Pseudovibrio sp. FO-BEG1: PSE_3897
Help
Entry
PSE_3897 CDS
T01669
Name
(GenBank) type I secretion target repeat protein
Organism
psf
Pseudovibrio sp. FO-BEG1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Peptidase_M10_C
Reprolysin_4
Peptidase_M10
Reprolysin_5
Metallopep
Barwin
Peptidase_M54
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV38401
LinkDB
All DBs
Position
complement(4225134..4229003)
Genome browser
AA seq
1289 aa
AA seq
DB search
MFYSDYAIINLPAGGGHGRHDDDTGHFVHTVLHEIGHALGLGHQGPYNGVRPNYPNGVKF
LNDSRHVSVMSYLSQDKNYTSGATSAYPQTFAAADLLALDKIYGDQSYNGKTFGTKNAFL
GDTVYGFNTNISEENNFRMVNLARYGNNNAYTLVDGGGNDTLDLSGFRKATIDLRVTQAD
DTSPYSSSVDREKKNISIAVGTVIENAVGTRGNDKITGNYADNHLWGGRGNDKMYGLEGD
DHFYLEAGNDVMDGGEGSDWLHIDTDADMTVDLNREELVSSFGRDKIISIENVDSGSGDD
RLIGNEADNKLQGNDGNDTLYGNGGNDYLKGGNGDDELHGGAGNDRFDLDAGDDQIHGGE
GTDIIYFYGHQGSRVDLTENTIETAYGNDTISGIESICAGHGDDYLRGNEENNSIRGNGG
DDIILGEAGDDYLSGSHGNDELYGGTGNDTLSEGSGDDLVEAGAGNDRIILGDGNDILDG
GDGNDRITISNKKGARIDLAVTAVQDTGYGMDKITNVENITGNKHDDVFAGTDGSNSLRG
MGGDDVIDGRGGDDSLEGNDGNDKINGGAGDDIIFGGEGNDELSGDDGNDRLYAGGGDDV
FLIGQGKDLLDGGAGHDIVRASDDEALIVDLKHTRLVTASGVKILRNIEGFEAGGGDDQL
IGTEGDNTLIGNAGDDVLSGLGGNDRLDGGDGNDKLDGGAGDDTLVGGGGDDILEAAEGN
NVLHGDAGNDVLTTGVGDDELHGGAGEDKLTSGDGSDKLFGDDGSDELRAGAGDDELHGG
DGDDILRGEAGDDELHGDAGDDNLIDTEGNNALFGGDGDDYLEAGDGKDILDGGAGNDTI
LLSRGRDTIRGGDGVDHLIADYEENLSINLSYTSARNTGIGQASITGIENVTTSSGRDRV
IGNDADNIIKTHAGEDTLNGGAGNDSLWGGDDRDLLNGGDGNDLLEGEADNDTLNGGTGD
DVVNAGDGNDKITLDEGNDIIRGGEGEDRLIVSGSKAARIDLNVSGAQQTGYGLDVISGI
ENISGGDGDDHLTGNDLRNEFHGGNGDDVLIGAGGDDYLQGGDGNDTLLGGLGNDNLIGG
AGDDTVNGGDGSDLITLGSGTDIIDGGDGRDSLRYDGSESITVDLSHADFQSTGIGQLKV
SNVEVVEGGSGDDVLIGDEVANTLRGGSGADTLQGGGGRDYIVLGNDDAVDRVVYTSVSD
VTLEGAAELVSGFDKGEDLFDFRQIDANTDNDGDQAFLFSDDGAAANSVWVTAYRSTQYV
YADVDGDAQADFKIAVSKADALSAEDFLL
NT seq
3870 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttttactctgattacgcgatcatcaatctacctgctggcggtgggcatggtcggcat
gatgacgatacagggcattttgttcatacggttctgcatgagattggtcatgcgctcggt
ttgggtcaccaggggccgtacaatggtgtccgacccaattatccaaatggtgtgaagttc
ctgaatgactcccggcatgtttctgtcatgtcctacctcagtcaagacaagaactacaca
tcaggcgctacaagtgcgtatccgcaaacttttgctgctgctgacctgttggcgttggat
aagatttacggtgatcaaagttataacggcaaaacctttggtaccaaaaatgcgttcctc
ggggataccgtctatggcttcaacaccaatatctcagaggaaaataacttccgaatggtc
aatctggccaggtatggaaacaataatgcctacacgctcgtcgatggtggcgggaatgac
acgctggacctgtctggcttcagaaaggcaacgatagatctgcgtgtcacgcaggccgat
gacacctctccttactcctcttcagttgaccgcgagaaaaagaacatcagcattgcggtg
gggactgtcattgaaaatgcggtcgggacccgcggcaatgacaagattaccggcaactat
gcggataaccatctgtggggtggtcgcggcaatgacaagatgtatggccttgagggggat
gaccatttctaccttgaagctggcaatgacgttatggacggcggcgaaggatcggactgg
ctgcatatcgatactgatgctgacatgaccgttgatctcaatcgggaagagctcgtctct
tcattcggacgtgacaagatcatcagtattgagaatgttgacagcggttctggtgatgat
cgccttatcggcaatgaggctgacaacaagctgcagggcaatgatggcaatgacaccctt
tatggcaatggtggcaatgattacctgaaaggtggcaatggcgatgatgagctgcacgga
ggtgcagggaatgatcgttttgatctggatgcgggtgatgaccagattcacggcggtgaa
ggaacggacatcatttatttctatggtcatcagggttcgcgtgtcgatctgactgaaaac
accattgaaacggcctatggcaatgatacgatttccgggatcgagagtatttgtgccggt
cacggggatgactatcttcgtggtaatgaagagaacaacagcattcgcggcaacggtggt
gatgacatcatccttggtgaagctggtgatgattatctcagcggctcccacggcaatgat
gagctctatggcggaaccggcaatgacaccttgagcgaaggttctggtgatgacctggtt
gaagctggtgctggcaatgaccgcattatccttggtgatggcaatgacattctcgatggc
ggtgatggcaatgaccggatcaccatcagcaataaaaagggtgcccgtatcgatcttgct
gtgacggctgtgcaggataccggctacggcatggacaagatcaccaatgtagagaacatc
accggcaacaaacatgatgatgtgtttgcgggcacggatggttccaactccctgcgtggc
atgggcggcgatgatgtgatcgatggccgtggtggtgatgactcgctggaaggcaatgac
ggaaacgacaaaatcaatggtggtgccggagatgacatcatctttggtggtgaaggaaat
gatgagctgtccggtgatgatggcaatgaccgactgtacgccggtggtggagacgatgtc
ttccttatagggcagggcaaagacctgctggacggtggtgccgggcatgacattgtgcgg
gcttctgatgatgaggctctgatcgttgatctgaagcatacccgtcttgtgacggcttcc
ggtgtcaaaattctgcgcaacatcgagggttttgaagctggtggtggagatgatcagctg
atcggtacagagggtgacaatactctgatcggcaatgcaggtgatgatgtgctgtccggc
ctgggtggcaatgaccgccttgatggtggtgatggtaacgacaagcttgatggcggtgct
ggcgacgatacccttgttggtggcggcggggatgatatcctagaagctgctgaagggaac
aacgtactgcatggagatgctggcaacgatgttctgaccactggtgttggtgatgatgag
ctgcatggcggtgccggtgaggacaagctgacctcaggtgacggcagcgacaagctgttt
ggtgatgacggttctgatgaactgcgcgccggagccggagatgacgagctgcatggcggg
gatggtgatgacatcctgcgtggtgaagctggagatgatgagctgcacggtgatgctgga
gatgacaacctgatcgacacagaggggaacaatgccctgtttggtggtgatggggatgat
tatcttgaagctggtgacggcaaagacattcttgatggtggtgccggcaatgacaccatt
cttctctcccgaggccgcgacaccattcgtggtggcgacggggttgatcatctgattgct
gattatgaagagaacctgtcgattaatctgtcttacacatctgcgcggaacaccgggatt
ggacaggcatctattactggcattgagaacgtcaccacgtcttctggtcgggatcgggtg
attggcaatgatgcagacaacatcatcaaaacccatgccggtgaggacactcttaatggt
ggtgccggcaatgatagcctgtggggtggtgatgaccgtgacttgttaaacggcggtgat
ggtaatgaccttctggaaggtgaagctgacaatgatacgctgaatggcggtactggtgat
gatgtggtcaatgcgggtgacggcaatgacaaaattacccttgatgagggcaatgacatc
atccgtggtggtgaaggtgaagacaggctgattgtatccggctcaaaagctgcccgtatt
gatctgaatgtgagtggtgctcagcaaaccggttatggccttgatgtgatctctggcatt
gaaaacatcagtggcggtgatggggatgatcatctgaccggtaatgaccttcgcaatgag
ttccatggcggaaacggcgatgatgtgctgatcggtgccggtggtgatgactacctgcag
ggtggtgatggaaatgacacgctgcttggcggtcttggcaatgataacctgattggtgga
gctggtgatgacactgtcaatggcggtgacggttctgatttgatcacgctcggctcaggc
acggatatcattgatggtggcgatggccgggattctctcagatacgatggttctgaaagt
ataacggtggacctgtcccatgcggacttccagagcactggcattggccagctgaaggtt
tccaatgttgaagtggttgagggtggttctggtgatgatgtgctgatcggtgatgaggtt
gccaacacgctgcgaggcggaagtggagctgatacactgcaaggtggcggtggccgggac
tatattgttctaggcaatgatgatgcggttgaccgtgtggtctacacatccgtttctgac
gttacccttgaaggtgctgctgagctggttagtggatttgacaagggggaagatcttttc
gacttccgtcagattgacgccaataccgacaatgatggtgatcaggccttcctgtttagt
gacgatggcgccgctgcgaactccgtgtgggtcaccgcttatcgctccactcagtatgtt
tatgcggatgtggatggggatgcccaggctgacttcaagattgcagtcagcaaagcagat
gcgctgagcgctgaggacttcctcctctaa
DBGET
integrated database retrieval system
