Oceanisphaera avium: CBP12_11775
Help
Entry
CBP12_11775 CDS
T04855
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ocm
Oceanisphaera avium
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
GAF
GAF_2
GAF_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ART80747
UniProt:
A0A1Y0D0T5
LinkDB
All DBs
Position
2558954..2560792
Genome browser
AA seq
612 aa
AA seq
DB search
MEHVKKFFSYHKSLLQLVHSEHFSRLEQPQKLAALLELCGDLLKTNRVSTWAFSDSGACL
SRELYYQPHLGLSPQPTTLWRRDHELYFNALEEAEILFTHHALHDVRTQSLRESYLGASS
SMAATLDAPIYDGPRLYGVLCIESDEHRRWHLADIACVTAFADTISLINSHHAWLNSRKQ
LDYVTYHDDFTGLQNQRALEHRMQRLLASAPEQEFAILWFDIDRLNTINNGLGAATGDIV
INEIASRLRDMPLPGKDMVARVVGDEFAMLCCWPEHLSPEVAVATIMAKLNVPIKVGEQQ
LAVTTSAGVALYPNDGLEISTLLRASESAMHYAKTCGRAQAQFYNQEISRSAKARVVLEQ
QLLNALENHGLSVFYQPILSVPHQTIASCEALVRWYHPTLGFLTPGDFLPLAYEVGLIAQ
LDLWVLERVCQDIQAARANKLSMPPVAVNLAADTIMDALLIDKVQHLLTRYSIKGHELEF
EMIEDVIKGDSLALRHTLEQLVSMGINLSIDDFGTGYSSLLRLKSLPFTKLKIDRSFIQS
LPDNQDDCAITLSVLGLAKGLGLAVVAEGVENSQQQDWLHQHDCHYVQGYKYHRPLAPYD
FFMLLSAPAAKS
NT seq
1839 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggaacacgttaaaaaattctttagctatcataagtccttgttgcagctggtgcatagc
gagcactttagccgtcttgagcaaccacaaaaattagccgctttgttagagctatgtggg
gacttattaaaaacgaatagggtatcaacttgggccttcagtgacagcggcgcttgttta
agtcgtgagctttattatcaaccacacctaggacttagccctcagcctacaaccttatgg
cgccgtgatcatgagctttactttaacgcgctagaagaggcagaaattctctttacgcac
catgcacttcacgatgtccgtactcaatccttacgagaaagttaccttggtgccagctct
tctatggccgcgaccctagatgcgcccatttatgatggccctcgattatatggcgtgtta
tgcattgaaagtgatgagcatcgacgatggcatctagctgatattgcttgtgtgacggca
tttgccgataccatcagccttattaactcccaccatgcttggttaaatagccgcaaacag
ttggactatgttacctaccacgatgattttacgggtttgcaaaatcagcgtgcactagag
catcgcatgcaacggttattagccagcgctcctgaacaagaatttgctattttatggttt
gatattgataggcttaataccattaataatggcttaggcgcggccacgggcgatatagtg
attaatgaaattgccagtcgcttaagggatatgccgcttccaggtaaagatatggtggcg
cgagtggtaggggatgagtttgcgatgttgtgttgctggcctgagcatctctcacccgag
gtggcagtagcgaccattatggctaagctcaatgtgccgattaaagtgggagagcagcaa
ctcgcggtgacaaccagtgcaggcgtagcactttaccctaatgatggtcttgaaattagt
acgctattacgagcaagcgagtcggctatgcactatgccaaaacctgtggtcgcgctcaa
gcacagttttataatcaagaaatttctcgttctgctaaagcacgagtggtactagagcag
caattgctgaacgccttggagaatcatggcttaagtgttttttatcagcctattttaagc
gtcccccatcaaactatagccagttgtgaagcgctagtacgctggtatcaccccacctta
gggtttctgacaccgggggattttctacctctcgcttatgaagtgggtttaattgcccag
ctcgacctgtgggtgttagagcgcgtctgccaagatattcaagcggcgcgagctaacaag
ttatcgatgccaccggtggcggttaatttggcggccgataccataatggacgctttattg
attgataaagtacaacatttattaacccgctatagcattaagggccatgaattagaattt
gagatgatagaagatgtgattaaaggcgactccttagcgctgcgtcacactcttgagcag
ttagtcagcatgggtattaacttatcgattgatgattttggtactggctactcctcacta
ttgcgcctaaagagtctgccctttactaaattaaaaattgatcgctcttttatccagtca
ctaccagataatcaagacgattgtgctattactttatcagtattgggcttggcgaaaggc
ttagggctagctgtggttgcagaaggagtagaaaatagtcagcaacaagactggttgcac
cagcatgattgtcattatgtacaaggctataaatatcaccgtccgctcgcgccgtatgat
ttctttatgctgctcagcgcacctgcagcaaagagttag
DBGET
integrated database retrieval system
