Plasmodium yoelii: PY17X_0942700
Help
Entry
PY17X_0942700 CDS
T01035
Name
(RefSeq) DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, putative
KO
K19036
ATP-dependent RNA/DNA helicase IGHMBP2 [EC:
5.6.2.5
5.6.2.3
]
Organism
pyo
Plasmodium yoelii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pyo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pyo03009
]
PY17X_0942700
03012 Translation factors [BR:
pyo03012
]
PY17X_0942700
Enzymes [BR:
pyo01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.3 DNA 5'-3' helicase
PY17X_0942700
5.6.2.5 RNA 5'-3' helicase
PY17X_0942700
Ribosome biogenesis [BR:
pyo03009
]
Eukaryotic type
Other ribosome biogenesis factors
PY17X_0942700
Translation factors [BR:
pyo03012
]
Eukaryotic type
Initiation factors
Initiation associated factors
PY17X_0942700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_11
AAA_12
AAA_19
AAA_30
Viral_helicase1
DEAD
NAT10_TcmA_helicase
UvrD_C_2
AAA_22
PhoH
nSTAND_NTPase5
NPHP3_N
ResIII
T2SSE
AAA
ABC_tran
NACHT
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3792406
NCBI-ProteinID:
XP_727066
UniProt:
A0A078KB85
Q7RAT3
LinkDB
All DBs
Position
9:1685642..1688476
Genome browser
AA seq
944 aa
AA seq
DB search
MGELNKTKILNYFEKLIKLENIYENKEIELCYEHLNKEELVEKGILLNNLTIKNVMKHYG
GNNNSYILKLVKKKKNIDTNDLSDDDNLENFNHNLFSKGSVIHFSKKRKKYKINNDQNCK
NGKNVNNSVTMGDNIGIYTCTVNKIKKNKINILIKNIDMLCKELNVSNPYMLSEKSYFDI
CLINSEISTNRQIQAIQLIKKSLENPNEILKILFLDQIPTQNPFLKKILSLFSEYNQEDE
TNQPNSTPLLSRVSDKSTSDKNTLDKSLADKSLADKSLADYIYKCNKTSWGNPNLNLSQK
KAVYHCLYSDNIFCIHGPPGTGKTTVLCEIIFQLLKNKNCKILITGPSNVSVDNILEKCV
QMKIKNVFRIGLKSKIKKTLWNYSYDEKIKECDSYKMCEDIDNDIEKLKSEILKLKKKKK
SEKGNFDKRSIINLKYEIKILNKSKKKKKNIFFKELIEKNNVVFSTCSSSSNYELNKFVK
MSNFLFDVVCIDECCQCTEPLCYIPISLAKKNVFLFGDHKQLSPLIKYNKNHNKLNITMF
ERLVNKYKENISFLLNIQYRMNHNILIWSNNIFYENKLNSHESCKNIKVDGIIGNKNKQL
KNGEYEQGAKNKKNQKSKKNQKNGKNGKNSNSIDNSCEEQNEINSEVEIKKYEYYPITWI
ETDGFDEFLDDTKNEDMINFEIKEKKGCQTKTSEKKNGKTIVKGDKTDVKSEDNKQGIGS
RNESEKREDNLEAIDAVKIKRQIENSDKYNVIDKDSEEDKLCKLNDEELNNIVKINVDEI
INLNNKSRGNIGEAYFIYKLIEFMIQIDNICGNDICIITPYSKQMNILKNIFYDNFFNNK
NYINEYKKIEISTVDSFQGREKEIVIFSLVCSNYFKNIGFLKDYRRLNVAITRAKRHVVI
VGNSNTISNDDVLNELYETVLNYGKVYLVNELIDVESMIDLCTF
NT seq
2835 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggaattgaataaaacaaagattttgaactattttgaaaagttaattaaattggaa
aatatttatgaaaataaagaaatcgaactatgttatgaacatttaaataaagaagaatta
gttgaaaaaggaattttattaaataatttaacaattaaaaatgttatgaaacattatgga
gggaataataattcttatattttaaaattagtaaaaaaaaaaaaaaatatagacactaat
gatttaagcgatgatgacaatttagaaaattttaatcataatttatttagtaaaggaagt
gtaatacatttttcaaaaaaaagaaaaaaatataaaattaataacgatcaaaattgtaaa
aatggtaaaaatgtgaataatagtgtaacaatgggtgataatataggcatatatacatgt
acagttaataaaataaaaaaaaataaaataaatattttaataaaaaatatagatatgtta
tgtaaagaacttaatgtttcaaatccttatatgttatctgaaaaatcttattttgatatt
tgtttaattaatagtgaaatatcaacaaatagacaaattcaagctattcaattaatcaaa
aaatcgttagaaaatccaaatgaaatattaaaaattctatttttagatcaaattccaact
caaaacccttttctaaaaaaaatattgtctcttttttctgagtacaaccaagaggatgaa
actaatcagccaaattccactccattgcttagtcgcgtgtcagataaaagcacttcagat
aaaaacactttagataaaagtttggcagataaaagtttggcagataaaagtttggcagac
tacatttacaagtgtaataaaacaagttggggaaatcccaatttaaatttaagtcaaaaa
aaggcagtataccattgtttatattctgataatattttttgtatacatgggccaccagga
actggaaaaacaaccgttttatgtgaaattatatttcaattattaaaaaataaaaattgt
aaaatattaataactgggcctagtaatgtgtcagtagataatatactagaaaaatgtgta
cagatgaaaataaaaaatgtttttcgtatagggttaaaaagtaaaattaaaaaaacatta
tggaactatagttatgatgaaaaaataaaagaatgtgatagttataaaatgtgtgaagat
atagataatgatattgaaaagttaaaatccgaaattttaaaattaaaaaaaaaaaaaaaa
agtgaaaaaggaaattttgataaaagaagtataatcaacttaaaatatgaaataaaaata
ttaaataaaagtaaaaaaaaaaaaaaaaatatattttttaaagaattaatagaaaaaaat
aatgttgtattttcaacatgttctagtagttcaaattatgaattaaataagtttgtcaaa
atgtcaaattttttatttgatgttgtttgtatagatgaatgttgtcaatgtactgaaccc
ttatgttatataccaatttctttggcaaaaaaaaatgtatttttatttggcgatcacaaa
caattatctccattaattaaatataataaaaatcataataaattaaatattacaatgttc
gaacgtttggtaaataaatataaagaaaatatatcatttttgttaaatatacaatataga
atgaatcataacattttaatttggtcaaataacattttttatgaaaataaattaaattca
cacgagtcatgcaaaaatatcaaagttgatggtatcataggaaataaaaataagcaattg
aaaaatggtgaatatgaacaaggggcgaaaaacaaaaaaaatcaaaaaagtaaaaaaaat
caaaaaaatggaaaaaacggaaaaaattccaactctattgataattcatgtgaagaacaa
aatgaaataaattcagaagttgaaataaaaaagtatgagtactatcctattacttggata
gagacagatggttttgatgaatttttagacgacaccaaaaatgaggacatgatcaatttt
gaaataaaggaaaagaaaggttgccagacaaaaactagcgaaaaaaaaaatggtaaaact
attgtgaagggtgacaaaactgatgtgaagagcgaggacaacaaacaagggataggaagc
aggaatgaatcagaaaaaagagaagacaatttagaggcaatagatgcagtaaaaataaaa
agacagattgaaaatagtgataaatataatgttattgataaagatagcgaagaagataaa
ctatgcaaattaaatgatgaagaattaaataatattgtaaaaataaatgttgatgagatt
ataaatttaaataataaatctagaggtaatattggagaagcttattttatttataaatta
atagaatttatgattcaaatagataatatatgtggaaatgatatatgtattataacacct
tattctaaacaaatgaatattttaaaaaatatattttatgataatttttttaataataaa
aattatattaatgaatataaaaaaatagaaatatctacagttgattcatttcaaggaaga
gaaaaagaaattgttattttttcattagtttgttcaaattattttaaaaatataggattt
ctaaaagactatagaagattgaatgtagctattactagagctaaaagacatgtagttatt
gttggaaattcaaacactatttccaatgatgatgttttaaatgaattatatgaaactgtt
ttaaattatggaaaagtatatcttgtcaatgaacttatagatgtagaatcaatgatcgat
ttatgtacattctaa
DBGET
integrated database retrieval system