNYAEINLIPVLKRINGVGSASAFSSR
DYSMRIWLKANIMANYGLIPSDITTALDDQNLEAAPGELGLQGEQAYQYTLKYKGKLQNA
TDFEDIIIKTTDDGRILRLKDVARVELGSQSYSTSTTIKGKPGTGVAIAQSAGSNAQEVV
AQSLAALKEASKNFPEGIKYTEMVNANDFLDASIEKVIHTLLEAFLLVFLVVFIFLQDWR
STLIPAISVPVAVVGTFFFLSVFGFTINLLTLFALMLAIGIVVDDAIVVVEAVHAKLDSG
YKSARKASLDAMSEISGAIISITLVMSAVFIPVTFISGSSGVFYQQFGITLAIAIILSAI
NALTLSPALCALLLKPHEEHQSKSYLQRFYVAFNVGFEKTTSKYKNALTFLIRKKAIVIG
VIVVFIGLFVYLMNTTATGFVPDEDQGIVFADVSLPAASSLERTDEVLDELQKIVEDIPE
VNAFLRATGRGFISGTGSNYGMFILKLKPWDERTGDGQSVQDIINQLFAKTATMKDARMI
FFAPPTVTGFGLSNGFEVQLQDQSGGTVDALYKVSQDFIEALSKRPEIQYASTTFDPTFP
QYEVVVDVAKTKLAGLDVEGVLSVMQGYLSGVYASNFNKFGKQYRVIYQGEPNFRANLES
LNAIKVKNANGVMAPITEFITLKRVYGPQSLTRFNLFTAAKISGAPNAGYSSGDAINAIE
EVAAETLPTGYGYEFSGMTREEISAGSQTVYIFMLCFIFVYFLLCAQYESFILPVAVLLS
VPAGLSGVLIFANLFGISNNIYIQITLVMLIGLLAKNAILIVEFAIQRRREGESIIQSGI
DGAIARFRPILMTSFAFIFGLFPLMISTGAGAVGNRAIGTGAIGGMLIGTILGIMVVPVL
FIIFQTLQEKIVGVPNHDWGDEDDEDENELPLHS
NT seq
3165 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaataaatttataaagcgaccggttctttcggcggtaatttctataatcgtttta
attttaggacttattggaattacaacattaccaatatctcaatatccagatattgcacca
cctacggtacaggtctcagcctcttatgatggagctaatgctgaagccgtattaaatagt
gttattgtaccattagaagaagcaattaatggtgttgagggtatgacctatatgacctct
acagcaactagtggctcggctagtataagtgtatattttgaattaggtacagatcctgat
attgcagcagtaaatgttcaaaatagtgtatctacagctacaaacctattaccttcagaa
gtaactcaggctggtgttactacagaaaagcaacaaagtagtaatgtctttatttttgga
ttatacagtgaaaacgatatttatgacgaagaatttattcagaattatgctgaaattaat
ttaattccagtattaaaaagaattaatggagttggtagtgcttcagcatttagttcaaga
gactatagtatgcgtatatggctaaaagctaatattatggctaactatggtttaattcct
tctgatattactacagcgcttgatgatcaaaacttagaagcagcaccaggagaattaggt
ttacaaggtgaacaagcctatcaatatactttaaaatacaagggtaaattacaaaatgca
accgattttgaagatattattattaagactacagatgatgggcgtattctacgtttaaag
gacgttgcgagagtagaattaggatcacaatcatatagtacatctactaccattaaaggt
aaaccaggtactggtgtcgctatagcacaatctgccggatctaatgctcaagaagtagtt
gctcagtcacttgcggctttaaaagaggcttctaaaaatttccctgaaggtataaaatat
accgaaatggtaaatgcaaatgattttttagatgcgtctattgagaaagtaattcacacg
ttattagaagcattcttattggtttttcttgtggtttttattttcttacaagattggcgt
tctacattaattcccgctatatctgtacctgtagctgttgtgggaactttctttttctta
agtgtatttgggtttaccattaatttattaactttatttgcgttaatgctcgctattggt
atagtggtagatgatgctattgttgtggttgaagcagtacatgctaaattagattcggga
tataaatctgcccgaaaagcaagtttagatgccatgagtgaaatttctggggcaattatt
tctattaccttggtgatgtctgcagtatttattccagtaacatttattagcggatcgtct
ggggttttctatcaacagtttggtattacacttgctatagcaattatattatctgctata
aatgcattaaccttaagtcctgccttatgtgctttgcttttaaaaccacacgaagaacat
cagtcaaaaagttatttacaacgcttctatgtggcatttaatgtaggttttgagaaaaca
acttctaaatataaaaatgcattaacatttttaattcgtaagaaagcgattgttattggt
gttattgttgtttttattgggttgttcgtttatttaatgaatactacggcaacaggtttt
gtacctgatgaagatcaaggaattgtttttgccgatgtaagtttacctgcggcatcatct
ttagaaagaacagatgaagtattagatgaattacaaaaaatagtggaagacataccagaa
gtaaatgcatttttaagagctacaggtcgtggttttattagtggtacagggtctaattat
ggtatgtttatcttaaaactgaaaccttgggatgagcgtacgggagatggacaaagtgta
caagatatcattaatcagttgtttgcaaaaacagcaaccatgaaagatgctagaatgata
ttttttgctccgccaaccgttacagggtttggtttaagtaacgggtttgaagtacagttg
caagaccaaagtggaggtactgtagatgcactttataaggttagtcaagattttattgaa
gcattgagtaaacgaccagaaatacagtatgccagcacaacgttcgatcctacgtttcct
caatatgaagtagttgttgatgtcgctaaaacaaaactagcaggtttagatgtagaaggc
gtattaagtgtcatgcaagggtatttaagtggtgtatatgcctcaaactttaataaattc
ggtaagcaatatcgtgttatttatcaaggtgaacctaattttagagccaatctagaaagt
ttaaatgccataaaagttaaaaatgccaatggagttatggcacctattactgagtttata
accttaaaaagggtgtacggaccacaaagtttaacgcgttttaacttatttacggcagca
aaaataagtggagctcctaatgcaggctatagttctggtgacgctattaacgctattgaa
gaagtagccgcagaaactttaccaaccggttatggatatgaattttcagggatgacaaga
gaagaaatttcagcaggtagccaaaccgtttatatatttatgttatgttttatatttgtt
tatttcttgctatgtgctcaatatgagagctttatacttccggtagctgttttgttatct
gttccagctgggctttcaggagttttaatatttgcgaatttatttggtattagtaacaac
atttacatacagattacattagtgatgttaattgggttactggctaaaaatgccatttta
attgtggagtttgccatacagcgaagacgagaaggagaatccattattcaatcaggtatt
gatggagcaatagcacgatttagacctattttaatgacatcatttgcgtttattttcggt
ttatttccgttaatgatttctacaggtgctggtgctgtaggtaacagagctattggtaca
ggtgctattggaggaatgttaattggtactatattaggaataatggttgtacctgtactt
tttatcattttccaaacacttcaagaaaaaatagttggagtgcctaatcacgattgggga
gacgaagatgatgaagatgaaaatgaattaccattacactcataa
DBGET
integrated database retrieval system
