Candidatus Hepatoplasma scabrum: HPPSJP_2510
Help
Entry
HPPSJP_2510 CDS
T09843
Symbol
cas9
Name
(GenBank) CRISPR-associated endonuclease Cas9
Organism
hsg
Candidatus Hepatoplasma scabrum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HNH_4
Cas9-BH
Gon7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDV03530
LinkDB
All DBs
Position
complement(287862..291473)
Genome browser
AA seq
1203 aa
AA seq
DB search
MNKEQNKKFLALDIGVTSLGWAISEYNKNTKKIDILDFGVRLWDSPEDSKSLDTKSSERR
IFRSGRRLNSRKKTRIKDLKNLFYSNNFLSAKDYSNHSEKIKLNGKNYLKNNIFDPLILR
KKGLTEKLTNLELLIALINIAKRRGYSNKFIIPDLEEKNNDARESIKKSDELIAKYKYPI
LAITESNLFNFNSPEKFIYRSKKLNLKKFEKYIYEDKSKTKIIETNVNNLILKYDLKFDK
NTNLKQKVKTLQDKINEFYTNHQILFNRKDYEIEVDAIIDKQIEYNSKLKNLEEDIKKII
FRQRDFEDGPGPNDQKIKEFWKNSLKKDSKQFYYKPFIENVGYCQFFPNKKRVSCFSIEN
DISFILNESSKIFSKLKKEKNIDNENIKILTKEIFNNYFTNFKFDKKIINDIFEKNKLQL
PPILKGISFANSGLFLHNFAKKKENKEFILKNLNINLNFLNSIKESKINKIAEILFKYKT
PQKLKNKLIEIDNFFNDDKKGYEWIKNNNDWIKRGNKTLSTSSEFILSALKNQLETGELI
SEYQYRLNAKKDQEKINKLNLNAKEFEPIRDKDMQKNSVVFRSINQIRLVVRDLFKKYNN
FDNVIIEVAKDLYAEKKIRKNIRNNQDKNQKRREEAAIELKKNNLDPSNKNINKYLIWKE
QQIDQQGKKEQYAIDIYDINLKEKIYLKEFILDINNNYQIDHIAPYSLVNDDSKNNKIVT
STKNNALKNNKTPLDYFKSQNLSTKIISNWKNKIEKSFDKNQIKQSYLFLDTINRSTEMG
FETRDINDTRYITKYISDYFKLEFTKISKKKNILTPKILQIQGGITSYFRRMWLNPTNSL
IGSLWGDDKKLRDISPFHHAVDAIILSNMISKEHIEIYQLSIRIIRYYNYLVNQFYKNKL
DKFNVKEELFKQKKAIDQVMTNFNIVNFTRADLLKEKIDDIFSYIINEIDQRIKNNQKLE
KIDFKADKFIFNLISPLIENLPQKINNLIPVKLKWKEEESIKEILNINTNELKKEKIKNK
VPGFLNTIEASEWAKLNNKKIEQYPYVSYKIDKRVRGQILAEQNPSGKKEALDPKTKQLK
SSFIKDKAGNYWDISKYIGYQYDDKNKLIPIYRNKMIEYAKNKQKINLVLFRNAQFKLPD
SEIVYVYRGLGGLGKVILAGNANLKQQSDSKYEKIIGNWPRIGVAKAQELKLVNITRLGK
LQE
NT seq
3612 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaagaacaaaataaaaaatttttagcattagatatcggggttacctcacttgga
tgagcaatttctgaatataataaaaatacaaaaaaaattgatatattagattttggagtt
agactttgagattcacctgaagatagcaaatcattagatacaaagtcatctgaaagaaga
atttttagatctggaagaagattaaattcacgaaaaaaaacaagaataaaagatttaaaa
aatttattttatagtaataattttttatctgcaaaagattatagtaatcatagtgaaaaa
ataaaattaaatggaaaaaattatttaaaaaataatatatttgatcctttaatcttaaga
aaaaaaggcttaacagaaaagttaacaaatttagaattattaattgcattaataaatatt
gcaaaaagaagaggatatagtaataaatttattattcctgatcttgaagaaaaaaacaac
gatgcaagagaaagtattaaaaaaagtgatgagttaattgctaaatataagtatcctatt
ttagcaattactgaaagtaatctttttaattttaattctcccgaaaaatttatctatcga
agtaaaaaattaaatttaaaaaaatttgaaaaatacatttatgaagataaatcaaaaact
aaaataatagaaacaaatgttaataatctaattttaaaatatgatttgaaatttgataaa
aatacaaatttaaagcaaaaagtaaaaactttgcaagataaaattaatgaattttacact
aatcatcaaattttgtttaatagaaaagattatgaaattgaagttgatgctattatagat
aagcaaattgaatataattcaaaattaaaaaatttagaggaagatattaaaaagataatt
tttagacaacgtgatttcgaagatggtccaggaccaaatgatcaaaaaataaaagaattt
tgaaaaaattctctcaaaaaagattcaaaacagttttactataaaccctttatcgaaaat
gtaggatattgtcaattctttccaaataaaaaaagagtatcttgtttttcaattgaaaat
gatatttcttttatattaaatgaatcttcaaaaatattttctaaattaaaaaaagaaaaa
aatattgataatgaaaatataaaaattctcacaaaagaaatttttaataattattttaca
aattttaaatttgataaaaaaataattaatgatatttttgaaaaaaataaattacaactt
cctcctattttaaaaggaattagttttgcaaatagtggactttttttacataattttgca
aagaaaaaagaaaataaggaatttattttaaaaaatctaaacattaatttaaatttttta
aattcaatcaaagaaagcaaaataaataaaattgctgaaattttatttaaatataaaaca
ccacaaaaattaaaaaataaattaattgaaattgataatttttttaatgatgataaaaaa
ggttatgaatgaatcaaaaataataatgattgaataaaaagaggaaataaaaccctatca
acttctagtgaatttattttatcagcgcttaaaaatcaattagaaacaggtgaacttatt
tctgaatatcaatacagattaaatgcaaaaaaagatcaggaaaaaatcaataaacttaat
ttgaatgcaaaggaatttgaaccgattagagataaagatatgcaaaaaaattctgttgtt
tttcgttcaattaatcagattagattggttgtccgtgatctttttaaaaaatacaataat
tttgataatgtaataatagaagttgctaaagatctttatgcagaaaaaaagatcagaaaa
aatattagaaataatcaagataaaaatcaaaaaagaagagaagaagcagcaatcgaactt
aaaaaaaacaatttagatccctctaataaaaatattaataaatatctaatttgaaaagaa
cagcaaatagatcaacaaggtaaaaaagaacaatatgcgattgatatctatgatataaat
cttaaagagaaaatttatttaaaagaatttatattagatataaataataattatcaaata
gatcatatagctccttattctttagtaaatgatgatagcaaaaataataaaatagtaaca
tcaacaaaaaacaatgctttaaaaaataataaaacacctttagattactttaaaagtcaa
aatttatcaacaaagattataagtaattgaaaaaataaaatagaaaaatcatttgataaa
aatcaaataaagcaatcatatctatttttagatacaataaatagatcaactgagatgggt
tttgaaaccagagatataaatgacacgagatatattacaaaatatattagcgattatttt
aaattagaatttaccaaaatcagtaagaaaaaaaatattttaactccaaaaatattacag
atacagggaggaatcacatcttattttagaagaatgtgattaaatccaactaattcttta
attggtagtttatgaggagatgataaaaagctacgtgatatttctccttttcatcatgcc
gttgatgcaattattctttcaaatatgatttcaaaggaacatattgaaatttatcaatta
agcataagaattattagatattataattatttagtaaatcaattttacaaaaataaactt
gataaatttaatgtaaaagaagaattatttaagcaaaaaaaggcaattgatcaagtaatg
acaaattttaatatcgttaactttacaagagcagatcttttaaaagaaaagatagatgat
attttctcttacattattaatgaaattgatcaaagaattaaaaataaccaaaaattagaa
aagatagattttaaagctgataaatttatttttaatttaataagcccacttattgaaaac
ttaccgcaaaaaataaataatttaattcctgttaaattaaaatgaaaggaagaagaatct
ataaaagaaattcttaatattaatacaaatgaattaaaaaaagaaaaaattaaaaataag
gtaccgggatttttaaatacaattgaggctagtgaatgagccaaattaaacaataaaaaa
attgaacaatatccttatgtatcttacaaaattgataaaagagttagggggcaaattctt
gcggaacaaaatccatctggaaaaaaagaagcattagatcctaaaacaaagcaattaaaa
tcttcatttattaaagataaagcaggaaattattgagatatttctaaatatattggatat
caatatgatgacaaaaataaattaattccgatttatcgaaataaaatgatcgaatatgca
aagaataaacaaaaaataaatcttgtattatttcggaatgcacaatttaaattacctgat
agtgaaattgtgtatgtttatcgtggattaggtggattaggaaaagttatattagcagga
aatgcaaatttaaaacaacaatcagattcaaaatatgaaaaaataattggaaactggcca
agaattggtgttgcaaaggcacaagaattaaaacttgttaacataacaagattaggaaaa
ttacaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
