KEGG   Candidatus Kinetoplastidibacterium kentomonadis: CKSOR_00703
Entry
CKSOR_00703       CDS       T05428                                 
Symbol
rpoB
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
  KO
K03043  DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:2.7.7.6]
Organism
kso  Candidatus Kinetoplastidibacterium kentomonadis
Pathway
kso03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:kso00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    CKSOR_00703 (rpoB)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:kso03021]
    CKSOR_00703 (rpoB)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:kso03400]
    CKSOR_00703 (rpoB)
Enzymes [BR:kso01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     CKSOR_00703 (rpoB)
Transcription machinery [BR:kso03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     CKSOR_00703 (rpoB)
DNA repair and recombination proteins [BR:kso03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      CKSOR_00703 (rpoB)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb2_1 RNA_pol_Rpb2_45 FH2 SopD
Other DBs
NCBI-ProteinID: AWD32804
UniProt: A0A3Q8EYG7
LinkDB
Position
complement(726400..730506)
AA seq 1368 aa
MSYSYTEKKRIRKSFAKREEVQKIPYLLATQLNSYQNFLQSDINPPDRSCHGLQAAFLSV
FPIVSHNGFAKLEFVQYELGNAVFDVKECQLRGLTFASPLKAKVRLIIFDRDSNKQVIKE
IKEQYVYMGEIPLMTENGSFIINGTERVVVSQLHRSPGVFFEHDKGKTHSSGKLLFSARI
IPYRGSWLDFEFDPKDILFFRIDRRRKMPITILLKAIGMTIEEILSYFFDFDTFEIKNNG
AMMKFIPERWKGEIAKFDILDKNGSILVKQDKRINAKNLKDISLSGIDNVFVPDNFLIGK
IVSQDIIDIETGEIIIKANDEITEENLYNLRSSKIKNISTIYINDLDRGPYISQTLKIDD
TLDQVSAKIAIYRMMRPGEPPTEEVIEFLFQKLFFNEETYDLSHVGRMKINSKFSKHDIG
NNVLTLTNEDILRTVKFLVELRNGRGQVDDIDHLGNRRVRCVGELTENQFRSGLVRVERA
VKDKLNQAEIDNLMPHDLINSKPISAAIKEFFGSSQLSQFMDQTNPLSEITHKRRVSALG
PGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRVCPIETPEGPNIGLINSMALYARLNDYGFLETPYKKV
VDGKITNQIDYLSAIEESHYVIAQANATLDKDGVFTDDLVASRQNGETMLTSPINIDYVD
IAPSQIVSVAASLIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPCLRPEKPLVGTGVERTVAVDSGT
TVQAKRGGIVEYVDAERIVVKVNDIENIAGEIGVDIYNLIKYTRSNQNTNINQRPIVKKG
DHIIAGDVLADGASSDLGELALGQNMLVAFMPWNGYNFEDSILISEKVVSDDRYTSIHIE
ELTVVARDTKLGPEEITRDISNLSETQLNRLDDSGITYIGSEVRTGDVLVGKVTPKGETQ
LTPEEKLLRAIFGEKASDVKDTSLRVPSGMVGTVIDVQVFTREGVKRDKRAQSIIDSELN
RYRQDLNDQLRIVENDLFDRILKTIIGKPVNSGPNKLSKNMTITKEYLLNLDRWHWFDIN
MSNDDDARFLEQAKDSFEHKRKEFDLLFEEKKKKLTQGDELPPGVLKMIKVYLAVKSRLQ
PGDKMAGRHGNKGVVSKIVPIEDMPHMADGTPVDIVLNPLGVPSRMNVGQVLEMHLGWAS
KGIGNRISNLLKMNINVNNIRSFLETIYCSKSSLEKIKNMNDTEIIEMANNLQSGVPFAT
PVFDGATEQEINDMISLAYPKEIADDLLLTESKTQAWLFDGRTGEKFERPITIGYMHFLK
LHHLVDDKMHARSTGPYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEMLTVK
SDDISGRTKLYENIVKGNHFIDAGMPESFNVLVKEIRSLALDIDLERN
NT seq 4107 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcttactcgtatacagaaaaaaaacgtattcgtaaaagttttgcaaaacgtgaagaa
gttcaaaaaataccgtacctgctagctactcaattaaattcatatcaaaattttttacaa
tcagatattaatccaccagatcgttcctgtcatgggttgcaagctgcatttttgtcagta
tttcctattgtaagtcataatggttttgctaaattagaatttgttcaatatgagcttggt
aatgctgtatttgatgtaaaagaatgtcaattacgtggattaacttttgcttcaccttta
aaagctaaggtacgtttaataatatttgatcgagattctaataaacaagttataaaagaa
attaaagaacaatatgtatatatgggtgaaattccattaatgactgaaaacggttcattt
attattaatggaacagaaagagtagttgtttcacaattacatagatcaccaggtgtattt
tttgaacatgataagggcaaaactcatagttcaggaaaattattattttctgctcgcata
atcccttatagaggatcttggttagattttgaatttgatcctaaagatatattatttttt
cgtatagatcgtcgcagaaaaatgcctataactatcttattgaaagctataggtatgact
atagaagaaattttaagctatttttttgattttgatacatttgaaattaaaaataatggc
gctatgatgaagtttataccagaaagatggaaaggtgaaatagctaaatttgatatttta
gataaaaatggttcaattttagtaaaacaagataaaagaattaatgcgaaaaatttaaaa
gatatttctttatcagggattgataatgtatttgttccagataattttttaattggaaaa
atagtatcacaagatattatagatattgaaactggcgaaattattattaaagctaatgat
gaaattacagaagaaaatttatataatttaagatcatctaaaattaaaaatatttccaca
atatatattaatgatttggatcgagggccttacatatctcaaacattaaaaattgatgat
actttagatcaggtctctgctaaaattgctatatatagaatgatgcggccaggagagcct
cctacagaagaagttatagaatttttatttcaaaaattattttttaatgaagaaacttat
gatttatctcatgttggaagaatgaagataaatagcaaatttagtaagcatgatattgga
aataatgttttaactcttactaatgaggatattttaagaactgtaaaatttttagtggaa
ttacgtaatggtcgtggtcaggttgatgatatcgatcatcttggtaatcgtagagtaaga
tgtgttggagaattaacagagaatcaatttagatctggattagttagagtagaaagagca
gtaaaggataaattaaatcaagcagaaatagataatttaatgccacatgatttaataaat
tctaaaccgatatctgcagctattaaagaattttttggttcaagtcaattatctcaattt
atggatcaaactaatcctttatctgaaattacacataaaaggagagtatctgctttaggt
cctggtggtttgactcgtgaaagggctggatttgaagttagagatgttcatccaacacat
tatggtagagtatgtcctattgaaacaccagaaggtcctaatataggactaataaattct
atggctttatatgcaagattaaatgattatggttttttagaaactccttataaaaaagtt
gtagatggtaaaattactaatcaaattgattacttatctgctatagaagaaagtcactat
gttatagctcaagcaaatgctacattagataaagatggtgtttttacagatgatttggtg
gctagccgccaaaatggagaaactatgttaacttctcctataaatatagattatgttgat
atcgcaccatctcaaatagtttcagtagctgcgtctcttattccatttttagagcatgat
gatgctaatagagcattaatgggagctaatatgcaacgtcaagcagttccttgtttaagg
cctgaaaaacctttagttggaactggtgtagaacgcactgtagctgtagattctggaact
actgtacaagctaaaagaggtggtatagtagaatatgttgatgctgaaagaatagttgta
aaagttaatgatatagaaaatattgctggtgaaataggtgtagatatttataatttaatt
aaatatactagatcaaatcaaaatactaatattaatcaaagacctatagtaaaaaaagga
gatcatattattgctggtgatgtattagcagatggagcttcttctgatcttggtgaatta
gctttaggtcaaaatatgttagtagcttttatgccttggaatggctacaattttgaggac
tctatattaatatctgagaaagtagtatctgatgatagatatacttctatacatatagaa
gaattaactgtagtagcacgtgatactaaattaggccctgaagaaattactagagacata
agtaatttatcagaaacacaattaaatagacttgatgattctggtatcacttatatagga
tcagaagttagaactggagatgtattagttggaaaagtaactcctaaaggagaaacacaa
ctgacaccagaagaaaaattattaagagctatttttggtgaaaaagcttcagacgtaaaa
gatacttctttaagggtgccttctggtatggtaggaactgttattgatgttcaagtattt
actagagaaggtgttaagcgagataaaagagctcaatcaattattgatagtgaattaaac
cgttatcgtcaagatttaaatgaccaactaagaatagttgaaaatgatttatttgataga
atactgaaaacaattattggtaaaccagttaatagtggtccaaataaattaagtaagaat
atgacaattactaaagaatatttacttaatttagatagatggcattggtttgatattaat
atgagtaatgacgatgatgcaagatttttagaacaagctaaggattcttttgaacataaa
agaaaagagtttgaccttttatttgaggaaaaaaagaaaaaattgacacaaggtgatgaa
ttaccaccaggtgttttaaaaatgattaaagtttatttagctgttaaaagtagattacaa
ccaggtgataaaatggctggtcgtcatggaaataaaggagttgtatctaaaatagtacct
attgaagatatgcctcatatggcagatggaacacctgtagatatagtattaaatccttta
ggtgttccatctagaatgaatgtaggtcaggtattagaaatgcatttaggatgggcttct
aaaggtataggaaatagaatttctaatttattaaaaatgaatataaatgttaataatatc
agaagctttttagaaactatttattgttctaaatcatctttagaaaaaattaaaaatatg
aatgataccgaaatcattgaaatggcaaataatctccaaagtggagtaccatttgctaca
cctgtttttgatggagctactgagcaagaaatcaatgatatgatatctttagcttatcct
aaagaaattgctgatgatttacttttaactgaatctaaaacacaagcttggctatttgat
ggtagaactggtgaaaaatttgaaagaccaattactataggatatatgcactttcttaaa
ttacatcatttggtagatgataaaatgcatgctcgttcaactggtccttattctttagtt
actcaacaaccattaggaggaaaagctcagtttggtggtcaacgttttggtgaaatggaa
gtttgggctttagaggcatatggagcagcatatactttacaagagatgttaactgttaaa
tcagatgatatttctgggcgtacaaaattgtatgaaaatatagtaaaaggaaatcatttt
attgatgctggaatgccagaatcatttaatgttttagtaaaagaaattcgttctttagct
ttagacatagatttggagcgtaattga

DBGET integrated database retrieval system