Sitophilus oryzae (rice weevil): 115881185
Help
Entry
115881185 CDS
T07985
Name
(RefSeq) guanine nucleotide exchange factor subunit Rich isoform X1
KO
K20476
RAB6A-GEF complex partner protein 1
Organism
soy
Sitophilus oryzae (rice weevil)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
soy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
soy04131
]
115881185
Membrane trafficking [BR:
soy04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
Rab associated proteins
115881185
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RIC1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115881185
NCBI-ProteinID:
XP_030754446
UniProt:
A0A6J2XTT9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1500 aa
AA seq
DB search
MYFPIGWPKVVQVPDLGQCSLKQVKCNRDRILVAILTDDILAIWFCKPCVPIVFHRRNTE
SLSKFGTNIIAEWKPDSSKIVVATSEGHLLLYTLNVISNQKGLYIQTDSPHANLRRDSAE
LFIKETIPPLSLQITEEALVWDGKITGIVCITMSEIMLSTTENHVLRYKWDGTQNRDYTL
DLRRIPFCINQQVSKAIPIVEDNTYIIDIEYSPLVGGFSIVLNDGRAAFLTASSLKFDPN
QVQGIWAQHIEDATCTTINHKYRLITFGRSNSECIVYYVDDSTGGLEVSHNCLLSSKDYP
GCPGSVGNVIWTPDGCALVATWQQGGLAMWSTFGALLMCSLGWDYGLNIDIQKWNPLQIM
SLDFATEGYQLWMVRKSNTYDSENRTVDNNNLSQNESDLILLDFAKSALTINPCMSQQSH
LYLQGEDKLYINSSENLIKTFSERSNRDDSVFGDNTIFTTTLAEGRQWLVIPIPSTYSAT
NWPIRYSGIDIDGQNIVIAGRTGVAHYSLQTRRWKLFGNETQEKDFIVAGGLLWWRDYII
LGCYSIIDNSDELRFYSKECKLDNKFAKIIPVNAPILLINILQDQLITFSSDAQVCIWRL
NQNDSAGDIDLIKVQAIDASALAVHPACIVSVTLTALRTETSGKNSNPRIPESIVLNVSG
RLLLVQREIRKGERFTCLMPTVLASCVENVWVPAITHQEKAHLTESLWLFCGSHGMRVWL
PLYPRDGDKPHSFMSKRIMLPFHLKIYPLAILFEDAIILGAENDTVLYTSDLNSPFSLPF
CVLQRTSQVYLHQILRQLIRRNLGFHAWEIAKSCMSLPYFPHSLELLLHEVLEEEATSKE
PIPDAQLPSVIEFIMEFPVYLQTVVQCARKTEIALWPYLFSAAGKPKDLFQECMDKSNLD
TAASYLIILQNLETSSVSRQYATMLLNTALNQSKWELAKDLVRFLRAIDPNDVESPRNSF
ILPSKLNNLQTPPVSPNAEDISVILGNVQSSRVRSYSTTISPKVVEKPNNSVDKMNALQE
SPKSNRKKSVPSSSNAKADTNYVRKRFSSFKPLSSYWRNIFKLTTPNNTAEEFFIDVILQ
KHARRLLSSHRLTDLGYFAAHLDFHLVAWLAKERDRAARIDDFVKALKQLHEEFQWPYPT
PSTLSSRAQSLGETQILEDQLRSLKLDVFNYPTSSSRVGDSGYMSFQGLPGRGLITPLST
LEQSSQIADEIDLDLENHSPNEKVNPTNDSSSPQEKEHLFFGAESAADHFSANLNLGLPT
TALQTNNAIDESIMSTVSSVWGEDIVSSPGTENWEVPSTQILEQLSNTDSRGSHKSEIQL
RYLLQLFMEASCLEWSLLISVLLRDAMAVLRTVNAAKSPDQSIEIVSRLRQGLLILNYWT
NTECLGYKAFMIAIQNQVSVLTRILETKIQHQQIVEYQQAVSASLNKVTLQKPRPRKTSQ
SQDTANQNVPVKSKKSTSSNVSVSSNKLNSDVGPTSTGESPVENHVENTIIPESTGCVIS
NT seq
4503 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattttccgatcgggtggccaaaagttgttcaggttccggatttaggtcagtgttca
ttaaaacaagtgaaatgtaacagagatcgtattttagtagcaattttaacagatgatata
ttagcaatatggttttgtaagccttgtgtgccaattgtatttcatcggcgaaatacagaa
tctctatcaaaatttggaaccaatattatagcagaatggaaaccagattcaagtaaaatt
gttgttgctacctcagaaggacatcttttactttatacgctaaatgttatatcaaatcaa
aaagggttgtatatccagactgactctcctcatgctaacttaagaagagatagtgccgaa
ctatttattaaagaaactatacctcccctgtctttgcaaataactgaagaagctctagta
tgggatggaaaaataacaggaattgtttgtataacaatgtctgaaataatgttatctact
actgaaaatcatgtactgagatataaatgggatgggactcaaaacagggattatacatta
gatttaagaaggataccattctgtatcaatcaacaagtttctaaagcaatacctatagtg
gaagataatacttatataattgatattgaatattctccgttagttggaggattttctata
gtgcttaatgatggaagagcagcatttcttacagcatcttctttaaaatttgacccaaat
caagtgcaaggaatatgggctcaacatattgaagacgctacctgtactactattaatcac
aaatatagattaattacctttggaaggtcaaactctgaatgtatagtttattatgttgat
gacagtactggtggactggaagtttcacataattgtcttctaagtagtaaggattaccct
ggctgtccaggatcagtaggcaatgtaatatggaccccagatggatgtgctttagtagct
acctggcagcaagggggcttagcaatgtggtctacatttggtgcattacttatgtgttct
cttggttgggactatggtttgaatattgacatacaaaaatggaatcctttacaaataatg
tcattggattttgcaactgaaggttatcagttatggatggtaagaaaaagcaatacatat
gactcagaaaaccgtacagttgataataataatctttctcagaatgagtctgatttaatt
cttttggattttgcaaaaagtgcattaacaattaatccttgtatgagccaacagagtcat
ctgtatttgcaaggagaagacaaactgtatataaattcatcagaaaatttaatcaaaaca
ttttcagaaagatcaaatcgtgatgattctgtttttggagataatactatttttacaact
acattagctgaaggtagacagtggcttgttattccaattccttccacatattctgctact
aactggccaattcggtattcaggtatagacatagatggtcaaaatattgttatagcaggt
aggacaggtgtagcccactattccttgcaaaccagaagatggaaattgtttggaaatgaa
actcaagaaaaagattttattgttgctggaggattgttgtggtggagggattatattatt
ctgggatgttacagcatcatagataattcagatgaactaagattttactcaaaagaatgc
aaattagacaataaatttgcaaaaataattcctgttaatgctccaattttgttaataaat
attttacaagaccagctgattacttttagttcagatgcacaagtttgtatttggagactt
aatcaaaatgattcagctggtgatatagatctcataaaagttcaagctatagatgcatca
gcgttagctgttcaccctgcttgtatagtatcagttactttgacagctctgagaactgaa
actagtggcaagaatagtaatccaagaataccagaaagtattgtgttaaatgtgagtggt
agattgttgttagtccaaagagaaattagaaaaggtgaaagatttacctgcctcatgcct
acagtattagctagttgtgttgaaaatgtttgggtgccagctattactcatcaagaaaaa
gctcatttgacagaatccttgtggcttttctgtggatctcatggaatgagagtgtggcta
cctttatatccaagggatggagataagcctcatagttttatgtcaaaaagaattatgctt
ccatttcatttaaaaatttaccctttagcgatattatttgaagatgctataatactcggc
gccgaaaatgatacagttttatatacatccgatttaaattcaccattttcactgcctttc
tgtgttcttcaaagaactagtcaagtttacttgcatcaaatattaagacaacttataaga
agaaatttaggatttcatgcttgggaaatagctaaaagttgcatgagtttaccatatttt
cctcattcattagaactacttcttcatgaggttttagaagaagaggctactagtaaggaa
cctatacccgatgcccaactaccaagtgtcatagaatttattatggagtttccagtttat
ctacaaactgtcgtgcagtgtgcacgaaaaactgaaattgctctgtggccttatttgttt
tcagctgccggcaaaccaaaagatttgtttcaagaatgtatggataagagtaatttggac
acagcagcatcatatttaataattttacagaacctggaaacctcttcggtgagtaggcaa
tatgcaaccatgttacttaacactgctttaaatcaatcaaaatgggaattggccaaggat
ttggtcagatttctaagagctatcgatccaaacgatgtagaatctccaagaaactctttt
atacttcccagcaagctgaacaaccttcagactcctccagtaagcccaaacgctgaagat
atatctgttatattagggaacgtgcagagttcgagggttcgatcgtacagtacaacaata
tcgccaaaagtagttgaaaaacccaacaacagtgttgacaaaatgaatgctttacaagaa
tctcccaaatcaaatcgcaagaaatccgtcccttcttcatcaaacgccaaagcagacaca
aattatgtaagaaaacgttttagtagtttcaagccgctgtcgtcctattggcggaacatt
tttaaattaacgacgcctaataatactgcagaagaatttttcatagacgtcattctacaa
aaacatgcgaggaggttgctatcgagtcatcgtttaacggatctgggatattttgcggct
catcttgattttcatttggtggcttggctggcaaaagaacgcgacagagccgctagaatt
gacgattttgtcaaagctctgaagcagcttcatgaagaattccaatggccctatcctaca
ccatcaactttgtcatccagggctcagtctttaggagaaacacaaattcttgaagaccag
ctacgttcgctaaaactggacgtttttaactatccgacttcgtcaagtagagtgggagat
agtgggtatatgagtttccagggtttgcccggcagaggactgataactccacttagtacc
ttggaacagtccagtcagatagctgatgaaatagacttggacttagagaatcacagtcct
aacgaaaaggtaaatcccacaaatgacagttcaagtccacaagagaaggaacatttattt
tttggagcagaatcagctgccgatcattttagtgcaaatctaaatctaggtttacccact
acagctctacaaacgaataatgccatagacgaatctataatgagtacggtaagttcggtt
tggggtgaagacatagtttccagtccaggaactgaaaattgggaagttccttcaactcaa
atcctggaacaactatcgaataccgacagcagaggatcacataagtcggaaatacagttg
aggtacttactgcagctgtttatggaagcaagttgtttggaatggtctttgttgatatcg
gtattacttagagacgccatggccgttctgaggacggtgaacgcagctaaatctccagat
cagtcaatagaaattgtttctagacttcgacagggattgttaattttgaattattggacg
aatacagaatgtttgggatataaagctttcatgatcgctatccaaaaccaggtatccgtc
ttaacgaggatactcgaaaccaagattcaacaccaacaaatcgtcgagtaccaacaggcc
gtatctgctagtttgaacaaggtaactcttcagaaaccacgtcctcgaaagactagtcag
agtcaagacacggccaatcagaatgtacctgtaaaaagtaagaaaagcacttctagcaac
gttagtgtttctagtaacaaactaaatagcgatgtaggtcctactagtacaggcgaatcc
cctgtagaaaatcacgtagaaaatactattatacccgagagtaccgggtgtgtgatatct
taa
DBGET
integrated database retrieval system
