KEGG   Plasmodium chabaudi: PCHAS_0901200
Entry
PCHAS_0901200     CDS       T01108                                 
Name
(RefSeq) CCR4-NOT transcription complex subunit 1, putative
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
pcb  Plasmodium chabaudi
Pathway
pcb03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pcb00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    PCHAS_0901200
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pcb03019]
    PCHAS_0901200
Messenger RNA biogenesis [BR:pcb03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     PCHAS_0901200
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     PCHAS_0901200
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind DUF3819 CNOT1_TTP_bind
Other DBs
NCBI-GeneID: 3490921
NCBI-ProteinID: XP_737891
UniProt: A0A4V0K7F4
LinkDB
Position
9:110611..119343
AA seq 2910 aa
MNNNFNINLQIEDGNTNKYEAEVNGYFAKLYTGEITVNTMIDIMKNLSCSPKGSKNNDIY
KSMLLILFNECKFFPKYPVEELEITAQLFGKLIKHNLLISYGNTLSVVLKCILEALKKGC
DSKVFNFGITALEQFEDSLICYPAFLSSLIPLPTLRQYNPQYVIHCNDLLNTLPEQFRTL
PYIDASTILKIKHISEISSYNNISNANISHIPNNDIKKISVTNASNLKNINNLVPHLATI
DGANQTTTNFITHNNLSDNNIENSAGNNIISENHNDNNTANTINNSNRTDSYISNNNQTQ
FANLMNNILNQNNNSNNFNNINNDNMLLYINNILPNLSNISDKNTIPSNINNLQTMNRNN
PLYKNKNASVNLNTIPGINNLNNAYNINLLDTNASANSNRAFQNKGLINTNEATHMNRNI
NLVTKNMTSPNLPNNTNQIRMDINIPNGGDSSQNIPINPNIIRTDNNKNENNYTSGIPQS
NNKETDEQTNGCIEIFYNQVQLKLPSNLNSKNISGFGLGQIECLMDNTHISKSIIIPSSV
VVGEVFSIFNTLCLLNIDEKIKILKDVMQPEYYSWLAFYIVKSRVSKEVNLHNVFLEFID
KLSYPMLIDTIINMTYDYILILFKYINELKEVSAFRTVLKNLGSWLGFITLGRNKPLKSK
ILDLKLVLFEAYDKDCLVCILPMVCKILESIKLSKNFKPPNPWTTTMLCLLTEIHELPNA
KTYIIFEVEVLFKNLSLDIQDYQNKTVLLSKRTQQYAQKNDLNIADPANTNSSILPSNID
IKSHSLKPNIANFTSPNDININNVNNNYYPYNNITNWNNANSGEPNNISENALLEEFENL
TKKNNQNNRIINHDKADYINKNNNQQLLNLKNIISHWNEYNANKSNPLQNDNILVSSFAP
PDIKSNNSNTFNKVFASISKAHSSMSDQTLNKIDPNIINNYNILNSSINANASNDHSKMN
NSKFFQNLCNATIISPSIALFQIQPNLKKVVPIAVDRSIKEIISAVLERSVAISCITTRE
IISKDFCLEKDQNIIRKAAHIMTASLAASLALATCKEPLRISLTQNLRELLQPTSTKDCN
DQVLIEQVVQVLSADNLELGCNLIEQAVIEKAIIDINEALAPTLLAKHVANEENVKLNDS
VNIMNNKKMQIEFAEILNLGTPITNNQLQIYKDFLNMNPLKKLHSSPKGLTLIYKNIDET
NPINTQQNDQQPSITTNENTKNDLIPNLGTNINIDYNNNIELNQNGSNIKMPHATSTIPP
NPNLNKVLKKLELATNQLKETIKDILMLPPILFNINKKKFIGNINKISLYILYSLSVDDN
LFNLIKSIPEIASLTHHKNETIISYTNRICKFLFEIALHNYNKSQQESKLNDMTGIYMEV
FLCILEKLKKKCPIAKEHISTSVMKTTMNLLNTPLNNATTSNNTNNKTEESNAENASDSE
KNDSLNSENIASQKENESNKDNNKTSNNYEQFYKSNANIIAGLIRYNLIDMDQYKQFLET
QLANKISNNNAIKFIIFLLKNILIDFHIYRYNYFKNIFDHLNNIINTNPKENNTNEQTNK
DSKIDNTTDMDANIFYNNNDKPITLSSAIDELTKEAKNIQEKTNSVIFSDYFEVCDEFSK
SDVESEKEDDDPDNPNEDTNKDLTKLKEEKNEQDEKAETNPIDPETESQLTTETSPKNEE
TKLETKNKKNKKNKDEKKDDNITNAKAEINETSSPSSKSKDIANKNSEPTTKKNTDNITE
NETEKNDSNAEKIGDSETERNKKKHINDKNGDEKTNYKKYLQILMNPQNLTTLTQIIDFC
LNKDWNIIQAKKFNDGIRDKGVGGVRIVPKPQKVPKQQQHIVSSIFMEWVKLSNIKSVDN
PNQIYVKFFQKISSQGLLQINNSDNFFTTCIYKAIEQAELFLDPYSEDFESFQIGDSKEL
LTSIYTNYLKTNENNETKGIESEIELTSDMLSKQDNQNENLKREYEESDSNIDKKNKKKT
DLIEEETENASHSKEKDKKKKKKKNEHTDAKSKPTEQTEMEKNKDQYNEKENNETNKYCE
DSEDNFTDAVSTNLTFNSNISNYEYSFSDEDNPHYFVNTSDRNNSNTNKMKNKKKDTLNF
VYSSINKSMNNDSILNSDKDIERNRLYSEVLKENCIITDPNKDKTDGKNTTKIAKNESND
TNLEKEKNPKSESNSQNNQNSQNDKIETQIDEDTKKDLEKHTQITNTLDTSPIDALAKMV
VSMMKLVDSQKITPYLLLQKVMNMFCRIVVYECRKKQNQFNQRPYFRLFLSILTEINKNE
KNLEQSYNKCILALGYYLRILNPLRVPMFVFAWVELISHKFFLPKILQTSKGWYIYNKLI
IYLFEFLYGFLKNSHLTQPIKLLYRATLRILLLLLHDFPEFLCVYSFSFCNSIPLNCMQL
RNIILSALPRNTKLPNPFNPNLKLNLLPEMKVAPVILNNFTFILIDYKIKKNVDEYFVTK
NITHLKKIHKKILIKNKVKSFYLKAKYNIPLLNALVLYIGMSLPPEILTIQKIPEANRHP
ALEIILFLIYKLDMEGRYYLLASITNHLRYPNAHTHFFSSLLLWIFNVSKNEIIKEQVTG
ILLERLIVNKPHPWGLLITFMQLIKNPIYNFWNCTFVRVSPEIETLFHTIANSSMLNKIP
NPTTNNNINSSGNINKPTTQSNDSYTSTYQYNLKNEKISNNEFKFLSNITNSMQNNKQPN
FDESKYRIQDKIKEFSNNMNIHHLMQNANEKININNTDLIRQILSSGNVNLKNYITATGP
TMTHQYDITNTINTKSHITNASNMNTYNINSSNNNMLNIPFYRDATNLSGIKTNTNSHNS
FESLQDNQFINNPYYIQDKNIMIDSHLQNSFNQIKRTPRFNTSQLHEDNENANNIQKHFN
FETNGKLTDQNRPDFINSNNFYDSKPDYYN
NT seq 8733 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataacaattttaacataaatcttcagatcgaggatggaaacactaataaatatgaa
gccgaagtaaatggatattttgctaagttgtacacaggggaaataacagttaacacaatg
atagatatcatgaaaaatctatcatgctcccctaaaggatcaaaaaataatgatatttat
aaatcgatgctattaatcttatttaatgagtgcaaattctttcctaaatatccagtagaa
gaattagaaataactgcacaattgtttggaaaattaattaagcacaatttattgatatca
tatggtaatactttatcagttgtattaaaatgtattttagaagctttaaaaaaaggatgt
gattctaaggtttttaattttggaataacagcattagaacaatttgaagactctttaata
tgttatcctgcctttttatcctccttaattccattacctactttaaggcaatataatccg
caatatgtaattcattgcaacgatttattaaatacacttccagaacagttcagaactctt
ccatatatagatgcctctacaatacttaagataaaacacatctctgaaattagttcctac
aataatatctctaatgcaaatatatctcatatacctaacaatgacattaaaaaaatatcc
gtaacaaatgcaagtaatttaaagaatatcaacaacttagttccacatttagccaccata
gatggtgcaaaccaaactactactaatttcattactcataataatcttagtgataataat
atagaaaatagtgcaggtaataatataatttctgaaaaccacaatgataacaatactgcc
aacactatcaataactcaaaccgaacagatagctacataagtaataataatcaaactcaa
ttcgccaatcttatgaataatattctgaaccaaaataataatagtaataactttaataat
ataaataacgataatatgttattatatattaataatattttaccaaacctctcaaatata
tcagataaaaatactataccatcaaatataaataatttacaaaccatgaatagaaataat
ccattatataaaaataaaaacgccagtgtcaatttaaatactataccaggtattaacaat
cttaacaatgcatataatataaacctgttagatactaatgcatcggcaaactcaaatcgg
gcatttcaaaataaaggtcttattaatacaaatgaagcaacacacatgaatagaaacatc
aatttagtaaccaaaaatatgacttctccaaatttgccaaataatactaatcaaattaga
atggatataaatatacccaatggtggagatagctcccaaaatattcctatcaatccaaat
atcatacgaacagataataataaaaatgaaaataattatacaagtggcattcctcaatct
aataataaagaaactgatgaacaaacaaacggatgtatagaaatattttataatcaagtt
caattaaaattaccttcaaatttaaattcaaaaaacattagcggatttgggttaggacaa
atagaatgcttaatggataatacacatatatcaaaaagtattattattccttcctctgta
gttgtaggagaagtatttagtatattcaatactctatgtttgcttaatatcgatgaaaaa
ataaaaatattaaaagatgttatgcaacccgaatattatagttggctagccttttatatt
gtaaaatcgagagtttcaaaagaagttaacttacataatgtatttttagaattcattgat
aaactaagctatcctatgcttatagatactattattaatatgacgtatgactatatactt
atcttatttaaatatataaatgaattgaaagaagttagtgcattcagaacggtactcaaa
aatttaggctcatggttaggatttataacattaggtagaaataaaccattaaaatcaaaa
atattagatttaaaattagttttatttgaagcttatgataaagattgtttagtatgtata
ttaccaatggtatgtaaaatattagaatctatcaaattatctaaaaattttaaaccacca
aatccatggactacaactatgttatgcttattaacagaaatacatgaattgccaaatgct
aaaacatatattatatttgaagttgaagttttatttaaaaacttatcattagatatacaa
gattatcaaaataaaacggttctattaagtaaaagaacccaacaatatgctcaaaaaaat
gatttaaatattgcagatccagctaatacaaactcttctattttaccatcgaatatagat
atcaaatcgcattctttaaaacccaatatcgcaaattttacttcacccaacgacatcaat
atcaacaacgtgaataataattactatccttataacaatatcacaaattggaataatgcc
aattctggggagcctaacaatatttctgaaaatgcactattagaagaatttgaaaatctt
actaaaaaaaataatcaaaataataggataataaatcacgacaaagctgattatataaat
aaaaacaataatcaacaattactaaatttaaaaaatataatatctcattggaatgaatat
aatgcaaataaaagtaatcccttacaaaatgataatattctagtttcctcatttgctcct
ccagatattaaatcaaataattccaacactttcaataaggtattcgctagtatctctaaa
gcacatagttcaatgagcgatcaaacattaaataaaattgatcccaatattattaataac
tataatattctaaattcatctataaatgcaaatgcatctaacgatcatagtaaaatgaat
aatagtaaattttttcaaaatttatgtaatgctacaattatatctccatctatagctctg
tttcaaattcaaccaaatttaaaaaaagttgttcctatagcagttgatagatcaattaaa
gaaatcatatccgcagttttagaaagatcagtagctatatcatgtattactactagagaa
attatatcaaaagatttctgtttagaaaaagatcaaaatataattcgaaaagcagcacat
attatgacagcatcattagctgcatcactagcattagctacatgcaaagaaccattaaga
atttcattaactcaaaatttaagagaattattacaacccactagtacaaaagattgtaat
gatcaagtcttgatagaacaagttgttcaagtacttagtgcagataatttagaattaggt
tgtaatttaattgaacaagcagttattgaaaaagcaataatagatattaatgaagcttta
gctccaactcttttagccaaacatgtagcaaatgaagagaatgttaaattaaatgattcc
gtcaacattatgaacaataaaaaaatgcaaatcgaatttgcagaaattttaaacttagga
acccctataacaaataatcaattacaaatttataaagattttctaaatatgaatccatta
aaaaaattacattcttctcctaaaggattaacattaatttataaaaatatcgacgaaaca
aatcccataaatacacaacaaaatgatcaacaaccatctatcactactaatgaaaatacg
aaaaacgatctaatccctaatttaggaacaaacataaatatagattacaataataatatt
gagttaaaccaaaatggaagtaacataaaaatgccacatgctacatcaaccataccacca
aatcctaatttgaacaaagttttaaaaaaattagaacttgcaactaatcaattaaaagaa
acaattaaagatatacttatgttaccaccaatattatttaatattaataaaaaaaaattt
attggtaatattaataaaataagcttatatattttatatagtctatcagttgatgataat
ctatttaatttaattaagtctataccagaaattgcttcattaactcatcataaaaatgaa
actattatttcttatacaaatagaatatgtaaattcctttttgaaattgcattacataat
tataataaatctcaacaagaatcaaaattaaatgatatgactggaatttatatggaagta
tttttatgtatattagaaaaattaaaaaaaaaatgccctattgcaaaagaacatatatct
acatctgtaatgaaaactactatgaacctactaaatacaccacttaataatgctaccaca
tctaataatactaataataaaactgaggaaagcaatgctgaaaatgctagtgattcagaa
aaaaatgattctctaaattctgaaaatatagctagccaaaaagagaatgaatcaaacaaa
gataataataaaacgagcaacaactatgaacagttttataaatccaatgcaaatattata
gctggcctaattagatataacctaattgatatggatcaatataaacaatttttagaaact
caactagccaataaaattagtaacaataatgcaatcaaatttattatttttctgttaaaa
aatatcttaattgattttcacatatatagatataactattttaaaaacatttttgaccat
cttaataatataataaatactaaccctaaagaaaataatactaacgaacaaacgaacaaa
gactcaaaaatagataacactactgatatggatgcaaacatattttataacaacaatgat
aaaccaattactttaagttcagcaattgatgaattaactaaagaggctaaaaatattcaa
gaaaaaacaaactctgtaatattttcggattattttgaggtatgtgatgaattttcaaaa
agtgacgttgaaagtgaaaaagaggatgacgaccctgataaccccaatgaagacactaat
aaagatcttaccaaattaaaagaagaaaaaaacgaacaggacgaaaaagctgaaacaaat
ccaattgatcccgaaacagaatcacaactaaccaccgaaacttcccctaaaaatgaagaa
acaaaattagaaactaaaaataaaaaaaacaaaaaaaataaagacgaaaagaaggatgat
aacataactaatgcaaaagccgaaataaatgaaacctcttcaccttcctcaaaatcgaaa
gacattgcaaataaaaactcagaaccaacaaccaaaaaaaacactgacaatattactgaa
aatgaaacagaaaaaaatgattcaaatgctgaaaaaatcggggatagtgaaactgaaaga
aataaaaaaaaacatatcaatgataaaaatggggatgaaaaaacaaattataaaaaatat
ctacaaattttaatgaacccacaaaacttaacaacactaacacaaattatcgatttctgc
ttaaataaagattggaatataatacaagccaaaaaatttaatgatggaattagagataaa
ggagtagggggagttagaattgttcctaaaccacaaaaagtaccaaaacaacaacaacat
attgttagttcgatttttatggaatgggttaaattaagtaatatcaaaagtgttgataat
ccaaatcaaatttatgtcaaattttttcaaaaaatatcaagtcaaggattattgcaaata
aataattccgataatttttttacgacatgtatttataaggctatagaacaagcagaatta
tttcttgatccatattctgaagattttgaaagctttcaaattggagattcaaaagaacta
cttacatccatctatacaaattatctgaaaacgaatgagaataatgagacaaaaggaatc
gaatctgaaattgaattaacctcagatatgttgtcaaaacaagacaatcaaaatgaaaat
ttaaaacgagaatatgaagaaagcgattcaaatattgataaaaaaaataaaaaaaaaaca
gatcttattgaagaagaaacagaaaatgctagccattctaaagaaaaagataaaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaatgaacatacagatgcaaaatctaaaccaaccgaacaaactgaaatg
gaaaaaaataaagatcaatataacgaaaaagaaaataatgaaactaataaatactgcgaa
gattcagaagataattttacagatgcagtatctactaatttaacttttaattcgaatatc
tcaaattatgaatattcattttctgatgaagataatccacactatttcgtaaatactagt
gatagaaataatagtaatacaaataaaatgaaaaataaaaaaaaagatactcttaatttt
gtatactcctctataaacaaatccatgaataatgattcgattctaaattcggataaagat
attgaaagaaatagattatattccgaagtgcttaaagaaaattgtatcatcaccgaccca
aataaagacaaaacagatggaaaaaatacgacgaaaatagcaaagaatgaatcaaatgat
accaatttagagaaagaaaagaaccccaaatcagaatcaaatagccaaaataatcaaaac
agccaaaatgacaaaatagagacccaaatcgatgaagatacaaaaaaggatttagaaaaa
catacacaaattacaaacacactagatacttcaccaatcgatgcactagctaaaatggta
gtatcaatgatgaaattagtagactcacaaaaaattacaccatatttattattacaaaaa
gtaatgaatatgttttgtagaatagtagtatatgaatgtcgaaaaaaacaaaatcaattt
aatcaaagaccatattttcgtttatttttatcaatattaacagaaataaataaaaatgaa
aaaaatcttgaacaatcatataataaatgtatattagcattaggttattatttacgtata
ttaaatccattaagagtcccaatgtttgtttttgcttgggttgaattaataagccataaa
ttttttttaccgaaaatattacagacatcaaaaggttggtatatatataataaattaata
atatatctctttgaatttttatatggatttctaaaaaattcacatttaacacaaccaatc
aaattattatatagagcaacattaagaatattattattattacttcatgattttccagaa
tttttgtgtgtatatagtttttcattttgtaattcaatacctttaaattgtatgcaatta
cgaaatattattttatctgccttaccaagaaatacaaaattaccaaacccatttaatcca
aatttaaaattaaatttattacctgaaatgaaagttgcaccagtaatattaaacaatttc
acttttatacttattgattataaaattaaaaaaaatgttgatgaatattttgtaaccaaa
aatataacccatttaaaaaaaatacataaaaaaattttaataaaaaataaagttaaatcg
ttttatttaaaagctaaatataatatacctctactaaatgctctcgttttatatattggt
atgtcattaccaccagaaatattaactattcaaaaaattcctgaagctaatcgtcatcca
gccttagaaattattttatttttaatttataaattagatatggaaggaagatattattta
ttagcatcaatcactaatcatttaagatatcccaatgctcatacacatttcttttcttct
ctattattatggatatttaatgtatcaaaaaatgaaattattaaagaacaagtaacagga
atattactagaacgcctaatagttaataaaccacacccttggggattattaataacattt
atgcaactcatcaaaaatccaatctataatttttggaactgcacatttgttcgtgtatca
ccagaaatagaaaccctttttcatacaatagccaactcatctatgttaaataaaattccc
aatcccactactaacaacaacatcaatagtagtggcaatatcaacaaaccaactacccaa
tcaaatgattcctacacatctacatatcaatataatcttaagaatgaaaaaatttcaaac
aatgaatttaaatttctatcaaatattactaactctatgcaaaataataaacaaccaaat
tttgacgaaagtaaatacagaattcaagacaaaataaaagaattttctaataatatgaat
atacatcacttaatgcaaaatgctaatgaaaaaattaatattaacaatactgatttaatt
aggcaaattttaagctcaggaaatgtaaatttaaaaaattatatcacagctaccggacct
actatgactcatcaatatgacataacgaataccataaatacaaagtcacatattaccaat
gctagcaacatgaatacatataatatcaactctagcaataacaacatgctcaatatacca
ttttatagagatgctacaaatttaagtggaataaaaacgaacaccaattcgcacaacagt
ttcgaatcactacaagataatcaattcattaataacccctactatattcaggataaaaat
ataatgatcgattcacatttacaaaatagctttaaccaaattaaaagaactccacgattt
aatacttcgcaattgcatgaagataatgaaaatgcaaataatattcaaaaacattttaat
ttcgaaacaaatggtaaattaacagatcaaaatagaccagactttattaattcaaataat
ttttatgattcaaaacctgattactataactaa

DBGET integrated database retrieval system