Clostridioides difficile 630Derm: CD630DERM_19620
Help
Entry
CD630DERM_19620 CDS
T03785
Name
(GenBank) ABC-type transport system, permease
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
pdf
Clostridioides difficile 630Derm
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pdf02000
]
CD630DERM_19620
Transporters [BR:
pdf02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
CD630DERM_19620
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEJ98536
LinkDB
All DBs
Position
1:2221135..2223552
Genome browser
AA seq
805 aa
AA seq
DB search
MFRNNNRTFIRKIALNDLKINKLKTYLSGIIIMISTCLLLTVTLVSYNASVDLVNASPYH
AIYKSVDEKAKNILYKDKNFSGVGTYKLIGSNKKTDCIMSIVYADDTAIKLMNFQPLKGK
LPTNKNEIAISEKYLQEFGLDKDIGDSIKLNYYDDITNKEVQCDFIIVGFLENYYQDNAK
QYYTVVSNDYFKNIASTPLQNKSNTFDESRPDTVDVLVKLSEENTEKDSASIKTQLKKIG
LSLGIKKYNIYLNDNYIESNLIDGEQIITVLVVGIVVLFSSVFVIYSIFYISVVNSVQMY
AKLKSLGMTSFQLKKIISLQGNILSIIFIPLGVIASCIIAYIIQPLAWQMIADLFIILIL
SLVMFLTVRISLFKPARIISKISAIEAMQYTETKFRKKVKNFSYINIKNLALKNIESNRK
KNLIALISLSISGVLFISIANLANSIDFKKQLSQQFVYNEDYIISIKSDNLYEHITEIQQ
NNPLTDSLKNEIKSIHGVKKLIESKAIKSNIIEPYIKDRDEKQFITLIKGITPELSKSLE
EYIVSGKIDYTHLDSDSLIINKYRTKYYGLNLKVGDTVTFNIFSGNDIIKKKMKIIGIID
NSNTGGMFFASDKTLESLTPYNTNLDFSILIDKKHSKEVEEKLLSIIQKNSNLMLYSYED
DYRMITRAFQYIIIASYIFVGLISCFGILNMTNTLVNSVLIRKKEFALLQAVGMTRKQLR
NMLYREGLNISIKAICTSSILGYFGSNLLCTFIKDVIRLDFINFKFSIFTILIFSFVLIG
IQVLVTELLVRNIEKKSLTERLRSQ
NT seq
2418 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttagaaataataatcgcacatttataagaaaaatagctttaaatgatttaaaaatt
aataaacttaaaacatatctttcaggtatcattataatgatttctacatgtttattatta
acagtgaccttagtttcatataatgcctctgtagatttagttaatgcatctccatatcat
gctatatataaatctgtagatgaaaaagcaaaaaatatactatataaagataaaaacttt
agtggcgtaggaacttacaaattaattggaagtaataaaaagacagattgtattatgtcg
attgtttatgcagatgatacagcaattaaacttatgaattttcaaccattgaaaggcaaa
ctacctacaaataaaaatgaaattgctatttcagaaaaatatttacaggaatttggttta
gataaagatattggagatagcattaaattaaattattatgatgatattacgaataaagaa
gttcaatgtgattttattattgttggatttctagaaaattattatcaagataatgccaag
caatactatacagtcgtttcaaatgattattttaagaatatagcttctacacctttacaa
aataaaagtaatacttttgacgagtcaagacctgatactgtagatgtattagttaaacta
tcagaagaaaatacagagaaagattcagcttcaattaagacacagttaaagaaaattggt
ttatctttaggtattaagaaatataatatatacttaaatgataactatattgaatcaaat
ttaattgatggtgagcagattattacagttttagtagttggaatagttgttcttttttct
agcgtttttgttatatatagtattttttatatttcagttgttaattcagttcagatgtat
gctaagttgaaatcgttaggtatgacttcttttcagttaaaaaagattatttctctacaa
ggaaatattttgtcaattatttttattccattaggggttatagcttcttgtataattgct
tacataattcaaccattagcatggcaaatgatagctgatttatttataattttaatttta
tcactggtaatgtttttaactgttagaatttctttatttaaaccagctagaattatttct
aaaatatctgctattgaagccatgcaatatacagaaactaaatttagaaaaaaagtaaaa
aattttagttatataaatataaaaaatctagcattaaagaatatcgagtcaaatagaaaa
aaaaatttgattgcattaatatcgctaagcattagtggagttttatttatttcaatcgct
aatcttgctaattcaatagatttcaaaaaacaactatctcaacaatttgtctataacgaa
gattatataattagcattaagagtgataacttgtatgagcatattacagaaatccaacaa
aataatccactaacagattctcttaagaatgaaattaaatctattcatggagtaaaaaaa
ttaattgaatccaaagcaattaaaagtaatattatagaaccttacatcaaagatagagac
gaaaaacaatttattactctaattaaaggtattacgcctgaactttcaaaatcacttgaa
gaatatattgtcagtggaaaaatagactatacacatttagattcagatagtttaattata
aataaatatagaacaaaatattatggattaaatttaaaagttggagatacagttacattt
aatatctttagtggaaatgatattattaaaaagaaaatgaaaattataggaatcattgac
aattccaatacaggaggtatgttttttgcttcagacaaaactttagaatctctaacacca
tataatacaaatttagatttttctattttaatagataaaaagcattctaaagaagttgaa
gaaaagttgttaagtataattcagaaaaattcaaatttaatgctttattcatatgaagat
gattatagaatgattactagagcatttcaatatataattatagcttcatacatttttgtt
ggtttaatttcttgctttggtatactaaatatgaccaataccctagtaaacagcgtttta
attagaaaaaaagagtttgccttacttcaagccgttggaatgacaagaaagcaactgcga
aatatgctttatagagaaggtctaaacataagtatcaaagctatatgtacttcaagtata
ctaggttattttggttcaaatctactttgcacttttataaaagatgtaattagattagac
tttattaattttaaattttctatatttactattttaattttttcattcgtattaattggt
atacaagttttagtgactgaattacttgtaagaaatatagaaaaaaaatcacttacagaa
cgcttacgttctcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system