Pseudoalteromonas sp. LC2018020214: JG479_16445
Help
Entry
JG479_16445 CDS
T10970
Name
(GenBank) choice-of-anchor I family protein
Organism
pslc Pseudoalteromonas sp. LC2018020214
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
choice_anch_I
Collagen
LPAM_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQM64275
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3676851..3678644)
Genome browser
AA seq
597 aa
AA seq
DB search
MFKKSIIALSLISVLTGCSLDGDDGQNGSQGLQGEQGANGINGINGVNANSVLNISLVGR
GVLNAQSPEGAAEIVAYQASKKWIYAINSSGDDSVINILPADTFDTAALVKDNEGVISAT
NLTSVITLSLNEHTQGDANSIAIDENNNLLAVAMAAKSTGDAGQIAFYDISGDSPVFIKN
VTVGFLPDMVTFTHDGAKAVVANEGEPSGDYSVDPEGSISIIDITNNVIADTALNIYFKA
YNNKQTELEAQGVVFANPNGRTINGNLINTTVAMDLEPEYVSISKDNKYAYVSIQENNAL
AIVNLQDNSLELKGLGFKDWSSLQLDASDKDGGVNFKSYPGLYGMYQPDTISSFSWKGAN
FIVTANEGDAREYFFDTTDEADCIAKGGLDYDKDDGCLAYIDESRVEDLTLAANFDYLNN
DDNDIGRLKVTTIKGDTNNDGQYESLYAYGARSFTIWDSNGLVVFDSGDDIGRITASVHG
EAFNNNEDENKGDSRSDDKGAEPEALTIGKIDDRTFAFIGLERMGGIMVYDITNPYNVQF
EDYFYNRGLIKDANITGDLAPEGMVFVPAEQSATGNPLLIVGNEISGSIAVWEIASK
NT seq
1794 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaaaaatcaattattgcgctgtcacttatatctgttcttactggttgctcactt
gatggtgacgatggccaaaacggctctcaaggattacagggagaacaaggcgcaaatggc
attaatgggataaatggtgtaaatgctaattcagtattaaatatcagcctcgtaggaaga
ggagtattaaatgcacaaagtccagaaggtgccgctgaaatagttgcttaccaagcatct
aaaaaatggatttacgctattaacagttcaggcgatgactctgttattaatattttaccc
gccgacacctttgatactgccgcacttgttaaagataacgaaggggttatcagcgccaca
aatttaacgtccgttattacgttgtctttaaacgagcatacccaaggcgatgcaaacagc
attgctattgatgaaaataataatttactagcggtcgcaatggctgctaaaagcacgggt
gatgcaggtcaaattgctttttacgatataagcggcgactcacctgtatttattaaaaat
gttacagtcggatttttaccagacatggtgacgttcacccatgatggcgcaaaggcagtg
gttgctaacgaaggtgaaccaagtggcgactacagcgtagatcctgaaggttctattagt
attatcgatataacaaataatgtaatagccgatacagcactaaatatttattttaaagcc
tataacaacaaacaaaccgaactagaagcgcaaggggtcgtttttgcaaaccccaatggt
cgtactattaacggtaatctgataaataccacagtagctatggatttagagcccgagtac
gttagcatttctaaagataacaaatacgcttatgtatctattcaagaaaacaatgcactt
gcaatagttaacctacaagacaacagccttgagctaaagggcttaggctttaaagattgg
tcaagcttacaacttgatgcctcagataaagatggcggcgttaattttaaatcataccca
gggctctatggtatgtaccagcccgatactatctcaagctttagttggaaaggcgctaac
tttatagtcactgccaacgaaggtgacgcaagagaatacttttttgatacaacggatgaa
gcagactgtatagcaaagggcggacttgattacgataaagacgacggctgcttagcatat
atagatgagagccgcgttgaagacttaacgcttgcagctaattttgattacttaaataac
gacgataacgatattggtcgcttaaaagtaacaacaataaaaggcgatactaataacgat
ggtcaatacgaatcgctttatgcttatggtgcacgttcgtttaccatttgggacagcaat
gggctggtggtgtttgattcaggcgatgatataggtcgtattactgcatcggttcatggt
gaagcatttaacaacaatgaagatgaaaacaaaggtgactcacgctcagatgataaaggc
gcagagccagaagcgctgactattggtaaaattgacgatcgtacatttgcttttataggg
cttgagcgtatgggtgggattatggtttatgatattaccaatccatataatgtgcagttt
gaagactacttctataatagaggcttaattaaagacgctaatattacaggcgatttagcg
cctgaaggaatggtattcgttccagctgagcaaagtgccacaggaaacccactcttaatc
gttggaaatgaaatatcaggctctattgccgtatgggaaatagcatctaaataa
DBGET
integrated database retrieval system