Oceanirhabdus sp. W0125-5: OW730_15335
Help
Entry
OW730_15335 CDS
T08747
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein/permease
Organism
ocw
Oceanirhabdus sp. W0125-5
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
Rad17
AAA_22
AAA_7
nSTAND3
Sigma54_activat
AAA_29
AAA_18
AAA_16
nSTAND1
AAA_5
AAA_25
MMR_HSR1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBW95059
LinkDB
All DBs
Position
3325677..3327455
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MINKRLLSLSESSKKWVGLTVLMNWVSIICNIFIIVFIGHMIDDLYKKKISNNLIPHLLF
IFFMLLLRFTCNRLSTRFSYYSSAEVRKLLREKIYKKLLKLGVNYTDTISTSSTVQIAVD
GVEALEVYFGRYLPQLFYSLLAPMTLFIVVSFISLKAAIVLILCVPLIPISIIAVMKIAK
KLLSKYWNIYTNLGDSFLENLQGLTTLKIFDLDGEKNNEMNEEAETFRKITMKVLAMQLN
SINIMDLIAFGGAAIGILIAINEFSLGKISVGGVIVIILLSSEFFIPLRLLGSFFHVAMN
GIAASDKIFNLLDKKVENERELTGEEKKLLENINIKFNNVDFSYDKKRTVLKDINLHIEN
KKMVALVGESGCGKSTVTNLLLKLKKVDNGEITLNGLNLNDIPFNKLREKIGFISHNSYI
FNGTIEDNMKMGKYDATNEEIKYALEKANLYDFVLDLPNKLKTNVGEGGAFLSGGQRQRL
ALARIIISNPEIIIFDEATSNIDVESEEKIWKSIYQIAKNKTVLVISHRLANVRNADLIY
VLDNGNMVEFGSHNQLMKNKSKYYDLLINQEKLEGIMDNRLSVESEVAISGE
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaacaaaagattactatcactaagtgaaagttctaaaaagtgggtaggacttact
gtattaatgaattgggtatctataatatgtaatatatttataatagtatttataggccat
atgatagatgatttatacaagaaaaaaatttctaataatttaataccacatttgctcttc
atattttttatgctccttttaagatttacttgtaataggttatcaactagattctcctat
tattcatctgccgaggtaagaaaattattaagggagaagatttataaaaagttgctaaag
ttaggggtaaattatacagacacaatctcaacttcatcaacagtacaaatagctgtagat
ggtgtagaggctcttgaagtatacttcggaagatatcttccacagttgttttatagttta
ttagctccgatgactttgtttatagtagtatcatttattagtttaaaagcagctatagta
cttattttatgtgtaccactaataccaatttctataatagcagttatgaaaatagctaag
aaattattaagtaaatactggaacatatatacaaacctaggggattcttttttggagaat
ttacaagggttaacgacattaaagatatttgatttagatggagaaaaaaacaatgaaatg
aatgaagaggctgagacctttagaaagataactatgaaggtcttagcaatgcagcttaat
tctataaatataatggatttaatagcatttggtggtgcagcgataggtatattaatagct
ataaatgaattctcattaggtaagatttcagttggtggagttatagtgataatattatta
tcgtcagaattttttattccattaagattattaggttcattcttccatgtggctatgaat
ggaattgctgcaagtgataagatatttaatttattagataaaaaagttgaaaatgaaaga
gaattaacaggtgaagagaaaaagttacttgaaaatattaatattaaatttaataatgta
gattttagttatgataaaaaaaggactgtattaaaggatataaacctacatattgaaaat
aaaaagatggtagcattagttggagaaagtggttgcgggaaaagtacagtaactaacctc
cttctaaaactaaagaaagtggacaatggtgaaataactttaaatgggcttaacctaaat
gatattccatttaataaattaagagaaaaaataggttttataagtcataactcatatatt
tttaatggaaccattgaagataatatgaaaatgggtaaatatgacgcgactaatgaagag
ataaaatatgctcttgaaaaagctaatttatatgactttgtgctagacctaccaaataaa
ttaaagactaatgtaggagagggcggagcttttttatctggtggacaaagacagagattg
gcacttgctagaataataatctctaatccagaaatcattatattcgacgaggcaacttct
aatattgatgtggaaagcgaagagaagatatggaaatccatttatcaaatagctaagaac
aaaacagttttagtaatatcacatagattagctaatgtaagaaacgcagatttgatttat
gtattggataatggaaatatggttgagttcggaagtcacaatcagcttatgaagaataaa
tcaaaatattatgatttacttattaatcaagaaaaattagagggtataatggacaataga
ttaagtgttgaaagtgaggtagctattagtggagaatag
DBGET
integrated database retrieval system