KEGG   Candidatus Purcelliella pentastirinorum: C9I82_349
Entry
C9I82_349         CDS       T05580                                 
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase beta subunit
  KO
K03043  DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:2.7.7.6]
Organism
ppet  Candidatus Purcelliella pentastirinorum
Pathway
ppet03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ppet00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    C9I82_349
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:ppet03021]
    C9I82_349
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
    C9I82_349
Enzymes [BR:ppet01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     C9I82_349
Transcription machinery [BR:ppet03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     C9I82_349
DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      C9I82_349
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_1 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb2_45 CBP_BcsO
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXN02307
UniProt: A0A346E002
LinkDB
Position
360165..364223
AA seq 1352 aa
MSYFFIGDYMVYSYTEKKRIRKSFGKRPQVLNIPNLLSIQLDSFDKFIKQDLTGKYGLES
SFRSIFPIKSYDNNVELQYITYSLGEPGFDVQECKIRGVTYSSPLRVKLRLLLYVFENSK
KILKSDKEQEVYMGEIPLMTFNGTFIVNGTERVVVSQLHRSPGVFFDSDKGKTHSSGKVL
YHARIIPYRGSWLDFEFDPKDNLFVRIDRRRKLPVTIILRAMGYSVEDILGIFFDSVIYK
LNNNGTFRMELIPSRLRGEIVCFDVIVNNFLYVEKGRRISAKHINKLISDNIKYIDVPFD
YLIGKVLIKNHYSFITGELILSANDKLTLNNLNKLKESNCFSIHTIFTNDLDHGSYISET
IRIDPTIDNLTALLEIYRMMRPGEPPTRETAEILFENLFFSEERYDLSSVGRMKFNRSLR
RNVVNGSSILDKSDIVDVIKKLIAIRNGKGEIDDIDHLGNRRVRSVGEMIENQFRIGLVR
VERAVKERISASELSSLMPQDIVNAKPISASIKEFFCSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRI
SALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRVCPIETPEGPNIGLINSLSVYARTNEYGFLETP
YRLVKKGLLTDEIHYLSAIEEGMYIIAQASTNFDHFGKFLDDFIICRHKGEASLFHIKQI
HYMDVSTQQIVSVGASLIPFLEHDDANRALMGANMQRQAIPTLISEKPLVGTGMERVVAV
DSGVTIIAKRSGVVQHVDADRIVIKVNEWEIISENYGIDIYNLIKYARSNQNTCINQSPC
VFLGDVISAGDVLADGSATDLGELALGQNMRVAFMPWNGYNFEDSILISERVAQKDRFTT
IHIQELSCISRDTKLGQEEVTSDIPNVGESALSKLDESGIVYIGAEVKGGDILVGKVTPK
GETQLTPEEKLLRAIFGEKASDVKDSSLRVPNGVFGTVIGVQIFTRDGVSKDKRALEIEN
MELDQVEKDLKYELKIIQNDLFIRIRKFLLSLYLCNIDVNKLNNDKLFDIKLDSKKDQTI
LDDFYKKYKILNNNFLKKFDDKKRKVVQGDELPPGILKIVKVYLAIRRHIQLGDKMAGRH
GNKGVISKINPIEDMPYDENGVPVDIVLNPLGVPSRMNIGQILETHLGMAAKGIGEKIDL
MLKNSVNVSNIRKFIKKIYGLGGFKYQNFDFDSFTEKEILDLALNLKDGFPVSSPVFDGA
DEEEIKKMLSLGGFPSSGQIVLFDGRTGEKFEQSVTVGYMYMMKLNHLVDDKVHARSTGS
YSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEMLTVKSDDVIGRTKMYKNIVD
GNHQMEPGMPESFNVLLKEIRSLGINIELEEE
NT seq 4059 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
attagttatttttttattggtgattacatggtatattcttataccgaaaaaaaaagaatt
cgtaaaagttttggtaaacgaccacaagttttaaatatacctaatttactttctatacaa
cttgattcttttgataaatttattaaacaagatttaacaggtaaatatggtttagagtct
tcttttcgttctatttttcctataaaaagttatgataataatgttgagttacaatatata
acttatagtttaggtgaaccaggttttgatgttcaagaatgtaaaataagaggagtaaca
tattcttcccctttacgtgttaaattacgtttattattatatgtgtttgaaaattcaaaa
aagatattaaaaagtgataaagaacaagaagtatatatgggagaaataccattaatgaca
tttaatggtacttttatagttaatggtactgaaagagtggttgtttctcaattacatcgt
agtcctggtgtattttttgatagtgataaggggaaaactcattcttctggtaaagtttta
tatcatgcacgtattattccatacagaggatcttggttagattttgaatttgatccaaag
gataatttatttgttcgtattgatcgtagacgtaaattacctgtgactattatacttaga
gctatgggttattctgttgaagatattttgggtatattttttgatagtgttatatataag
ttaaataataatggtacatttagaatggaattgattccttctcgtttaagaggtgagata
gtttgttttgatgttattgttaataattttttatatgttgaaaaaggtcgtagaatatct
gctaaacatattaataaattaattagtgataatattaaatatattgatgtaccttttgat
tatttgataggtaaagtattgattaaaaatcattatagttttattactggtgaattaata
ttatctgctaatgataagttgacattaaataatctaaataaattgaaagaatctaattgt
ttttcaattcatactatttttactaatgatttagatcatggttcttatatttctgaaact
atacgtattgatcctactattgataatttaactgcattattagaaatttatagaatgatg
agaccaggtgaaccaccaacacgtgaaacagcggaaattttatttgaaaatttatttttt
tctgaagaacgttatgatctttcatcagtcggtagaatgaaatttaatcgttctttaagg
cgtaatgttgtaaatggtagtagtattttagataaaagtgatattgtagatgtgattaag
aaattgattgctattagaaatggtaaaggtgaaattgatgatatagatcatttaggtaat
aggcgtgttagatctgtaggtgaaatgatagaaaatcaatttcgtataggtttggttaga
gttgagagagctgttaaagagcgtatttcagcaagtgaattaagttctttaatgcctcag
gatattgtaaatgcaaaaccaatatctgcttctataaaggaatttttttgttctagtcag
ttatcacaatttatggatcaaaataatcctttatcagaaattactcataaaagacgtatt
tcagcgttaggacctggtggtttaactagagaacgagctggttttgaagttcgtgatgtt
catcctactcattatggtagagtttgtcctatagaaactcctgaagggcctaatatagga
ttaattaattctctttcggtttatgcaaggacaaatgaatatggttttttagaaacacca
tatcgtttagttaaaaaaggtttattaactgatgagattcattatttatctgcaattgaa
gaagggatgtatattatagctcaagctagtactaattttgatcattttggaaaatttttg
gatgattttattatttgtcgtcataaaggggaagcgagtttatttcatattaaacaaatt
cattatatggatgtttctacacaacaaatagtttcggttggtgcttctcttattcctttt
ttagaacatgatgatgctaatcgtgcattaatgggtgctaatatgcaaagacaagctatt
cctactttaatatctgaaaaacctttagtgggtacgggaatggaacgtgttgttgcagtt
gattctggtgttactattatcgctaagagaagcggtgtagttcaacatgtggatgcagat
cgtattgttattaaagtaaatgaatgggaaattatttctgaaaattatggtattgatata
tataatttaatcaaatatgctcgttctaatcagaatacatgtatcaatcagagcccatgt
gtttttttaggtgatgttataagtgcaggtgatgttttagctgatggatcagctacagat
ttaggggaattagctttaggtcagaatatgagagttgcatttatgccatggaatggatat
aactttgaagattctattttaatatctgagcgtgtagctcaaaaagatagatttactact
attcatatacaagaactatcttgtatatctagagatacaaaattaggacaagaagaagtt
acatctgatattcctaatgttggtgaatctgctttatctaaattagacgaatctggaata
gtttatattggtgctgaagttaagggtggtgatattttagtcggtaaagttacacctaaa
ggtgaaacacaattgactccagaagaaaaattattaagagcaatttttggtgaaaaagca
tcagatgttaaagattcatcactaagagttcctaatggtgtatttggaactgtaattggt
gttcaaatctttactagagatggtgtttctaaagataaaagagcattagagattgaaaat
atggaattggatcaggttgaaaaggatcttaaatatgagttgaaaattattcaaaatgat
ttatttattagaataagaaaatttttattgtctttgtatttatgtaatattgatgttaat
aaattaaataatgataaattatttgatattaaattagatagtaaaaaagatcagactata
ttagatgatttttataaaaaatataagatattaaataataattttttaaaaaaatttgat
gataaaaaacgtaaagtcgtacaaggtgatgaattacctcctggaatattaaaaatagtt
aaggtttatttagccattagacgtcatattcaattaggagataaaatggccggtcgtcat
ggtaataaaggtgtaatttctaaaattaatcctattgaagatatgccttatgatgagaat
ggtgtgccagttgatatagtacttaatccattaggagtaccatctcgtatgaatattggt
caaattttagaaacacatttaggtatggctgcaaaaggtataggtgaaaagattgatttg
atgttaaaaaattccgttaatgtgtcaaatattcgtaaatttataaagaagatttatggt
ttaggtggttttaagtaccaaaattttgattttgatagttttactgagaaagaaatatta
gatttggcattaaatttaaaagatggttttcctgtatctagtcctgtttttgatggtgct
gatgaagaagagattaaaaaaatgttatctttaggtggttttccttcttctggacaaatt
gttttatttgatggacgtactggtgaaaaatttgaacaatctgttacagtgggttatatg
tatatgatgaaacttaatcatttagttgatgataaagttcatgctcgttctacaggttct
tatagtcttgttactcaacaacccttaggtggtaaagctcaatttggtggtcaaagattt
ggtgagatggaggtttgggcacttgaagcatatggtgctgcttacactctgcaagaaatg
ttaactgttaaatctgatgatgttataggtcgtactaaaatgtataaaaatattgttgat
ggtaatcatcaaatggaacctggtatgcctgaatcttttaatgttttattaaaggaaatt
cgttctttaggtataaatattgaattagaagaagaataa

DBGET integrated database retrieval system