Fructilactobacillus sanfranciscensis: LSA_2p00290 Help Entry LSA_2p00290       CDS       T01627                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K07012   CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4] Organism lsn  Fructilactobacillus sanfranciscensis Brite KEGG Orthology (KO) [BR:lsn00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02048 Prokaryotic defense system [BR:lsn02048]     LSA_2p00290 Enzymes [BR:lsn01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      LSA_2p00290 Prokaryotic defense system [BR:lsn02048]  CRISPR-Cas system   Type I CRISPR-Cas system    Type I signiture cas proteins     LSA_2p00290 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Cas3_HD Cas3_C DEAD ResIII Helicase_C Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AEN99730 UniProt:  G2KWT3 LinkDB All DBs Position pLS1:18746..21508 Genome browser AA seq 920 aa AA seqDB search MIDLTKRERALWAKKRSDDGNQHWLPLVTHLIDAQKTINWLFNHWISDEQRQLIANGLSD ENIQKLVKFIGFSHDIGKATPAFQTKPSYGGDRSLDAEVIERLVRSGFVKLDDSLLTCAS KSPHAEAGEAILENLGVPVSVGAIIGGHHGKPLPDAPRAQLNDYTANYYQSDIDQAAQKR WKQVQTDIFDYGLKLSGYERIDQIPSINQPQAVLLEGLLIMADWLASSEYLNDDESKPLF PLIQMNQSLTDIDMNSRFENAIETWDLSGEWEPQRVSTDNDPYKSRWGFNARPVQLAMTS IIGDTVDPGMVIVEAPMGLGKTEIALVAAEQLAYQKGKDGLFMGLPTQATTNAMFDRVDG WLEKLAENQDEKFSIKLMHGKAQFNKNYQNLPYASNIDDPDGSGKAGSVVVNSWFSGKKS ILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFLKHLGFSGKVVIIDEVHAYDSYMNQYLYKAINWLGA YHVPIVILSATLPKEKRNLLLIAYLRGKYGKKYKQIFEASTGWQDTQAYPLLSILDGSKL TQISNFPGQNDQPVTQLDVERLNLDDKTLIQHVLHKISAGGIAGIIVNTVRRAQKLARLV PQDTQLMILHSAFLSPDREKQEEALQNSIGKHGQRPTKMIVIGTQVLEQSLDIDFDVLYT DIAPMDLILQRAGRLHRHDIKRPEALKLPQVYVMGINDFGDYGDANQAIYPKYLLIKTDY FLKNKIILPDDISKLVQEVYDPHTDDQVGDIADAKAEFDNKFETEKHKANAFQIDKPSYG RNTTIHGWLNRSQVDVDKDEQKANAAVRDIRETLEVILLKHTNQGNFLLDGRHLAKVAPQ EIAEQLIRIPSAVTPRIDKAIDALENLTSKYYPQWQESPWLRGALALPLDDNLSARLGEW SLTYTSKFGLSYERKDENER NT seq 2763 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgattgatctaactaaacgggagcgggctttatgggctaaaaaaaggtctgatgatggt aatcaacactggttgccactagtcactcacttaattgatgcacaaaaaacaattaattgg ctgtttaaccactggatcagtgatgagcaacgccaattaattgccaatggtttatctgat gaaaacattcaaaaattagtgaaatttattgggttctcccatgacattggaaaagcaact ccggcatttcaaacgaaaccatcatatggtggtgatcgatcacttgatgctgaggttatt gagcgtttagttaggagcggttttgtaaaattagatgattcacttttaacgtgtgcttcg aagtcaccgcatgctgaagctggtgaagcaatcttggaaaatttgggtgttcctgtttcg gtgggcgctattattggtggacaccacggaaagccattgccggatgcccccagagcacaa ttgaatgactacacggctaattattatcaaagcgatattgaccaagcggctcaaaaacgt tggaaacaggttcaaacagatatttttgattatggtttaaaattatctggatatgaaaga attgatcaaattccttcaattaatcaaccacaggcagtcctgctagaaggccttttgatc atggccgactggttggcgtcaagcgaatatttaaacgacgatgaatcaaagccacttttc cccttgattcagatgaatcagtcgcttactgatattgatatgaatagtcgctttgaaaac gcaattgaaacttgggacttgagtggtgaatgggaaccacaaagagtttcaactgataat gatccatacaaatctcgctgggggttcaatgctcgaccggttcagctggctatgactagc ataattggcgatacggttgatccaggaatggtgattgttgaggcaccaatgggcctgggg aaaacggagatcgctttagttgcggctgaacaattagcatatcaaaagggtaaagatggt ttattcatggggttgccaactcaagccacaactaatgctatgtttgatcgagttgatggt tggctggaaaagctggcagagaatcaagatgaaaaattttcaattaaattaatgcatggt aaagctcaatttaataaaaactatcaaaatttaccttatgcttcgaatattgatgatcct gacggttcgggtaaggctggatccgtggtggttaattcgtggttttctggcaaaaaatca attttaactaaattcacggtgggaacaattgataatctgttgttgatgggattaaaacaa aaacatttatttttaaaacatctgggatttagtggcaaggttgtcattattgacgaagtt catgcttatgacagctacatgaatcaatacttatataaggcaatcaattggcttggggcc taccatgtaccaatcgtgattttatctgcaactttgcccaaagaaaaacgaaatttgctt ttaattgcgtatttaagggggaagtatggtaaaaagtacaaacaaatttttgaggcttct acaggttggcaagatacacaagcttatcctttattaagcattttggatggcagtaagtta acacaaatttcaaactttccaggacagaatgatcagccggtaactcaattggatgttgaa cgcctcaatcttgacgataaaacgttgatacagcacgttttacataaaattagtgctggt ggaattgccggaattatcgttaatactgttcgacgagctcagaaacttgctaggctggtc ccccaagatacccaactgatgattcttcactctgcttttctttcaccagatcgggagaaa caggaagaggctttacaaaattcaattggcaaacatggccaacgtcctaccaaaatgatc gtcattggtactcaggtattggagcagtctttggacattgacttcgacgttttgtatacg gacattgcaccaatggacttaatattacaacgagccggtcgtcttcatcggcacgatatt aaaaggccggaagcacttaaattaccgcaggtatatgtaatggggatcaatgattttggt gattatggagatgctaaccaagcgatctatccgaaatatttactgataaaaacggattat tttttaaaaaataaaattattttaccagatgatatttcaaaacttgttcaggaagtctat gatccccatacagatgatcaagttggtgacattgctgatgctaaggcagaatttgataat aaatttgagacagaaaaacataaagccaatgcttttcagattgataaaccgagttatgga agaaatactaccattcatggttggttgaatcgcagtcaagttgatgttgataaggatgaa caaaaagccaatgcggcggtccgagatatcagggaaaccttggaagttattttattgaag cacacaaatcaaggcaattttttgttagatggtcgtcatttggctaaagttgcgccacaa gagattgccgaacagctgattagaattccctcagcagttacaccgagaattgataaagca attgatgctttagaaaatttgacgagtaaatattatccccagtggcaggaaagtccatgg ttgcgaggggcactagcattgccactagatgataacttatcagcaaggttgggtgagtgg tcccttacgtacacttcaaagtttgggctaagttatgaaaggaaggatgaaaatgagcga tag

DBGET integrated database retrieval system