Shewanella psychromarinicola: EGC80_13635
Help
Entry
EGC80_13635 CDS
T09848
Name
(GenBank) outer membrane protein assembly factor
KO
K07278
translocation and assembly module TamA
Organism
spsr
Shewanella psychromarinicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spsr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spsr02000
]
EGC80_13635
Transporters [BR:
spsr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EGC80_13635
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA_TamA_1
POTRA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZG37489
UniProt:
A0A3N4DKY3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3100206..3101996)
Genome browser
AA seq
596 aa
AA seq
DB search
MSGFVLADENWLTINVTGVPKKIEKNIFAHLGTLPDNDVQRRAFLFTVDDNTHDALESMG
YYHAILDIDVKENDKGPWELSLNITPGEPVIIQWVDINFQGDMLQDNTFSLWLNSLKIKP
GDTLNHGVYDSIKSQLITLALARGYFDGQYTKSEININRDLNTAQINLLFNSGKRYLFGD
VHFEGSTLNDDIVESLIPFDADAPYATQLLTEFNRNLLNTGYFSNIKVLPQLDKIDTGVV
PINVQLSPRPSHLIGVGLGADIGNSTENSVDPRVRVTWRTPQINRYGHNQETSAEWSPER
PKILTTYTIPLTHPLDDQLKIKLGILRDTYGVTQDYDAEKRQFNNTGQLESRKYLVGLTR
QRRSKSNWLHGYSVESIREFYNQLDTDFDPRFYLLGYNLTKTVRGDNSLDPKSGYRQTYS
LEYADPSLGSTIRLVHLQARFKWVDTLFDKHRFVARMDLAANIVDKNDIDNIPPSLRYFA
GGDQSIRGYSYQELGPYIDYINSEGGLSRQVVGGRYLAIGSVEYQYYLTPTWRVATFVDA
GNAFDTQQFEPVVSVGGGVHWISPIGPIRMDLGFGLKETETVARSYRFHLTMGTDL
NT seq
1791 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaggctttgtgctggccgacgaaaattggttaacgattaacgttaccggcgtgccg
aaaaaaattgaaaagaacatttttgctcatttaggcaccttgccagacaacgatgttcaa
cggcgtgcatttttatttaccgttgacgataacacccatgacgcccttgaatccatgggc
tactaccatgcaattttagatattgatgttaaagaaaatgataaaggtccttgggagtta
agcctcaatataaccccaggcgaaccagtcattattcaatgggtggatattaattttcaa
ggtgacatgctccaagataataccttttcactctggctaaacagtctaaaaattaagcct
ggtgataccttaaaccacggtgtctatgattcgataaaatcacagttaatcacgttagcg
ctggcaagaggatattttgatggtcaatacaccaaatcagaaatcaacattaatcgtgac
ttaaataccgcccaaattaacctactgtttaattctggtaagcgctatttatttggtgat
gttcactttgaaggcagtactctcaatgatgacattgttgaatcattaattccttttgat
gctgatgcgccttacgccacacagctattaactgagtttaatcgcaatttattaaacaca
ggttacttcagtaacattaaagtattaccacaattagataaaattgatactggggtagtg
cccattaacgttcagttaagtccacgccctagtcatcttattggagtaggtttaggtgct
gatatcggtaacagtactgaaaacagtgtcgatcctcgcgtgcgagtcacttggcgcacg
ccgcaaataaatcgctatggccataatcaagaaaccagtgcagagtggtctcctgaacga
cctaaaattttgacgacttatactattccattaacccaccctttggatgatcaactaaaa
ataaaactaggaatattacgtgacacatatggtgtcacccaagattatgacgctgaaaaa
cgtcaatttaataataccggtcaactagagtctagaaagtacttggttggattaacccgt
caacggcgctctaaaagcaattggttacatggttattcagttgagtctattagagaattc
tataatcaactcgatacagatttcgacccacgtttttatttattgggttacaacctcaca
aaaaccgttcgtggtgataatagcctcgatcccaagtcaggttatcgtcaaacttatagc
cttgaatacgctgatccttccttaggctccaccattcgtcttgtccatttacaagccaga
tttaaatgggttgatactctatttgataagcacaggtttgtcgccagaatggacttagcg
gccaatattgttgataaaaatgatattgacaatattccaccatcgttacgttatttcgcc
ggtggcgaccaaagtatacggggttacagttatcaagaattagggccttatattgactat
atcaacagcgaaggaggcttatctcgacaggtcgtcggcggacgctatttagccattggt
agtgtagaatatcaatactatctcactccaacctggcgcgtcgcgacctttgtcgatgct
ggcaatgcttttgatactcagcaatttgaacctgttgtatctgttggcggtggagtgcac
tggatatcacccattggtccaattagaatggacttaggttttggcttaaaagaaaccgag
acggtcgcacgttcatatcgtttccatttaaccatgggaacagatttatga
DBGET
integrated database retrieval system