Rhodomicrobium vannielii: Rvan_0318
Help
Entry
Rvan_0318 CDS
T01353
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat-containing protein
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
rva
Rhodomicrobium vannielii
Pathway
rva04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rva00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
Rvan_0318
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rva00536
]
Rvan_0318
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rva00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
Rvan_0318
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADP69607
UniProt:
E3I742
LinkDB
All DBs
Position
complement(372489..374993)
Genome browser
AA seq
834 aa
AA seq
DB search
MADQLVQVWGRDISGTTEYIYYFDGLNYTLLGSTNNTTAAVDAAVGSATIAEYKVIVSLD
DTQNPANIVVFNQAGTLQTAGSHTVNGQYDVTLLDVAATGATGATGDTGATGSTGATGDT
GATGATGATGATGATGDTGATGATGATGATGATGATGATGDTGATGATGATGATGATGAT
GDTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGDTGATGATGATGATGATGAT
GDTGATGATGATGATGATGATGATGATGDTGATGATGATGATGATGATGATGDTGATGAT
GATGATGATGATGDTGATGATGATGATGATGATGDTGATGATGATGDTGATGATGATGAT
GATGATGATGATGATGATGDTGATGATGATGATGDTGATGATGATGEAGEPGATGATGAT
GATGATGATGDTGATGATGDTGATGATGATGDTGATGPEGGPTGPAGATGATGATGATGA
TGAGETGATGATGATGATGATGENGQNGQNGQNGQNGQNGQNGAPGATGATGATGATGAT
GDTGATGATGATGVGETGATGATGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
RTGATGATGRTGATGATGKTGATGATGKTGATGATGATGKKGATGATGATGKSGGHCKPD
HGKPDHGHGSNSSDHGSKGDRPTFISGSAKTQGSTGETAKSTAGDNQLQSIAKQVSASLR
PTDVAPKNVASLLNNLKNGSDIKAGGIFKDNGNSGSFNPINLNNQTHHLSLPKH
NT seq
2505 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgatcaactagtgcaggtctggggtcgtgatatatctggaaccacagaatatatt
tactacttcgatggcctaaattatacgcttttgggtagcacaaataatacgacagcggca
gttgatgcggcggtcgggagcgccacgatcgccgagtacaaggtcatcgtcagcctcgat
gatacacagaacccggccaatatcgtcgtgttcaaccaggccggaacgcttcaaacagca
ggaagtcataccgtaaacgggcagtatgacgttacgcttctagatgtcgccgctaccggt
gctacaggtgccacgggcgataccggtgctacaggtagtaccggtgccacaggtgacact
ggcgccactggtgccacgggcgctaccggcgctaccggcgctaccggcgacactggagcc
acaggcgctaccggtgcaacgggtgcaaccggcgctactggcgcaaccggcgctacgggt
gacaccggtgctaccggtgcaacgggtgctaccggtgccacaggcgctaccggtgcaacc
ggtgacactggagccacgggcgctaccggcgcaactggagctacaggcgctaccggcgct
accggcgctaccggcgctaccggcgctaccggcgcaaccggcgcaaccggcgcaaccggt
gacactggagccacaggcgctaccggcgcaaccggtgcaacgggtgcaaccggcgcaacc
ggtgacactggagccacaggcgctaccggcgcaaccggtgcaacgggtgcaaccggcgct
actggcgcaaccggcgctacgggtgacaccggtgctaccggtgccactggagccacaggc
gctaccggtgcaaccggtgctacgggcgcaaccggcgacactggagctacgggcgcaacg
ggtgccacaggcgctaccggcgcaacgggtgcaaccggcgacactggagccacgggcgct
acaggcgctactggcgctaccggcgcaacgggtgcaaccggcgacactggagccacgggc
gctacaggcgctactggcgacacgggagccacgggtgcaacgggagctacgggtgcaact
ggagctacgggcgcaacgggtgccacaggcgctaccggcgcaacgggtgcaaccggcgac
actggagccacgggcgctactggagctacaggcgctactggcgacacgggagccacgggt
gcaaccggcgccacgggtgaagccggcgaacccggtgccacaggcgctacgggagctacg
ggtgcaactggagctacgggtgctacgggcgacactggagctacgggcgctaccggtgat
accggtgctaccggcgcgacaggtgcaacgggtgacactggcgcaacgggtcctgaaggt
ggtccgacgggtccagccggtgccacgggtgctacaggtgcaacgggtgccacaggtgcc
actggcgcgggtgaaaccggcgctacgggcgctacgggtgctacgggcgcaacaggtgcc
accggcgaaaacggccaaaacggccagaatggccagaatggtcaaaacggccagaacggc
cagaacggcgcgccgggtgctacaggcgcgactggtgccacgggtgctaccggcgcaacg
ggtgataccggtgctacgggcgcaaccggtgccacgggcgtaggtgaaacaggtgccact
ggagctacgggcgctaccggtgataccggtgctaccggcgcgactggcgacactggagct
acgggcgctaccggtgataccggtgctaccggcgcgactggcgacactggagctacgggt
gctaccggcgcaacgggtgctacaggagccaccggcgctacgggtgctaccggtgccacg
ggtgctaccggcgcaacgggtgctaccggcgctaccggcgcaacgggtgccaccggcgca
acgggtgccacaggtgctaccggcgcaacgggtgctaccggtgccacaggcgctaccggc
aggaccggtgccacgggtgctaccggcaggaccggtgccacgggtgctaccggcaagacg
ggagctacgggtgccaccgggaagacgggagccacgggtgctaccggggctaccggcaag
aagggtgctacgggcgctaccggcgctacgggcaagtccggcgggcattgcaagccggac
cacgggaagcccgatcatggtcacggctcgaacagcagcgatcatggctccaagggcgac
cgcccgaccttcatctccggctcagccaaaactcagggaagcaccggagaaactgccaag
agcaccgctggtgacaaccagcttcagagcatcgcgaaacaggtaagcgcgtctctgcgg
cctacagatgtcgcacccaaaaatgtggcgtcgttgctgaataacctcaagaatggcagc
gacatcaaagcgggcggcatcttcaaggacaatggtaattcaggttcgttcaacccgatc
aacctgaataaccagacacatcatttgtccttgcccaagcactaa
DBGET
integrated database retrieval system
