Trichomonas vaginalis: 4746882
Help
Entry
4746882 CDS
T01022
Symbol
TVAGG3_0293850
Name
(RefSeq) nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
KO
K12604
CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
tva
Trichomonas vaginalis
Pathway
tva03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tva00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
4746882 (TVAGG3_0293850)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
tva03019
]
4746882 (TVAGG3_0293850)
Messenger RNA biogenesis [BR:
tva03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
mRNA cycle factors
P-body specific factors
4746882 (TVAGG3_0293850)
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ccr4-NOT complex
4746882 (TVAGG3_0293850)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Not1
CNOT1_CAF1_bind
CNOT1_TTP_bind
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
4746882
NCBI-ProteinID:
XP_001302143
UniProt:
A2G0U7
LinkDB
All DBs
Position
V:complement(7263424..7268829)
Genome browser
AA seq
1801 aa
AA seq
DB search
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L
NT seq
5406 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
