Kosakonia calanthes: AAEY27_06975
Help
Entry
AAEY27_06975 CDS
T10644
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
KO
K26149
c-di-GMP phosphodiesterase [EC:
3.1.4.52
]
Organism
kca Kosakonia calanthes
Brite
Enzymes [BR:
kca01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.4 Phosphoric-diester hydrolases
3.1.4.52 cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase
AAEY27_06975
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WZV99614
LinkDB
All DBs
Position
1483430..1485616
Genome browser
AA seq
728 aa
AA seq
DB search
MKDRKYSYVRKFVLALILCLVAIPVSRFISPSTIVDASNVYLAWLPLSVTLAIILLFGRH
GILPVIIGFALINESFLRLPAAEAAVLLFCQLFSVLLMCAIVRWRLGSRWRHGIPNKDMG
VRILWLAFIAPVGIKVSMYIAGAWLNYPIHLSSFFGNGTIIYSIIDIQSLICAALIFTMI
IYYPLRMILNPRFARTFWRRSVTPCLTRKKRLFTLVWMATLIATVIILCAPFKSDIVAGY
LVPVIFVIFTFGISKLTPSLITLSWPISAFMLLAYNNNFFHGVRSDYSLAFVMSVLICFT
INMLYMTRVFSRSQWLKQRWQAQAMSDPLTGLPNLRALEKQIEQQPDCVVCCLHMKNLEF
LSRHFGMMMRVHVKRSVTQALQPLLHDGERFFQLPGSELLLVLTGPETLARLHNMLDYLN
SRRIYWNNTGLEIEFGASWGELHGSGEALHQTLGQLSWLSEQACAENQVLALTNSLQVVN
DQTTERVLLLNKVKRALDEGGIVLYAQPIVDANGQGYHEILTRLVSDGNIMTPDQFIPVI
AQFNLGARFDMQVVESLLQWMQAHPQEGNRARYSLNLMPLTLMQKQFSAQFLALFERYSV
PAHEVIIEITEEQAFSNSEISILNIMQLRQAGFKIAIDDFGTGYANFERLKRVQADIIKI
DGCFVRDILQDKQDAMIVKAICELAKAKSLTVVAEFVENEAQREILLNAGVDYLQGYLLG
KPQPLADA
NT seq
2187 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagacagaaaatacagttacgtgaggaagtttgtgcttgcgttaattctgtgcctg
gtggcgattcctgtttcacgatttatttcaccgagtactattgttgatgccagcaatgtt
tacctcgcctggttaccattaagcgtaacgctggcaattattttattatttggccgacat
ggaatcctgccggttatcattggctttgccttgattaacgagagttttttacgtttaccc
gctgccgaagcggcagtgttattattctgccagttgttttcggtattgctgatgtgcgcc
atcgtgcgctggcggcttggctcgcgctggcgccacgggattcccaacaaagatatgggc
gtgcgcatcctgtggttggcatttattgccccagtgggaattaaagtgtcaatgtatatc
gccggagcgtggctaaactacccaatacatttatcaagtttctttggtaatggaacaata
atatattccattatcgatattcagagtttgatttgtgccgcattgatttttaccatgatt
atctattatccattacggatgattcttaatcctcgttttgccaggacattctggcggcgc
agcgttacaccttgtttaaccagaaaaaaacgtttatttacccttgtttggatggcgaca
ttaattgccacggttattattttatgcgcaccttttaaatccgatattgttgcaggttat
ctggttccggttatttttgttatcttcacttttggtatcagcaagttgacaccttcgctg
attacattaagttggcctatatccgcttttatgctgctggcctataacaacaattttttc
catggcgtacgttctgattactcgctggcgttcgtgatgtcggtgctgatctgcttcacc
attaacatgctgtatatgacgcgcgtttttagccgcagccagtggctgaaacagcgctgg
caggcgcaggcaatgagcgacccgctaaccggtttgccgaatttgcgtgcgttggaaaaa
caaatcgagcagcaaccggattgcgtggtgtgttgcttgcacatgaaaaaccttgagttc
cttagccgacatttcggcatgatgatgcgcgtgcatgtgaagcgcagcgtcactcaggca
ttacagccgctattgcatgatggcgagcgctttttccagttgccaggcagcgagttactg
ttggtgctgaccgggccggaaacgctggcgcgcttgcacaatatgttggattacctgaac
agtcgccgcatttactggaacaataccgggctggaaattgagtttggcgcttcgtggggt
gagttgcacggtagcggggaagcattgcaccaaacgctggggcaactaagttggctttcg
gaacaagcctgcgccgaaaatcaggtattggcgttaacgaacagtctgcaagtagtaaac
gaccaaaccaccgagcgcgtattactgcttaataaagtcaaaagggcgctggatgagggc
ggcatcgtgctgtatgcgcagcccattgtcgatgccaacggccagggttaccacgagatc
ctgacgcggctggtcagcgatggcaacatcatgacgcctgaccagtttattccggtgatt
gcgcagtttaacctcggcgcgcgtttcgatatgcaagtggttgaaagcttattgcaatgg
atgcaggcgcatccgcaagagggtaatcgcgcgcgttactcgctaaacctaatgccgcta
acgttgatgcaaaagcagttctccgcgcaatttctggcactttttgaacgctattcagtt
ccagcccacgaagtgattattgagatcaccgaagagcaggccttttcgaattcggaaatc
agcattcttaacatcatgcagttacgtcaggcggggttcaaaatcgctatcgacgacttt
ggtaccggctatgccaactttgaacgtctgaaacgcgtgcaggcggacatcatcaaaatc
gatggctgtttcgtgcgggatattttgcaggacaagcaagatgcgatgatcgtgaaggcg
atttgcgagctggcgaaggcgaaatccctgaccgtggtggctgaattcgttgaaaacgag
gcgcagcgagaaatattactcaatgcgggagtggattatctacaaggttatttactcggg
aagccgcagccattggcggacgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
