Malus sylvestris (European crab apple): 126624497
Help
Entry
126624497 CDS
T09027
Name
(RefSeq) protein DETOXIFICATION 45, chloroplastic-like isoform X1
KO
K26938
MATE family, citrate exporter
Organism
msyl
Malus sylvestris (European crab apple)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
msyl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
msyl02000
]
126624497
Transporters [BR:
msyl02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
126624497
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126624497
NCBI-ProteinID:
XP_050149518
LinkDB
All DBs
Position
5:25392464..25435829
Genome browser
AA seq
643 aa
AA seq
DB search
MQTQPLTTLGPSLSLSLSLTQFSLSLLLLHCKTPIISLSLCTKEFQQLVKMVATLFRSGA
LSNGLTAGASDRNPITRKSRLFNSLHRRGDCNIVARSGRKDLSNANAVGGCNLYATRRAL
CTPLVTRRRRPCFPMVANQLSSDLGVGSSEVEGKLGLEEEEALIGVGSGDLETYSPDVKR
ELLMLSLPAILGQAIDPLAQLMETAYIGNLGSVELASAGISMNIFNYISKIFNIPLLSVA
TSFVAEDLAKSESKVSTSENGYLDGNTNGKPKPVDGVVERKQLSSVSTALLLAVGIGIFE
AVALSLGSGLFLNMMGISSDSPMCIQAQRFLQLRAFGAPAVVASLALQGVFRGFKDTKTP
VLCLGIGNSLAVFLLPLLIYYFRLGATGAAISTVISQYTVTFLMIWFLNKRAILLPPKVG
SLQFGGYLKSGGFLLGRTIACLTTLTLGTSMAARQGPVAMAAHQICIQVWLAVSLLTDAM
AASGQALIASYLSKGEYKIVKEVADSALKIGLFTGISLSVILGVSFGSLATLFTNDPEVL
AIVRSGILFVSASQPLNALAYVFDGLHYGVSDFAYAARSMMVVGALSSAFLLYAPSIFGL
HGVWLGLTLFMGLRAVAGYARYLSKSGPWWFVHRDFQTVQLAT
NT seq
1932 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaacccaaccactgaccactcttggcccctctctatctctgtctctctcactcact
caattctccctctctcttcttcttcttcactgcaaaaccccaataatctcactctctctc
tgcacaaaggaattccaacaactggtgaaaatggtggctaccctgttcagaagtggcgcc
ctttctaacggattaaccgccggagccagtgaccgcaacccgataactcgaaagtccagg
ttgtttaattcattgcacagaaggggagattgtaatattgtagcaagaagtggtaggaag
gatttgagcaatgccaatgctgtggggggatgcaatctgtatgctacacgaagagcactg
tgcacgccgctagtgacacgccgcagaagaccctgtttccccatggtggctaatcaattg
agttcggatttgggtgtgggatcctctgaggtggaagggaagttgggtttggaggaagag
gaagctctcataggtgtagggagtggtgaccttgaaacatattctccagatgtcaaacgt
gagctattgatgctttctttacctgcaattctgggtcaggccattgatccattagcacaa
ctaatggagactgcatacattggcaatttgggttccgtggaattggcttcagctggtatt
tcaatgaacatctttaattatatctcaaagatatttaatatccctctcctcagtgttgct
acatcttttgttgctgaagaccttgctaagagtgaaagtaaagtttctacttcagaaaat
ggttatctagatggcaatactaatggtaaacccaaacctgttgatggagtcgttgagaga
aagcagctatcttcagtgtctacagctttattgttagcagttgggattggaatatttgag
gccgtggccctgtctttgggatctgggttgtttctaaatatgatgggcatatcatcagac
tcacctatgtgcattcaagcacaacgatttcttcaactaagagcatttggtgctcccgca
gttgtagcatctttggctcttcaaggagttttccgtggatttaaggatacaaaaactcca
gtactatgtctaggtattggtaattcgttagctgtgtttttgttgcccctccttatttat
tattttcgtttgggtgcaactggtgcagccatttccactgttatatctcaatacactgtc
acctttttaatgatctggtttctaaataagagagctatactattgcctccgaaggttgga
tcactacaatttggtggataccttaaatccggtggttttcttcttggacgaactattgct
tgtcttacaaccttgacattgggaacatcaatggctgctcgtcaaggtccagtagctatg
gctgctcatcagatatgtattcaagtttggttggctgtatcccttctaactgatgcaatg
gctgcatctggtcaggccctgattgcaagttacttatcaaaaggtgaatacaaaattgtg
aaagaagttgctgactctgcgttaaagataggattgttcacaggtatttccttgtctgta
attttgggagtatcttttggttctctagctacgttgttcaccaacgatcctgaagtatta
gcaattgttagatctgggatattgtttgtcagtgctagtcagcctttaaatgctctagct
tatgttttcgatggcctccattatggtgtttcagattttgcatatgccgcccgctccatg
atggtagtgggggcattatcttccgcatttttgctatatgctccttccatctttggcctt
catggagtttggctgggtttgactctcttcatgggcttgcgtgcagttgcaggctatgcc
agatatctgtcaaaatcaggcccgtggtggttcgtgcacagggatttccagacagttcag
ctagccacttga
DBGET
integrated database retrieval system
