Paramecium tetraurelia: GSPATT00003071001 Help Entry GSPATT00003071001 CDS       T01055                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K12604   CCR4-NOT transcription complex subunit 1 Organism ptm  Paramecium tetraurelia Pathway ptm03018   RNA degradation Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]  09120 Genetic Information Processing   09123 Folding, sorting and degradation    03018 RNA degradation     GSPATT00003071001  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ptm03019]     GSPATT00003071001 Messenger RNA biogenesis [BR:ptm03019]  Eukaryotic type   mRNA surveillance and transport factors    mRNA cycle factors     P-body specific factors      GSPATT00003071001   mRNA degradation factors    3'-5' decay     Ccr4-NOT complex      GSPATT00003071001 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  CNOT1_TTP_bind DUF3819 Not1 CNOT1_CAF1_bind CNOT1_HEAT Motif Other DBs NCBI-GeneID:  5041285 NCBI-ProteinID:  XP_001455500 Genoscope:  GSPATT00003071001 UniProt:  A0DYI6 LinkDB All DBs Position undetermined AA seq 2107 aa AA seqDB search MNYVSRSPQVPIYQQIKTFVQGLAQKRNQKVVLNEVQSLINQLGIPGEQYFLLQLLESIE IQKEKQSLTQKGQFLVQWLQQASSKSHFIDYFCGVVEAVCPQSQSITEYLCELCNALKVP ALVQMIMWLSITFSSNQNFSKEGIKMLKKKLQEPFQQKNNLQVPQHVTHTLLYQLRNVPE LSDLEQEIKNFNEYVQNTKQADLKCLYDDGKKYMKLDPVNIEIPKINECIKPVDILRELG PYTSNLSQIFTEYTDSDIMDCLLYLANNQGEDSSKDAHKDKDATKDVQQLFKSTSNTQQP DWDLLSSNDANKQPEDDFIKFFINDNNKRQWSQVFEKLDRPNLELSLSGYNNLMGFLGKI KKQQQQFQLPHRLLLDKWHNKKSQINFLTCMLKANKPEQLFWNEIQPKKLVVMEHNINYK NQQQSQYWQNLEFVQMLIELSEYGYIAEIRDFFESAIKQNQDLIILALFQISPTQGGALI DELFTQLFPNYVSQHANSSPVLEQMWKFNQNLFITGISELYKKEYGKKENSCLNLSRVLD IVQQLFQNSQQNNTSLLTMAKFDDYQFSVPLGILAGKREYLNFDIWLNERIKSQGIPFVN VLLQYIDENVIQQVKEHQIKSGLPIGQLGQMQIQQLDQILDKGQLKLEMITIIFEQLMNQ GDKLGNKIKQTTQQFYKELVQVFPQLAGQPNQKTNQEVESKTDSYFESYYNEQISLENFL NQMVQWKTQGSIQEKEVYACIITNLYNEYQFHLKYPKKELELTGQLFGGVLERGLVEGQS IQIGLRIIQVSLKNNTQRYEFAVKALEVMKNKIYEWPWFAQEVMACEQLSFKNPDLLADI IRVCEKHGIKSPLQPAPPIQTVFHKPLQLVAQKEKQEEEPIQLTLKKSESVPVQQTHPAP IVVPAVVQPIQIPTQQPQPVIVPQQQPVTQVQQHQQIHLQSVTPPPTLQKSSQLPVQHTP QPQKQKSEDSNTNINLTYKQILQVEFDEFQRCGADSEVKEYFTFTLNSISQNNVEQKAAE IRQKLENQDALFYFIKTIAYLRSPMAQQQAQGPNVMCCLLAALNKSKYFSEVAKEVSIGL TRLLTFNKTSPSADDRSTIKNMGSFLGQITVSRDKPFLFKYFDYKTLLKQNQLTIYPLCK ILEQVKSSQIFTKNNKWVNRILQELDAAKETCNTMAKYEIMNLLKSIEYTVQPINPTPTP ITIPNPVVPTITQPIVQPIMDMDPLNKLNIKNLPQYVMADSKNLNDKLNEADCKNLVATA LDHAISDIIPPVISRSVTIALITTRELVFKDFALEPNEKHMLRGMHMIASHLSGSLAMVT CREPLKVRITHYLKEGIEQIDLDNKTKETFVQTAAQENLDLGCALIRKAVIERALEDVNQ DPSILEQLEKRQRCKEKGQQYRDEITQNQLKFLPEPLQPRISGLTEEEIRIYEEFGNKKK QPKQSVLQKVSTLCQLLQDPQSNEEKIQQLIQDLNEQDQSNPEQFYKDLADKFLQVILTN NLTSEKISISLDLITILIRKINEKVGKKWSELVIEFITKNIELLEHSPLWWQAFPIMLNK RLIQMQEAEQVMTQILTKDNQMNVSSIVFILRKVIIEEDNNNSAYLNQFKPIFKELSKKK DTNPTVSKFFMELTSFVSNNPQTKVFQKKLNLIKGFYQKIDEEFSNKLSLKLKQWYQLSS EEEFNNFFRVEGESQFFVEDQLSKFCAYAIELSMTDVNKDYMDHSQIEQLGKMLTMMSKG LDPKMKPKFFEKLFDGCLMVLTKLHEATKQKFNQRQLFKLFYNLLFDLQILDEENIRLFH NKFAEFLEKVEPSLYPGFSYAWLELLCNRYFQQIITTNENAYARLIIKLLEFVRDTITEE TIQYHYVQEYLKGVTRLFMLLLTDQRKFCSKYAFSFADEVPFNHVQLLNFSLAAYPNDQT DDPQSCTNIYDIADAQQFGQVVHACFEEPTQTKIKEEIQFMLNMSDEDLKIKVSKYFDYD QKSKLPTTISGFFLLLPRHENLTIQQQRALLTRIIKHSSFAIRNNVINVILNQIRYPERA TEFYIRYILSQFIVGDNSQIQEQYTTLITKRFLSENPKTWGMLYLHEELKRTQSNNNQYK QYQIQRQ NT seq 6324 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaattatgtttcacgtagtccttaagttcccatctatcaacagataaagacgtttgtg caaggtctagcccaaaagcgaaaccagaaggtagtgttaaatgaggtttaatctctcatt aatcaattgggcatacctggtgaatagtatttcctgcttcaactcctggaaagcatcgaa atacagaaggagaagcaatcactcactcagaaagggtaattcctggtgtaatggctccaa taagcctcatccaaatcccactttatagattacttctgtggtgtggttgaagcagtgtgt ccttaatcctaatccatcactgaatatttgtgtgaattgtgtaatgctcttaaagtgccg gctctggtccaaatgattatgtggttgtctatcactttttcttcaaatcagaatttctct aaagaaggcataaagatgttgaagaagaagctataggagccattttaatagaaaaataat ttataggtgccatagcacgtaactcacacattattgtaccaactcagaaacgtccctgaa ttgtcggatcttgaataagaaattaaaaatttcaacgagtacgtataaaatacaaaatag gcggatttaaaatgtttgtatgatgatggcaaaaagtacatgaaattggatccagttaac atagaaatccctaaaattaatgaatgcattaagcctgtagacattcttagagaattagga ccttataccagcaatttgtcttaaatcttcacagaatacactgatagtgatattatggat tgcttattgtatttggctaataaccagggcgaggattcttctaaagatgctcataaagat aaagatgctactaaagatgttcaatagttgtttaaatcgacatcgaatacctaatagcca gattgggacttattatcgtctaatgatgcaaataaacaaccagaagatgattttattaaa ttctttatcaatgacaacaacaaacgatagtggtcttaagtatttgagaagttggataga cccaatttagagttgtcactgtcaggatataataatttaatgggattcttaggcaaaatt aagaaataataataacaattttaattgccccatagactcttattggacaaatggcataat aagaaatcttagatcaattttcttacctgtatgttaaaagcaaataagccagaatagttg ttttggaatgaaatttagcctaaaaagctagtagttatggaacacaatattaattataaa aattaataataatcgcaatattggtaaaatttagagtttgttcaaatgctaatagaattg agtgagtatggatacatagctgaaatcagagacttttttgaatcagcaattaaatagaac caagatttaataatattggctttattctaaatttcacccacttaaggtggagcattaata gatgaattatttacatagctatttcctaattatgtatcataacatgccaattcttcacca gtattagaatagatgtggaaattcaattagaatttatttattactggaatcagtgagtta tataagaaagaatatgggaagaaagaaaattcatgtttaaatttatcaagggtcttggac atagtttaacaactctttcaaaattcccagtaaaacaacacatcattgttaacaatggct aaatttgatgactatcaattttcagttcctttgggtattttagcgggtaagagagaatac ttgaattttgatatttggttgaatgagagaattaaatcttaaggtattccttttgttaat gtactcctacaatacatagatgaaaatgttattcaataagttaaggagcatcaaataaaa tctgggttaccaattgggtagttgggatagatgcaaatttaataattagattagatttta gataagggacaattgaaattagagatgataacaatcatttttgagtagttgatgaatcaa ggggataaattgggaaataagattaaacaaactacataatagttttataaggaacttgtt caagtctttccttaattggcaggatagccaaattaaaaaactaattaagaagttgaaagt aagacagacagttattttgagagttactacaatgagtaaatcagtttggaaaacttctta aattagatggtgtaatggaaaacacagggaagtatataagagaaagaagtatatgcttgc ataataacaaatttgtataatgaatatcagtttcatttgaaataccctaagaaggaattg gaattaacaggataattatttggaggagtattggaaagaggattggtagaaggtcaaagc atttagataggtttgaggataatttaagtgtcattaaagaacaacacatagagatatgag tttgctgttaaggcattggaagtaatgaaaaataaaatatatgaatggccttggttcgca taagaagttatggcatgcgaacaattatcttttaagaatccagatcttttggcagatata attagagtgtgtgaaaaacatggaataaaatcccctttgtaacctgctccaccaatatag actgtttttcataagccgctctaattggtagcttagaaagagaagtaagaagaggaacca atttaattgactttaaagaaatctgaatcagtccctgttcaatagacacatccagctccc attgtggttccagcagtagttcaacccatacaaattcctacataataaccgtaacctgta atagtacctcaataacaaccagttacctaggttcaataacatcaataaattcatttacaa tcagtcactcctcctccaaccttatagaagtcctcataattaccagtttaacatacacct taaccttaaaaatagaaatctgaggatagcaatacaaacattaatctcacctacaaacaa atattataagtggaattcgatgagttttaaagatgtggagcagattcagaagtcaaggag tattttactttcactttgaacagcatctcctagaataatgttgagtagaaggcagctgaa ataagatagaaattagaaaactaggatgctttgttctatttcattaaaacaattgcctat ttacgttctccaatggcacaataataagcataaggtccgaatgtaatgtgttgtctactt gctgcattgaataaatcgaaatatttctctgaagtagccaaggaagtcagcataggatta acaagattactgaccttcaataaaaccagtccttctgcagatgatcgaagtaccattaaa aacatgggtagtttcttgggtcaaataacagtatccagagacaaacctttcttgtttaag tattttgattacaagacattattaaaataaaatcaactcactatttatccactttgtaaa atcttggaataggttaaatctagtcaaattttcactaaaaataataagtgggtaaataga atcttataagaattggatgctgctaaagaaacatgcaatacaatggccaagtatgaaatc atgaatctacttaaatcaatcgaatatacggtctaacctataaatccaacacccactcct attactataccaaatccggttgttccaacgataacataacctattgtttaaccaatcatg gatatggatccacttaataaattgaatatcaagaatctacctcaatatgtgatggctgat tctaaaaacttaaatgacaaattgaatgaggctgattgcaaaaatcttgtggctacagcc ttagatcatgccatatctgatatcattccacctgttattagcagaagtgttactatagca ttaattacaactagagaactagtttttaaagatttcgctctcgaaccaaacgaaaaacac atgttaagaggaatgcatatgatagcttctcatttatcaggtagtttggccatggttact tgcagagaacccttaaaagtcaggatcacccattatctcaaagaaggaattgaatagatt gatcttgacaataaaaccaaagaaacttttgtataaactgctgcataagaaaatttagat ctaggatgtgctctgatcagaaaagcagttatagaaagagcattggaggatgtcaattaa gatccttccattttggaataattagaaaagagacaacgatgcaaagagaaaggctaacaa tatagagatgaaatcacttaaaatcaactaaaattcttacctgaaccattacaaccaaga atctctggtttgactgaagaagaaattagaatctatgaagaatttggtaataagaagaaa tagcctaaataatcagtcttgcaaaaggtttctactctctgttaactactctaagaccca tagagcaatgaagaaaaaatttaacaattaattcaagatttaaatgaataggattaatcg aatccggagcaattttataaggatttggctgataaatttttataggttatcttaaccaat aacttgacttcagagaagatctctatctccttggatttgattactatccttataagaaag ataaatgaaaaagttggtaagaaatggagtgaattggttattgaattcattactaaaaac atcgaactcttagaacatagtccattatggtggtaagcattccctattatgttgaataaa agattaatctaaatgtaggaggctgaataagtgatgactcaaattctcactaaggacaat caaatgaatgttagttccattgtattcatacttagaaaggttataattgaagaagataat aataatagtgcatatttgaattaattcaaacctatttttaaagaactcagtaaaaagaaa gacactaatccaacagtctctaaattctttatggaacttactagttttgtctccaataac ccttaaactaaggttttctaaaagaaattaaatttaatcaaaggtttctattaaaaaatt gatgaagaattttcgaataaattatctctcaaattgaaacaatggtactaattaagttca gaggaagagttcaacaacttttttagagttgaaggagaaagccaattctttgttgaagat taattgagtaagttctgtgcatatgcaattgaattgagtatgactgatgtgaataaagat tatatggatcactcctaaattgaataattagggaagatgcttacaatgatgtctaaggga cttgacccaaagatgaaacctaaattttttgaaaaactatttgatggatgtttaatggta ctcacaaagttacatgaagccactaaatagaaatttaattaaagacaattattcaaactg ttttataatttactttttgatttacaaattttggatgaagagaatattagattattccat aataaatttgctgagtttttagaaaaggttgaaccaagtctgtatccaggattctcttat gcttggttagaattactttgcaatagatatttctaatagattataactacaaatgagaat gcctatgcaaggttgatcattaaattattagaatttgtgagggatactattactgaagaa actatctaatatcattatgtctaagagtatcttaagggagtgacaagattatttatgctt ttgttgactgattagagaaaattctgcagtaagtatgccttcagttttgcagatgaagtg cctttcaatcatgtgtaattattaaatttcagtttggctgcttatcccaatgatcaaact gatgatcctcaatcttgcaccaatatttatgacattgcagatgctcaataatttggacaa gttgttcatgcttgttttgaagaacctacctaaaccaaaatcaaagaggaaatccaattc atgctaaatatgagtgatgaagacttgaaaatcaaggtaagtaagtattttgattatgat caaaaatctaagttaccaaccaccatttcaggttttttccttttattaccaagacatgaa aatctcactattcaatagcaaagagctttattaacaagaataataaagcattcaagtttt gcgattagaaacaatgtgataaatgtaatattgaattaaattcgttatcctgaaagggct actgaattctatattcgatacatcctatcacaattcattgttggggacaattcctaaatt taagaataatatacgacattgatcactaaacgtttcttatcggaaaaccccaagacttgg ggaatgctttacttgcatgaggaattaaagagaactcaatctaataacaaccaatacaaa tagtattagattcaaagacaatga

DBGET integrated database retrieval system