Phosphitispora sp. TUW77: ABFY19_13135
Help
Entry
ABFY19_13135 CDS
T10992
Name
(GenBank) S-layer homology domain-containing protein
Organism
phos Phosphitispora sp. TUW77
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPO21800
LinkDB
All DBs
Position
complement(2731581..2734118)
Genome browser
AA seq
845 aa
AA seq
DB search
MRKFKRMIALVTVALFVLAFAAPAGAATFSDVSGTSSDSIYRLNALGIIDGYPDGTFKPA
NSITRAEFAKIAMSAAGNASSADFLKDAASKFSDVKPGQWFTGWVNLAANLGYIQGYPDG
TFKPQSNITYAECVTILVRLLGYSDKLPGEWPTEYLVKAAELGVTDDVSFSANGAANRGD
IAMMTSETLDQNLVVWDKDVDDFAFKRDADDNVYTLLADKFDGAVYDEDDYFIADWEMNA
DHQIVLEVTGTINPFTGEEVEGGYTGYLTLAEDCVVDGGRVVTTMSGNRINFIYNEDDEE
VTYVDIVSTALSSGNVEMDGEKLKIDGVSYRFADDAYNGYVAEPAGEYNYQYKTYFDEDN
RIYLNARINEPNKPHIIDEIDSDLTMEYLDGGSVDLDQDDILVIRNYQYVSVDDLQPGDV
AYVFEDEYGCDVFVDAYAPGFRYSTTAKFNAAMETTGDDVFDQVKVGGQKYDLISAAAMS
TDDGDEWSDVADGDETFFDDVYDENVFIVLDRSMDICLIVTDADSESNTIYGVVDKVLDT
DLDDFITSIKIMKTDGATVTYDVDTADMELTYDSVGTTFSAVDAVFDGAAVKFQLNDSGD
IDDLEVLDDQANSITDGSEDLNKLYIDGSWYYTNSDTVVLNAPTDEDPDVVSTSNLLSDA
ESNTINCWVKLDGNKVELVMIVGDTVEGAADDMAMVIDDYIYDGDTWVTVDIRGTVEDYE
VSSGTPATDELFDYSMSGSKIVLGTATDATVDYDVYGVVTDVDAANDALEVNDTWYEVDA
DSYIYDMTGSDPVYVDGIDGIDEDDCIFVIEVTGDDDRKGVADVILIVDEDDYTECDFEA
GYPEV
NT seq
2538 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaagtttaaaagaatgattgctctcgtaactgtagctctgttcgttcttgcattc
gcggctcctgccggggcagccaccttctcagatgtaagtggcacatcatccgacagtatc
tacagactgaacgctctcggaatcattgatggttatcccgatggaacctttaagcctgcc
aacagtattacacgtgcagaatttgctaaaatagctatgtctgctgcaggaaatgccagc
agcgccgatttcttgaaagatgctgcttccaagttttcagatgttaagcctggtcaatgg
ttcaccggctgggttaacctggctgcaaaccttggttatatccagggttatccagatgga
acatttaagcctcaaagcaatattacttatgctgagtgcgtaaccatcctggttcgtctt
cttggctacagcgacaagcttcctggcgaatggccgactgagtaccttgtaaaagctgct
gaactcggtgttaccgatgatgttagcttctcagctaatggtgctgcaaatcgtggcgat
atcgctatgatgacttccgaaactcttgatcaaaatcttgtagtatgggataaagatgtt
gatgattttgcattcaagagggatgctgatgacaacgtctacacactgttagctgacaag
tttgatggcgcagtttatgacgaagatgattatttcattgccgattgggaaatgaacgct
gaccatcagatagtattggaagttacaggaactattaatccatttaccggtgaagaagtt
gaaggtggttacaccggataccttacattggctgaagattgtgttgttgacggcggacgg
gttgttacaacaatgtccggaaatagaatcaacttcatttataatgaagatgatgaagaa
gttacttatgttgacatagtttctactgcactgtctagtggcaatgtagaaatggatggc
gaaaaactgaagattgacggcgtttcatacagatttgcagatgacgcttataacggatat
gttgctgaacctgcaggtgaatacaattatcagtacaaaacatattttgacgaagacaac
aggatttaccttaatgctagaattaatgagccaaacaaaccacatataattgacgaaatt
gactccgacctgactatggaatacctggatggaggcagtgttgacctcgatcaggacgac
atccttgttattagaaactaccaatatgtatcagttgatgacctccagcctggtgacgta
gcatatgtatttgaagatgaatatggctgtgatgtatttgtagatgcttatgctcctgga
ttcaggtattcaactacagctaaatttaatgcagctatggaaacaaccggtgatgatgta
tttgaccaagtaaaagttggcggccaaaagtatgacctgatttcagctgcagcgatgtca
actgatgatggtgacgaatggtctgacgtagctgatggtgatgaaacattctttgatgat
gtttatgatgaaaatgtgtttatagtattagacaggtctatggatatttgcttaatcgtg
acagatgctgacagtgaaagcaataccatttacggtgttgttgacaaggttcttgataca
gacctggatgattttatcacaagcattaagattatgaagactgatggtgctactgttaca
tatgatgttgatactgctgatatggaattaacttatgacagtgttggtactaccttctct
gcagtggatgcagtatttgatggcgctgcagttaagttccagctcaatgacagtggagac
attgatgaccttgaagttcttgatgatcaagcaaatagtattactgatggttcagaagac
ctgaataaactgtatatcgatggttcatggtactatacaaatagtgatactgtggttctc
aatgcacctacagatgaagatcctgatgtagttagtacatctaacctgcttagtgatgct
gaatcaaatactattaattgctgggtgaagttagatggcaacaaagttgagttagtcatg
attgttggcgacacagttgaaggcgctgctgatgacatggccatggtaattgacgattat
atctatgatggcgacacatgggtaactgttgatatccgtggtactgttgaagattacgaa
gttagcagtggaacacctgctactgatgaactgtttgactactcaatgagcggatccaag
attgtccttggaactgcaacagatgctaccgttgattatgacgtatacggagttgtaaca
gatgttgatgcagctaacgatgcattagaagttaatgacacctggtacgaagtagatgca
gacagctacatctatgacatgaccggtagtgaccctgtatatgtagatggtattgacgga
attgacgaagatgattgcatattcgtaatcgaagtaactggtgacgacgatcgtaagggt
gtagcagatgtaatccttatagttgacgaagatgactacactgaatgcgactttgaagcc
ggatatcctgaagtataa
DBGET
integrated database retrieval system
