Paramecium tetraurelia: GSPATT00004757001
Help
Entry
GSPATT00004757001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K12604
CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
GSPATT00004757001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ptm03019
]
GSPATT00004757001
Messenger RNA biogenesis [BR:
ptm03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
mRNA cycle factors
P-body specific factors
GSPATT00004757001
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ccr4-NOT complex
GSPATT00004757001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CNOT1_TTP_bind
DUF3819
Not1
CNOT1_CAF1_bind
CNOT1_HEAT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5011567
NCBI-ProteinID:
XP_001425783
Genoscope:
GSPATT00004757001
UniProt:
A0BIL8
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
2117 aa
AA seq
DB search
MNYVSRSPQVPIYQQIKAFVQGLAQKRNQKVVLNEVQSLINQLGIPGEQYFLLQLLESIE
VQKEKQSLTQKGQFLVQWLQQASSKSHFIDYFCGVVEAVCPQSQSITEYLCELCNALKVP
SLVQMIMWLSITFSSNQNFSKEGIKMLKKKLQEPFQQKNNLQVPQYVIHTLLYQLRNIPE
LSDLEQEIKNFNEYVQNTKQADLKCLYDDGKKYMKLDPVNIEIPKINECIKPVDILRELG
PYTSNLSQIFTEYTDSDIMDCLLYLANNQGEDASKDAHKDTHKDAHKEALKEAQKDVQQL
FKLTSNTQQPDWNQLSNEVNKQQEEDFIKFFINDNNKRQWSQVFEKLDRPNLQLSQQGYN
NLMGFLGKIKKQQQQFQLPHRLLLDKWHNKKSQITFLNCMLKANKPEQLFWNEIQPKKLV
IMEHNTNYKNQQQLQYWYNLEFVQMLIELSEYGYIAEIRDFFESPIKQNPDLVILALFQI
SPTQGGALIDELFTQLFPNYVSQHANSSPVLEQMWKFNQNLFITGISELYKKEYGKKENS
CLNLSRVLDIVQQLFQNSQQNNTSLLTMAKFDDYQFSVPLGILAGKREYLNFDIWLNERI
KSQGIPFVNVLLQYIDENVIQQIKEYQLKAGLPNGQLGQMQIQQLDQILDKGQLKLEMIT
IIFEQLMNQGDKLGNKIKQTTQQFYKEVVQVFPQLAGQPNQKTNQEVESKTDSYFESYYN
EQISLENFLNQMVQWKTQGSIQEKEVYACIITNLYNEYQFHLKYPKKELELTGQLFGGVL
ERGLVEGQSIQIGLRIIQVSLKNNTQRYDFAVKALEVMKNKIYEWPWFAQDVMACEQLSF
KNPDLLAEIIRVCEKHGIKSPLQPAPPPIQPVFHKPLQLVAQKEKQEEEPVQLTLKKSES
VPVQQVQPTPIVVPAVVQPIQIPIQQTQPIIVPQQQPVTQVQQHQQVHLQSVTPPPTLQK
TSQLPVQHTPQPQKQKQEDNSTNINLTYKQILQLEFDEFQRCGADSEVKEYFTFTLNSIS
QNNVEQKAAEIRNKLENQDALFYFIKTIAYLRSPMAQQQAQGPNVMCCLLAALNKSKYFS
DVAKEVSKGLTRLLTFNKTSPSADDRSTIKNMGSFLGQITVSRDKPFLFKYFDYKTLLKQ
NQLTIYPLCKILEQVKSSQIFTKNNKWVNRILQELDTAKETCNTMAKYEIMNLLKQIEYQ
VQPINPTPTPITIPNPVVPIITQPIVQPIMDLDPLNKLNIKNLPQYVMADSKNLNDKLNE
ADCKNLVATALDHAISDIIPPVISRSVTIALITTRELVFKDFALEPNEKYMLRGMHMIAS
HLSGSLAMVTCREPLKVRITHYLKEGIEQIDLDNKTKETFVQTAAQENLDLGCALIRKAV
IERALEDVNQDPSILEQLEKRQRCKEKGQQYRDEITQNQLKFLPEPLQPRISGLTEEEIR
IYEEFGNKKKQPKQSVLQKVSTLCQLLQDPQNNEEKIQQLIQDLNEQDQSNPEQFYKDLA
DKFLQVILTNNLTSEKISISLDLITILIRKINEKVGKKWSELVTEFITKNIELLEHSPLW
WQAFPIMLNKRLIQMQEAEQVMTQILTKDNQMNVSSIVFILRKVIIEEDNNNNTYLNQFK
PIFKELSKKKDTNPTVSKFFLELTSFVSNNPQTKVFQKKLNLIKNFYQKIDEEFSNKVSL
KLKQWYQLSSEEEFNNFFRVEGESQFFVEDQLSKFCAYAIELSMTDVNKDYMDHSQIEQL
GKMLTMVSKGLDPKMKPKFFEKLFDGCLMVLTKLHEATKQKFNQRQLFKLFYNLLFDLQI
LDEENIRLFHNKFAEFLEKVEPSLYPGFSYAWLELLCNRYFQQIITTNENAYARLIIKLL
EFVRDTITEETIQYHYVQEYLKGVTRLFMLLLTDQRKFCSKYALSFADEVPFNHVQLLNL
SLAAFPNDQTDDPQSCTNIYDIADAQQFGQIVHACFEEPTQTKIKEEIQLMLNLNDDDLK
IKVSKYFDYDQKSKLSCLISGFFILLPRHESLTIQQQRTLLTRIIKNSSFAIRNNVMNVI
LNQIRYPERATEFYIRYILQQFIVGDNFLIQEQFTTLITKRFLSENPKTWGMLYLHEELK
RTQSNNNQYKQYQIQRQ
NT seq
6354 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattatgtttcacgcagtccttaagtccctatctatcaatagataaaggcgtttgtc
taaggtctggcccaaaagcgaaactagaaggtcgtgttgaatgaggtttaatctctcatt
aatcaattgggcatacctggtgaatagtattttctgcttcaacttctagaaagcatagaa
gtgcagaaggagaagcaatcattaacacagaaggggtaattcctggtgtaatggcttcaa
caagcttcatctaaatcccatttcatcgattacttttgtggtgtagttgaagcagtgtgt
cctcagtcccaatccattactgaatatttgtgtgaactgtgtaatgctcttaaagtgcca
tctctggtccaaatgattatgtggttgtctatcacattttcatcaaattagaatttctct
aaagaaggcataaagatgctgaagaagaagctacaagagccattttaatagaaaaataac
ttataagtgccccagtatgtaattcacacattgttgtatcaactcagaaacattcctgaa
ttgtcggatcttgaataagaaattaagaatttcaatgagtacgtataaaatacaaaatag
gcggatttaaaatgtttgtatgatgatggcaaaaagtacatgaaattggatccagtaaac
atagaaatccctaaaattaatgaatgcatcaagcctgtagacattcttagggaattagga
ccttatacaagcaatttgtcataaatcttcacagaatacactgatagtgatattatggat
tgcttattgtatttggccaataaccagggtgaggatgcttccaaagatgctcataaagat
acccataaggatgctcataaagaggctcttaaggaggcttaaaaagatgttcaatagttg
tttaaattgacatcgaatacttaacagccagattggaattagttatcaaatgaagtgaat
aagcaataggaagaagattttattaagttctttatcaatgacaacaacaaacgacagtgg
tcttaagtatttgagaagttggatagacccaatttatagttgtcacagtaaggatataac
aatctaatgggattcttaggcaaaattaagaaataataataacaatttcaattgcctcat
agattgttattggacaaatggcataataagaaatcttagatcacttttcttaactgtatg
ttaaaagcaaacaaacctgaatagttgttctggaatgaaatctaacccaaaaagttagtg
atcatggaacataatactaattataaaaaccaataataattgcaatattggtacaattta
gagtttgttcaaatgctaatagaattgagtgagtatggatacatagctgaaatcagagac
ttttttgaatcgccaattaaatagaacccagatttagtgatattggctttattccaaatt
tcccccacttaaggtggagcattaatagatgaattatttacttagctatttcctaattat
gtatcataacatgccaattcatcaccagtattagaatagatgtggaaattcaattagaat
ttatttataactggaataagtgagttatataagaaagaatatgggaagaaagaaaattcc
tgtttaaatttatcaagggtcttggatatagtttaacaactctttcaaaattcccagtaa
aacaatacatcattgttaacaatggctaaatttgatgattatcaattttcagttcctttg
ggtattttagcaggtaagagagaatacttgaattttgatatttggttgaatgagagaatt
aaatcttaaggtattccttttgttaatgtactcctacaatacatagatgaaaatgttatc
taatagataaaggagtactaacttaaagctggattaccaaatggttaattgggatagatg
caaatccaataattagattagatattagataagggataattgaaattagagatgataaca
attatttttgagtagttgatgaatcaaggagacaaattgggaaataagattaaacaaaca
acttaatagttttacaaggaagttgtttaagtgtttccttaattggcaggacagccaaat
taaaaaactaattaggaagtcgaaagtaagacagacagttattttgagagttattacaat
gagtaaatcagtttggaaaacttcttaaattagatggtttaatggaaaacacagggaagt
atataagagaaagaagtgtatgcttgtataataacaaatttgtataatgaatatcaattt
catttgaaataccctaagaaggaattggaattgacagggtaattatttggaggagtattg
gaaagaggattagtagaaggtcaaagtatttagataggcttgaggataatttaagtgtca
ttaaagaacaacacatagagatatgattttgcggttaaggctttggaggttatgaaaaat
aaaatatacgaatggccttggtttgcataagatgttatggcatgtgaacaattatccttt
aagaatccagatctattggctgaaattattagagtgtgtgaaaagcatggaataaaatcc
cctttgtaacctgctccaccaccaatatagccagtatttcacaagcctctttaattggtt
gcttagaaagaaaagtaagaggaggaacccgtgtaattgactctaaagaaatcagaatca
gttcctgtttaataggtacaaccaactccaatcgtagttccagccgtagtacaacccatt
taaatacctatccaataaacataacctattatagtaccataatagcaaccagtcacatag
gttcaataacatcaataagtgcatttacaatcagtcactccgcctcctactttatagaag
acttcttaattacctgtttaacatacacctcaaccttaaaaacaaaagtaagaggataat
agtacaaacattaatctcacttacaaatagatcttgtaattggagtttgatgagttttaa
agatgtggagctgattcagaagttaaagagtactttacctttactttgaacagcatctcc
tagaataatgttgagtaaaaggctgcagaaataagaaataaattagaaaactaggatgct
ttattctatttcattaaaactattgcttacttacgttctcctatggcttaatagtaggca
tagggtcctaatgtaatgtgttgtttacttgctgcattgaataaatcaaagtacttctca
gatgttgccaaggaagtgagcaaaggattaactagattattgactttcaataaaacaagt
ccttctgccgatgatagaagcactatcaaaaatatgggaagcttcctgggtcaaatcaca
gtatccagagacaaaccattcttgtttaagtactttgattacaaaaccttactaaaataa
aatcaactcacaatttatcctctttgcaagatcttagaataggtcaaatctagtcaaatt
ttcacaaagaataataagtgggtgaatagaatcttataagaattggatactgctaaggaa
acatgcaatacaatggctaaatatgaaatcatgaatctgctcaaataaatcgaatactaa
gtttaacccatcaatccaacacccactcctattactataccaaatccagttgtaccgatc
ataacttaacctattgtataacctattatggatttggatccacttaataaattgaatatc
aagaatctacctcaatatgtgatggctgattctaaaaacttaaatgacaaattgaatgag
gctgactgcaaaaatcttgtggctacagccttagatcatgccatatctgatatcattcca
cctgtcattagcagaagtgttactatagcattgattacaacaagagaattagtttttaaa
gattttgcacttgaaccaaatgaaaaatacatgttaagaggaatgcatatgatagcttct
catttatcaggtagtttggccatggttacttgcagagaacccttaaaagtcaggatcact
cattatcttaaagaaggcatcgaataaattgatcttgacaataaaaccaaagagactttt
gtctaaactgctgcataagaaaatttagatttaggatgtgctctgatcagaaaagcagtt
atagaaagagcattggaggatgtcaattaagatccttccattttggaataattagaaaag
agacaacgatgcaaagagaagggctaacaatatagagatgaaatcacttaaaatcaacta
aaattcttacctgaaccattacaaccaagaatctctggtttgaccgaagaagaaattaga
atctatgaagaattcggtaataagaagaaacagcctaaataatcagtcttgcaaaaggtt
tctactctctgttaactactctaagatccatagaacaatgaagaaaaaatttaacaatta
atccaagatttaaatgaataggattaatcgaatccggagcaattttataaggatttggct
gataaatttttataggttatcttaaccaataatttgacttcagagaaaatatcaatctca
ttggatttgattactatccttattagaaagataaatgaaaaagttggtaagaaatggagt
gaattggttactgaattcattactaaaaacatcgaactcttagaacatagtccattatgg
tggtaagcattccctattatgttgaataaaagattaatctaaatgtaggaggctgaacaa
gtgatgactcaaattctcactaaggacaatcaaatgaatgttagttccattgtattcata
cttagaaaggtcataattgaagaggataataataataatacatatttgaattaattcaaa
cctatttttaaagaactcagtaaaaagaaagacactaatccaacagtctctaaattcttt
ttggaacttactagttttgtctccaataacccttaaactaaggttttctaaaagaaatta
aatttaatcaaaaatttctattaaaaaattgatgaagaattttcgaataaagtatctctc
aaattgaaataatggtactaattaagttcagaggaagagttcaacaacttctttagagtt
gaaggagaaagccaattctttgttgaagattaattgagtaagttctgtgcttatgcaatt
gaattgagtatgactgatgtgaataaagattatatggatcactcctaaattgaataatta
gggaagatgcttacaatggtgtcaaagggacttgacccaaagatgaaacctaaatttttt
gaaaaactatttgatggatgtttaatggtactcacaaagttacatgaagccacaaaatag
aaatttaattaaagacaattattcaaactgttttataatttactttttgatttacaaatt
ttggatgaagagaatattagattattccataataaatttgctgagtttttagaaaaggtt
gaaccaagtctgtatccaggattctcttatgcttggttagaattactttgcaatagatat
ttctaatagattataactacaaatgagaatgcttatgcaaggttgatcattaaattacta
gaatttgtgagggatactattactgaagaaactatccaatatcactatgtccaagagtat
cttaagggagtgacaagattatttatgcttttattgactgattagagaaagttctgtagt
aaatatgctttgagttttgcagatgaagtacctttcaatcatgtataattgttgaatttg
agtttggcagcttttccaaacgatcaaactgatgatcctcaatcttgcaccaatatttat
gacattgcagatgcccaataatttggataaattgttcatgcttgttttgaagaacctacc
taaactaaaatcaaagaggaaatccaattgatgctaaatttgaatgatgatgatttgaaa
atcaaggtaagtaaatactttgactatgatcaaaaatcgaaattatcttgcttgatctct
ggcttcttcatcttattaccaagacacgaaagtcttactatccaataataaagaacatta
ttaacaaggattataaagaattcaagttttgccattagaaataatgtgatgaatgtaatc
ttgaattaaattcgttatcctgaacgtgcaaccgaattctatattcgatacatcttgtaa
tagttcattgttggtgataactttttaatttaagagtaatttactacattgatcactaaa
cgtttcctatctgaaaatccaaagacttggggaatgctgtacttgcatgaagaattaaag
agaacttaatctaataacaaccaatacaaatagtattagatttaaagacaatga
DBGET
integrated database retrieval system
