Olea europaea var. sylvestris (wild olive): 111393535
Help
Entry
111393535 CDS
T05244
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
oeu
Olea europaea var. sylvestris (wild olive)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111393535
NCBI-ProteinID:
XP_022874872
LinkDB
All DBs
Position
4:9014999..9023948
Genome browser
AA seq
1035 aa
AA seq
DB search
MLSELGSRPMLGNNENSFGGDLEKEIGFLLREQRRQEAIDREKELNLYRSGSAPPTVDGS
LSAVGGLFKHGGVVGGSSGNSSAFAEYARNKSGNGFMSEEELRSDPAYLSYYYGNVNLNP
RLPPPLLSKEDWRFTQRFQGGNSTIGDRRKVNRIDTDCAGGSLFSMPPGFNSKNQEIENE
TEWGVDGLIGLPGLGLGNKQKSLDEIFQDDFARAAPVSRHPSRPASRNAFGENVDNIGSA
EAELVHMRHKLTSADPVRSASNVQTSSASQHVGPPTSYSYAAALGASLSRSSTPDPQHIA
RAPSPCLTPIGGGRIGNSEKRSINGPNALNDTSTHINESTDLVTALSGMGLSAGSMDEEN
NLPSRIKQEVDDHENFFNLPGGQNNLKQHAYLKKSESGQFNMSSVLQHAKMMPSDAGVSN
GDGLDVSNSSFQTELHKTSASSNNSFVHGSSTTAVNGRSGLFSQYQHLDSPNSSFSNYRL
GGYPMSPISGQLGNSNLPPLFENAAAASAMAMPGMDSRMLGGSNMGAAALDQNMGRMGNQ
MAGSALQAPYVDPSEYAVAQLAALYDPSLERNYMGNSYMDLLQKAYLGTLLSPHKMQYGV
PLSGKTSSSSPHGYYGNPAFGIGLSYPGSPLASPVIPTSPGGPGSPMRHGEFNMRFPGGM
RNIAGGVMGPWHLDNLDNSFSSSLLEEFKSNKTRCFELSEITGHVVEFSADQYGSRFIQQ
KLETATVEEKNMVFLEIFPQALTLMTDVFGNYVIQKFFEHGMASQKRELAGKLFGHVLTL
SFQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIKMVEELDGHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEEHIQF
IVSTFFDQVVILSTHPYGCRVIQRVLEHCEDPTTQDKVMEEILGSVSMLAQDQYGNYVIQ
HVLEHGKPHERSAIIQELTGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFSDSNERQLLVNEMLGTTDE
NEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCSDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLV
AAGERRIAAQSSHPS
NT seq
3108 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatctgaattgggaagccgaccgatgcttggtaataatgaaaattcctttggaggt
gacttggagaaggagattgggtttttgcttcgtgaacagcgacgccaagaggcgattgat
cgtgaaaaggagctgaatttgtataggagtgggtcagctccacctactgttgatggttca
ctaagtgccgttggtgggttgtttaaacatggtggtgttgttggtggcagtagtggcaat
agctctgcctttgctgagtatgcaagaaataagagtggtaatggtttcatgtcagaggag
gagcttaggtccgatcctgcatatctatcttactattacgggaatgtcaatctgaatcca
aggctaccgcctcctctgttatccaaggaggattggcggtttacacagaggttccaaggc
gggaattcgacgattggggataggaggaaggtgaataggattgatactgattgtgctggg
ggatccttgttttcgatgcctccaggattcaattctaagaaccaagagattgagaatgag
acagaatggggtgttgatggattaattggtttgcctggattagggctgggtaacaaacag
aagagccttgacgaaatatttcaggatgactttgcccgtgctgctcctgtatctaggcac
ccttcacgcccagcaagccgaaatgcttttggtgagaatgtagataacattggttcagca
gaggctgagctggttcatatgcgtcataaattgacatctgcagaccctgtacgctctgct
tcaaatgttcagacctcatctgcttctcaacatgttggaccgcccacatcatattcttat
gctgctgctttgggagcttccttgtcaagaagctccactcctgatcctcaacacattgct
cgggctcctagtccttgtcttacacccattggaggaggcaggataggaaattctgaaaaa
agaagcattaatggccctaatgccttaaatgacacttctactcacataaatgagtctact
gacctggtaactgctttgtcaggcatgggtctttcagctggttctatggatgaggagaat
aatttaccgtctcgaattaaacaagaagttgatgaccatgagaatttcttcaatcttcca
ggtggtcagaataacctgaagcagcatgcatacctgaagaaatctgaatctgggcaattc
aatatgtcttctgttcttcagcatgcaaaaatgatgccttctgacgctggtgtaagcaat
ggcgatggtttggatgtcagcaactcttcttttcaaactgagctgcacaaaaccagtgct
tcttctaataactcttttgtgcatggatcctctaccacagcagttaatggtcggagtggc
ctattttctcaatatcagcatctggatagtccaaattcatcattttcgaattatcgtttg
ggtggctaccccatgagtccaatatcaggtcaacttggtaattctaatttgccgcctctg
tttgaaaatgctgctgctgcatctgctatggccatgccgggtatggactctaggatgttg
gggggatcaaatatgggagctgctgccttagaccagaacatgggtcgaatgggaaatcag
atggcagggagtgcactgcaggcgccttatgtggacccttcagagtatgctgtagcacag
cttgcagctctttacgatccttctttggagagaaactacatgggtaattcatacatggac
ttgcttcagaaagcttatcttggtactctgctatcccctcataaaatgcagtatggtgtt
cccttaagtggcaagaccagtagttctagtcctcatggttactatggaaatccagcattc
ggcattgggttgtcatatcctgggagcccattggctagccctgtaattccaacctctcct
ggaggacctggtagccctatgaggcatggtgagttcaacatgagattccctggtgggatg
agaaacatagctggtggtgtcatgggaccttggcatttggataacctggacaatagcttc
agttcttctctgttggaagagtttaagagcaataaaaccaggtgttttgaactttcagaa
ataactggtcatgttgttgagttcagtgctgatcagtatggaagccggttcattcaacaa
aaacttgaaactgctacagtagaagaaaaaaacatggttttcttggaaatttttcctcaa
gctcttactttaatgactgatgtgttcggcaattatgttatccagaagttttttgaacat
ggaatggcatctcagaagagagaattggctggcaagctttttggacatgttcttacactt
agcttccaaatgtatgggtgtcgggtgatacagaaggcaatagaagttgttgatttggat
caaaagatcaagatggtggaagagcttgatggacatgtcatgcgctgtgtgcgggatcaa
aatgggaaccatgtcatccagaaatgcatcgagtgtgttccggaggagcatattcagttt
attgtgtcaacattctttgaccaagttgtgattctctccactcatccatacggatgccgg
gtgatacaaagagtactagagcactgcgaggacccaaccacccaggacaaagtaatggaa
gagattctggggtctgtaagtatgttggcgcaggatcaatacggcaattatgtcattcag
cacgtcctggagcatggaaagccacatgagcgatctgctataattcaggaattaactggg
aagatagttcaaatgagtcagcaaaagtttgcttcgaatgtagttgaaaagtgcttgact
tttagtgattcaaatgagcgccagctcttggtgaatgagatgcttgggacaactgacgag
aatgagcctttgcaggctatgatgaaagatcaattcgcgaattatgttgtacagaaagta
ctcgagacatgtagtgatcagcagcgtgaactgatactgtcgagaataaaagttcatctg
aatgcactgaagaagtacacatatgggaagcatatcgtagcccgtgtagagaaacttgtt
gcagctggagaaaggagaattgctgcccagtcttcacatccttcttag
DBGET
integrated database retrieval system
