Vanderwaltozyma polyspora: Kpol_1028p15
Help
Entry
Kpol_1028p15 CDS
T01049
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K12604
CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
vpo
Vanderwaltozyma polyspora
Pathway
vpo03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vpo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
Kpol_1028p15
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
vpo03019
]
Kpol_1028p15
Messenger RNA biogenesis [BR:
vpo03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
mRNA cycle factors
P-body specific factors
Kpol_1028p15
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ccr4-NOT complex
Kpol_1028p15
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Not1
CNOT1_CAF1_bind
CNOT1_HEAT_N
CNOT1_TTP_bind
DUF3819
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5547055
NCBI-ProteinID:
XP_001646600
UniProt:
A7TFY5
LinkDB
All DBs
AA seq
2019 aa
AA seq
DB search
METSTAQISDENNTPGFLIMDTFEEESQRIVLAQICLFMVKLDKNNYEQFKLKIDYLLEK
SNIEVYYKYWKKLLQLTAIDLNKNDKKLKELVDIPLLRLLYNTFMELPYKDVDVILFLNQ
NILNDKSLKIVCDCNLSDIINRFDTYSDSKILDSLNIIQNSKQYADKLPIISDPYKYLRY
FFDNTTSETFSFDLATFLYNNNTMEVADILALLITEIITSGSLDIVPKDNSWLIPRTIKA
SRILSTDFSKVISFISLGLKVDWNRIFNLMSTKYLDRTATPPTIFALNFILNLLGDGKLI
EKFLYHDWQIDFKFNIVFNLQELSSHKDSFDFSNLKNIIKIPFDEDSQRNPLLNINSINC
INVQLYLIQKEIKDSKLKKNYFIKVKQDMNIYPEIFSWVICSNKKFLENSIENINEKGKL
HLDLLYKSLKKESDALSLVLKDSNEPEIISLLGNKIISSDPTLLNVFLNILDKHKLLSQY
LMEINIDTIFKVLEYSDNENIDTIFDILFNINQNRKDEFFNYITSNLKSGKYENINPYIT
YRLLKLSKNRELSKEEDKFNSIRFSIIEKCPSAIICSSQFKNNKLKSLASEKLEDIEHKV
QLSFQSLYKGEITVDRLADFLLTLKESDQIEDEYKFSLYIQTIFSERLYFKQYPTQALHI
TSVLFGLMIKLNMLEDFLLDMAFIMLLEYVNDNEPQLFQFSVMAIEVFVTQLQSYPGFCS
QLMSSNSFMNSNSSVSQYISKISENKSSNMKTSTKDANSIPEHIQIHNFGVPNDPELMNQ
VIPPNATKDKIYFTMNNLTEENIDIEIKKIAVEVNENYFKWFAQYLLFERVLKEPNNQKI
YSLITTKINTDIFGYMQYFTLKLLHNLISTKDIEKIDKSILKNASLWLGKITLGNNIPLD
NPRFSIFRIILDGYTSNRLEIVIPFVTKIMASTADSIIFKFPNPWTLKILQLLKEMHQRS
ELSLTLSFEIEILFKALGLDLEDIGNSEYLIEHCKLKESCDIEMGATTVSNKLNTKMSNL
DLNIDNFNKAQQHIVDNMSSIKINTSGLSQLTLDISLKNVFEMSILNFSDPRSSKIVQHM
SEAVVSATMNNLSNILNSSTEYNEIIRVALKLSESMFDANIRGDIRDIIYSEIWGFLQGN
LVKTKLNIYFDLQKEFQLAMSQNYSLIMAIFRRSVLDLSIIEIRNKIENHLNISRLNGIY
GQGNSFNSTYGKSSTSIQLPIPNLSNIPRFPNMPVIQNNTNSMPPGLAPSLNNNSHPMQF
TYNGSPQYPPGLLISPAPINTEKIASVPNQLIHNQDMHILTTSINSLGIFLEALNAKNGE
QIPDLENSIKSVMFHICSFLKINEGNIQYTLETIKSILNLLTRYLHNRESQKILFGFLKD
VSLQNRSLSYFVFIWFDNAQFDFKNKSHILIELLNSSLISILEIDQYLSMKIKSCKFGII
ENIFVLIEKICLSNSTFSFYSDFSKTISSLIVIEDPKVKKFLEDYDNLCSTSKIVKTLTK
KELMWTIFIEWVNITEKEEFDSEIASIFLMQLVQKNVLNTSNNFIDFIKYSMELSIITFS
KTGNNDKAFLLIDALSYLIFQLYQSLDYDKFTRESYLELVLTTLSLQLVKDINTLNENFN
ERLYFRLISNILSLWGNNYETTTFTSDNRDTEVKEIEKLGYLKIIYSFINLIQPLAYPAF
AFSYLSLISHRMYLSSLLLYPDHKCWDMVNVHLLSIIDFLKHSSEQKPVMELSNVYYFGL
LRILLSIINDCPEYIIENHSALISRIPDKLIQIKNIISSTTPKQLDYVSPTSEIDFTTEI
NSFSGILIKDKELYTNLVLKKHVRNYLRIPTSSLIKSINKELLSKVYNEHSGIGYKWFTV
DICRVGELVLQILVDIGKESKNVSLKTIFSKKGSHFQLLKNLIDTNNDETQYFIIKTLFD
YLRYPNVQTNWVVFFLLKIFTEGNGDEKSLKIREMIIRCLIERLIVFPPYPWGCVALLNQ
IYLANSSLLLQIPSLENNLILKNMVIQIIYKFTNQISDN
NT seq
6060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagactagtacagcgcaaattagtgatgagaataatacaccaggtttcctaattatg
gacacctttgaagaagaatctcagagaattgttttggcacagatatgcttatttatggtt
aaattagataagaataattatgaacaatttaaacttaagatcgattacttgttagaaaag
tcaaatattgaagtttattataaatattggaagaaattattacaattgactgctatagat
ctaaataaaaatgacaagaagcttaaagaacttgttgatattcctctacttagattgtta
tacaatacttttatggaattgccctataaggatgtagatgtcatattatttttgaatcaa
aatatacttaatgataagtcattgaaaatagtctgtgattgcaatctctctgatatcata
aatcgattcgatacttatagtgatagtaaaatattggattcactgaatataattcaaaat
tcaaagcaatatgctgataaattaccaattatatcggatccatataaatatttgagatac
ttttttgataataccacttctgaaacgttctcatttgacttggctactttcttatataac
aataacactatggaagttgctgatatattagcattacttataactgaaattattacaagc
ggttcattggatattgttccaaaagataatagttggttaatccctagaactattaaagca
tcaagaatactgagtactgatttttcaaaggtaattagtttcatttcactaggtctaaaa
gtagattggaatagaatcttcaatctaatgtcaacaaagtacctagatagaacagcaaca
cctccaacaatttttgcattgaatttcattctaaatctattaggtgatggtaaactcatt
gaaaagttcttatatcatgattggcaaattgattttaaatttaatattgtattcaattta
caggaactatcctctcataaagatagctttgacttctcaaatttgaaaaacattatcaag
atcccatttgatgaagattcacaaagaaatccacttttaaatataaattcaatcaactgc
ataaatgtccagctttaccttattcaaaaagaaattaaagattccaagttaaaaaagaat
tatttcatcaaagtaaagcaagatatgaatatatatccagaaatattttcctgggtaatc
tgctcaaataaaaaattccttgaaaactcgattgaaaatatcaacgaaaaggggaaacta
caccttgatctattgtacaaatctttgaaaaaagaatctgatgctttatcattagttttg
aaagattctaatgaaccagaaataatatcattattaggaaataaaataataagtagtgac
cctacgctgttaaatgtatttttgaacatacttgataaacataaattattatcacaatat
ttaatggaaattaatattgatacaatatttaaggttttggagtacagtgacaatgaaaat
atcgatacaatttttgacatattattcaatattaatcaaaatagaaaagatgaatttttt
aactatatcacctcaaacttgaaaagtggaaagtatgaaaatatcaatccttatattact
tacagattactaaaactttctaaaaatcgagaactctctaaggaagaagacaaatttaac
tcaattcgatttagcatcatcgaaaaatgtccatctgctattatttgttcaagtcaattt
aagaataacaaattaaaaagtttagcatcagaaaaattggaagatatcgaacacaaagta
cagctgtccttccagtctctttataaaggagagataacagtcgatagactggctgatttt
ttacttaccttaaaggaaagtgatcaaatagaagatgaatataaattttcattatacatt
caaacaatattctctgaaagattatactttaaacaatacccaactcaagctctccatata
acatcggtattatttggcttaatgataaaactgaatatgttggaagatttcctattggat
atggcgtttatcatgttattagaatatgtaaatgacaatgagcctcaattattccagttt
tcggttatggcaattgaagtatttgttacccaattgcaatcatatcctggcttctgtagc
caactaatgtccagcaactcatttatgaattctaactcaagtgtctctcagtatatttcg
aaaatctcagaaaacaagtcaagtaatatgaaaacatctacaaaagatgctaattcgatt
cctgaacatatacaaatacataattttggtgttccaaatgatcctgaattaatgaaccaa
gttatacctccaaatgctacaaaggataaaatatactttacaatgaataacttaactgaa
gaaaatattgacattgaaataaagaaaatagcagtagaagttaatgaaaactattttaaa
tggtttgcacaatatttactttttgaacgtgtattaaaagaacctaataaccaaaaaatt
tactctttaataactactaagataaatacagacatttttggatatatgcaatatttcact
ttgaaattattgcataatttgatatcgacaaaggatattgagaagatagacaagagtatc
cttaaaaatgcttcattgtggttaggtaaaataacactaggaaataatattcctctcgat
aatccaagattttctatatttagaattattttggatggatatacaagtaataggttggaa
attgttataccatttgtaacaaaaataatggcaagcactgcagattccattatatttaaa
tttccaaatccatggaccctaaagatccttcaattactaaaggaaatgcatcaaagatcg
gaattatcactaaccctaagctttgaaattgaaatattattcaaagccttgggtttagac
ttagaggatattggaaattcagaatatttgattgaacattgtaaactaaaggagagttgt
gatattgaaatgggcgcaactactgtcagtaataagttgaatacgaaaatgtccaatttg
gatttaaacattgataattttaataaggctcaacaacatattgtcgataatatgtcttca
attaagattaacacatcaggtctctctcaattaacattggatatttcattgaaaaatgta
tttgaaatgtctattttaaacttcagtgatccaaggtcatcgaaaattgttcaacacatg
tcagaagctgttgtgtctgcaacaatgaataacttgagtaatattttgaattcatctaca
gaatataatgaaatcattagagtagcattaaaattatcagaatccatgtttgatgctaat
attcgtggagatattagagatataatatattctgaaatatggggctttctacagggcaat
ttagtcaaaactaagctaaatatatactttgacttgcaaaaggaatttcaacttgctatg
tctcaaaactattcattaataatggcaatttttcggaggtctgtcttagacttatccata
attgaaataaggaacaagattgaaaatcatctaaacatcagcagattaaatggtatttat
ggacaaggtaattcatttaatagtacttatggtaaatcctctacgtccattcaattgcca
attccaaatctttcaaatattccaagatttccaaatatgccagtgattcaaaataataca
aattccatgccgcctggcttagccccatcattgaataacaatagtcatccaatgcaattc
acttataatggaagtcctcagtatccacctggactactaatctcacctgctccaattaat
actgaaaaaattgcatcagtaccaaatcagttaattcataatcaagatatgcatattttg
acaacttcaatcaattcattaggaatttttcttgaagctttgaatgccaaaaatggtgaa
caaatacccgacctggagaattcaattaaaagtgtcatgtttcatatttgttcattttta
aaaattaatgaagggaatattcaatatactttagaaacaataaaaagcatattgaattta
ttaacaagatatttacataatcgagaatctcaaaagattttgtttggatttctaaaagat
gtttcactacaaaataggtcactaagctattttgtatttatatggtttgacaatgctcaa
tttgatttcaagaataaatctcatatattaattgagctattaaatagtagcttaatttca
atacttgaaattgatcaatatctttcaatgaagattaaatcatgcaagtttgggattatt
gaaaatatatttgtattgatagagaaaatatgtctatcaaattccacattctctttctac
agtgatttttcaaaaacaatcagttctttaatagtcattgaagatcctaaagtcaagaaa
tttcttgaagattatgataatttatgttctacttctaaaatagttaaaactttaaccaaa
aaggagctaatgtggacaatatttattgaatgggtaaatattactgaaaaagaagaattt
gatagtgaaattgcaagtatatttttgatgcaattagttcaaaaaaatgtattaaatacc
agtaataattttattgattttattaaatacagcatggaattgagcataattacattttct
aaaaccggtaataatgataaagcatttttattaattgatgccctatcctacttgatattt
caattatatcaatcgttagattatgataaatttaccagagaatcatacctagaacttgta
ttgaccacactaagtcttcagttggtcaaagatattaatactttaaatgaaaactttaat
gaaagattatatttccgtcttatttcaaatattctttctttatggggaaacaattacgag
actactacatttacatctgataatagagataccgaagtaaaagaaatcgagaaattggga
tacctaaagattatttattcctttattaatttgattcagccattagcatatccagcgttt
gcattctcttatctctcgttgatttctcatagaatgtatttgtctagtttattattatat
ccggatcataaatgctgggatatggtaaatgtccatttactaagcatcattgatttttta
aagcattcttcagaacagaaacctgttatggaactgtcgaatgtatattacttcggttta
ttaagaattttgttaagcatcatcaatgattgtccggaatacataattgaaaaccactct
gctttaatatctagaattccagataagttaattcagataaagaatattatatcctcaaca
acgccaaagcaacttgattatgttagccctacaagtgaaattgatttcactactgaaata
aattcatttagtggtatattaattaaagataaggaactatacactaacctggtactgaag
aaacatgttcgcaactatttgaggatacctactagttcattaataaagtctattaataag
gaattactgtcaaaggtatacaacgaacattctggtatcggctataagtggttcacagta
gatatttgcagagtaggagaattggtgttacaaattcttgttgatattggtaaagaaagt
aaaaatgtttctctaaaaactatttttagcaaaaagggatcacacttccaattactgaag
aacttgattgatactaacaatgatgaaacacagtactttattatcaagacattgtttgac
tatttgaggtatccaaatgtccaaacaaactgggttgttttcttcttattgaaaatattt
actgaaggtaatggggatgaaaaatcattaaaaattcgagagatgattattagatgtctg
atcgaaagattgatagtattcccaccatatccatgggggtgcgtcgctttattgaatcaa
atatatttagcaaatagttctttgttgctacaaatcccatccttggaaaacaatcttata
ttaaagaatatggtaatccaaatcatttacaaattcacaaaccaaatttctgataactga
DBGET
integrated database retrieval system