Lytechinus variegatus (green sea urchin): 121415504
Help
Entry
121415504 CDS
T11173
Name
(RefSeq) deleted in malignant brain tumors 1 protein-like isoform X1
KO
K13912
deleted in malignant brain tumors 1 protein
Organism
lvg Lytechinus variegatus (green sea urchin)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SRCR
SRCR_2
Hepsin-SRCR
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121415504
NCBI-ProteinID:
XP_041464644
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(14045272..14073131)
Genome browser
AA seq
2633 aa
AA seq
DB search
MMASPAVGGKLVWRSKLWILPLIAVFCPPFIQCQFEKEGDVRLVEGPTQNQGRVEIFHDG
LWGTVCDDSWDVYDARVVCRQLGYSNNIGGAWAGGKYPRGSGPIHLDDVACEGNETRLDL
CKSNGWDIQNCGHSEDAGVICQDGAEGDIRLVDGPTPNQGRVEIFHDGLWGTVCDDSWDV
YDARVVCRQLGYSNNIGGAWAGGKYPRGSGPIHLDDVACEGNETRLDLCQNDGWDNNFCG
HGSDAGVICQDGTEGDIRLADGPTPNQGRVEIFHDGLWGTVCDVSWDVYDARVVCRQLGY
SNNIGGALEGSKYPEGSGPIHLNYVDCEGNETRLDLCQSDGWDDNFCGHESDAGVICQDG
TEGDIRLADGPTPNQGRVEIFHDGLWGTVCDVSWDVYDARVVCRQLGYSNNIGGALEGSK
YPEGSGPIHLNYVDCEGNETRLDLCQSDGWDDNFCGHESDAGVICQDGTEGDIRLADGPT
PNQGRVEIFHDGLWGTVCDERWDVYDARVVCRQLGYSNNIGGALNGGKYPSGSGPIHLDF
VDCEGNETRLDLCQNDGWDNNFCGHESDAGVTCQDGTEGDIRLVDGPTPNQGRVEIFHDG
LWGTVCDDIWDVYDARVVCRQLGYSNNIGGALNGGKYPSGSGPIHLDYVDCEGNETRLDL
CQIDGWDNNFCGHESDAGVICQDGAEGDIRLVDGPSPNQGRVEIFHDGLWGTVCDDIWDV
YDARVVCRQLGYSNNIGGALNGGKYPSGSGPIHLDFVDCEGNETRLDSCQRGDWDNHFCG
HESDAGVICQDGTKGDIRLADGPTPSEGRVEIFHDGLWGTVCDHSWDVYDARVVCRQLGY
SNNIGGALDGGKYPKGSGPIHLDYVDCEGNETRLDLCQRGGWDNNFCGHESDAGVICQDG
TEGDVRLVDGPTPNEGRVEIFHDGLWGTVCDDSWDVNDARVVCRQLGYSGDVLARSYAHY
GQGSGPIYLDDVDCTGSESSLMYCSNRGWGIHNCVHSEDAGVFCDFIGEKEGDIRLVDGF
SPYDGRIEIFHNGLWGTVCDDAWDDYDARVVCRQLGYSGDVGVARHGGVYSRGLDPIYLD
DVGCEGDELRLDACFNNGWGNNNCGHSEDAGVYCGNDVGNEGDIRLVNGSTANQGRVEIF
HEGQWGTVCDDYWDDPDARVVCRQLGYLGDVNARVLGVYGVGSGPILLDNVNCDGNEDRL
DLCNSNGWYNHDCGHSEDAGVYCDAGDGLNGEVRLVDGSTPNEGRVEIYHDGQWGTICFD
SWHGWDDRDARVVCRQLGFSGDVGEARSPITYGHGSGPIYLEGVRCQGYEARLDLCVNDG
WYNDNCGHSQDAGVYCPTDGASEGDVRIVNGYSLDQGRVEIYHNGQWGTVCDDNWDDDDA
RVVCRQLGFLSNVGKANDLARYGQGTGPIYLDDVFCEGNEARLDACVSNGWGINNCGHSE
DAGVYCGSDVGKEGEIRLVNGSTPNDGRVEIFHDDQWGTVCDDSWDDADARVVCRQLGYV
GDVGEARSPIIYGQGSGPIYLDDVGCEGDEARLDLCVSNGWYNSNCGHSEDAGVYCTVDG
ANDGNIRLVNGPTMNEGRVEIYYNGQWGTVCDDSWDDSDARVVCRQLGYSGDAVASSRAT
YGEGAGPIYLDDVLCGGGEARLDECDNNGWGINNCRHSEDAGVSCTIDDGMNGEVRLVDG
STPNEGRVEIYYNGQWGTVCDDDWDDTDARVVCRQLGFSGHYGKAVGLARYGQGTGPIYL
DDVLCGGSEARLDECDNNGWGIHNCGHSEDAGVHCGHEVGNEGEIRLVNGSTPNEGRVEI
FHDTQWGTVCDDDWDDNDARVVCRQLGFLGGVGQANGLARYGQGTGPIYLDDVLCEGNEA
RLDECGSNGWYISNCGHSEDAGVYCPTDVANEPGDIRLVNGPTMNEGRVEIYFNDQWGTV
CDDRWDDLDARVVCRQLGYSVDAVASSGATYGQGTGPIYFNKVNCAGNEARLDACDVNAL
GVDDYCGHSEDAGVYCHVIRDEDIRLVNGSTPNQGRVEIFYKGVWGTVCDDEWDDTDASV
VCRQLGYASGLALGGGKYLRGSGPIYLDDVVCEGSEDRLSLCISNGWGNHNCRHSEDAGV
YCYDENEGDVRIMDGDIPDEGRVEIYHNGQWGTVCDDSWDDLDARVVCRQLGYSGDVGEA
RIESPYGEGHGPIHVDYVSCSGSESRLVTCNNGGWGNNNCRHYEDAGVYCGIDVGNDGDI
RLRNGSTANQGRVDIYYNGQWGTVCDDEWDDADAIVVCRQLGYISGTAWSGGKYPHGSGP
IYLDDVACEGNEDRLTLCISNGWLNHNCGHSGDAGVYCNIGDGKEGEIRLADGPTPNQGR
IEIFHGGEWGTICDDSWTVNNARVVCRQLGYQGDVGTSVLGGTYGPGSGPILDVDSCEGS
ESKLIDCSIEGWISQNCGHSRDAGVSCETISANDGDIRLVNGSTENEGRVEIFHNGLWGT
ICDDGWDDADARVVCRQLGYMGDVGGARGRSTYGQGSDPIYLDDVGCYGSESRLTDCSND
GWGSHNCGHSEDAGVYCYVPSTTDPGVHASTKPRYATSASVVGVLASVGVCLFLLTLLAI
GAVCWTCRKSKSQFSFITLVHDSPLEQDSEIALDRLSDQQPAENSIWFNCNLP
NT seq
7902 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggcgtcgcctgccgttggagggaaactagtgtggagaagtaaactatggatattg
cctcttatcgctgttttctgtccacccttcatacaatgtcaatttgaaaaagagggggat
gtccgtcttgttgagggccccactcaaaaccaaggtcgggtagagatcttccacgatggc
ttgtggggtacagtctgtgatgacagttgggatgtttatgatgctagagtagtttgtcga
cagcttggatactcaaacaacattggtggagcctgggctggtggaaaatatccgagggga
tcaggccccatacaccttgatgacgtcgcctgcgagggaaatgaaactcggttggattta
tgcaagagcaacggctgggatattcagaactgtggacattcggaagatgccggtgttatt
tgtcaagatggcgcagaaggtgatatccgcctagttgatggtcccactccaaaccaaggt
cgggtagagatctttcatgatggtttgtggggtacagtctgtgatgacagttgggatgtt
tatgatgctagagtagtttgtcgacagcttggatactcaaacaacattggtggagcctgg
gctggtggaaaatatccgaggggatcaggccccatacaccttgatgacgtcgcctgcgag
ggaaatgaaactcggttggatttatgccagaatgacggttgggataataacttctgtgga
cacgggagtgatgctggtgtgatctgtcaagatggcacagaaggtgatatccgccttgct
gatggtcccactccaaaccaaggtcgggtagagatcttccacgatggcttgtggggtaca
gtctgtgatgtcagttgggatgtttatgatgctagagttgtttgtcgacagcttggatac
tcaaacaacattggtggagctttggaaggttcaaaatatccagaaggatctggccccata
caccttaattacgttgactgtgaaggaaacgaaactcggttggatttatgccagagcgac
ggttgggatgataacttctgtggacacgagagtgatgctggtgttatctgccaagatgga
acagaaggtgatatccgccttgctgatggtcccactccaaaccaaggtcgggtagagatc
ttccacgatggcttgtggggtacagtctgtgatgtcagttgggatgtttatgatgctaga
gttgtttgtcgacagcttggatactcaaacaacattggtggagctttggaaggttcaaaa
tatcctgaaggatctggccccatacaccttaattacgttgactgtgaaggaaacgaaact
cggttggatttatgccagagcgacggttgggatgataacttctgtggacacgagagtgat
gctggtgttatctgccaagatggaacagaaggtgatatccgccttgctgatggtcccact
ccaaaccaaggtcgggtagagatcttccatgatggcttgtggggtacagtctgtgatgag
agatgggatgtttatgatgctagagttgtttgtagacagcttggatactcaaacaacatt
ggtggagctttgaacggtggaaaatatccgagtggatctggtcccatacacctcgatttc
gttgactgtgaaggaaacgaaactcggctggatttatgccagaacgacggttgggataat
aacttctgtggacacgagagtgatgctggtgttacctgccaagatggcacagaaggtgat
atccgcctagttgatggtcccactccaaaccaaggtcgggtagagatcttccacgatggc
ttatggggtacagtctgtgatgacatttgggatgtttatgatgctagagtagtttgtcga
cagcttggatattcaaacaacattggtggagctttgaacggtggaaaatatccgagtgga
tctggtcccatacaccttgattacgttgactgtgaaggaaacgaaactcggttggattta
tgccagatcgacggttgggataataacttctgtggtcatgagagtgatgctggtgttatc
tgccaagatggcgcagaaggtgacatccgcctagttgatggtccctctccaaaccaaggt
cgggtagagatcttccacgatggcttgtggggtacagtctgtgatgacatttgggatgtt
tatgatgctagagtagtttgtcgacagcttggatactcaaacaacattggtggagctttg
aacggtggaaaatatccgagtggatctggtcccatacacctcgatttcgttgactgtgaa
ggaaacgaaactcggttggattcatgccagagaggcgattgggataaccacttctgtgga
catgagagtgatgctggtgtgatctgccaagatggtacaaaaggggatatccgccttgct
gatggtcccactccaagcgaaggtcgggtagagatcttccacgatggcctgtggggtaca
gtctgtgatcatagttgggatgtttatgatgctagagtagtttgtagacagcttggatac
tcaaacaacattgggggagctttggatggtggaaaatatccaaaaggatctggtcctata
caccttgattacgttgactgtgaaggaaacgaaactcggctggatttatgccagagaggc
ggttgggataacaacttctgtggacacgagagtgatgctggtgttatctgccaagatggc
acggaaggtgatgttcgtcttgttgatggccccactccaaacgaaggtcgggtagagatc
tttcatgatggcttgtggggtacagtctgcgatgacagttgggatgttaatgatgcgaga
gtagtttgccgacagcttggatactcaggtgatgttctggccaggagttatgctcactat
ggacaaggatcagggccaatatacctcgatgatgtcgactgtacgggatccgagtctagc
ttgatgtactgcagtaaccgtggatggggcatccacaactgcgtacactctgaagatgca
ggggttttctgtgattttattggtgaaaaagagggagatatccgcctcgttgatgggttc
agtccttacgatggaaggattgaaatatttcacaatggtctatggggtactgtctgtgat
gacgcctgggatgactacgatgccagggtagtttgtcgacagcttggatactcaggcgac
gttggtgttgcaaggcatggcggtgtgtatagtcgtggattagatccaatatatcttgat
gatgttggctgtgagggagatgaacttagattagatgcatgtttcaacaacggttggggt
aacaataactgcggacattctgaagatgctggagtttactgtggtaatgacgttgggaat
gaaggagatatccgccttgttaacggctccactgcgaaccaaggacgggttgagatcttc
catgaaggccaatgggggacagtctgtgacgactactgggatgaccctgacgcaagggta
gtttgtcgacagcttggatacttgggtgatgttaacgcaagggttcttggtgtttatggg
gtcggatcgggtccgatactcctcgataatgttaactgcgacgggaatgaagataggtta
gatttatgcaacagtaatggttggtataaccacgactgcggacattcagaagatgctgga
gtttactgcgatgctggtgatggattgaatggcgaagttcgccttgttgatggttccacc
ccaaacgaaggtcgggtggagatctatcacgacggtcaatgggggacgatttgctttgat
agttggcatggttgggatgaccgtgatgcgagggtggtttgtcgacaacttggattttcg
ggcgacgttggtgaggccaggagtcccattacatacggacatggatccggcccgatatac
cttgaaggtgttagatgtcagggatatgaagcaaggttggatctatgcgtcaacgacggt
tggtacaacgacaattgcggacattctcaagatgcaggagtttactgccctactgatggt
gcatcagaaggagatgttcgcattgtaaatgggtactctcttgatcaaggtcgggtggag
atctaccacaatggtcagtggggtacagtctgtgatgacaattgggacgacgacgacgca
agggttgtttgtcgacaacttggattcttgagcaacgttggtaaggccaatgatcttgct
agatatggacaaggaactggcccgatataccttgatgatgttttctgtgagggaaatgaa
gctagattggatgcatgcgtcagcaatggttggggtatcaataactgcggacattctgaa
gatgctggtgtttactgtggcagtgatgttggaaaggaaggagagatccgcctagtaaac
ggttccactccaaacgatgggcgggtcgagatattccacgacgatcagtggggaacagtc
tgtgatgatagttgggatgacgctgatgcgagggtggtttgtcgacaacttggatacgta
ggtgatgttggtgaagccaggagtcccattatatacggacaaggatccggcccgatatat
cttgatgatgttggatgtgagggagatgaagcgaggttagatttatgtgtcagcaatggt
tggtacaacagcaactgcggacattctgaagatgctggggtttactgcactgttgatggc
gcaaatgacggaaacattcgtcttgttaacggccccaccatgaacgaaggtcgggttgag
atctactacaacggccaatgggggacagtctgtgatgatagttgggatgactctgatgca
agggtagtttgtcgacaacttggatattcaggcgacgctgtagccagtagtcgtgctact
tacggagaaggagctggcccgatataccttgacgatgttctctgtgggggaggtgaagct
aggttagatgaatgcgataacaacggttggggtatcaataattgcagacattctgaagat
gctggtgtttcctgcactattgatgatggaatgaatggtgaagtacgtcttgttgacggt
tccaccccaaacgaaggtcgagttgagatctactacaatggtcagtgggggacggtctgt
gatgacgattgggatgacactgatgcgagggttgtttgtcgacaacttggattctcgggc
cactatgggaaggctgttggtcttgctagatacggacaaggaactggcccgatatacctt
gacgatgttctctgtgggggaagtgaagccaggttagatgaatgcgataataacggttgg
ggtatccataactgcggacattctgaagatgctggagttcactgtggccatgaagttgga
aatgaaggagaaatccgtctcgtaaacggttccacaccaaacgaaggtcgggttgagatc
ttccacgacactcagtggggtacggtttgtgatgacgattgggacgacaatgatgcgagg
gttgtttgtcgacagcttggattcttgggaggcgttggtcaggccaatggtcttgctaga
tatggacaaggaaccggcccgatataccttgacgatgttctctgtgagggaaatgaagct
aggttagatgaatgcggtagcaacggttggtacatcagcaactgtgggcactctgaagat
gccggggtttattgccctactgatgttgcgaatgagcctggagacattcgtcttgtcaac
ggccccacaatgaacgaaggtagggttgagatatacttcaacgatcagtggggtacagtc
tgtgatgaccgttgggatgaccttgacgcgagagtagtctgtcgacaacttggatattcg
gttgacgctgtggccagtagcggtgctacttacggacaaggaactggcccgatatacttt
aacaaagttaactgtgcgggaaatgaagccagattagatgcatgcgacgtcaacgctttg
ggtgtcgatgattactgcggacattctgaagatgctggagtctactgccatgtcattcgt
gacgaagatattcgacttgttaacggttccaccccaaaccaaggtcgggttgagatcttc
tataaaggtgtgtggggaacagtatgcgatgacgagtgggatgacaccgatgcaagtgtg
gtttgtcgtcagcttggatacgcttctggtttagccttgggtggtggtaaatacctacga
ggatctggtccaatataccttgacgatgttgtctgtgaggggagtgaagacagattaagt
ttgtgcatcagcaacggttggggtaaccacaactgcagacattctgaagatgctggagtt
tactgctatgatgaaaacgaaggagacgttcgcattatggatggagacattcctgatgag
ggtcgggttgagatttaccacaatggccagtggggtacagtttgtgatgacagctgggat
gaccttgacgcgagagtagtctgtcgacaacttggatactcaggcgatgttggcgaggcc
aggattgagagtccatacggagaaggacatggaccgatacatgttgattacgtcagctgc
tctgggtctgaatccaggctggtcacttgtaataatggtggatggggtaataacaactgc
aggcattatgaagatgcaggggtttactgcggcatagatgttggaaatgacggagatatt
cgtcttcgtaacggatctactgcaaaccaaggtcgggtcgacatctactataatggtcag
tggggaacagtctgtgatgacgagtgggacgatgctgatgcaattgtagtttgtcgtcag
cttggatacatttctggtacagcctggagtggtggtaaatacccacacggatcaggtcca
atataccttgatgatgttgcctgtgaggggaatgaagacagattgactttgtgcatcagt
aacggttggcttaaccacaactgtggacattctggagatgctggagtttactgcaatatt
ggtgatggtaaagagggagagattcgccttgccgacggtcccactccaaaccaaggtcgg
atcgagatctttcatggcggcgagtggggtacaatctgtgatgatagttggactgttaat
aatgcaagggtagtttgtcgacaactgggataccaaggcgatgtcggcacatctgtgctt
gggggtacatacggaccaggatctggcccaatactcgatgtcgacagttgcgaggggtct
gagtctaagttgattgattgcagtattgagggatggataagtcaaaactgtggacattct
agagacgctggggtatcctgtgaaacaatcagtgcaaatgatggagatattcgccttgta
aatggttcgactgaaaacgaaggtcgggttgagatcttccacaatggtctttgggggaca
atctgcgatgacggttgggatgacgctgatgcgagggtagtttgtcgacaacttggatac
atgggcgatgttggtggggccagaggtcgtagcacatatggacaaggctctgatcccata
tacctcgatgatgtcggctgttatggatccgagtctagattgactgattgtagtaatgac
ggatggggtagccacaactgcggacattctgaagatgctggagtttactgttatgttcct
tcgaccacggaccctggcgtccatgcttcgacaaagccacggtatgctacatctgcaagt
gtcgtgggtgtcttggcatccgtaggtgtgtgtctcttcttgctgacgctgcttgccatc
ggagccgtgtgttggacctgtaggaaatcaaagagtcagttttcattcataactctggta
cacgactcacctctggaacaggactcagagattgctttggataggttgagtgatcaacaa
cctgctgaaaacagtatctggtttaactgtaatcttccatga
DBGET
integrated database retrieval system
