KEGG   Plasmodium berghei: PBANKA_0943100
Entry
PBANKA_0943100    CDS       T01111                                 
Name
(RefSeq) CCR4-NOT transcription complex subunit 1, putative
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
pbe  Plasmodium berghei
Pathway
pbe03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pbe00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    PBANKA_0943100
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pbe03019]
    PBANKA_0943100
Messenger RNA biogenesis [BR:pbe03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     PBANKA_0943100
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     PBANKA_0943100
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind DUF3819 CNOT1_TTP_bind
Other DBs
NCBI-GeneID: 55149891
NCBI-ProteinID: XP_034421783
UniProt: A0A509AIX9
LinkDB
Position
9:complement(1554259..1563132)
AA seq 2957 aa
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DBGET integrated database retrieval system