Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_001790
Help
Entry
EHE19_001790 CDS
T07161
Name
(GenBank) cellulase family glycosylhydrolase
KO
K01179
endoglucanase [EC:
3.2.1.4
]
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
Pathway
rher00500
Starch and sucrose metabolism
rher01100
Metabolic pathways
rher02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rher00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
EHE19_001790
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
EHE19_001790
Enzymes [BR:
rher01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.4 cellulase
EHE19_001790
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulase
Dockerin_1
AP_endonuc_2
WxL
PhiKZ_gp35
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU67298
UniProt:
A0A4V6EN06
LinkDB
All DBs
Position
410896..412557
Genome browser
AA seq
553 aa
AA seq
DB search
MKKGKKIISLFTALALTSTICLTSLGTNVNAVDSNNDDWLHCVGNKIYDMYGNEVWLTGA
NWFGFNCSENVFHGAWYDVKDILTSVADKGIGFLRIPISTELLYSWMKGKPNPVSSVTAS
NNPPYHVCNPDFYDPTTDDVKNSMEIFDYIIGYCKELGIKVMIDVHSPDANNSGHNYELW
YGKSTSTAGVVTTDMWIDTLAWLADKYKNDDTILAFDLKNEPHGKRGYTGNKCPSDIAKW
DNSTDENNWKYAAEKCAKAVLAKNPKLLIMIEGIEQYPKTEKGYTFDTPDIFGASGDASP
WYGAWWGGNLRGVKDYPIDLGPLNSQIVYSPHDYGPSVYAQSWFEKDFTTQTLLDDYWYD
TWAYINDQGIAPLLIGEWGGHMDKGKNQKWMTLLRDYMIDNRIHHTFWCINPNSGDTGGL
IGNDWSTWDMEKYGLLKPALWQTKSGKFIGLDHVIPLGKNGISLGEYYNTPDPEDPVDPQ
DPEEPEDPQDPDPIVNIGDVNEDGTIDAIDFAVLKQHLLGITVKINLKNADMNDDGSIDA
IDFAKLKVLLLNN
NT seq
1662 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagggaaaaaaattatatcgctatttactgcacttgctttaacttctactatt
tgtttaacaagtttaggaactaatgttaatgcagttgatagcaataatgatgactggctt
cattgcgtggggaataagatatatgatatgtatggcaatgaggtttggctgacaggtgct
aactggtttggctttaactgtagtgaaaatgtatttcatggcgcttggtatgacgttaaa
gatattttaacaagtgtagcagataaaggaataggatttttaagaattcctatttctacg
gaattattatatagctggatgaaaggcaagccaaatccagtttccagtgtaactgctagt
aataatccaccttatcatgtttgtaatccagatttttatgatcctacaactgatgatgta
aaaaacagtatggagatatttgattacataattggatattgtaaagaacttggaataaaa
gtaatgatagatgtacatagtccagatgctaacaattcaggacataactatgaattatgg
tatggaaaaagtacatctacagcaggagtagttactactgatatgtggatagatactttg
gcttggcttgctgataagtataaaaatgatgatactattttggcatttgatttaaaaaat
gaaccacacggtaaacgtggatatacaggaaataagtgtccttctgatattgctaaatgg
gataattctacagatgagaataactggaagtatgctgctgagaaatgtgcaaaggcagta
cttgcaaaaaatccaaaactgttaataatgattgaaggtattgagcaatatccaaagact
gaaaaaggttatacatttgatactcctgatatttttggagcatctggtgacgcttctcca
tggtatggagcatggtggggtggtaacttaagaggtgtaaaggactatcctattgattta
ggtcctctaaacagtcagattgtatactctccacatgactatggtccatcagtatatgca
caatcatggtttgaaaaagactttacaacacaaacattattagacgactattggtatgat
acttgggcatatattaatgaccagggaatagctcctcttctcataggtgagtggggagga
cacatggataaaggcaagaaccaaaaatggatgacacttttaagagattatatgattgac
aatcgtattcatcacacgttttggtgcataaatcctaattcaggtgatactggaggatta
atcggaaacgattggtcaacatgggatatggagaagtatggactcttaaagcctgcatta
tggcaaacaaaatcaggtaagttcatcggacttgaccatgtaatacctcttggtaaaaat
ggaatctctctaggtgagtattataatacaccagatccagaagacccagtagatcctcag
gaccctgaagagccagaagatcctcaagatccagatccaattgttaatattggtgatgta
aatgaggatggtactattgatgccattgactttgcagtattaaagcagcacttattaggc
attactgtaaaaattaatttaaagaatgctgatatgaacgatgatggcagtatagatgca
attgactttgcaaagttaaaagtattgctgttaaacaactag
DBGET
integrated database retrieval system
