Spiroplasma culicicola: SCULI_v1c10680
Help
Entry
SCULI_v1c10680 CDS
T03047
Symbol
trmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase TrmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
scq
Spiroplasma culicicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
scq03016
]
SCULI_v1c10680 (trmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:
scq03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
SCULI_v1c10680 (trmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
SCULI_v1c10680 (trmE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
Ras
MMR_HSR1_Xtn
Roc
Dynamin_N
RsgA_GTPase
AAA_24
AAA_29
FtsK_SpoIIIE
ABC_tran
GTP_EFTU
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI53408
UniProt:
W6A8B7
LinkDB
All DBs
Position
complement(1171241..1172593)
Genome browser
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MNKLFLEDTIVAPATKLAKQAISIIRISGSDAFKITNKILKDDLIYKNTQQLRKIYDNNF
LIDEALIITFIDKKSFTGENVVEINCHGGVLVTKKIISLLINNGARMAEPGEFSQRAFLN
SKINLLQAESINNLIESKNELALKINAIGVTGQNNKELLNIKENLVDIISRIQTSIDYPD
YDDIEGSDSQSISKVLQLTNNNLKKIINISKRAQNINEGIQTLILGAPNVGKSSLLNSLI
NEDKAIVTDIEGTTRDIVEGQLNFDNFTLNLIDTAGIRKTQDAVEQIGIEKSLKLISQAE
LILYVIDNQIDDEIMSKIKDKNFIIVRNKIDILDQKQLHNLKNNSKDMIFISAKENNVEP
LIKKIEAMWNNEEVLESSLPIITNMNSIINLEKIFELIQTSIKNLNQGFTIDMINLDLYN
ALDILNNILGIIDADEEIINNIFKKYCLGK
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaattatttttagaagacacaatagttgctcctgccactaagttagcaaaacaa
gctattagtattattagaatatcgggaagtgatgcttttaaaataacaaacaaaatttta
aaagacgatcttatttataaaaatacacaacagttaagaaaaatttatgataacaatttt
ttaattgatgaagctctaataataacttttattgataaaaaatctttcactggtgaaaat
gttgttgaaataaattgtcatggtggagttcttgttactaaaaaaattatttctctttta
ataaataatggagcaagaatggctgaaccaggagaattttcacaaagagcttttttaaat
agcaaaattaatttacttcaagcagagtcaattaacaatttgatagagtcaaaaaatgaa
cttgcacttaaaattaatgcaattggagttacaggtcaaaataataaggaacttttaaat
attaaagaaaatttagttgatataatttcaagaattcaaacttcaattgattatccagat
tatgatgatattgagggttcagattctcaaagtatttcaaaagttttacaattaacaaat
aataatttaaaaaaaattattaatattagtaaaagagcacaaaatattaatgaaggaatt
caaactttaattcttggtgctccaaatgttggtaaatcttctttattaaattctttaatt
aatgaagataaagcaattgtcacagatattgaaggaacaactcgagatatagttgaagga
caattaaactttgataattttacattaaatttaattgatacagcgggaattagaaaaaca
caagatgctgttgaacaaattggaattgaaaaaagtttaaaattaatttcacaagcagaa
ttaattttatatgtaattgataatcaaattgatgatgaaatcatgtcaaaaattaaagac
aaaaattttattattgtaagaaataaaattgatatacttgatcaaaaacaattgcataat
ttaaaaaataattctaaagatatgatttttatcagtgcaaaggaaaataatgttgaacca
cttataaaaaaaattgaggcaatgtgaaacaatgaagaagttttagaatcgagtttacca
attattacaaatatgaattcaattattaatttagaaaaaatatttgaattgattcaaact
tcaattaaaaatttgaatcaaggttttacaattgatatgattaatttagatttatataat
gccttagatattttaaataatatacttggtataatagatgcggatgaagaaattataaat
aatatttttaaaaaatattgtttaggaaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
