KEGG   Plasmodium falciparum HB3: PFHG_01740
Entry
PFHG_01740        CDS       T01052                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
pfh  Plasmodium falciparum HB3
Pathway
pfh03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pfh00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    PFHG_01740
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pfh03019]
    PFHG_01740
Messenger RNA biogenesis [BR:pfh03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     PFHG_01740
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     PFHG_01740
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind DUF3819
Other DBs
NCBI-ProteinID: KOB59977
UniProt: A0A0L7K9L8
LinkDB
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DBGET integrated database retrieval system