KEGG   Streptococcus infantarius subsp. infantarius: Sinf_1255
Entry
Sinf_1255         CDS       T01765                                 
Name
(GenBank) CRISPR-associated protein, SAG0894 family
  KO
K09952  CRISPR-associated endonuclease Csn1 [EC:3.1.-.-]
Organism
sif  Streptococcus infantarius subsp. infantarius
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sif00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:sif02048]
    Sinf_1255
Prokaryotic defense system [BR:sif02048]
 CRISPR-Cas system
  Type II CRISPR-Cas system
   Type II signiture cas proteins
    Sinf_1255
SSDB
Motif
Pfam: Cas9_REC Cas9_PI HNH_4 Cas9-BH RuvC_III TBCC_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEZ62568
LinkDB
Position
complement(1276484..1280611)
AA seq 1375 aa
MEKSYSIGLDIGTNSVGWAVITDDYKVPAKKMKVLGNTDKKYIKKNLLGALLFDSGETAE
VTRLKRTARRRYTRRKNRLRYLQEIFAKEMTKVDESFFQRLEESFLTDDDKTFDSHPIFG
NKAEEDAYHQKFPTIYHLRKYLADSQEKADLRLVYLALAHMIKYRGHFLIEGELNAENTD
VQKLFNVFVETYDKIVDESHLSEIEVDASSILTEKVSKSRRLENLIKQYPTEKKNTLFGN
LIALALGLQPNFKTNFKLSEDAKLQFSKDTYEEDLEELLGKVGDDYADLFISAKNLYDAI
LLSGILTVDDNSTKAPLSASMIKRYVEHHEDLEKLKEFIKINKLKLYHDIFKDKTKNGYA
GYIDNGVKQDEFYKYLKTILTKIDDSDYFLDKIERDDFLRKQRTFDNGSIPHQIHLQEMH
SILRRQGDYYPFLKENQAKIEKILTFRIPYYVGPLARKDSRFAWANYHSDEPITPWNFDE
VVDKEKSAEKFITRMTLNDLYLPEEKVLPKHSHVYETFTVYNELTKIKYVNEQGESFFFD
ANMKQEIFDHVFKENRKVTKAKLLSYLNNEFEEFRINDLIGLDKDSKSFNASLGTYHDLK
KILDKSFLDDKTNGQIIEDIVLTLTLFEDRDMIHERLQKYSDFFTSQQLKKLERRHYTGW
GRLSYKLINGIRNKENNKTILDFLIDDGHANRNFMQLINDESLSFKTIIQEAQVVGDVDD
IEAVVHDLPGSPAIKKGILQSVKIVDELVKVMGDNPDNIVIEMARENQTTGYGRNKSNQR
LKRLQDSLKEFGSDILSKKKPSYVDSKVENSHLQNDRLFLYYIQNGKDMYTGEELDIDRL
SDYDIDHIIPQAFIKDNSIDNKVLTSSAKNRGKSDDVPSIEIVRNRRSYWYKLYKSGLIS
KRKFDNLTKAERGGLTEADKAGFIKRQLVETRQITKHVAQILDARFNTKRDENDKVIRDV
KVITLKSNLVSQFRKEFKFYKVREINDYHHAHDAYLNAVVGTALLKKYPKLTPEFVYGEY
KKYDVRKLIAKSSDDYSEMGKATAKYFFYSNLMNFFKTEVKYADGRVFERPDIETNADGE
VVWNKQKDFDIVRKVLSYPQVNIVKKVEAQTGGFSKESILSKGDSDKLIPRKTKKVYWNT
KKYGGFDSPTVAYSVLVVADIEKGKAKKLKTVKELVGISIMERSFFEENPVSFLEKKGYH
NVQEDKLIKLPKYSLFEFEGGRRRLLASATELQKGNEVMLPAHLVELLYHAHRIDSFNST
EHLKYVSEHKKEFEKVLSCVENFSNLYVDVEKNLSKVRAAAESMTNFSLEEISASFINLL
TLTALGAPADFNFLGEKIPRKRYTSTKECLSATLIHQSVTGLYETRIDLSKLGEE
NT seq 4128 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaagtcatattcaattggactcgatataggtactaatagtgtaggttgggctgtg
attactgatgattacaaagttccagctaaaaagatgaaagttttaggaaatacagataag
aagtatatcaagaaaaacttactgggtgcactgttatttgatagcggtgaaactgctgaa
gtaacacgtttgaagcgtacagctagacgtcgctatacacgtcgtaaaaatcgtttacgt
tatctacaagaaatttttgctaaagaaatgacaaaagttgatgaaagtttctttcaacgc
ttggaagaatctttcttgacagatgatgataaaacttttgattctcatccaatttttgga
aataaagctgaagaagatgcttatcatcaaaaattcccgacaatttaccatttgagaaaa
tatcttgctgattctcaagaaaaagcagatttacgtttagtttatctagctttggcacac
atgattaaatatcgtggtcattttttgattgaaggtgaattgaatgctgaaaatacagat
gttcaaaagttattcaatgtttttgttgaaacatatgataagattgttgatgaaagtcac
ttatcggaaattgaagttgatgcttcaagtattttaacagaaaaagttagtaaatcacgt
cgtttagaaaatcttattaagcagtatccgacggaaaagaaaaatactttatttggaaat
ctaattgcactagctttaggtttgcaaccaaatttcaaaacgaattttaagttatctgaa
gatgccaaattacaattttctaaagatacttatgaagaagatttagaagagttacttggg
aaagttggagatgattacgcagatttatttatttcagctaaaaatctatacgatgctatt
ttgttgtcaggaattttaactgttgatgataattctacaaaagcacccctatctgcttca
atgattaaacgttatgttgaacaccatgaagatttagaaaaacttaaagagttcattaaa
ataaataaacttaaactttatcatgatatttttaaggacaaaaccaaaaatggctatgct
ggctatatcgataatggtgttaaacaagacgaattttataaatatttgaaaacaattctc
actaaaatcgatgatagtgattattttcttgataaaatcgaacgtgatgatttcttaaga
aaacaaagaacatttgataatggttcgattccgcaccaaattcatttacaagaaatgcat
tctattttacgacgtcaaggtgattattatccattcttaaaagaaaatcaagctaaaatt
gaaaaaatattaacttttagaatcccttactacgtaggtccattagcaagaaaagatagt
cgttttgcttgggctaattaccattcagatgagccgattacaccgtggaattttgatgaa
gtggtggataaagaaaaatcagctgaaaagtttatcacacgaatgactttaaatgattta
tatttacctgaagaaaaggttttaccgaaacacagtcatgtatatgaaacatttacggtt
tataatgaattaacaaaaattaagtatgttaatgaacaaggtgagtcgtttttcttcgat
gcaaatatgaagcaagaaatctttgaccacgtatttaaagaaaatcggaaagttacgaaa
gctaaacttttaagctatcttaataatgagttcgaagagtttcgaatcaatgatttaatt
ggtcttgataaagatagtaaatcatttaatgcaagccttggaacttatcatgatttgaaa
aagattttggataaatctttcttagatgataagacaaatggacaaatcattgaagatatt
gtgttgactttgaccttatttgaagatagagatatgattcatgaacgtcttcaaaaatac
agtgatttctttacttcgcaacagttgaagaaacttgaacgtcgccattatactggttgg
ggacgtctatcatataaactgattaatggaattcgcaataaggaaaataacaaaactatt
cttgatttcttgattgatgatggtcatgctaaccgcaattttatgcaattgattaacgac
gagtcattatcatttaaaactattattcaagaagcacaagttgtaggtgatgtcgatgat
attgaagctgttgttcatgatttacctggaagtcctgctattaaaaaaggtattctacaa
agtgtcaaaatcgttgatgagctagttaaagtgatgggagataaccctgataatattgtt
attgaaatggcgcgtgaaaatcaaacaactggttatggaagaaataaatcaaatcaacgt
ttgaaacgcctacaagactctctgaaagaatttggtagtgacatccttagtaagaagaaa
ccttcttatgttgatagtaaagttgaaaattctcatcttcaaaacgatcgtttgttccta
tactatatccaaaatggtaaggatatgtacacaggagaagaacttgatattgatcgttta
agcgattatgatattgaccatatcatccctcaagcctttattaaggataattcaatcgat
aataaggtcttgacaagttcagctaaaaaccgcggtaagtcagatgatgtgccaagtatt
gaaattgttcgtaatagaagatcgtactggtataaattgtataaatcaggactaatctct
aaacgtaaatttgataatttaactaaagcagaacgtggtggattaactgaagctgataaa
gccggatttattaaacgccaattagttgaaacacgtcaaatcacaaaacatgtcgcacaa
attttagatgcccgttttaatacaaaacgtgatgaaaatgacaaggtgattcgtgatgta
aaagtcattactttgaaatcaaacttagtttcgcaattccgaaaagaatttaaattctat
aaagttcgtgaaattaatgattatcaccacgctcacgatgcttatctcaacgcagtagtt
ggaacagctttgcttaaaaaatatccaaaattaacaccagaatttgtatacggtgagtat
aaaaaatatgatgttcgtaaacttattgccaaatcttctgatgactattctgaaatgggt
aaagcaacagcaaaatatttcttctattcaaatttgatgaacttctttaaaactgaggtc
aaatatgcagatggtagagtatttgaacgaccagatattgagacaaatgcagatggtgaa
gttgtctggaataagcaaaaagattttgacattgttcgaaaagttctgtcataccctcaa
gttaatattgtgaaaaaagttgaagctcaaactggtggattctcaaaagaatctatcttg
tctaaaggtgattcagataaattaataccacgtaagacgaaaaaggtttattggaatact
aaaaaatacggtggttttgatagtccaacagtcgcttattcagttttggtagttgctgat
attgagaaaggtaaagctaagaagttaaaaaccgtaaaagaattagttggtatttctatt
atggaacgctctttctttgaagaaaatcctgtctcattcttagagaaaaaaggatatcat
aatgttcaagaggacaaattaataaaacttcctaaatacagcctttttgagtttgagggt
ggaagaagacgtttgttggcgagcgccacggagttgcaaaaaggaaatgaagtaatgctt
ccagctcatttagttgaattactttatcatgctcatcgaattgatagctttaacagcact
gagcatttaaaatatgtaagtgagcataaaaaagaattcgaaaaagtcttatcttgtgta
gaaaatttttctaacctatatgttgatgttgaaaaaaatttaagcaaggttagagcagct
gctgaaagtatgactaacttttcacttgaagaaatttcagcatcatttattaatttatta
acattaacagcattgggtgcaccagctgactttaatttcttaggtgagaagatacctcgt
aagcgctatacttcgacaaaagagtgtttatctgccaccctcatccaccaatctgtcact
ggcctttatgaaacacgtattgatttgagtaaattaggagaagagtaa

DBGET integrated database retrieval system