Papilio polytes (common Mormon): 106109358
Help
Entry
106109358 CDS
T07437
Name
(RefSeq) tetratricopeptide repeat protein 37
KO
K12600
superkiller protein 3
Organism
ppot
Papilio polytes (common Mormon)
Pathway
ppot03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppot00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
106109358
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ppot03019
]
106109358
Messenger RNA biogenesis [BR:
ppot03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ski complex
106109358
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_2
TPR_1
TPR_8
TPR_16
TPR_12
TPR_11
TPR_19
TPR_CcmH_CycH
TPR_7
TPR_6
ANAPC3
TPR_17
ARM_TT21_C
SIX1_SD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106109358
NCBI-ProteinID:
XP_013146284
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1272 aa
AA seq
DB search
MTDIKSLLKEARKLVDEKKFKEAQECCKNILRKDKQNYLGLVLLGKALDESDQAPLAYQK
AIAAKPDHPLAWVGLANYYERKDDDGAKLKLIPIYGEILKLQIDEEKALECITKLGQLGM
SLKNGKTLLTIAEYMTKNQDGKLYEAAQEKLLVLLKADVQCEENDISVILDVLKHIYNTG
PNESLQLLWGKLILQKQDLNHSAMEVIQLSFFSENVVLREILCKHLCKKFVDYNSFLDFP
IESHYEQITKGIENSKYPGLLQSMISYSKGLYFEAYKQSVPLINYQEAEVTETTFIIRCT
MKLKKWPVTQKLVTNFLTKVKDINFANDLKKMLFLSLAEQKKWKQAVNVIKEFPMENLSV
NEQFYLAKCLIEINEPVDHIIQELKPTDHYLELQALYYLKEKKYTEVITLLENENCNTLH
FLYMGIAYWEQKHYEKCLLNLLKAAKLDSEHPDTFLYLGYYYYYYKEDINKSKKCFEKAY
SINNTEANIIKHLSEVYSKLQLKDEDFELLNNAKNCLKMTEWVDFKLGLHYLNRREWDNA
INNFRNVIKINFSNLIAFECLADAYYSRGSYTSALKAYNKVISLSPERSSHCLTRIGYIY
SLLTEYENAITTFETVLKIDPSSLLALKGISETWMRIARKKLNAKLYGSARDTAQFAVNY
LTKALMIKKQYSCFWNLLAESLVFITKLPNKYSFVYMKNTQDDFEEAVVKKEKSVIFPQI
LACYSRVAKQKQQITSYDLASVYLSYYHENKNLVNLQISFNLALACINMKPSVWKNWNLL
GKICMFLKKYDIAQHCFIKALLLTRKWSIAKVWCNLGTLYVKLQLFKLANYCFWRGQSTL
PSYPQSWIGQGIIAEKIREEEAMDLFRHASRLGYHQESALGYADWVCRTLKNADCQDNTE
LKYVIEGLYAVTYAIDLLEWFSSFEPDNACACTILGILQERNGLLRSALKSYEKAFDYAE
DDKRNITLLNIGRIHVRLGKYDDAINSYKAITEASLDSTCGLALALYKKGLYQEAYSAYD
TALHWLSNNDNEKADLLVAMAGIAYMYKGVDDAKTLLFHSIQISQKKPTPYSLFAICSLG
IVHSDQSLSKLALSELQKYEQDPNFGYDIGFLKSYLVGDENVELGIKLLSDSLLNHPSNA
NLWFCLAQYCLKASNKAKIASRCAQRAIISARYSEQDCNSAKMLATASIAEHVAGDRAKA
MVIAKEGLHMYPSQSEVWAAVLLSVLNHKIWLEKKDWILSAIAHIRRNLDISRPLSRWVT
LLEKKLSKLLQL
NT seq
3819 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgatattaaatcgttactaaaagaagcaagaaaattagtagatgaaaagaaattc
aaggaggctcaggaatgttgtaaaaatatcctaagaaaagataagcagaattatttaggg
ttagtcttactgggtaaagctcttgatgaatctgatcaagctccactagcatatcaaaaa
gccattgcagcaaaacctgatcatcctttagcctgggttggtctagcaaattactatgaa
cgaaaagatgatgatggggctaaattaaaactaattcctatatatggagaaatattaaaa
cttcaaatagatgaggaaaaagcattagagtgcataacaaaacttgggcagcttggaatg
tctttgaaaaatggcaaaaccctattaacaatagctgagtatatgacaaaaaatcaagat
ggtaaactgtatgaagcagcccaagaaaaattgcttgttttgcttaaagcagatgttcaa
tgcgaagagaatgatatttcagtaattttggatgttcttaaacacatatacaacacagga
ccaaatgaatctttacaattattatggggcaaattaatcttacaaaaacaagacttaaac
cattctgcaatggaagtgatacagctctcatttttctctgaaaatgttgttttgagagaa
atactgtgtaaacatttgtgtaaaaaatttgttgattataattcctttttagattttcca
attgaatctcactatgaacaaataacaaaaggaattgaaaactccaaataccctggttta
ttacaaagcatgatatcctacagtaaaggtttatactttgaagcttataaacagtctgtc
cctttgattaattaccaagaagcggaagtaacagaaactacattcattattagatgtaca
atgaagttaaagaagtggccagtgacacaaaaacttgttacaaactttttaacgaaagta
aaggatattaactttgctaatgatttaaagaaaatgttatttttgtctcttgctgagcaa
aaaaagtggaaacaagctgttaatgtaatcaaggaatttccaatggaaaatttgagtgta
aatgaacagttttatttagcaaaatgtttaattgaaataaatgaaccagttgatcatata
atccaggaattaaaaccaacagatcactatttagaacttcaagcattatattatttgaaa
gagaaaaaatatacagaggtgataactttgctagaaaatgaaaactgtaatactttgcat
tttctctatatgggtattgcctattgggaacaaaaacactatgaaaaatgcctcttgaat
ctactgaaagcagcaaaactggattctgagcatccagatacttttttgtatctaggatat
tattactattactacaaggaagatataaacaaatcaaagaaatgttttgaaaaagcctat
agcataaataatactgaggctaatattattaaacatttaagtgaagtttattctaaatta
caattaaaagacgaagattttgaattattaaataatgcaaagaattgtttgaaaatgact
gagtgggtagacttcaaattaggtctacattatttaaatagaagagaatgggataatgct
ataaataatttcagaaatgtgatcaaaattaattttagtaatttgattgcatttgaatgt
ttggccgatgcatattattctcgaggttcctatacatcagcattaaaagcttataataaa
gtaatatcacttagtccagaaagaagctctcattgtttaactagaattgggtacatttac
tcattacttacagaatatgagaatgccattacaacatttgaaactgtattaaagattgat
ccatcttcattattggctcttaagggaatttcagaaacatggatgagaattgcaaggaaa
aagttgaacgctaaactttatggcagtgctagagacactgcccagtttgcagtaaattat
ttaaccaaagctttaatgattaaaaaacaatattcctgcttttggaatctgttggctgag
tctcttgtattcattactaaactaccaaacaaatattcttttgtttatatgaaaaataca
caggatgattttgaagaagcagtagttaaaaaagaaaaaagcgtaatttttccacaaatt
ctggcatgctattcccgagttgcaaaacaaaaacaacaaataacatcatatgatttagca
tctgtttatctctcttattatcatgaaaacaaaaatttggtaaatttacaaatatctttc
aatttggcactcgcttgcataaatatgaaaccctctgtatggaaaaattggaacttgttg
ggtaaaatatgcatgtttctgaaaaaatatgatattgcccaacactgtttcatcaaagcg
ttattgttaacacgtaaatggtcaatagcgaaggtatggtgtaacctagggacattatat
gtaaaactgcaactttttaaacttgccaattattgcttttggagaggacaatctacatta
ccatcttatcctcaaagttggattggacaaggcataatagctgaaaagattagggaagaa
gaagctatggatctatttcgacatgcttcacgccttggttaccatcaggagagtgcactt
ggctatgctgattgggtttgccgtaccttaaaaaatgcagattgccaagacaatactgag
cttaagtatgtcatagagggtctttacgctgtaacctatgctatagacttgcttgagtgg
ttttctagttttgagcctgataatgcttgtgcatgtactattcttggaatattacaagaa
agaaatgggcttttgcggagtgcattaaaaagctatgaaaaggcttttgattatgcagaa
gatgacaaaaggaatataactcttttgaatataggcagaattcatgttagattaggaaaa
tatgatgatgccattaacagttacaaggctattacagaagcaagtttggactctacatgt
ggattagcacttgcactttataaaaaaggtctatatcaggaagcatattctgcctatgac
acagctctgcattggctgagcaataatgataatgaaaaggcagatcttcttgttgccatg
gctggtatagcatatatgtataagggtgtagatgatgcaaaaacattattattccatagt
attcaaatatcgcagaaaaaacccacaccttacagtttatttgcaatttgctcattaggc
attgtccattctgatcaaagcttatcaaaattagctttaagtgagttacaaaaatatgag
caagaccctaattttggctatgatataggatttttaaaatcatacctagttggtgacgag
aatgttgaattaggaattaaattgttaagtgattcccttctgaaccacccgagtaatgcc
aatctgtggttttgtctggcccaatattgcttaaaagcgtcaaacaaggcaaaaatcgcc
agtcgttgtgctcaacgagcaatcatttctgctcgttatagtgagcaggattgtaattca
gcgaaaatgcttgcaactgctagcattgcagaacatgtcgctggtgatcgagctaaagct
atggttattgccaaagaaggcctccatatgtatccaagtcaatctgaagtatgggctgca
gttttactatctgtactaaaccacaaaatttggttagagaaaaaagactggatattaagt
gctattgctcatatccggcgaaatttagacatttcaagaccactaagcaggtgggttacc
ttattggaaaaaaaattaagcaaactattacagttataa
DBGET
integrated database retrieval system
