KEGG   Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181: MCCPILRI181_00084
Entry
MCCPILRI181_00084 CDS       T03704                                 
Symbol
rpoB
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
  KO
K03043  DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:2.7.7.6]
Organism
mcar  Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181
Pathway
mcar03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcar00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    MCCPILRI181_00084 (rpoB)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mcar03021]
    MCCPILRI181_00084 (rpoB)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcar03400]
    MCCPILRI181_00084 (rpoB)
Enzymes [BR:mcar01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     MCCPILRI181_00084 (rpoB)
Transcription machinery [BR:mcar03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     MCCPILRI181_00084 (rpoB)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcar03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      MCCPILRI181_00084 (rpoB)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_45 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb2_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: CEA10452
LinkDB
Position
1:96497..100360
AA seq 1287 aa
MAYKIRKINRNVERRDYTKLSMNLSLPNLIGIQTETFEWFKTKGIQEVLDEFFPILSFDG
SSVLTLENWGFKEPRLSVRQAREESKIYDAPIYANLKLSVNKTEEIQKEFDGVDQEDTLK
VLTHWLEEKTGNGNITFKQQSQNSYFFEITIKKSEKPDLIQIDIIEDKKTSLICNVSIYK
SGEVFLGDFPLMTEAGTFIINGSQKVIVSQLVRSPGAYFNKELNRKTGEMIYFADIIPSR
GTWLEYETDSKKIGSDAINPLYVKIDKSRKTTATSLLLAFGISKDDILNIFDNDEVLVET
LQQDSIIGDFKIDWSNQVQEIYKKIRQGETATSEGASKFINSILFDKRKYDLTKAGRFKL
KQKLSIKNRILNKVIAEDILDANNNVLIAKDTEVTKNNIQEISKILDQDVMSIDLKYLSD
IPGNRKVQKIRVYKDSELKTDTTCLIGLTSSSNEEFITVADILSTVSYLLNLKYNIGEID
DIDNLGNRRVRTVGELLQNQFRMGLNRIDKNVKEKLATSDLYKVKTSTIINAKPLTAIIG
EFFNLSQLSQFMDQINPLSELTNKRRLTALGPGGLSRDRAGLEVRDVHPSHYGRICPIET
PEGPNIGLINNLSTYARVNEYGFITTPYRKVINGIIQNDQVEYLTADQEKNFIIAQSNVN
QDENGKILDETIVSRFNGDDYMAKVEEIHYIDVSPKQIVSVATSGIPFLENDDANRALMG
ANMQRQAVPLIKPESPIVATGIEFEAARDSGEAIVAKEDAIVKYVDSKTIITDGESGIRT
YILSDYERSNNGTSLTQSPIVKVGDVVKKGEIIADGPSMDQGELAIGQNVVVAFSTYNGY
NFEDAIVMSEIIVIDDRFTSIHIDEYTLEVRNTKQGQEEVTREIPNMSEQAKRHLDAEGI
VAIGTEVKVGDVLVGKVTPKGQVQLSPEDKLLHAIFGEKSRNVKDNSLRVPNGGEGIVQS
IKRFKAKSALNPDGIELPADIIEVIKVYVVQKRKIQEGDKMSGRHGNKGIISRILPIEDM
PHLEDGTPVDIILNPQGVPSRMNIGQILEIHLGMAAKKLNQKVITPVFEGLNEKELEEIM
AEAGMTNYGKVTLIDGQTGEPFDKPIAVGVMYMLKLSHMVDDKIHARNVGPYSLITQQPL
GGKAQNGGQRFGEMEVWALEAYGAAHTLREILTIKSDDIKGRSKTYEAIVRSKRIPEPGI
PESFNVLSKEIMGLGFNMYMIDEVGEKSAINAYDKKDFEIDNYDDEILIKTDNLYIDDQD
VDAEFEDLTYVDENDILNSFELDNEEE
NT seq 3864 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcttataaaattcgaaaaatcaatcgtaatgtagaacgtcgtgattatactaaacta
tcaatgaatctttctttgccaaatttaattggtattcaaactgaaacttttgaatgattt
aaaactaaaggaattcaagaagttttagatgaatttttcccaattttatcatttgatgga
tctagtgttttaactttagaaaattgaggttttaaagaacctagattatctgttagacaa
gcaagagaagaatcaaaaatttatgatgctccaatttatgcaaatctaaaattatcagtt
aataaaactgaagaaattcaaaaagaatttgatggtgttgatcaagaagatactttaaaa
gttttaactcattgattagaagaaaaaactggtaatggtaatataacatttaaacagcaa
tcacaaaattcttatttttttgaaataactattaaaaaatctgaaaaaccagatttaatt
caaattgatattattgaagataaaaaaacttcattgatttgtaatgtatctatttataaa
tcaggtgaagtgtttttaggtgattttccattaatgacagaagctggaacttttattatt
aatggttctcaaaaagtcattgtatctcaattagtaagatctccaggagcttattttaat
aaagaattaaatcgtaaaactggagaaatgatttattttgcagacatcattccaagtaga
ggaacttgattagaatatgaaactgattctaaaaaaatcggaagcgatgcaattaatcct
ttatatgtaaaaattgataaatcaagaaaaactacagctacttctttattattagctttt
ggtattagtaaagatgatattttaaatatttttgataatgatgaagtactagttgaaact
ctacaacaagattcaattattggagattttaaaatagattgatcaaatcaagttcaagaa
atttataaaaaaattagacaaggtgaaaccgcaactagtgaaggtgcttctaaatttatt
aatagtattttatttgataaaagaaaatatgatttaactaaagctggaagatttaaatta
aagcaaaaactttctattaaaaatagaattttaaataaagttatagctgaagatattctt
gatgctaataataatgtgttaatagctaaagatactgaagttactaaaaataatattcaa
gaaatttctaaaattttagatcaagatgtaatgagtattgatttaaaatatctatctgat
attccaggaaatagaaaagttcaaaaaattagagtttataaagatagtgaactaaaaact
gatactacttgtttaattggtttaactagttcatctaatgaagaattcataacagtggct
gatattttatcaactgtttcttatttattaaacttaaaatataacattggtgaaattgat
gatattgataacttaggaaacagaagagttagaactgttggtgaattattacaaaatcaa
tttagaatgggattaaaccgtattgataaaaatgttaaagaaaaattagctacaagtgac
ttgtataaagttaaaacttcaacaattattaatgcaaaacctttaactgcaattattggt
gagtttttcaatttatcacaattatctcaatttatggatcaaattaacccattatcagaa
ttaactaataaacgtagattaacagctttaggacctggtggtttatcaagagatagagca
ggattagaagtgcgtgacgttcacccatctcattatggaagaatttgtcctattgaaaca
ccagaaggaccaaacattggattaattaataacttgtcaacttatgcaagagttaatgaa
tatggatttattacaactccatatagaaaagttattaatggaatcattcaaaatgatcaa
gttgaatatttaacagccgatcaagaaaaaaactttattatcgctcaatctaatgttaat
caagatgaaaatggaaaaattttagatgaaactatagtttcacgttttaatggtgatgac
tatatggctaaagttgaagaaattcattatattgatgtttctccaaaacaaattgtttca
gttgctacaagtggtattccatttttagaaaatgatgatgccaatcgtgctttaatgggt
gctaacatgcaacgtcaagcagtacctttaattaagccagaatcaccaattgttgcaact
ggtattgaatttgaagcagcacgtgattcaggtgaggctattgttgcaaaagaagatgca
attgttaaatatgttgattcaaaaaccataattactgatggagaatctggaattagaact
tatatcttatcagattatgaaagatcaaataatggaacttcattgactcaatcaccgatc
gttaaagttggagatgttgttaaaaaaggtgaaattattgctgatggtccatcaatggat
caaggtgaattagcaattggtcaaaacgtggttgttgctttttcaacttataatggatac
aactttgaagatgctattgttatgagcgaaataattgttatagatgatcgctttacttca
attcatattgatgaatatactttagaagtaagaaatacaaaacaaggtcaagaagaagta
actagagaaattcctaatatgtcagaacaagctaaaaggcatttagatgctgaaggaatt
gtagctattggtactgaagttaaagttggagatgttttagttggaaaagtaactccaaaa
ggacaagttcaactttctccagaagacaaattattacatgctatttttggtgaaaaatct
agaaatgttaaagataattcgttaagagttccaaatggtggagaaggaattgttcaatca
attaaacgttttaaagcaaaaagcgcattaaatcctgatggaattgaattaccagctgac
attatagaagtaattaaagtttatgttgttcaaaaacgtaaaatccaagaaggagataaa
atgtctggtcgacatggaaacaaaggtattatttcaagaattttacctattgaagacatg
ccgcatttagaagatggaacaccagttgatattatcttaaacccacaaggggttccttca
cgcatgaacattggacaaattttagaaatccatttaggaatggctgctaaaaaactaaat
caaaaagttattactcctgtttttgaaggattaaatgaaaaagaattagaagaaataatg
gctgaagctggaatgacaaattatggtaaagttactttaattgatggtcaaactggtgaa
ccatttgataaaccaattgctgttggagttatgtacatgttaaaactatctcacatggtt
gatgataaaattcatgcacgtaatgttggtccttactcattaattactcaacaaccatta
ggaggaaaagctcaaaacggtggtcaacgttttggagaaatggaagtatgagctttagaa
gcttatggagctgctcatacattacgtgaaattttaacaattaaatcagatgacattaaa
ggtcgttcaaaaacttatgaagcaattgttagatcaaaaagaattcctgaacctggaatt
ccagaatcatttaacgttttatcaaaagagattatgggattaggatttaatatgtatatg
attgatgaagttggtgaaaaatcagcaattaatgcatatgataaaaaggactttgaaatt
gataattatgatgatgaaattctaatcaaaactgataatttatacattgatgatcaagat
gttgatgctgaatttgaagatttaacttatgttgatgaaaatgatattttaaactcattt
gaactagataatgaagaagaataa

DBGET integrated database retrieval system