Candidatus Profftella armatura: SSDC_01325
Help
Entry
SSDC_01325 CDS
T02777
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
ssdc
Candidatus Profftella armatura
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssdc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
ssdc03032
]
SSDC_01325 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ssdc03400
]
SSDC_01325 (gyrA)
Enzymes [BR:
ssdc01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SSDC_01325 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
ssdc03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SSDC_01325 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
ssdc03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SSDC_01325 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGS06954
UniProt:
S5R407
LinkDB
All DBs
Position
328433..331042
Genome browser
AA seq
869 aa
AA seq
DB search
MNQFAKEVISILLEEEMCKSYLDYAMSVIVGRALPDVRDGLKPVHRRVLFAMHEMNNLWN
RPFVKCARVVGETMGKYHPHGDVSIYDALVRMAQSFSLRCTLVDGQGNFGSIDGDSAAAM
RYTECRLNKISNELLIDLDKETINFISNYDGKEKEPSVLPTRIPNLLINGSSGIAVGMAT
NIPPHNLTEVIDGVLYVLHNPECSINDLIKIIPAPDFPTAGIIYGLSSVHDGYYTGKGRV
IIRAKTHIEEFNRENRTAIIIDELPYQVNKKSLLEKISQLVKEKKLECISNLRDESDKSG
MRIVIELKRNEIPEIVLNKLYKQTQLQNTFGMNMLALVNGQPKLLNLKEILYYFILHRKE
VIKRRTIFELRKAREYAHILEGLTIALTNIDNFIQIIRSTSTPQEAKNKIIESTWNLPDV
SKIIGFNKKNYNTISKINNISKLQNNDMYKLSDIQAQEILKMPLQRLTNMEQKKIINKYE
NVIKKVIDLTDILSNSKRIIEIITDELNIIKNKYGSHKKNIRRSEIILNAINPSTEDLIA
SQDMVITLSNLGYIKSQPISEYRAQKRGGRGKKAMMTKDEDWINQLFIANTHDYILCFSN
YGRLYWLKVWQIPQGSRNSRGKPIINMFSLKNKEKITVILPLSNNKRDFPKNNYVFMSTS
LGIVKKTLLSNFSNPRKSGIIAVNLSNEDFLIGAALTDGSYDIMLFSDSGKAVRFNENSV
RAMGRSARGVIGMRLEKKQKVIALLVSNNQKQSVLTATENGYGKRTLIKEYTKHNRGTKG
IISIKTNKRNGKVVAATLVNRYHEIMLITTGGILIRTRVSEIRKMGRSTQGVILITVENK
SKLCGVQRVMENDIKDNKNNSICNKNNNI
NT seq
2610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcaatttgctaaagaagtaatttctattttacttgaagaggaaatgtgtaaaagt
tatcttgattatgcgatgagtgtaattgttgggagagcattaccagatgtgcgggatgga
ttaaaaccagttcatagacgtgtattatttgctatgcatgaaatgaataatttatggaat
cgtccttttgtaaaatgtgcacgagttgttggggaaactatgggaaaataccatcctcat
ggtgatgtatcaatttatgatgctttagtaagaatggcacaatcattttctttacgttgc
acattagtagatggacaaggtaattttggttctatagatggggatagtgctgcggcaatg
cgttatactgaatgtcgtttaaataaaatttctaatgaattacttattgatttagataaa
gaaactattaattttatttcaaattatgatggaaaagaaaaagaaccatctgtattacca
acacgtattccaaatttactaataaatggttcttctggtattgctgttggtatggcgact
aacatacctcctcataatttaacagaagttattgatggtgtattatatgttttacataat
ccagaatgctcaattaatgatttaatcaagataattccagctcctgattttccaacagca
ggtattatttatggattatctagtgttcatgatggctattatactggaaaaggtcgtgta
ataatacgagccaaaactcatatagaagaatttaatagagaaaatcgcacagcaattatt
attgatgaacttccatatcaagttaataaaaaatcattattagaaaaaatttctcaatta
gttaaggaaaaaaaattagaatgtatttctaatttacgagatgaatcagataaatctggg
atgcgtatagttattgaattgaagagaaatgaaataccagaaatagtattaaataaatta
tataaacaaactcagttacaaaatacctttggtatgaatatgttagcattagttaatgga
cagcctaaattattaaacctaaaagaaatactttattattttattttacatcgtaaagaa
gtaataaaacgaaggactatttttgaattacgtaaagcgcgtgagtacgctcatattcta
gaaggattaacgatagcattaacaaacattgataattttatacagattattcgttcaaca
tccacacctcaagaagcgaaaaataaaattattgaatctacatggaatttacctgatgtt
agtaaaataattggttttaataaaaaaaattataatactatttcaaaaattaataacata
tctaaattacaaaataatgatatgtataaattatctgatatacaggctcaagaaatttta
aagatgcctttacaacgtttaactaatatggaacaaaaaaaaataattaataaatatgaa
aacgttataaaaaaagttatagatttaacagatatattatctaattcaaaacgaattata
gaaataattactgatgaactaaatataattaaaaataaatatggaagccataaaaaaaat
atacggcgctctgaaataattttaaatgccataaatcctagtacggaagatttaattgca
tctcaagatatggtaattacattatcaaatttaggatatatcaaatctcaaccaatttct
gaatatcgcgcacaaaaacgaggaggtagaggaaaaaaagccatgatgacaaaagatgaa
gattggattaatcaactatttatagctaatacacatgattatatcttatgtttttctaat
tatggtagattatattggctaaaggtttggcaaatccctcagggatctcgaaattcacga
ggtaaaccaattattaacatgttttcattaaaaaataaagaaaaaattactgtaatttta
cctttatctaataataaacgtgattttccaaaaaataattatgtttttatgtcaactagt
ctaggtattgttaaaaaaactttattgtcaaattttagtaatccacgtaaatctggaatt
attgctgttaatttaagtaatgaggattttttaattggagcagcattaactgatggtagt
tatgatattatgcttttttcggattctggtaaagcagtacgttttaatgaaaattctgta
cgagcaatgggacgctcggctcggggagttataggtatgaggctagaaaagaaacaaaaa
gttatagccttattagtctcaaataatcaaaaacaatcagttttaactgcaaccgaaaat
ggttatggtaaacgtacgttaataaaagaatacacaaaacacaatagaggtactaaagga
ataatttcaattaaaactaataaacgaaatgggaaagttgtagcggcaacattggttaat
aggtatcatgaaattatgttaattacaactggaggtattcttatacgcacacgtgtttca
gaaattcgtaaaatgggaagatctactcaaggagttattttaataactgttgaaaataaa
tctaaattatgtggagtacaacgtgtaatggaaaacgatattaaagataataaaaataat
agcatatgtaataaaaataataacatataa
DBGET
integrated database retrieval system