KEGG   Mycoplasma iguanae: NV226_01275
Entry
NV226_01275       CDS       T08523                                 
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
  KO
K03043  DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:2.7.7.6]
Organism
migu  Mycoplasma iguanae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:migu00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    NV226_01275
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:migu03021]
    NV226_01275
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:migu03400]
    NV226_01275
Enzymes [BR:migu01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     NV226_01275
Transcription machinery [BR:migu03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     NV226_01275
DNA repair and recombination proteins [BR:migu03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      NV226_01275
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_45 RNA_pol_Rpb2_1 RNA_pol_Rpb2_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: UVD81920
UniProt: A0ABY5RAA6
LinkDB
Position
264284..267820
AA seq 1178 aa
MGKQKFELKKFGPITLRRDYSKSKNVFETPDYLTSQRESFNYFIEKGIDEALNQFYPIKS
NNGKVEIQYIRNKKIRIEKPKNEFEAIKAAKQKGESYSCKVYAHLRKLNVETSEISESQE
VLYGEIPLMTSAGTFIINGSEKVIVSQLIRSSGVYYGRNVRNKQADDLFNKVEILPQLGS
WVEIYHRVTGNSIDTIKVRIDKNKNILLSTFLRALGLSKEDGTINALFGNSRVLNETLKK
DKNADMRECQKAIYRIIRKGDRLTDEAVENLIPVTLFNERRYNLSKTGRYMINRKLNLIQ
RIEGRFLAEDLVDANSNKVLFKTGTHITAQMAKEIQEYFNNGTLASYPIPGISPSVYGKQ
IEINPELAKRINIISVKIWPSKKAMEQKSEPTLIIGNDPTSDEAHLLISDIVAIVGYYFN
LNENIGQEDDPDSLINKRIIGIGELLQNQLKIAFNKLEKNSKERMSIKEIDKITPRNITN
NKPVYNQFKTFFNSSKLSQFMDQYNPLSEIANKRRITSLGPGGLNRETAQFEVRDVHPTH
YGRICPIETPEGQNIGLILNYASYSKIDEYGFIQAPYFKVNNGVVDYSKVVWLTAIQEIG
YTFAQSTVEIDSKNRIIEENVTVRKNHNYLIVEPKDIDYIDVSSKEMTSIAASAIPFLEN
DDANRALMGSNMQRQAVPLLKAEAPLVATGSEADIAKYATTNLVAKVDGEVVFVDSEKIK
IKDAEGATKTYNLRLFEKSNQGTLISQRPIVKIGDKVKAGDLIVDGPSSDKGELALGKNV
LVAFTTWNGYNYEDAIIISEKLVKNDAFTSIHIEEQTIPFRNSKAGDDILTADIPNVSNY
AKRSLDANGIVTVGSEVSAGDVLVGRTSPKVEDNLTPEEKLMNAIFSQKISNRKDTSLKV
KHGHGGTVIDVQILSRDAGDNLEDGIEKIIKVFIAQKRKIKVGDKMAGRHGNKGVISLVL
PVEDMPHLEDGTPIDILLNPQGVPSRMNVGQVLELHLGMAAKTLDVKFVSPVFDGVKYDQ
IQELLEETGLPKNGKVTLIDGITGDHFDNEVSVGVMYMLKLYHMVDDKVHARSVGPYSLI
TQQPLGGKSQNGGQRFGEMETWAIESYGASNILQELLTYKSDNIEGRNRLYNVLAQGGEM
PRRGMPESFSVLAYELRGLCIKLEIHEKDREELVQEEF
NT seq 3537 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggtaaacaaaaatttgaattaaaaaaatttggacctattactttaaggagagactat
tcaaaaagtaaaaacgtttttgaaactcctgattacttaacttctcaaagagaatctttt
aactatttcattgaaaaaggaattgatgaagcacttaatcaattttatccaattaaatca
aataatggaaaagtggaaattcaatatatcagaaataaaaaaattagaattgaaaagcca
aaaaatgaatttgaagctattaaagctgcaaaacaaaaaggtgaatcatattcatgtaag
gtttatgctcatttgagaaaattaaatgttgaaacatcagagattagcgaatctcaagaa
gttttatatggagaaattcctttaatgacatcagcgggaactttcattattaatggtagt
gaaaaagttattgtttcgcagttaatcagatcatcaggagtttattatggaagaaatgtt
cgtaataagcaagctgatgacttatttaacaaagtggaaattttaccgcaattaggttca
tgagttgaaatttatcacagagttacaggtaattcaattgatactattaaagtaagaatt
gacaaaaataaaaacattttactttctacatttttgagagctttaggtttatcaaaagaa
gatggaacaattaatgcattatttggtaattcacgtgttttaaatgaaaccttaaagaaa
gataaaaatgctgatatgcgtgagtgtcaaaaagcaatttatcgaattattcgtaaaggt
gatcgtctgactgatgaagctgttgaaaacttaattcctgtaactttatttaatgaacgt
cgttacaatctatcaaaaactggtagatacatgattaatagaaaattaaacttaattcaa
agaattgaaggaagatttttagctgaagatttagttgatgcaaactcaaataaagtactg
tttaaaacaggaactcatattactgcccaaatggcaaaagaaatacaagaatattttaat
aatggaactttagcttcttatcctattcctggaatttctccttcagtttatggaaaacaa
attgaaattaatcctgaattagctaaaagaattaatattatttctgttaaaatttgacct
tctaaaaaagcaatggaacaaaaatcagaaccaactttaattattggtaatgatcctaca
agtgatgaagctcatttattaatttcagatattgtcgctattgttggttactactttaat
ttaaatgaaaacattggtcaagaagatgatcctgattcattaattaataagagaattatt
gggattggtgaattgctacaaaatcaattaaaaattgcttttaacaaattagaaaaaaat
tcaaaagaaagaatgtctattaaagaaattgacaaaattaccccaagaaatattacaaac
aataaacctgtttataatcaatttaaaacattctttaactcttcaaaactttcacaattt
atggatcaatataatccactttcagaaattgctaataaaagaagaattacatctttaggt
cctggtggtcttaaccgtgaaactgctcaatttgaagttcgtgatgtgcaccctactcac
tatggaagaatttgtccaattgaaactcctgaaggacaaaatattggtctaattcttaat
tatgcttcttactcaaaaattgatgaatatggtttcatccaagctccttatttcaaagtt
aataatggtgtagttgattattctaaagttgtatgattaacagccattcaggaaattggt
tacacttttgctcaatcaactgtagaaattgacagcaaaaatcgaattattgaagaaaat
gtaaccgtaagaaaaaatcataattatttaattgttgaaccaaaagatattgattacatt
gatgtttcatcaaaagaaatgacatcaattgcagcttccgctatcccctttttagaaaat
gacgatgctaaccgggcattgatgggatctaacatgcaacgtcaagctgtgcctttacta
aaagcagaagctcctttagttgctaccggttcggaagctgatattgctaaatatgcaact
actaacttagtagctaaagttgatggtgaagttgtatttgttgattccgaaaaaattaaa
attaaagatgctgaaggtgcaaccaaaacttacaatttaagattatttgaaaaatcaaat
caaggaacactaatttcacagcgtccaattgtcaaaattggtgataaagttaaagctggt
gatttaatcgttgatggtccttcttctgataagggagaattagctttaggtaaaaatgtg
cttgtagctttcacaacctgaaatggttataactatgaggatgccattatcatttctgaa
aaattagtaaaaaatgatgcctttacctcaattcatatcgaagaacaaactatcccattt
agaaactcaaaagctggagatgatattttaacagctgatattcctaatgtttcaaattat
gctaaacgttctttagatgctaacgggattgttactgttggttctgaggtttctgcagga
gatgtgctagtaggtagaacttcacctaaagtggaagataatttaacacctgaagaaaaa
ttgatgaatgcaattttttctcaaaaaatttctaatagaaaagacacatcactaaaggta
aaacatggacatggtggaactgttattgatgtgcaaattctttctcgtgatgccggagat
aatttagaagatggaattgaaaaaattatcaaagttttcattgctcaaaagagaaaaatt
aaagtcggagataaaatggcaggacgccacggaaataaaggggttatttctctagtgctt
ccagttgaagacatgccacacttagaagatggaacaccaattgatattttacttaatccc
caaggtgttccctcacggatgaatgttggtcaagtgcttgaattacacttaggtatggcc
gctaaaactttagatgtaaaatttgtttctcctgtctttgacggagtaaaatatgatcaa
attcaagaattattagaagaaactggtttacctaaaaatggaaaagtaacattaattgat
ggaatcacaggtgatcattttgacaatgaagtatctgttggtgtgatgtacatgttaaaa
ctgtatcacatggttgatgataaggttcatgcacggagtgtaggtccttactcactaatt
acgcaacaaccattaggaggaaaatctcaaaatggtggacaaagatttggagaaatggaa
acatgagcgattgagtcttatggagcttcaaatattttacaagagttactaacttacaaa
tcagataatatcgaagggcgtaaccgtctatacaatgtactagctcaaggtggagaaatg
ccacgtcggggaatgccagaatcattcagtgttctagcttatgaattaagaggattgtgt
attaaactagaaattcatgaaaaagacagagaagaattagtgcaagaggagttttag

DBGET integrated database retrieval system