KEGG   Plasmodium falciparum HB3: PFHG_01714
Entry
PFHG_01714        CDS       T01052                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K01148  poly(A)-specific ribonuclease [EC:3.1.13.4]
Organism
pfh  Plasmodium falciparum HB3
Pathway
pfh03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pfh00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    PFHG_01714
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pfh03019]
    PFHG_01714
Enzymes [BR:pfh01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.4  poly(A)-specific ribonuclease
     PFHG_01714
Messenger RNA biogenesis [BR:pfh03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Other 3'-5' decay factors
     PFHG_01714
SSDB
Motif
Pfam: CAF1
Other DBs
NCBI-ProteinID: KOB59953
UniProt: A0A0L7K968
LinkDB
AA seq 862 aa
MSSVFNYFFKNFVLKEKRNLFFKYNILERGYSKITSVNLNNWNNIHKEIIQKINNSDFVS
IDVEYTGLHLKDERYISLDSSYEAHCYGAKSFFPCQIGISIAKKKDIVEDLYQTDEENNK
IKKKSSVHTRKVIYENGNMNKICNIEKKKQEWHISPYCIYVFPKENKYFSVSTSTLSFLK
ENNFDFNEWIFNGVGYLRPNEEEEKKKNIVEKINELNNLLSKCNTNKKNIIPGEKIHIDK
IIQEIENYKIVDDEDKEAIISIIKKIGKWINNTNNDKNYCKHEEDKKKLNMNKDTNINYI
NNNKDKANGNDIHIHIPTTNIDNNNIYNITNNIVKEKTFASLNNNFIQKQKNELTNNNVY
NVKQTFSSINSNIKNIPNNYITNEDVYDNNEKIINKSTKENDNKCYNNIHNNDTIGHIEC
DINNMDDISNYPLYLEIENPYLRLLAHTLITKYFDSIFCISVKVNDRKHLAVYRSEKDSY
KEQIKNLEQEIEKINQIIGVRLLFDEIIKNKKIIIGHNCFYDILHIYQTFYHDLPKSINV
FKKKWTELFPHTFDTKYINETNEYLYALNGPATLKGLCEYMASLISSSNDFDFFFNFMND
PTDLPQCFIPFINPKKMTKYNMTQNFIHQKNNMLYSNDGNNMENDKIQQELLYGTKGDNI
IPNRSIELNSENNTLKNNNNNNDNYNENNMIYVNNTNDKHILNSDEHNAGYDSLLTCLLF
IFQCHYILKKNNLMWKDIYFSESNKANNTNSKYFFDIFLNMSNKIKIVKTQPNVISLCSA
ENYEMSRHFYMYDYPRYFKKWEIMKIWSPIWITLSKVDDQSCWIIAKSDDDAKNIKMIYK
MLQNPQFKLCTYEEYIHKFKSN
NT seq 2589 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaagtgtttttaattatttttttaaaaatttcgttttaaaagaaaagaggaatttg
ttttttaaatataatatattagaaagggggtactctaaaataacaagtgttaacttaaat
aattggaataatatacacaaagaaataatacagaagattaataacagtgattttgtttct
atagatgtagaatatacaggtttacatttaaaagatgaaagatatatttcactagattct
agttatgaagcacattgttatggagccaaatcatttttcccttgtcaaatcggaatatct
attgctaagaagaaagatatagttgaagatttatatcagacggatgaggaaaataataaa
ataaaaaaaaaaagtagtgtacatacaagaaaggttatatatgaaaatggaaatatgaat
aaaatttgtaatatagagaaaaaaaaacaagagtggcatatatcaccatattgtatttat
gtatttcctaaggaaaataaatattttagtgtatctacaagtacccttagctttttgaaa
gaaaataattttgattttaatgaatggatatttaatggagtaggatatttaagaccaaat
gaagaagaggagaaaaaaaaaaatatagtagaaaaaattaatgaattaaataatctacta
agtaaatgtaataccaacaaaaaaaatatcataccaggagaaaaaatacatattgacaaa
attatacaagaaattgagaattataaaattgtggatgacgaagataaagaagcaattata
tccataattaaaaaaatagggaaatggataaataatacaaataatgataaaaattattgt
aaacatgaagaggataagaaaaaattaaatatgaataaagatacaaatataaattacata
aataataataaagacaaagctaatggtaatgatatccatatacacatacctacaaccaac
attgataacaataatatttataatattactaataatattgtcaaggaaaaaacatttgca
agtttaaataataattttatccaaaaacaaaaaaatgaattaactaataataatgtgtat
aatgtaaaacaaacattttcatccattaatagtaacataaagaatataccaaacaattat
ataactaatgaagatgtttatgataataatgaaaagataattaataagtctacaaaggaa
aatgataataaatgttataataatatacataataatgatacaattggacatatagaatgt
gatataaataatatggatgatatatcaaattatccattatatttagaaattgaaaatcca
tatttacgtttactagcacatacattaataacaaaatattttgattcaatattttgtata
tctgttaaagttaatgacagaaaacatctagcagtgtatcggagtgaaaaggattcatat
aaagaacaaattaaaaatcttgaacaagaaatagaaaaaataaatcaaattataggagta
agattattatttgatgaaataataaaaaataaaaaaataattattggacataattgtttt
tatgatattttacatatatatcaaacattttatcatgatttacctaaatctataaatgta
tttaaaaaaaagtggacagagttatttcctcatacatttgataccaaatatattaatgaa
acaaatgaatatttatatgctttaaatggaccagcaacattaaaaggtttatgcgaatat
atggcatccttaatttcatcaagtaatgatttcgatttcttttttaattttatgaatgac
ccaactgatttgccacaatgttttattccatttataaatccaaagaagatgactaaatat
aatatgactcaaaattttatacatcaaaaaaataatatgctttattcaaatgatggtaat
aatatggaaaatgataaaatacaacaggaattattatatgggacaaaaggggataatatt
ataccaaatagaagtattgaattaaattcagaaaataatacattaaaaaataataataat
aataatgataattataatgaaaataatatgatatatgtgaataatacaaatgataaacat
atactgaacagtgatgagcacaatgctggttatgatagtttattaacttgcttacttttt
atatttcaatgtcactatattttaaaaaaaaataatctcatgtggaaagatatatacttt
tccgaaagtaataaagcaaataataccaatagtaaatatttttttgatatatttttaaat
atgtctaataaaataaaaattgtaaaaacacaaccaaatgttatttccctatgtagtgca
gaaaattatgaaatgtccagacacttttatatgtatgattatccacgttattttaaaaaa
tgggaaattatgaaaatatggtctcccatatggattacactaagtaaagttgatgatcag
tcatgttggataatagccaaaagtgatgatgatgcaaaaaacattaaaatgatatataaa
atgctacaaaatccacaatttaaattgtgtacttatgaagaatatattcataaatttaaa
tcgaattga

DBGET integrated database retrieval system