Staphylococcus lugdunensis N920143: SLUG_18850
Help
Entry
SLUG_18850 CDS
T01951
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
KO
K16898
ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
sln
Staphylococcus lugdunensis N920143
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sln00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sln03400
]
SLUG_18850
Enzymes [BR:
sln01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
SLUG_18850
DNA repair and recombination proteins [BR:
sln03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
SLUG_18850
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
PDDEXK_1
UvrD_C_2
DEAD
AAA_12
ResIII
DASH_Spc19
ATP-synt_ab
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCB54389
LinkDB
All DBs
Position
complement(1987884..1991534)
Genome browser
AA seq
1216 aa
AA seq
DB search
MIPVKPEGVIWTDAQWQSIYAKGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQRIIRDNVDVDRLLV
VTFTNLSAREMKHRVEQRIQEAALEDPNNTHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYD
VLDVDPNFRTSSEAENILLLEQTIDETLEHYYDVLNSDFIELAEQLSKDRNDDDFRTIIK
SLYYFSIANPNPFEWLTQLVKPYQNEAQQDNLLQLLTDLSRIFLRAAQEALSKSYEIFTL
AEDTDKQIAVIEDEMAFMTKAFDGDMIQSDVIANHEFVSRFPALTKKIKEVNETMGDALV
EAKAYYDKYKSLVSKVQADYFSRSAQDLKRDMQRLAPRVNILADIVKDVITAFGQKKRSR
NILDFADYEHFALQILTNDDGSPSHIAEMYREQFAEILVDEYQDTNRVQEQILSCIKTGS
EADGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFNAEGNGTGIRIDLSQNFRSRKEVLST
TNYLFKHMMDEEVGEISYDDAAQLYYGAPFDEVDHPVELRTLIEADKEHSELNGSEQEAE
YIVKQVKDILENKRIFDMKTGHYRQPTYKDIVILERSFSQARDLQQAFKDHDIPFHVNSR
QGYFEQTEVRLVLSFLRTIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFTEDELANIRVFSPNDDYFYQS
IVNYINHDLANKKLVKKLQNFIADIKMYQIYSQSNPVYQLIDKFYHDHYVIQYFSGLIGG
KGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIDRGQDFGEENIVGPNDNVVKMMTI
HSSKGLEFPFVIYSGLTREFNKKDLREQVILNQKYGLGIDYYDIDKNMAYPSLSSVAYKA
ITEKEMISEEMRLIYVALTRAKEQLILIGRLKSTKKLEEYEKLAISGSHIAVNERLTAEH
PFELIYGILSKHKSYELTPDLMFENDIANLAESIRPNVNIIIDYFEDIIEANHQDMNEQR
SISDLNTLDTGNDDIKAKITQQLKFKYPNVINTTKPSKQSVSELKRQLETEESDTNYDRV
RQYRIGVATYERPRFMRHVTKRKANEVGTLMHTVMQHLPFKPERMTEEALEQYIDHLITQ
QIIEHDAKKDIKFPEIMTFIQSDLYLEIAEAEQIYRELPFVVNQAKVDNISDNHEDVAII
QGIIDLIYKKDNQYYFVDYKTDAFNRRKGMTDEEIGEQLKEKYRIQMQYYKNALETMLHT
EVKGSLYFFQFGRLSI
NT seq
3651 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataccagtcaagcccgaaggggtaatttggacagatgcgcagtggcaaagtatatat
gctaaaggtcaagatgtgttagttgcggccgctgccggctcagggaaaacggcagtttta
gtagaaagaattattcaacgtatcatcagagacaatgttgatgttgatcgattattggtg
gttacttttactaatttaagtgcacgtgaaatgaaacatagggtagaacaacgcattcaa
gaagcagcacttgaagatcctaataatacgcatttaaagaatcaacgcataaagatacac
caagctcaaatttctacattgcatagtttttgtttaaagctaatacaacagcattacgat
gtgttagatgttgatcctaattttagaacgagtagtgaagcagaaaacatcttactgtta
gaacagaccatagatgaaactttagaacactactatgatgtgttaaacagcgatttcatt
gaactagcagagcaattgtctaaggatagaaatgacgatgactttagaacaatcattaaa
tctctttattactttagtattgcgaaccccaatccttttgaatggttaacccaattagtg
aaaccataccaaaatgaagcacaacaagacaacttgttacaattgttgacagatttgtcg
cgtatttttttacgtgctgcacaagaggctttaagtaaaagctatgaaatatttacttta
gctgaagatacggacaagcaaatagctgtcattgaagatgaaatggcttttatgactaaa
gcctttgatggagatatgatacaaagtgatgtaattgcaaatcatgaatttgtcagtaga
tttcctgcattgactaaaaagataaaagaagtaaatgaaactatgggtgatgcacttgtt
gaagctaaagcatattacgataaatataaatcgcttgtatccaaagtccaagcagactat
ttctcacgcagtgcgcaagatttaaagcgagatatgcaaaggttggcaccacgagtaaat
atattagcagacattgttaaagacgttataactgcatttggtcaaaaaaaacgaagtcgt
aatatcctagactttgctgactatgagcattttgcgttacaaatattaacaaatgatgat
ggctcaccttctcatatcgcggagatgtatcgcgaacagtttgctgaaatattagtagat
gaataccaagataccaatcgcgtacaagaacaaatattatcctgcattaagactggttca
gaagcagacggtaatttatttatggtaggggatgtcaagcaatctatttacaaatttaga
caagcagacccaagtctatttattgagaaatatcaacgttttaatgcagagggtaacggc
acaggtatacgcattgatttgtcgcaaaacttccgatctagaaaagaagtgttaagtacc
actaactatttatttaagcacatgatggacgaagaagttggtgaaattagttacgatgat
gctgcacaattgtactatggtgcgccatttgatgaggtggatcatccagtagagctgcgt
acattgattgaagcagataaagaacatagtgaactaaatggctcagaacaagaagctgaa
tatattgttaaacaggtgaaagatattttagaaaataagcgtatatttgatatgaaaacg
ggtcactatcgtcaaccaacatataaagatattgttattttagaacgtagtttttcgcaa
gctagagacttgcaacaagcgtttaaagatcatgacataccctttcacgtgaacagtaga
caaggctatttcgaacaaacggaagtgcgattagttttatcatttttaagaacaatagat
aatcctttacaagatatttatttagtaggattgatgcgttcggtcatctatcaatttacc
gaagatgaattagctaatatacgtgtcttcagtcctaatgatgactatttctatcaatct
attgtgaactatattaaccatgatttggctaataaaaaattagtaaagaaactacaaaat
ttcatagctgatattaaaatgtatcagatttatagtcaaagtaatccagtttaccaactc
atagataagttttaccatgaccattatgttatccaatatttcagtggtttgattggtggt
aaaggacgacgggccaatctttatggattatttaataaggctatcgaatttgaaaattct
agttttagaggactttatcaatttattcgttttatagatgaactgattgaccgcggccaa
gattttggcgaagaaaatatcgtaggtcctaatgataatgtcgttaaaatgatgactatt
catagcagtaagggattagaatttccatttgttatttattcaggattaacaagggaattt
aataagaaagatttacgggaacaagttatcttaaaccaaaaatatggtttaggtatcgat
tattatgatattgataaaaatatggcatatccttcactgtcatctgttgcttataaagca
ataacagaaaaagaaatgatatcagaagaaatgcgtttaatttatgtggcattgacacgt
gcaaaggaacaacttattttaattggcagacttaaatctacaaaaaaacttgaagagtac
gaaaaattagctatttcaggttcacatatagctgttaatgagcgtttgacagcagaacat
ccttttgaacttatttatggtattttgtcgaagcataagtcctatgaactgacaccggat
ttaatgttcgaaaatgatattgcaaatttagcagaaagcataagaccaaacgtaaatatc
attattgattattttgaagatattattgaagctaatcatcaagatatgaatgagcagcgt
tctatttcggatcttaatacgttggatacaggcaacgatgatattaaggcgaaaattacg
caacagcttaagtttaaatatccaaacgtgattaataccactaagccttctaagcaatcc
gtatctgaattaaaacgacaactggaaactgaagaaagcgatacgaactacgatcgcgtt
cgacaatatcgcattggtgttgcgacatatgaacggccaagatttatgcgtcatgttacg
aagcgtaaagccaatgaagtaggaacattaatgcacaccgtcatgcaacatttgcctttc
aaacctgagcgtatgacagaggaagcattggagcaatatattgatcatttaatcacacaa
caaattattgaacatgatgctaagaaagacattaaatttccagaaataatgacgtttatt
caaagtgatttatatcttgaaatcgcagaagctgaacaaatttatcgtgaattacctttt
gttgtaaatcaagcaaaagttgataatatatcagataaccatgaagacgtagcgattatt
cagggtataattgatctaatttataagaaagataatcaatattactttgttgattataag
acagatgcttttaatagacgaaaaggtatgacagatgaagaaataggagaacaacttaaa
gaaaaatatcgcattcaaatgcaatattataaaaatgctttagaaaccatgctccatact
gaagtaaaaggttctttatatttcttccagtttggtagattatccatatag
DBGET
integrated database retrieval system
