Candidatus Phytoplasma australasiaticum subsp. australasiaticum: H7685_000025
Help
Entry
H7685_000025 CDS
T09447
Symbol
thrS
Name
(GenBank) threonine--tRNA ligase
KO
K01868
threonyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.3
]
Organism
pphs
Candidatus Phytoplasma australasiaticum subsp. australasiaticum
Pathway
pphs00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pphs00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
H7685_000025 (thrS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
pphs01007
]
H7685_000025 (thrS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
pphs03016
]
H7685_000025 (thrS)
Enzymes [BR:
pphs01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.3 threonine---tRNA ligase
H7685_000025 (thrS)
Amino acid related enzymes [BR:
pphs01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (C/G)
H7685_000025 (thrS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
pphs03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
H7685_000025 (thrS)
Prokaryotic type
H7685_000025 (thrS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_2b
HGTP_anticodon
tRNA_SAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQV26749
LinkDB
All DBs
Position
4199..6145
Genome browser
AA seq
648 aa
AA seq
DB search
MIEIEYQQNHQKQLFPNNITVNKIITSNNLEFLNNFENLPIAAYFNNKLITLDKPLTEDG
LLNIITISDSISWSILNNNSALIMANAIFRIYPNSLLVNKSINQEGFYCDIDLVNNIISE
RDFEIIEKTMINIIRENLPISEKELSISEIKDLFKFNHYKLHALQSIQPSQKLFLYQRGN
FLDFCKESEYFPNININRYFKILKTSGVYWQGNSKNKVLTRIYGVAFFRQRDLANYLKTL
EERKKRDHKFINKEQNFFMFSSSVGAGLPFWLSKGATIRRIIERYIVDKEILYGYQHVYT
PVVANVSLYKTSGHLELYKEDMFPIMQLQDGEQLILRPMNCPHHMEIFRQKIHSYKDLPL
KIAELGLLHRYEPSGAVSGLERVRAMSLNDAHIFITPEQIKQEFVEIINLIEEVYKDFGI
KDYYFNLSTHDPSKKDKYFDDPNMWLNSEKILKDILNELKLNYKEKIGDAAFYGPKLDVQ
VFTALNHEVTLSTIQLDFLLPKRFNLSYIDHNNQNKTPVVIHRAITSTIERFTAYLIEQN
KGVFPLWIAPVQVIIIPINNMLHIDYVKKIQKEMIQHNLRVEINDKEYTFNYKIRAAYLA
KIPFQVIIGEREIQNNNLHVRQYNNPEKRNMSMIDFVKMLTDLIKNKS
NT seq
1947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaaattgaatatcaacaaaatcatcaaaaacaattatttcctaataatattact
gttaataagattatcacttctaataatttggaatttttaaataattttgaaaatttaccg
atagcagcttattttaataataagttaattactttagataagcctttaactgaagatggt
ttgttaaatattattaccatatccgatagtatctcttggtctattttaaataataacagc
gctttaattatggctaatgctatttttcgtatttatcctaattcattattagttaataag
tctataaatcaagaaggattttattgtgacattgatctagttaataatataatttcggaa
cgagattttgaaattatcgaaaaaactatgattaatattattcgagaaaatttacctatt
tctgaaaaagaactatctatttcagagattaaagatctatttaaatttaatcattataaa
ttgcatgcattgcaatctattcaaccttcgcaaaagttatttttatatcaacgaggtaat
tttttagatttttgtaaagaaagtgaatattttcctaatattaatattaatcgttatttt
aaaattttaaaaacatctggtgtttattggcaaggaaattctaaaaataaagttttgact
cgtatttatggagttgctttttttagacaacgcgatttagctaattacttaaaaactttg
gaagaaagaaaaaaaagagatcataaatttataaataaagaacaaaatttttttatgttt
tcttcatctgtgggagctggtttgcctttttggttatcaaaaggagcaactattaggcgt
attatcgaaagatacattgtcgataaagaaatattatatggctatcaacatgtttatact
ccagttgttgctaatgtttctttatataaaacatctggtcatttagaattatataaggaa
gatatgtttccgattatgcaattgcaagatggtgaacaattaattttacgacctatgaat
tgccctcatcatatggaaatttttcgtcaaaaaattcatagttataaagatttacctcta
aaaatagctgaattaggccttttacatcgttacgaaccttctggagctgtttcaggttta
gaaagggttcgagctatgtcgttaaatgatgctcatatttttattacgccagaacaaatt
aaacaagaatttgttgaaatcattaatttaatcgaagaagtttataaagattttggaatt
aaagattattattttaatttgagtacccatgatccttctaaaaaagataaatattttgat
gatccaaatatgtggttaaattctgaaaaaattttaaaagatattttaaatgaattaaaa
ttgaattataaagaaaaaattggtgatgctgctttttatggtcctaaattggatgtgcaa
gtattcacggctttaaatcatgaagtaactttatcaactattcaattagattttttattg
cctaaaagatttaatttatcttatatagatcataataatcaaaataaaacacctgtagtg
attcatagggctattacatctactatagaaagatttactgcttatttgatagaacaaaat
aaaggtgtttttcctttatggattgcacctgtacaagttatcattattcctattaataat
atgttgcatatcgattatgttaaaaaaattcaaaaagaaatgatacaacataatttaaga
gttgagattaatgataaagaatatacttttaattataaaattcgtgctgcttatttagca
aaaattccttttcaagttattattggtgaacgcgaaatacaaaataataatttacatgtt
cgccaatataataatccagaaaaacgtaatatgtctatgatagattttgttaaaatgttg
acagatttgattaaaaataaaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system