Tenacibaculum mesophilum: F9Y86_01425
Help
Entry
F9Y86_01425 CDS
T06242
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug domain-containing protein
KO
K16091
Fe(3+) dicitrate transport protein
Organism
tmp
Tenacibaculum mesophilum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tmp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tmp02000
]
F9Y86_01425
Transporters [BR:
tmp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
F9Y86_01425
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
CooC_C
DUF5901
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFS27132
LinkDB
All DBs
Position
complement(302846..305338)
Genome browser
AA seq
830 aa
AA seq
DB search
MKSKLKACSIIFTLFLAVQTVVAQYTISGKIIDEKGNPINNVEVFDASGGKLAISDAQGN
YKTQPLQSGNYSLVFFSYNFEIKEHALTITNKNIVENITLLKLDEELSEVIINQRLRKVF
SLKRLKAVEGTAIYEGKKTEVVLLDQTVGNKAANNARQIYSQVVGLNIYENDDAGLQLNI
GGRGLDPNRTSNFNTRQNGYDISADVLGYPESYYTPPAEALQEIQIVRGAASLQYGTQFG
GLLNFKFNEPNKSKEFEFITRQSTGSFGLFNSFNSVGGTVDKTGYYGYINYKRGDGFRPN
SEFNSINIYGHVDHKLSEKTTLTVEATYLNYLAKQAGGLNDKMFNEDPFQSNRSRNWFRV
NWNLWTVKLDHNFTEDTRLSVNLFGLNASRKAIGFRGNYKSSNVSPITYVDEPFADGNYA
TRDLINGQYKNWGTEIRFLSNYDFRGQKNTYLLGVKYYKANNSEEQGAGSNGVDANFTFA
DVDAYASSNFKFPNTNVALFGEHIFKLSDKFSITPGFRLEYIKTGSNGDYKTVLWNNEDL
QNGVPLPNGINTFRDDRTKERSFALFGIGASYKPSTKLEIYANASQNYRSVTFNDIRTVS
PTFKVDENIDDEEGGTADIGIRGKIKNIVTYDLSGFGLFYNKRIGIFWVSSGPDAGDRLR
TNVGDAFIYGFEGFTDVSLANVFKLPSNYVLNTYVNLALTQSEYTDSLEKSVIGNQVEFI
PNLNLKTGVKFGYKNFLSSLQLTHLSEQQTDATHATVDSTHPSYGTIGPIPAYTIVDASF
SYSYKKWKLETGVNNLLDEKYFTRRATGYPGPGIIPSSPRNWYVTLQFKI
NT seq
2493 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcaaaattaaaggcctgtagcattatttttaccttatttttagctgtgcaaaca
gtagtagcacaatataccatttcaggaaaaataattgatgaaaaaggaaaccctattaat
aatgttgaagtttttgatgcttcaggcggaaagttagcaatatcagatgctcaaggaaat
tataaaacccaaccattgcaatcaggaaactattcattggtattcttttcttacaatttc
gaaataaaagaacatgcactaactattacaaataaaaatattgtagaaaacataacactt
ttaaagttagatgaagaattatcagaagtaattatcaatcaaagactaagaaaagtattt
agtttaaaaagattaaaagcagtagaaggaactgccatttacgaaggaaaaaaaacagag
gtagttttattagaccaaacagtaggaaacaaagcagctaataacgcacgccaaatatac
agtcaagtagttggactcaatatttacgaaaatgacgatgcaggattacagttaaatatt
ggaggtagaggcttggatcctaacagaacatcaaactttaatacacgacaaaacggttac
gacattagtgcagatgtattaggatatccagaaagctattatacacccccagcagaggcc
ttgcaagaaatacaaattgttagaggagctgcatcattacaatacggaacacaatttgga
ggcttattaaattttaaatttaatgaacctaataagagtaaagaatttgagttcataaca
agacaatctacaggatctttcggtcttttcaattcttttaacagtgttggaggtacagtt
gataaaacaggttattacggttacataaattataaacgaggagatggttttagaccaaat
tcagaatttaattcaataaatatttatggtcatgtagatcataaactatcagaaaaaaca
actttaacagtagaggcaacatatttaaattatttagctaaacaagcaggagggttaaat
gataaaatgtttaatgaagatccttttcaaagtaacagatcaagaaactggtttcgtgta
aactggaatttgtggacggtaaaactagaccataattttacagaagacacgcgcctaagt
gttaacttatttgggttaaatgcttcgagaaaagccatagggtttagaggaaattataaa
tcaagtaatgtaagtcctataacgtatgtagatgaaccttttgcagatggaaattatgct
acgagagatttaattaacggacaatataaaaactggggaacagaaattcgctttttatca
aactatgattttagagggcaaaagaatacttacttattgggtgtaaaatattacaaagca
aataattcagaagaacaaggagcaggatctaatggtgtagatgcaaactttacatttgca
gatgtagatgcctatgcctcatctaattttaaattccccaatacgaacgtagcattattt
ggagaacatatttttaaactatcagataaattttcaataactcctggatttagattagaa
tacataaaaacaggaagtaacggagattataaaacagtattgtggaataatgaagatcta
caaaacggagtgccgttacctaacggaattaatacgtttagagacgatagaacaaaagaa
agaagctttgctttatttggtattggagcaagttataaaccctcgacaaagttagaaatt
tatgcaaatgcttctcaaaactaccgttcagtaacctttaatgacatccgtacggtaagt
cctacttttaaagtagatgaaaacatagatgatgaagaaggaggcacagcagatattgga
ataagaggaaaaattaaaaacatagtaacctacgacctaagcggatttggactattttac
aacaaaagaatcggaattttttgggtaagtagcggacccgatgcaggagacaggttaaga
actaatgtaggagacgcttttatttatggttttgaaggttttacagatgttagtttggca
aatgtatttaagttgccatcaaactacgtgctaaatacctatgtaaacctagcgttaaca
caatcagaatatacagattcattagaaaaatcagtaataggaaatcaagtagagtttata
ccgaacctaaacttaaaaacaggagtgaagtttggatataaaaactttttaagtagctta
cagttaacgcatttgtctgagcaacaaacagatgctacacatgcaacagtagatagcaca
catcctagttacggaacaataggtcctataccagcatatacaattgtagatgcttctttt
tcatattcgtataaaaaatggaagctagaaacaggagttaacaacctgttagacgaaaaa
tactttacacgtagggcaacaggatatcctggaccaggtattataccatcatctcctaga
aactggtatgtaacattacagttcaagatttaa
DBGET
integrated database retrieval system