KEGG   Vanderwaltozyma polyspora: Kpol_1028p15
Entry
Kpol_1028p15      CDS       T01049                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
vpo  Vanderwaltozyma polyspora
Pathway
vpo03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vpo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    Kpol_1028p15
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:vpo03019]
    Kpol_1028p15
Messenger RNA biogenesis [BR:vpo03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     Kpol_1028p15
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     Kpol_1028p15
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind CNOT1_HEAT_N CNOT1_TTP_bind DUF3819
Other DBs
NCBI-GeneID: 5547055
NCBI-ProteinID: XP_001646600
UniProt: A7TFY5
LinkDB
AA seq 2019 aa
METSTAQISDENNTPGFLIMDTFEEESQRIVLAQICLFMVKLDKNNYEQFKLKIDYLLEK
SNIEVYYKYWKKLLQLTAIDLNKNDKKLKELVDIPLLRLLYNTFMELPYKDVDVILFLNQ
NILNDKSLKIVCDCNLSDIINRFDTYSDSKILDSLNIIQNSKQYADKLPIISDPYKYLRY
FFDNTTSETFSFDLATFLYNNNTMEVADILALLITEIITSGSLDIVPKDNSWLIPRTIKA
SRILSTDFSKVISFISLGLKVDWNRIFNLMSTKYLDRTATPPTIFALNFILNLLGDGKLI
EKFLYHDWQIDFKFNIVFNLQELSSHKDSFDFSNLKNIIKIPFDEDSQRNPLLNINSINC
INVQLYLIQKEIKDSKLKKNYFIKVKQDMNIYPEIFSWVICSNKKFLENSIENINEKGKL
HLDLLYKSLKKESDALSLVLKDSNEPEIISLLGNKIISSDPTLLNVFLNILDKHKLLSQY
LMEINIDTIFKVLEYSDNENIDTIFDILFNINQNRKDEFFNYITSNLKSGKYENINPYIT
YRLLKLSKNRELSKEEDKFNSIRFSIIEKCPSAIICSSQFKNNKLKSLASEKLEDIEHKV
QLSFQSLYKGEITVDRLADFLLTLKESDQIEDEYKFSLYIQTIFSERLYFKQYPTQALHI
TSVLFGLMIKLNMLEDFLLDMAFIMLLEYVNDNEPQLFQFSVMAIEVFVTQLQSYPGFCS
QLMSSNSFMNSNSSVSQYISKISENKSSNMKTSTKDANSIPEHIQIHNFGVPNDPELMNQ
VIPPNATKDKIYFTMNNLTEENIDIEIKKIAVEVNENYFKWFAQYLLFERVLKEPNNQKI
YSLITTKINTDIFGYMQYFTLKLLHNLISTKDIEKIDKSILKNASLWLGKITLGNNIPLD
NPRFSIFRIILDGYTSNRLEIVIPFVTKIMASTADSIIFKFPNPWTLKILQLLKEMHQRS
ELSLTLSFEIEILFKALGLDLEDIGNSEYLIEHCKLKESCDIEMGATTVSNKLNTKMSNL
DLNIDNFNKAQQHIVDNMSSIKINTSGLSQLTLDISLKNVFEMSILNFSDPRSSKIVQHM
SEAVVSATMNNLSNILNSSTEYNEIIRVALKLSESMFDANIRGDIRDIIYSEIWGFLQGN
LVKTKLNIYFDLQKEFQLAMSQNYSLIMAIFRRSVLDLSIIEIRNKIENHLNISRLNGIY
GQGNSFNSTYGKSSTSIQLPIPNLSNIPRFPNMPVIQNNTNSMPPGLAPSLNNNSHPMQF
TYNGSPQYPPGLLISPAPINTEKIASVPNQLIHNQDMHILTTSINSLGIFLEALNAKNGE
QIPDLENSIKSVMFHICSFLKINEGNIQYTLETIKSILNLLTRYLHNRESQKILFGFLKD
VSLQNRSLSYFVFIWFDNAQFDFKNKSHILIELLNSSLISILEIDQYLSMKIKSCKFGII
ENIFVLIEKICLSNSTFSFYSDFSKTISSLIVIEDPKVKKFLEDYDNLCSTSKIVKTLTK
KELMWTIFIEWVNITEKEEFDSEIASIFLMQLVQKNVLNTSNNFIDFIKYSMELSIITFS
KTGNNDKAFLLIDALSYLIFQLYQSLDYDKFTRESYLELVLTTLSLQLVKDINTLNENFN
ERLYFRLISNILSLWGNNYETTTFTSDNRDTEVKEIEKLGYLKIIYSFINLIQPLAYPAF
AFSYLSLISHRMYLSSLLLYPDHKCWDMVNVHLLSIIDFLKHSSEQKPVMELSNVYYFGL
LRILLSIINDCPEYIIENHSALISRIPDKLIQIKNIISSTTPKQLDYVSPTSEIDFTTEI
NSFSGILIKDKELYTNLVLKKHVRNYLRIPTSSLIKSINKELLSKVYNEHSGIGYKWFTV
DICRVGELVLQILVDIGKESKNVSLKTIFSKKGSHFQLLKNLIDTNNDETQYFIIKTLFD
YLRYPNVQTNWVVFFLLKIFTEGNGDEKSLKIREMIIRCLIERLIVFPPYPWGCVALLNQ
IYLANSSLLLQIPSLENNLILKNMVIQIIYKFTNQISDN
NT seq 6060 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagactagtacagcgcaaattagtgatgagaataatacaccaggtttcctaattatg
gacacctttgaagaagaatctcagagaattgttttggcacagatatgcttatttatggtt
aaattagataagaataattatgaacaatttaaacttaagatcgattacttgttagaaaag
tcaaatattgaagtttattataaatattggaagaaattattacaattgactgctatagat
ctaaataaaaatgacaagaagcttaaagaacttgttgatattcctctacttagattgtta
tacaatacttttatggaattgccctataaggatgtagatgtcatattatttttgaatcaa
aatatacttaatgataagtcattgaaaatagtctgtgattgcaatctctctgatatcata
aatcgattcgatacttatagtgatagtaaaatattggattcactgaatataattcaaaat
tcaaagcaatatgctgataaattaccaattatatcggatccatataaatatttgagatac
ttttttgataataccacttctgaaacgttctcatttgacttggctactttcttatataac
aataacactatggaagttgctgatatattagcattacttataactgaaattattacaagc
ggttcattggatattgttccaaaagataatagttggttaatccctagaactattaaagca
tcaagaatactgagtactgatttttcaaaggtaattagtttcatttcactaggtctaaaa
gtagattggaatagaatcttcaatctaatgtcaacaaagtacctagatagaacagcaaca
cctccaacaatttttgcattgaatttcattctaaatctattaggtgatggtaaactcatt
gaaaagttcttatatcatgattggcaaattgattttaaatttaatattgtattcaattta
caggaactatcctctcataaagatagctttgacttctcaaatttgaaaaacattatcaag
atcccatttgatgaagattcacaaagaaatccacttttaaatataaattcaatcaactgc
ataaatgtccagctttaccttattcaaaaagaaattaaagattccaagttaaaaaagaat
tatttcatcaaagtaaagcaagatatgaatatatatccagaaatattttcctgggtaatc
tgctcaaataaaaaattccttgaaaactcgattgaaaatatcaacgaaaaggggaaacta
caccttgatctattgtacaaatctttgaaaaaagaatctgatgctttatcattagttttg
aaagattctaatgaaccagaaataatatcattattaggaaataaaataataagtagtgac
cctacgctgttaaatgtatttttgaacatacttgataaacataaattattatcacaatat
ttaatggaaattaatattgatacaatatttaaggttttggagtacagtgacaatgaaaat
atcgatacaatttttgacatattattcaatattaatcaaaatagaaaagatgaatttttt
aactatatcacctcaaacttgaaaagtggaaagtatgaaaatatcaatccttatattact
tacagattactaaaactttctaaaaatcgagaactctctaaggaagaagacaaatttaac
tcaattcgatttagcatcatcgaaaaatgtccatctgctattatttgttcaagtcaattt
aagaataacaaattaaaaagtttagcatcagaaaaattggaagatatcgaacacaaagta
cagctgtccttccagtctctttataaaggagagataacagtcgatagactggctgatttt
ttacttaccttaaaggaaagtgatcaaatagaagatgaatataaattttcattatacatt
caaacaatattctctgaaagattatactttaaacaatacccaactcaagctctccatata
acatcggtattatttggcttaatgataaaactgaatatgttggaagatttcctattggat
atggcgtttatcatgttattagaatatgtaaatgacaatgagcctcaattattccagttt
tcggttatggcaattgaagtatttgttacccaattgcaatcatatcctggcttctgtagc
caactaatgtccagcaactcatttatgaattctaactcaagtgtctctcagtatatttcg
aaaatctcagaaaacaagtcaagtaatatgaaaacatctacaaaagatgctaattcgatt
cctgaacatatacaaatacataattttggtgttccaaatgatcctgaattaatgaaccaa
gttatacctccaaatgctacaaaggataaaatatactttacaatgaataacttaactgaa
gaaaatattgacattgaaataaagaaaatagcagtagaagttaatgaaaactattttaaa
tggtttgcacaatatttactttttgaacgtgtattaaaagaacctaataaccaaaaaatt
tactctttaataactactaagataaatacagacatttttggatatatgcaatatttcact
ttgaaattattgcataatttgatatcgacaaaggatattgagaagatagacaagagtatc
cttaaaaatgcttcattgtggttaggtaaaataacactaggaaataatattcctctcgat
aatccaagattttctatatttagaattattttggatggatatacaagtaataggttggaa
attgttataccatttgtaacaaaaataatggcaagcactgcagattccattatatttaaa
tttccaaatccatggaccctaaagatccttcaattactaaaggaaatgcatcaaagatcg
gaattatcactaaccctaagctttgaaattgaaatattattcaaagccttgggtttagac
ttagaggatattggaaattcagaatatttgattgaacattgtaaactaaaggagagttgt
gatattgaaatgggcgcaactactgtcagtaataagttgaatacgaaaatgtccaatttg
gatttaaacattgataattttaataaggctcaacaacatattgtcgataatatgtcttca
attaagattaacacatcaggtctctctcaattaacattggatatttcattgaaaaatgta
tttgaaatgtctattttaaacttcagtgatccaaggtcatcgaaaattgttcaacacatg
tcagaagctgttgtgtctgcaacaatgaataacttgagtaatattttgaattcatctaca
gaatataatgaaatcattagagtagcattaaaattatcagaatccatgtttgatgctaat
attcgtggagatattagagatataatatattctgaaatatggggctttctacagggcaat
ttagtcaaaactaagctaaatatatactttgacttgcaaaaggaatttcaacttgctatg
tctcaaaactattcattaataatggcaatttttcggaggtctgtcttagacttatccata
attgaaataaggaacaagattgaaaatcatctaaacatcagcagattaaatggtatttat
ggacaaggtaattcatttaatagtacttatggtaaatcctctacgtccattcaattgcca
attccaaatctttcaaatattccaagatttccaaatatgccagtgattcaaaataataca
aattccatgccgcctggcttagccccatcattgaataacaatagtcatccaatgcaattc
acttataatggaagtcctcagtatccacctggactactaatctcacctgctccaattaat
actgaaaaaattgcatcagtaccaaatcagttaattcataatcaagatatgcatattttg
acaacttcaatcaattcattaggaatttttcttgaagctttgaatgccaaaaatggtgaa
caaatacccgacctggagaattcaattaaaagtgtcatgtttcatatttgttcattttta
aaaattaatgaagggaatattcaatatactttagaaacaataaaaagcatattgaattta
ttaacaagatatttacataatcgagaatctcaaaagattttgtttggatttctaaaagat
gtttcactacaaaataggtcactaagctattttgtatttatatggtttgacaatgctcaa
tttgatttcaagaataaatctcatatattaattgagctattaaatagtagcttaatttca
atacttgaaattgatcaatatctttcaatgaagattaaatcatgcaagtttgggattatt
gaaaatatatttgtattgatagagaaaatatgtctatcaaattccacattctctttctac
agtgatttttcaaaaacaatcagttctttaatagtcattgaagatcctaaagtcaagaaa
tttcttgaagattatgataatttatgttctacttctaaaatagttaaaactttaaccaaa
aaggagctaatgtggacaatatttattgaatgggtaaatattactgaaaaagaagaattt
gatagtgaaattgcaagtatatttttgatgcaattagttcaaaaaaatgtattaaatacc
agtaataattttattgattttattaaatacagcatggaattgagcataattacattttct
aaaaccggtaataatgataaagcatttttattaattgatgccctatcctacttgatattt
caattatatcaatcgttagattatgataaatttaccagagaatcatacctagaacttgta
ttgaccacactaagtcttcagttggtcaaagatattaatactttaaatgaaaactttaat
gaaagattatatttccgtcttatttcaaatattctttctttatggggaaacaattacgag
actactacatttacatctgataatagagataccgaagtaaaagaaatcgagaaattggga
tacctaaagattatttattcctttattaatttgattcagccattagcatatccagcgttt
gcattctcttatctctcgttgatttctcatagaatgtatttgtctagtttattattatat
ccggatcataaatgctgggatatggtaaatgtccatttactaagcatcattgatttttta
aagcattcttcagaacagaaacctgttatggaactgtcgaatgtatattacttcggttta
ttaagaattttgttaagcatcatcaatgattgtccggaatacataattgaaaaccactct
gctttaatatctagaattccagataagttaattcagataaagaatattatatcctcaaca
acgccaaagcaacttgattatgttagccctacaagtgaaattgatttcactactgaaata
aattcatttagtggtatattaattaaagataaggaactatacactaacctggtactgaag
aaacatgttcgcaactatttgaggatacctactagttcattaataaagtctattaataag
gaattactgtcaaaggtatacaacgaacattctggtatcggctataagtggttcacagta
gatatttgcagagtaggagaattggtgttacaaattcttgttgatattggtaaagaaagt
aaaaatgtttctctaaaaactatttttagcaaaaagggatcacacttccaattactgaag
aacttgattgatactaacaatgatgaaacacagtactttattatcaagacattgtttgac
tatttgaggtatccaaatgtccaaacaaactgggttgttttcttcttattgaaaatattt
actgaaggtaatggggatgaaaaatcattaaaaattcgagagatgattattagatgtctg
atcgaaagattgatagtattcccaccatatccatgggggtgcgtcgctttattgaatcaa
atatatttagcaaatagttctttgttgctacaaatcccatccttggaaaacaatcttata
ttaaagaatatggtaatccaaatcatttacaaattcacaaaccaaatttctgataactga

DBGET integrated database retrieval system